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Anais: resumos dos trabalhos. Infoteca-e
RIBEIRO, Z. M. de A.; SILVA, J. B. T. da; MENEZES, J. E.; BARROS, L. M. G.; GRYNBERG, P..
A Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia realiza o XXIII Encontro do Talento Estudantil, como parte das comemorações do 44º aniversário da Unidade. Os trabalhos expostos a partir do dia 04 são apresentados pelos seus respectivos autores, nos dias 05 e 06 de dezembro de 2018. Este evento intensifica a interação entre pesquisadores, professores e estudantes das instituições de pesquisa e ensino no Distrito Federal. O Encontro busca incentivar, aprimorar e valorizar a produção científica dos estudantes de graduação e de pós-graduação, que atuam na pesquisa de caracterização, conservação e biotecnologia de recursos genéticos animais, microbianos e vegetais. Também viabiliza a divulgação dos resultados de pesquisa por eles desenvolvidos sob a orientação das...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Recursos genéticos; Biotecnologia; Controle Biológico.
Ano: 2019 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1109965
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Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..
bitstream/item/183671/1/Midorikawa-et-al-2018-Frontiers-in-Bioengineering-and-Biotechnology.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Carbohydrate-active enzymes; XlnR; Sugar transporters; ClrA; Aspergillus tamarii; Transcriptome; Lignocellulose; Bioethanol.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096563
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Anti-band 3 and anti-spectrin antibodies are increased in Plasmodium vivax infection and are associated with anemia. Repositório Alice
MOURÃO, L. C.; BAPTISTA, R. de P.; ALMEIDA, Z. B. de; GRYNBERG, P.; PUCCI, M. M.; CASTRO-GOMES, T.; FONTES, C. J. F.; RATHORE, S.; SHARMA, Y. D.; SILVA-PEREIRA, R. A. da; BEMQUERER, M. P.; BRAGA, E. M..
bitstream/item/181515/1/s41598-018-27109-6.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Malaria-associated anemia; Plasmodium vivax.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1094169
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Complete genome sequences of six Chrysodeixis includens Nucleopolyhedrovirus isolates from Brazil and Guatemala. Repositório Alice
CRAVEIRO, S. R.; SANTOS, L. A. V. M.; TOGAWA, R. C.; INGLIS, P. W.; GRYNBERG, P.; RIBEIRO, Z. M. A.; RIBEIRO, B. M.; CASTRO, M. E. B..
bitstream/item/180896/1/e01192-16.pdf
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: ChinNPV; Alphabaculovirus.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060366
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Comprehensive profiling and characterization of Arachis stenosperma (peanut) and Meloidogyne arenaria (plantroot nematode) smallRNAs identified during the course of the infection. Repositório Alice
GRYNBERG, P.; GUIMARÃES, L. A.; COSTA, M. M. C.; TOGAWA, R. C.; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Meloidogyne.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1062094
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Cowpea-Meloidogyne incognita interaction: root proteomic analysis during early stages of nematode infection. Repositório Alice
VILLETH, G. R. C.; CARMO, L. S. T.; SILVA, L. P.; FONTES, W.; GRYNBERG, P.; SARAIVA, M.; BRASILEIRO, A. C. M.; CARNEIRO, R. M. D.; OLIVEIRA, J. T. A.; GROSSI-DE-SA, M. F.; MEHTA, A..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: 2-DE; Differential expression; MS; Nematode?plant interaction; Plant proteomics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1023130
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Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains. Repositório Alice
RUIZ, J. C.; D'AFONSECA, V.; SILVA, A.; ALI, A.; PINTO, A. C.; SANTOS, A. R.; ROCHA, A. A. M. C.; LOPES, D. O.; DORELLA, F. A.; PACHECO, L. G. C.; COSTA, M. P.; TURK, M. Z.; SEYFFERT, N.; MORAES, P. M. R. O.; SOARES, S. C.; ALMEIDA, S. S.; CASTRO, T. L. P.; ABREU, V. A. C.; TROST, E.; BAUMBACH, J.; TAUCH, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; McCULLOCH, J.; CERDEIRA, L. T.; RAMOS, R. T. J.; ZERLOTINI, A.; DOMINITINI, A.; RESENDE, D. M.; COSER, E. M.; OLIVEIRA, L. M.; PEDROSA, A. L.; VIEIRA, C. U.; GUIMARAES, C. T.; BARTHOLOMEU, D. C.; OLIVEIRA, D. M.; SANTOS, F. R.; RABELO, E. M.; LOBO, F. P.; FRANCO, G. R.; COSTA, A. F.; CASTRO, I. M.; DIAS, S. R. C.; FERRO, J. A.; ORTEGA, J. M.; PAIVA, L. V.; ALMEIDA, J. F.; GOULART, L. R.; FERRO, M. I. T.; CARNEIRO, N. P.; FALCÃO, P. R. K.; GRYNBERG, P.; TEIXEIRA, S. M. R.; BROMMONSCHENKEL, S.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MOORE, R. J.; MIYOSHI, A.; OLIVEIRA, G. C.; AZEVEDO, V..
Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Patógeno; Genética; Genome.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906799
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Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains. Repositório Alice
RUIZ, J. C.; D'AFONSECA, V.; SILVA, A.; ALI, A.; PINTO, A. C.; SANTOS, A. R.; ROCHA, A. A. M. C.; LOPES, D. O.; DORELLA, F. A.; PACHECO, L. G. C.; COSTA, M. P.; TURK, M. Z.; SEYFFERT, N.; MORAES, P. M. R. O.; SOARES, S. C.; ALMEIDA, S. S.; CASTRO, T. L. P.; ABREU, V. A. C.; TROST, E.; BAUMBACH, J.; TAUCH, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; McCULLOCH, J.; CERDEIRA, L. T.; RAMOS, R. T. J.; ZERLOTINI, A.; DOMINITINI, A.; RESENDE, D. M.; COSER, E. M.; OLIVEIRA, L. M.; PEDROSA, A. L.; VIEIRA, C. U.; GUIMARÃES, C. T.; BARTHOLOMEU, D. C.; OLIVEIRA, D. M.; SANTOS, F. R.; RABELO, É. M.; LOBO, F. P.; FRANCO, G. R.; COSTA, A. F.; CASTRO, I. M.; DIAS, S. R. C.; FERRO, J. A.; ORTEGA, J. M.; PAIVA, L. V.; GOULART, L. R.; ALMEIDA, J. F.; FERRO, M. I. T.; CARNEIRO, N. P.; FALCÃO, P. R. K.; GRYNBERG, P.; TEIXEIRA, S. M. R.; BROMMONSCHENKEL, S.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MOORE, R. J.; MIYOSHI, A.; OLIVEIRA, G. C.; AZEVEDO, V..
Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma de C pseudotuberculosis; Análise de genoma; Ilhas de patogenicidade; Corynebacterium Pseudotuberculosis; Caseous lymphadenitis; Pathogenicity.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/914696
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Background and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076414
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074046
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Identification and expression profile of odorant-binding proteins in Halyomorpha halys (Hemiptera: Pentatomidae). Repositório Alice
PAULA, D. P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, N. F.; ANDOW, D. A..
2016
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Brown marmorated stink bug; Chemoreception; RNA-Seq; Semiochemicals; Transcriptome.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1055555
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Revealing new perspectives on the regulation of gene expression by the trans-splicing mechanism in Shistosoma mansoni. Repositório Alice
MOURÃO, M. M.; BITAR, M. L.; LOBO, F. P.; GRYNBERG, P.; BORONI, M.; WAISBERG, M.; MACEDO, A. M.; MACHADO, C. R.; FRANCO, G. R..
Schistosomiasis is the second most prevalent neglected tropical disease caused by a Trematode flatworm from the genus Schistosoma. Schistosomes possess a complex life cycle requiring numerous and intricate mechanisms to rule transcriptional and post-transcriptional gene regulation. Thus, it is believed that spliced leader (SL) trans-splicing could play an important role in the parasite biology. The purpose of this study was is to shed light on the function of the trans-splicing mechanism in S. mansoni by searching gene categories that could be target of this process and attempting to silence transcripts harboring the SL sequence. Here, we analyze different life stages cDNA libraries enriched on SL-transcripts of S. mansoni. Our results show that, contrary...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; Gene expression; Schistosoma mansoni.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/908752
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Spring is coming: genetic analyses of the bud break date locus reveal candidate genes from the cold perception pathway to dormancy release in apple (Malus x domestica Borkh.) Repositório Alice
MIOTTO, Y. E.; TESSELE, C.; CZERMAINSKI, A. B. C.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. da S.; SARTOR, T.; CATTANI, A. M.; DELATORRE, C. A.; ALENCAR, S. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRYNBERG, P.; OLIVEIRA, P. R. D. de; KVITSCHAL, M. V.; DENARDI, F.; BUFFON, V.; REVERS, L. F..
Chilling requirement (CR) for bud dormancy completion determines the time of bud break in apple (Malus × domestica Borkh.). The molecular control of bud dormancy is highly heritable, suggesting a strong genetic control of the trait. An available Infinium II SNP platform for genotyping containing 8,788 single nucleotide polymorphic markers was employed, and linkage maps were constructed in a F1 cross from the low CR M13/91 and the moderate CR cv. Fred Hough. These maps were used to identify quantitative trait loci (QTL) for bud break date as a trait related to dormancy release. A major QTL for bud break was detected at the beginning of linkage group 9 (LG9). This QTL remained stable during seven seasons in two different growing sites. To increase mapping...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bud dormancy; Linkage mapping; MdoFLC; MdoICE1; MdoPRE1; Apples; Chilling requirement.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1109789
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Spring is coming: genetic analyses of the bud break date locus reveal candidate genes from the cold perception pathway to dormancy release in apple (Malus x domestica Borkh.) Repositório Alice
MIOTTO, Y. E.; TESSELE, C.; CZERMAINSKI, A. B. C.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. da S.; SARTOR, T.; CATTANI, A. M.; DELATORRE, C. A.; ALENCAR, S. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRYNBERG, P.; OLIVEIRA, P. R. D. de; KVITSCHAL, M. V.; DENARDI, F.; BUFFON, V.; REVERS, L. F..
bitstream/item/195614/1/fpls-10-00033.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bud dormancy; Linkage mapping; MdoFLC; MdoICE1; MdoPRE1; Apples; Chilling requirement.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108014
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Systemic and sex-biased regulation of OBP expression under semiochemical stimuli. Repositório Alice
PAULA, D. P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, N. F.; ANDOW, D. A..
bitstream/item/177766/1/s41598-018-24297-z.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: OBP transcripts; Anthonomus grandis grandis.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092003
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The genome sequence of Pseudoplusia includes single nucleopolyhedrovirus and an analysis of p26 gene evolution in the baculoviruses. Repositório Alice
CRAVEIRO, S. R.; TOGAWA, R. C.; INGLIS, P. W.; GRYNBERG, P.; MELO, F. L.; RIBEIRO, Z. M. de A.; RIBEIRO, B. M.; BÁO, S. N.; CASTRO, M. E. B. de.
Background: Pseudoplusia includens single nucleopolyhedrovirus (PsinSNPV-IE) is a baculovirus recently identified in our laboratory, with high pathogenicity to the soybean looper, Chrysodeixis includens (Lepidoptera: Noctuidae) (Walker, 1858). In Brazil, the C. includens caterpillar is an emerging pest and has caused significant losses in soybean and cotton crops. The PsinSNPV genome was determined and the phylogeny of the p26 gene within the family Baculoviridae was investigated. Results: The complete genome of PsinSNPV was sequenced (Roche 454 GS FLX ? Titanium platform), annotated and compared with other Alphabaculoviruses, displaying a genome apparently different from other baculoviruses so far sequenced. The circular double-stranded DNA genome is...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pseudoplusia includens; Baculovírus; Praga; Insiticida biológico.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1029685
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Transcriptome profiling of twonear-isogenic rice lines infected by Magnaporthe oryzae using RNA-SEQ. Repositório Alice
BEVITORI, R.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; GRYNBERG, P.; GUIMARÃES, L. S. M.; ABREU, A. G. de; MELLO, R.; GROSSI DE SÁ, M. F..
The research described here focused on early signaling events involved in the expression of rice genes in plants infected with M. oryzae using RNA-Seq technique for differential gene expression we analyzed the rice transcriptome in infected leaves at 24 hours post-inoculation.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Doença de planta; Fungo; Brusone; Engenharia genética.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1014926
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