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Correlação da heterose de híbridos de milho com divergência genética entre linhagens. Repositório Alice
GUIMARÃES, P. de S.; PATERNIANI, M.E.A.G.Z.; LÜDERS, R.R.; SOUZA, A.P. de; LABORDA, P.R.; OLIVEIRA, K.M..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a produtividade de híbridos simples de milho obtidos de cruzamentos dialélicos entre linhagens divergentes, estimar a capacidade de combinação das linhagens e confirmar se a divergência genética entre as linhagens, obtida por marcadores moleculares, é correlacionada com a heterose dos híbridos simples no campo. Trinta e seis híbridos resultantes do dialelo parcial e as 12 linhagens parentais foram avaliadas em Campinas em blocos ao acaso, com três repetições e duas testemunhas. A capacidade de combinação das linhagens foi estimada de acordo com o modelo 4 de Griffing. Estimaram-se a correlação matricial, mediante a estatística de Mantel, entre heterose, produtividade e capacidade específica de combinação com...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Zea mays; Marcadores moleculares; Dialelo parcial; Capacidade de combinação; AFLP; SSR; Molecular markers; Partial diallel; Combining ability; Yield.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122872
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Desenvolvimento de marcadores associados à resistência do bicho-mineiro: seleção e validação de SNPs. Repositório Alice
BAZIOLI, J. M.; GUIMARÃES, P. de S.; STRAZZA, B. A.; SCHENK, J. C. M.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P..
O objetivo deste estudo é o desenvolvimento de marcadores do tipo SNPs associados com a resistência ao bicho-mineiro em café. A estratégia principal utilizou as análises genômicas de microarranjo, para caracterização de expressão diferencial de genes-candidatos em plantas resistentes infestadas com o bicho-mineiro. Inicialmente, análises in silico de 2137 destes genes identificaram aqueles potencialmente relacionados com a especificidade da resposta de defesa da planta. Uma vez selecionados, o perfil de expressão de 22 genes foi confirmado por qRT-PCR em experimentos utilizando plantas resistentes e suscetíveis, infectadas pelo bicho-mineiro. Para busca de polimorfismos do tipo SNPs, que poderão ser utilizados como marcadores para seleção-assistida,...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção-assistida; Estresse biótico; Melhoramento molecular; Molecular breeding; Marker-assisted selection; Biotic stress.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113382
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Diversidade genética de populações do bicho-mineiro em regiões cafeeiras do Brasil. Repositório Alice
SIMÕES, B. I. E.; SCHENK, J. C. M.; SILVA, K. A. da; GUIMARÃES, P. de S.; MALUF, M. P.; PADILHA, L..
Considerada a principal praga do cafeeiro, o bicho-mineiro (Leucoptera coffeella) aparece em todas as regiões produtoras de café do país, causando maiores danos em lavouras estabelecidas em locais de clima quente e seco, como o de Cerrados. O conhecimento da variabilidade genética deste inseto pode auxiliar na concepção de estratégias de manejo adequadas do cultivo. Nosso objetivo foi avaliar a diversidade genética em populações do bicho-mineiro de lavouras de café arábica utilizando marcadores moleculares do tipo ISSR. Neste trabalho, amostras de lagartas foram coletadas de diferentes cultivares e em cinco regiões no país com altitudes que variaram de 460m a 950m. O controle químico da praga era realizado com diferentes princípios ativos de produtos de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador ISSR; Variabilidade genética; ISSR; Genetic variability; Leucoptera Coffeella; Coffea Arábica.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113239
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Effects of somatic embryogenesis on gene expression of cloned coffee heterozygous hybrids. Repositório Alice
OLIVEIRA, K. C. de; GUIMARÃES, P. de S.; BAZIOLI, J. M.; MARTINATI, J. C.; SANTOS, M. M. dos; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P..
Cloning of superior coffee plants by somatic embryogenesis can assist breeding programs on reducing the cost and time for launch of new cultivars. This study aimed to evaluate the efficiency of this methodology for cloning coffee trees with high heterozygosity, and to gather evidence that clonal progenies are faithful copies of mother plants. Selected plants IAC1 and IAC 2 from Coffea arabica breeding populations, resistant to leaf rust and leaf miner, respectively, were cloned via indirect somatic embryogenesis. Expression of selected genes involved in biological processes potentially affected by in vitro cultivation was evaluated by quantitative analysis. Genes encoding proteins associated with maintenance of DNA integrity and control of cell cycle...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: In vitro cultivation; Differential expression; Coffea Arábica; Somaclonal variation.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113261
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Marcadores SNP avaliados em cultivares de Café Arábica. Repositório Alice
PEREIRA, L. F. P.; SCHENK, J. C. M.; MALUF, M. P.; SANT'ANA, G. C.; NOGUEIRA, L.; PEREIRA, L. A.; SILVA, B. S. R. da; GUIMARÃES, P. de S.; GUERREIRO FILHO, O.; PADILHA, L..
A demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: GBS; Discriminação de cultivar; Cultivar discrimination; Coffea Arábica.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113242
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Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica. Repositório Alice
GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P..
RESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção-assistida; Melhoramento molecular; Sequenciamento de RNA; Expressão gênica; Plantas sem cafeína; Assisted-selection; Sequenciamento de transcriptoma; RNAseq; Molecular breeding; Gene expression.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114189
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Valor nutritivo do colmo de híbridos de milho colhidos em três estádios de maturidade Repositório Alice
SALAZAR, D. R.; STABILE, S. dos S.; GUIMARÃES, P. de S.; PATERNIANI, M. E. A. G. Z.; SANTOS, M. V. dos; SILVA, L. F. P. e.
Resumo ? O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da maturidade da planta sobre a qualidade nutricional do colmo de híbridos de milho, para definir critérios de seleção em programas de melhoramento de milho para ensilagem. Foram avaliados 15 híbridos de milho, do programa de melhoramento do Instituto Agronômico, em Campinas, SP, colhidos com 90, 120 e 150 dias após a germinação, em experimento com delineamento de blocos ao acaso, com três repetições. O quarto e o quinto internódios do colmo foram retirados para determinação da composição bromatológica e digestibilidade in vitro. Com o avanço da maturidade, houve queda no teor de fibra e aumento no de lignina de ambos os internódios. Observou-se aumento na digestibilidade da matéria seca do quinto...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Degradabilidade; Melhoramento genético; Parede celular; Zea mays; Lignina.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/864474
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