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Building a transcriptome molecular marker platform for diagnosis of fungal plant pathogens. Repositório Alice
HERAI, R.; DITA, M.; WAALWIJK, C.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; KEMA, G.; FALCAO, P.; GIACHETTO, P.; YAMAGISHI, M..
By using an Expressed Sequence Tag (EST) library from all four races of Foc, we developed a molecular marker platform based on single sequence repeats (SSR).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Patógenos de planta; Molecular markers; Pathogens.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946607
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Laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. Repositório Alice
KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P.; SILVA, F. R. da; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos..
Apresentamos aqui a proposta de implementação de um Laboratório Multiusuário de Bioinformática, reunindo diversas unidades e competências da Embrapa.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Laboratório multiusuário; Bioinformatics.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876188
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Quantitative analysis of the intestinal bacterial communities in broiler chickens using qPCR and metagenomic analysis. Repositório Alice
FURLAN, L.; CANTÃO, M.; GIACHETTO, P.; LUNEDO, R.; FERNANDES, C.; MACARI, M..
The 16S rDNA sequence analysis has been one of the most used approaches for microbiota taxonomic profiling. Among the available techniques, real-time quantitative PCR (qPCR) and next generation sequencing (NGS) and metagenomic analysis has been widely used by researchers, because in addition to qualitative, it also provide quantitative data. Thus, the aim of our study was to compare the effectiveness of these 2 methods for quantification of 3 groups of bacteria of the intestinal microbiota of broilers fed on a standard corn-soybean based diet.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise de DNA; Análise metagenômica; Enterobacteriaceae; Metagenomics.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953791
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Quantitative analysis of the intestinal bacterial communities in broiler chickens using qPCR and metagenomic analysis. Repositório Alice
FURLAN, L.; CANTÃO, M.; GIACHETTO, P.; LUNEDO, R.; FERNANDES, C.; MACARI, M..
The 16S rDNA sequence analysis has been one of the most used approaches for microbiota taxonomic profiling. Among the available techniques, real-time quantitative PCR (qPCR) and next generation sequencing (NGS) and metagenomic analysis has been widely used by researchers, because in addition to qualitative, it also provide quantitative data. Thus, the aim of our study was to compare the effectiveness of these 2 methods for quantification of 3 groups of bacteria of the intestinal microbiota of broilers fed on a standard corn-soybean based diet.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise de DNA; Análise metagenômica; Metagenomics; Enterobacteriaceae.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946489
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