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An example of cooperation between scientist and managers : The Meditearranean Lagoon Network (Languedoc-Roussillon, France) ArchiMer
Laugier, Thierry; Malet, Nathalie; Munaron, Dominique; Derolez, Valerie; Fiandrino, Annie; Barral, Marc; Moragues, Laurent; Mazouni, Nabila; Graille, Chantal.
The poster presents the approach that led to the construction of a network of cooperation between managers and scientists for coastal lagoon management in the region of Languedoc-Roussillon, its architecture and modus operandi, its achievements and developments over time. At the end of the ninety’s, eutrophication and lack of knowledge were identified as issues to enhance the management of coastal lagoons on the Mediterranean coast of France. In 2000, in the region of Languedoc-Roussillon, scientists (Ifremer) and institutional managers (Regional Council of Languedoc-Roussillon and Water Agency Rhône-Méditerranée & Corse) joined their forces in building a network to address this need. The core of this network consists of an operational tool for the...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11343/8101.pdf
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An Unstructured Numerical Model to Study Wind-Driven Circulation Patterns in a Managed Coastal Mediterranean Wetland: The Vaccares Lagoon System ArchiMer
Boutron, Olivier; Bertrand, Olivier; Fiandrino, Annie; Hoehener, Patrick; Sandoz, Alain; Cherain, Yves; Coulet, Eric; Chauvelon, Philippe.
The spatiotemporal structure of wind-driven circulation patterns and associated water exchanges can drive important bio-hydrodynamic interactions in shallow lagoons. The Vaccares lagoon system is a complex shallow hydrosystem located in the central part of the Rhone Delta (France). It is internationally recognized as part of a biosphere reserve within the framework of UNESCO's Man and Biosphere Programme, and as a RAMSAR site. Due to its frequent occurrence in this area, and considering the shallowness of the Vaccares lagoon system, wind is assumed to play a major role in the hydrodynamic and biological processes. In this study, a hydrodynamic model was developed to investigate the structure of wind-driven circulations in the Vaccares lagoon system, to...
Tipo: Text Palavras-chave: Coastal lagoon; Mathematical model; Hydrodynamics; Calibration; Validation; Wind-driven circulation.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00303/41382/40558.pdf
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Analyse statistique des données du RSL - Etude des trajectoires écologiques des lagunes entre 2001 et 2012 ArchiMer
Derolez, Valerie; Ouisse, Vincent; Fiandrino, Annie; Munaron, Dominique; Bissery, Claire; Kloareg, Maela.
Les questions abordées dans le présent rapport concernent la recherche et l’interprétation d’un repère de représentation des données du RSL (colonne d’eau et phytoplancton) pour l’ensemble des stations des lagunes de Provence-Alpes Côte d’Azur (PACA), Languedoc-Roussillon (LR) et Corse : 1) Est-il possible de trouver un repère pertinent de représentation des trajectoires d’évolution pour toutes les stations, en effectuant des regroupement par typologie de stations ? Comment interpréter les deux premiers axes de l’analyse en composantes principales (ACP) ? 2) Le premier axe des repères d’ACP constitue-t-il un « Gradient d’eutrophisation » ? 3) Est-il possible de mettre en évidence un effet météorologique sur les évolutions des teneurs en azote et phosphore...
Tipo: Text Palavras-chave: Lagunes; Eutrophisation; Restauration; Trajectoires; Nutriments; Phytoplancton..
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00173/28423/26754.pdf
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Assessment of eutrophication of French Mediterranean lagoons in relation to meteorological interannual variability ArchiMer
Malet, Nathalie; Derolez, Valerie; Laugier, Thierry; Munaron, Dominique; Fiandrino, Annie; Messiaen, Gregory; Fortune, Martine; Souchu, Philippe; Barral, Marc; Daloz, Aurélien; Moragues, Laurent.
Since recent decades, nutrient-related eutrophication, originating from agricultural use of fertilizer and population enhancement, can be considered worldwide as the main disturbance for coastal lagoons. Since coastal lagoons are very shallow and enclosed, their functioning is tightly linked to meteorological conditions. The aim of this study is to compare different rainfall levels and eutrophication response on coastal lagoons of the Languedoc-Roussillon (Western Mediterranean coast), subject to different nutrient loads from their watershed, in order to check the possibility to distinguish the effects of watershed management or rainfall conditions on water quality (waste water treatment plant improvement, decrease of fertilizer spreading).
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00008/11945/8651.pdf
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Bilan sur les principales pressions pesant sur les lagunes méditerranéennes et leurs liens avec l’état DCE ArchiMer
Derolez, Valerie; Fiandrino, Annie; Munaron, Dominique; Cadoret, Marine.
L’objectif de cette étude est de mettre en évidence et de hiérarchiser les pressions anthropiques ayant le plus d’impact sur les éléments de qualité DCE sur les lagunes méditerranéennes et de consolider ainsi les liens état/pressions. Il s’agit également de mettre en évidence des groupes de masses d’eau homogènes en termes de pressions. Ce travail s’appuie sur les précédentes études menées sur le sujet (Battut, 2010 ; Bouchoucha et al., 2010 ; Meinesz et al., 2013) et vise à les compléter grâce : • à la mise en œuvre d’une approche descriptive multidimensionnelle qui permet de mettre en évidence les interactions entre les différentes métriques de pression et d’état et de regrouper les masses d’eau similaires, • à l’intégration de données de pression et...
Tipo: Text Palavras-chave: Lagunes; Pressions anthropiques; État DCE.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00254/36574/35112.pdf
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Caractérisation des sites du canal de Port La Nouvelle pouvant recevoir les courantomètres H-ADCP, Channel Master RD instrument ArchiMer
Lagarde, Franck; Fiandrino, Annie; Canessa, Julien; Lefeuvre, Patrick.
CONTEXTE - Après avoir prospecté durant l'année 2004 pour définir des sites intéressants pour la mesure de champs de courant et l'estimation de débits dans le Canal de Port La Nouvelle avec des courantomètres horizontaux H-ADCP Channel Master (RD Instrument), 6 sites ont été retenus (mars 2005). Chaque site retenu doit être caractérisé par sa bathymétrie et une observation des champs de courant sur l'ensemble de la section de chenal (mesure tridimensionnelle de champs de courant) en vue d'une estimation ponctuelle du débit de chenal. Etant donné la sensibilité des H-ADCP Channel Master (RD Instrument), des essais ont été réalisés sur les sites retenus afin d'observer le comportement des appareils et leur aptitude à mesurer les courants en fonction des...
Tipo: Text
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18489/16032.pdf
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Déterminisme du recrutement larvaire de l’huître creuse (Crassostrea gigas) dans la lagune de Thau. ArchiMer
Lagarde, Franck; Fiandrino, Annie; Richard, Marion; Bernard, Ismael; Mortreux, Serge; Ubertini, Martin; Chiantella, Claude; Boj, Marie; Meddah, Slem; Leurion, Axel; Soriano, Solenn; Fuhrmann, Marine; Le Gall, Patrik; Chiera, Caroline; Berteaux, Tom; Guillou, Jean-louis; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Perignon, Adeline; Bonnet, Delphine; Roques, Cecile; Bec, Beatrice; Cochet, Helene; Gervasoni, Erika; Miron, Gilles; Pouvreau, Stephane.
Since spat mortality events that were firstly detected in 2008, Mediterranean shellfish industry seeks to exploit the Pacific oyster spat from lagoon natural recruitment. The CRCM, Cepralmar and Ifremer developed accordingly a research project named PRONAMED Phase 1 and 2 - 2010-2014, in order to define the economic potential of spatfall and improve knowledge of the reproductive cycle of Crassostrea gigas in this specific environmental context. The results of the past three year‘s study (2012, 2013, 2014) showed that broodstock have the ability to provide larvae after sexual maturation and spawning. A coincidence was noted between moon phase (new and full moon) and spawnings with an amplifying effect of storms on the intensity of spawning (Ubertini et al....
Tipo: Text Palavras-chave: Lagune; Recrutement; Naissain; Huître creuse; Ecologie larvaire; Cycle de reproduction; Captage naturel.; Lagoon; Recruitment; Spat; Pacific oysters; Larval ecology; Reproduction Cycle; Natural spat collection..
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00279/39054/37620.pdf
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Développement d’une méthode d’estimation des débits dans les graus de lagunes. Application sur la lagune de Bages-Sigean ArchiMer
Fiandrino, Annie; Lagarde, Franck; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Chiantella, Claude; Roucher, Benoit; Meyer, Johann.
Les travaux présentés dans le présent rapport finalisent l’étude engagée dans le cadre de l’Axe 1 : « Amélioration des connaissances et compréhension des processus concernant le fonctionnement et le devenir du littoral méditerranéen » de la Convention Cadre entre l’Ifremer et l’Agence de l’Eau Rhône Méditerranée et Corse portant sur le « Développement de modèle hydrodynamiques et hydrosédimentaires sur les masses d’eau de transition ». Au terme de cette étude, nous disposons d’une méthode de jaugeage des débits en canal, opérationnelle dans la majorité des configurations de profils verticaux de courant rencontrées. Le chenal portuaire de Port-La-Nouvelle, unique voie de communication entre la lagune de Bages-Sigean et la Méditerranée, a été retenu comme...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00060/17104/14620.pdf
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Directive Cadre Eau. Estimation du degré d’échange avec la mer pour les lagunes du bassin Rhône Méditerranée & Corse ArchiMer
Derolez, Valerie; Leurion, Axel; Fiandrino, Annie.
In the context of the update of the inventory of water bodies of the Rhone-Mediterranean and Corsican (RM & C) basin, an assessment of pressures and impacts on the lagoons is expected during the second water management plan (2010-2015) of the Water Framework Directive (WFD). Pressures due to pollutant inputs may have a varying impact on lagoons, according to their degree of interaction with the sea. The more exchanges with the sea will be high, the more export opportunities and dilution of pollutants will be high. The more exchanges will be limited, the more pollutants will accumulate in the lagoons, making then more vulnerable to inputs. The objective of this work is to propose, for the 28 lagoons (21 transition water bodies) of RM & C Basin, an...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00094/20558/18231.pdf
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Distribution of picophytoplankton and nanophytoplankton along an anthropogenic eutrophication gradient in French Mediterranean coastal lagoons ArchiMer
Bec, Beatrice; Collos, Yves; Souchu, Philippe; Vaquer, Andre; Lautier, Jacques; Fiandrino, Annie; Benau, Laurent; Orsoni, Valerie; Laugier, Thierry.
We explored the role of natural and anthropogenic environmental perturbations in shaping the community structure and dynamics of pico- and nanophytoplankton in coastal waters. The distribution patterns of phycoerythrin-rich picocyanobacteria (PE-CYAN) and phycocyanin-rich picocyanobacteria (PC-CYAN), autotrophic picoeukaryotes (PEUK) and nanophytoplankton (NANO) were examined over a period of 3 yr in 24 Mediterranean coastal lagoons displaying wide trophic gradients (from 0.2 to 630 mu g chlorophyll a [chl a] l(-1)) and salinity gradients (from fresh to marine waters). In summer, picoplanktonic abundances reached 3 x 10(8) cells l(-1), 5 x 10(9) cells l(-1) and 6 x 10(10) cells l(-1) for PE-CYAN, PC-CYAN and PEUK, respectively. PE-CYAN and PC-CYAN showed...
Tipo: Text Palavras-chave: Autotrophic picoeukaryotes; Picocyanobacteria; Nanophytoplankton; Abundance; Biomass; Eutrophication; Mediterranean lagoons.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00031/14267/11547.pdf
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Effect of environmental drivers on the reproduction of the pacific oyster Crassostrea gigas in the Mediterranean: The case of the Thau lagoon ArchiMer
Ubertini, Martin; Lagarde, Franck; Le Gall, Patrik; Mortreux, Serge; Pernet, Fabrice; Fiandrino, Annie; Pouvreau, Stephane; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle.
The aquaculture of the oyster Crassostrea gigas is largely based on natural recruitment of the species on spat collectors along the french Atlantic coast, the remaining spat being provided by hatcheries and nurseries. Due to an increase in the climate/meteorological variability, during the last twenty years, the natural spat collection has become variable, from null to overabundant depending on the year. Since 2008, the oyster spat mortalities worsen the situation, reducing the available spat and increasing the cost of the latter. However, the temporal variability of the natural recruitment modalities in the Mediterranean do not allow the aquaculture industry to rely on native spats, making the understanding of natural recruitment in the Mediterranean a...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00248/35894/34422.pdf
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Estimation des échanges entre la mer et la lagune de Biguglia : Utilisation de la méthode d’estimation des volumes d’eau échangés entre la mer et les lagunes par différence de hauteurs d’eau. ArchiMer
Tunin-ley, Alina; Malet, Nathalie; Fiandrino, Annie; Orsoni, Valerie; Baldi, Yoann.
Le projet a pour objectif premier de disposer d'un modèle hydrodynamique opérationnel (modèle MARS) sur la lagune de Biguglia et de le valider sur la base de paramètres mesurés in situ (hauteurs d'eau, salinité, température, débits échangés avec la mer). Cela permettra ensuite de caractériser le fonctionnement physique de la lagune à l'aide de descripteurs hydrodynamiques (influence relative des différents forçages, temps de résidences...) puis d'en dégager une typologie saisonnière. Cette étude préliminaire a pour but d’estimer les volumes journaliers entrants et sortants à partir des données de hauteurs d’eau de part et d’autre des graus. Cette étude a été menée sur la lagune de Biguglia grâce à la méthode développée au LER-LR sur différents étangs du...
Tipo: Text Palavras-chave: Echanges mer/lagune; Hauteur d’eau; Grau; Hydrodynamique; Biguglia (lagune Corse).
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00214/32525/31011.pdf
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Etude sanitaire de la zone de production conchylicole n°11.05 "Etang du Grazel" ArchiMer
Rousselet, Mathilde; Crottier, Anais; Fiandrino, Annie.
Une étude sanitaire est réalisée en vue du classement de la zone par l’administration. Dans le cas présent, la zone d’étude « Etang du Grazel » n°11.05 est déjà classée en B pour le groupe 3 dans l’arrêté n°2010/11/2754 du 9 août 2010 avec une période de pêche décrite du 1er avril au 30 septembre. Cette zone n’était pas suivie dans le cadre du REMI pour la surveillance de ce groupe de coquillage en raison d’une absence d’information sur l’exploitation de cette ressource (moules). Cette zone est suivie dans le cadre du REMI pour la surveillance du groupe de coquillages fouisseurs (palourdes, groupe 2) depuis 2004.
Tipo: Text
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27929/26208.pdf
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Etude sanitaire de la zone n° 34.39 "Lotissements conchylicoles de la lagune de Thau" Groupe III. Département de l'Hérault ArchiMer
Marzin, Anahita; Crottier, Anais; Piquet, Jean-come; Abadie, Eric; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Fiandrino, Annie.
L’étude de zone des lotissements conchylicoles de la lagune de Thau (34.39) a été menée, à la demande du Comité Régional de la Conchyliculture en Méditerranée et du préfet de l’Hérault, pour étudier la possibilité de sectoriser la zone de production en sous-zones, au regard du risque microbiologiques (REMI). Une étude de dossier a été réalisée afin de recenser les principales sources de contamination. Celles-ci sont essentiellement d’origine anthropique et impactent différemment les secteurs envisagés. Des prélèvements de coquillages du groupe 3 ont été réalisés de mai 2017 à mai 2018 avec une fréquence bimensuelle. Au regard des critères du règlement (CE) n° 854/2004, les résultats des analyses microbiologiques (indicateur Escherichia coli) ont permis...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Étude de zone; Lagune de Thau; Département de l’Hérault.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00459/57056/58965.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Région Occitanie. Edition 2019 ArchiMer
Serais, Ophelie; Cimiterra, Nicolas; Fiandrino, Annie; Crottier, Anais; Grouhel-pellouin, Anne; Piquet, Jean-come.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique (REMI) et du réseau de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport comprend un bilan national et décrit le programme annuel 2018 de la région Occitanie. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. En 2018, 28 zones de production ont été suivies par le REMI en Occitanie dont 12 dans l’Aude, 14 dans l’Hérault, 1 dans le Gard et 1 interdépartementale Hérault-Gard. Le taux de réalisation de la surveillance régulière microbiologique est de 94,9%, et 116 alertes ont été déclenchées au cours de l’année. La qualité...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. Coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Occitanie; Hérault; Gard; Aude; Classement sanitaire des zones de production; Estimation de la qualité; Élevage et pêche de coquillages..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00502/61320/64892.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole.Départements des Pyrénées orientales, de l’Aude, de l’Hérault et du Gard. Edition 2018 ArchiMer
Crottier, Anais; Abadie, Eric; Brun, Melanie; Piquet, Jean-come; Fiandrino, Annie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel des départements de l’Hérault, du Gard et de l’Aude. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. Sur les 29 zones de production conchylicole classées et suivies en Occitanie, la qualité a pu être estimée pour 23 d’entre elles. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans les départements de...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de l’Hérault; Départemen tdu Gard; Département de l’Aude.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55635/57280.pdf
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Evaluation of the lake model FLake over a coastal lagoon during the THAUMEX field campaign ArchiMer
Le Moigne, Patrick; Legain, Dominique; Lagarde, Franck; Potes, Miguel; Tzanos, Diane; Moulin, Eric; Barrie, Joel; Salgado, Rui; Messiaen, Gregory; Fiandrino, Annie; Donier, Sylvie; Traulle, Olivier; Costa, Maria Joao.
The THAUMEX measurement campaign, carried out during the summer of 2011 in Thau, a coastal lagoon in southern France, focused on episodes of marine breezes. During the campaign, three intensive observation periods (IOPs) were conducted and a large amount of data were collected. Subsequently, standalone modelling using the FLake lake model was used, first to assess the surface temperature and the surface energy balance, and second to determine the energy budget of the water column at the measurement site. Surface fluxes were validated against in situ measurements, and it was determined that heat exchanges are dominated by evaporation. We also demonstrated that the model was sensitive to the light extinction coefficient at Thau, due to its shallowness and...
Tipo: Text Palavras-chave: Lake modelling; Surface energy budget; Coastal breeze; Water heat storage; Surface temperature.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00161/27257/25466.pdf
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Evidence of the presence of viral shellfish contamination in shellfish after short rainfall events ArchiMer
Le Saux, Jean-claude; Serais, Ophelie; Krol, Joanna; Parnaudeau, Sylvain; Salvagnac, P.; Delmas, G.; Cicchelero, V.; Claudet, J.; Pothier, P.; Balay, K.; Fiandrino, Annie; Pommepuy, Monique; Le Guyader, Soizick.
Infectious diseases linked to the consumption of raw shellfish have long been identified. Over the past century, various strategies have been set up in shellfish growing areas throughout the world to guarantee the sanitary quality of shellfish and to protect consumers. However despite sanitary improvements, human enteric viruses - especially Hepatitis A virus and norovirus– have been found to be associated with shellfish outbreaks. A recent example demonstrated the impact of storm events. Following heavy rain and sewage overflow, shellfish beds were contaminated and the shellfish from them were marketed after depuration. However, since viruses persist longer than fecal contamination indicator bacteria, several clusters of gastroenteritis cases were...
Tipo: Text Palavras-chave: Virus; Shellfish; Contamination events.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17736/15257.pdf
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Facteurs explicatifs de la dynamique spatio-temporelle des mortalités d’huîtres creuses Crassostrea gigas dans la lagune de Thau ArchiMer
Pernet, Fabrice; Lagarde, Franck; Cesmat, Ludovic; Jeannée, Nicolas; Barret, Jean; Le Gall, Patrik; Quere, Claudie; Fiandrino, Annie; Miguet, Marine; Boulet, Hélène; Keck, Nicolas; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle.
Cette étude avait pour objectif principal de déterminer les facteurs explicatifs de la dynamique spatio-temporelle des surmortalités d’huîtres creuses dans la lagune de Thau. Les facteurs étudiés étaient : la pathologie (détection d’ADN appartenant à l’Ostreid herpesvirus 1 OsHV-1 et au groupe bactérien Vibrio splendidus), l’état énergétique des huîtres (triglycérides, sucres totaux et acides gras comme marqueurs trophiques), les pratiques d’élevage et l’hydrodynamique. Afin de répondre à ces objectifs, nous avons suivi la mortalité d’un lot d’huîtres sentinelles, âgé de moins d’un an, maintenu indemne de mortalité, dans lequel on ne détectait pas d’ADN appartenant à OsHV-1. Le lot a été déployé mi-mars 2011 sur 106 stations dans la lagune de Thau, où les...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00092/20355/18015.pdf
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Field investigations and multi-indicators for shallow water lagoon management: perspective for societal benefit ArchiMer
Brehmer, Patrice; Thang Do Chi,; Laugier, Thierry; Galgani, Francois; Laloe, Francis; Darnaude, Audrey M.; Fiandrino, Annie; Mouillot, David.
1. Abiotic and biotic variables of coastal lagoons are highly heterogeneous in both space and time, and this heterogeneity complicates the assessment of their ecological status. These variables are essential to the monitoring and preservation of these fragile ecotones and the resources and services they sustain. 2. An integrative approach for evaluating the ecological status of coastal lagoons, based on field investigations of the key parameters driving their functioning and a set of selected ecological indicators matching lagoon management information needs for societal benefits, is investigated. Consistency in lagoon status evaluation from multiple and different variables was estimated, through a case study comparing three adjacent yet contrasting French...
Tipo: Text Palavras-chave: Coastal lagoon; Ecological assessment; Ecotoxicology; Eutrophication; Indicator; Management; Mediterranean Sea; Observatory.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00056/16702/14202.pdf
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