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Antimicrobial Compounds from Eukaryotic Microalgae against Human Pathogens and Diseases in Aquaculture ArchiMer
Falaise, Charlotte; Francois, Cyrille; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin; Haure, Joel; Tremblay, Rejean; Turcotte, Francois; Pasetto, Pamela; Gastineau, Romain; Hardivillier, Yann; Leignel, Vincent; Mouget, Jean-luc.
The search for novel compounds of marine origin has increased in the last decades for their application in various areas such as pharmaceutical, human or animal nutrition, cosmetics or bioenergy. In this context of blue technology development, microalgae are of particular interest due to their immense biodiversity and their relatively simple growth needs. In this review, we discuss about the promising use of microalgae and microalgal compounds as sources of natural antibiotics against human pathogens but also about their potential to limit microbial infections in aquaculture. An alternative to conventional antibiotics is needed as the microbial resistance to these drugs is increasing in humans and animals. Furthermore, using natural antibiotics for...
Tipo: Text Palavras-chave: Biological activity; Antimicrobial; Antibacterial; Antifungal; Antiviral; Biological activity; Haslea; Microalgae; Sustainable aquaculture.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00349/46052/45719.pdf
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Approche de la capacité trophique dans le bassin ostréicole (Baie de Bourgneuf) ArchiMer
Haure, Joel; Baud, Jean-pierre.
A hydrobiological study coupled with the evolution of the production of cupped oysters Crassostrea gigas has been carried out from March 1990 to March 1991 on two oyster culture areas (North and South) of the Bay of Bourgneuf. - The northern area is characterized by an environment which is variable though time and composed of a high nutritive and mineral load. This high particular load (average value = 154 mg.l- 1) is linked to meteorological conditions and especially to the wind speed and direction. The individual growth of cultivated oysters is low (i.e.: 58.8 g). - The southern area shows homogenous hydrobiological characteristics throughout the year. The average phytoplanktonic biomass is 4.4 µg.l-l of chlorophyll and the particular load is low...
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrobiology; Trophic capacity; Crassostrea gigas; Bay of Bourgneuf; Hydrobiologie; Capacité trophique; Crassostrea gigas; Baie de Bourgneuf.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/rapport-6441.PDF
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Approche de la capacité trophique dans un bassin ostréicole (Baie de Bourgneuf) ArchiMer
Haure, Joel.
Une étude spatio-temporelle a été menée de mars 1990 à mars 1991 sur deux stations ostréicoles (nord et sud), de la baie de Bourgneuf. Cette étude se divise en deux parties distinctes : - L'une, hydrobiologique a permis, par des prélèvements hebdomadaires à basse mer plus trois heures, de caractériser les masses d'eau qui baignent chaque point d'étude, - L'autre, a eu pour but d'observer, par un suivi mensuel, l'évolution de la croissance, de l'engraissement et de la mortalité d'un échantillon d'huîtres (Crassostrea gigas) élevé sur chacun des secteurs; L'examen des résultats obtenus amène aux constatations suivantes :  - Le secteur nord présente un milieu hétérogène d'une richesse nutritive importante mais est accompagnée d'une charge sestonique minérale...
Tipo: Text Palavras-chave: Baie de Bourgneuf; Crassostrea gigas; Seston; Météorologie; Hydrobiologie; Croissance; Mortalité; Capacité trophique.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56095/57630.pdf
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Bases génétiques et plasticité de la croissance et de la survie chez l'huître creuse, Crassostrea gigas ArchiMer
Ernande, Bruno; Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Haure, Joel; Martin, Jean-louis.
Growth and survival are the two most interesting characters for oyster farming as they determine the biomass produced in the farms (growth x survival). Thus, a selection program aiming at improving these two characters could be of a great help. However, the oyster, as a sessile organism, is influenced by environmental variability (spatial and temporal) either natural or caused by the used oyster culture methods. Submitted to this variability, oysters must have evolved so as to adapt (short term) to this environmental variability.
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Huîtres; Croissance; Plasticité; Génétique.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3279.pdf
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Bases génétiques et variabilité des caractères physiologiques impliqués dans la croissance de Crassostrea gigas ArchiMer
Baud, Jean-pierre; Palvadeau, Hubert; Nourry, Max; Haure, Joel; Penisson, Christian; Boudry, Pierre.
La production française d' huître creuse Crassostrea gigas représente, avec 144000 tonnes de production, la 4ème' place au ni veau mondial après la Chine (2 285 000 t), le Japon (225 000t.) et la Corée (1 85 000t.). Ce bivalve filtreur possède un potentiel d'adaptation élevé puisqu'on le trouve sous des latitudes très diverses. Malgré son importance économique mondiale (2 900 000 tonnes de production en 1996), à ce jour, très peu de programmes de sélection ont été mis en oeuvre sur cette espèce, qui n'est pas considérée comme domestiquées au sens génétique du terme. Toutefois, avant de lancer des programmes - nécessairement de grande ampleur - pour la sélection de souches d' huîtres creuses Crassostrea gigas, il est utile de répondre au préalable à...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Variabilité génétique; Croissance; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15881/13303.pdf
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Caractérisation des facteurs de risques associés au mortalités estivales - Synthèse du thème 3 - Risque associé au stress environnemental - 2002-2005 ArchiMer
Burgeot, Thierry; Gagnaire, Beatrice; Renault, Tristan; Haure, Joel; Moraga, D.; David, E.; Boutet, L.; Sauriau, P.g.; Malet, Nathalie; Bouchet, V.; Lapegue, Sylvie; Bouilly, Karine; Le Moullac, Gilles; Arzul, Genevieve; Knoery, Joel; Quiniou, Francoise; Bacher, Cedric; Soletchnik, Patrick.
Les mortalités d'huîtres observées sur les côtes françaises apparaissent principalement à proximité du sédiment et pendant la gamétogenèse. Les interactions de facteurs environnementaux sur les écosystèmes conchylicoles comme la température, les apports des bassins versants et le compartiment sédimentaire illustrent un risque de mortalité lié à différentes sources de stress (Thème 1). Les variations de la qualité de la ressource trophique pendant l'effort de gamétogenèse favorise une baisse de l'énergie disponible (Thème 2) et contraint l'organisme fragilisé à fournir un effort d'adaptation (Fent 2004). L'apparition d'un stress pendant cette période sensible des huîtres pourrait constituer un facteur aggravant de mortalité. L'objectif de cette étude est...
Tipo: Text
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41538/40746.pdf
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Caractéristiques hydrobiologiques de quatre secteurs ostréicoles de la Baie de Bourgneuf en 1987 ArchiMer
Baud, Jean-pierre; Haure, Joel; Marion, Anne; Robert, Jean-michel.
Une étude hydrobiologique de quatre secteurs ostréicoles a été menée de mars à octobre 1987. Les eaux de la baie de Bourgneuf sont favorables à l'ostréiculture en raison de leurs teneurs en chlorophylle, sels nutritifs et seston. Les caractéristiques hydrobiologiques sont cependant différentes entre les secteur nord et sud, ces derniers présentant des conditions de milieu d'élevage plus stables. Le gradient de richesse phytoplanctonique de la zone intertidale proche du continent est orientée selon la veine principale du courant résiduel des masses d'eau, avec une décroissance marquée du nord au sud. Le secteur le plus nord (S3) est en période estivale une zone à forte probabilité de développement de dinoflagellés durant les marées de vives eaux. La zone du...
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrobiologie; Ostréiculture; Phytoplancton; Baie de Bourgneuf.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15879/13301.pdf
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Cinétique d'acquisition du terroir Marennes-Oléron par l'huître creuse Crassostrea gigas : approche par les isotopes stables ArchiMer
Malet, Nathalie; Sauriau, Pierre-guy; Haure, Joel.
Japanese oysters previously reared in controlled conditions were replaced into the Marennes Oléron Bay on intertidal oyster parks during 2002 summertime. Kinetics of carbon and nitrogen isotope ratios was followed in 5 organs (digestive gland, gills, mantle, muscle and gonads). Results confirmed excepted significant differences in isotopie signatures between organs and revealed differences in the time required reaching equilibrium with the isotopie signatures of local food sources.
Tipo: Text Palavras-chave: Cinétique; Isotopes stables; Bassin de Marennes Oléron; Crassostrea gigas.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-6526.pdf
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Cold storage of Pacific oysters out of water: biometry, intervalval water and sensory assessment ArchiMer
Buzin, Florence; Baudon, Violaine; Cardinal, Mireille; Barille, Laurent; Haure, Joel.
Due to the important economic activity of oyster production in France, microalgal toxic events represent a significant constraint for shellfish farmers who face closures of bivalve production-sites. The frequency of closures of 3 weeks or less represents half of the total closures along the French coasts. Cold storage could be a simple and affordable solution for temporary and short-term storage before commercialisation. A stock of marketable Pacific oyster Crassostrea gigas was therefore stored during 22 days in non-immersed conditions at 3 degrees C with 100% humidity. At the end of the experiment, the oyster mortality rate remained at a low level of less than 3.5%. The sensory attributes, odour, appearance, texture and flavour, did not show significant...
Tipo: Text Palavras-chave: Quality control; Refrigeration; Sensory evaluation; Shelf life; Shellfish.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15245/12840.pdf
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Comparaison de la croissance et de la mortalité de différentes familles et lignées d'huître plate Ostrea edulis en système intensif ArchiMer
Baud, Jean-pierre; Le Bayon, Nicolas; Haure, Joel; Nourry, Max; Palvadeau, Hubert; Penisson, Christian; Naciri-graven, Yamama; Goyard, Emmanuel; Barre, Marc.
As of 1985, Ifremer set up a selection programme for resistance to the protozoan Bonamia ostreae in European flat oysters (Ostrea edulis). Two selection lines, L85 and L89, from the third and second generation, respectively, were produced with 17 and 21 different families. The experimental design also included a mixed line (L85 x L89) of seven families and a control line of five families from Quiberon broodstock maintained without selection pressure.
Tipo: Text Palavras-chave: Croissance; Génétique; Huîtres plates; Ostrea edulis.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/acte-3245.pdf
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Compte rendu de la réunion REGEMO sur l'amélioration génétique de l'huître plate du 11 mars 1998 à Nantes : Bilan actualisé du programme de sélection ArchiMer
Goyard, Emmanuel; Lapegue, Sylvie; Cochennec, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Langlade, Aime; Joly, Jean-pierre; Buestel, Dominique; Oheix, Jocelyne; Haure, Joel.
Le programme de sélection de l'huître plate a été initié en 1985 par des pathologistes de la Tremblade. La sélection ne portait que sur le seul critère de tolérance des huîtres plates au parasite Bonamia ostreae et correspondait plus à un outil pour étudier divers aspects de la parasitose qu'un un programme d'amélioration génétique visant la relance de la culture de l'huître plate. Dans le cadre du réseau REGEMO, ce programme a ensuite été repris par les généticiens de l'Ifremer : 1) rappel historique et définition d'un vocabulaire commun à l'ensemble des membres du réseau REGEMO. 2) Inventaire et bilan des opération menées ou en cours ( sur la dernière génération de sélection produite ne 1995, sur le matériel issu de cette génération et produit en 1997....
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Sélection génétique; Huître plate; Ostrea edulis; Génétique population; Croissance.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/15977/13419.pdf
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COMSAUMOL (maintien de la COMmercialisation par la SAUvegarde et la détoxication des MOLlusques). Etude 2008-2010. Rapport final ArchiMer
Haure, Joel; Hussenot, Jerome; Buzin, Florence; Dupuy, Beatrice; Palvadeau, Hubert; Penisson, Christian; Papin, Mathias; Nourry, Max; Lassus, Patrick; Marcaillou-le Baut, Claire; Mondeguer, Florence; Royer, F.; Amzil, Zouher; Belin, Catherine; Cardinal, Mireille; Le Grel, L.; Le Bihan, V.; Jaouen, P.; Massé, A.; Castaing, Jean-baptiste; Sabiri, Ne.; Pontié, M..
La contamination des denrées d’origine marine par des toxines algales (phycotoxines) a pris depuis quelques années une importance considérable. Ce phénomène est largement lié à l’augmentation du nombre de zones géographiques touchées ainsi qu’à la diversification des espèces toxinogènes et à l’identification de nouveaux composés toxiques. Les données épidémiologiques sont cependant encore peu nombreuses car elles sont liées à la mise en place de contrôles systématiques récents. L’Union Européenne a établi un Laboratoire Communautaire de référence pour les phycotoxines, situé à Vigo (Espagne) qui coordonne les activités des laboratoires Nationaux de références correspondants (en France c’est le LNR Phycotoxines de l’AFSSA qui assure cette mission). C’est...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00092/20277/17922.pdf
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Contrôle des performances des souches d'huîtres plates résistantes au protozoaire Bonamia ostreae 2ème année ArchiMer
Haure, Joel; Nourry, Max; Le Bayon, Nicolas; Baud, Jean-pierre.
Un contrôle des performances de souches d'huîtres plates, Ostrea edulis, issues d'un plan de sélection a été réalisé d'avril à novembre 1995 en élevage intensif. Un débit d'eau de mer fixé à 4l/heure/huître et un apport nutritif (Skeletonema costatum) de 3.10(9) cellules/jour/huître semblent constituer un bon compromis pour satisfaire les exigences physiologiques de l'huître plate. Les lots d'huîtres résistantes ou tolérantes à Bonamia ostreae présentent de meilleures performances de croissance que les lots témoins. Une hiérarchisation de la croissance validée sur le plan statistique a été mise en évidence comme suit : R6 (F0*F1) > R7 (F1*F2) > Q (lot témoin). La plupart des huîtres ont été infestées par le ver Polydora, malgré le traitement à la...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique quantitative; Ostrea edulis; Bonamia ostreae; Souche résistante.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15875/13297.pdf
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Croissance, engraissement et mortalité de l'huître creuse Crassostrea gigas en baie de Bourgneuf : comparaison de quatre secteurs ostréicoles ArchiMer
Haure, Joel; Baud, Jean-pierre.
A study on mortalities, growth and fattening of the oyster Crassostrea gigas was carried out spring with the autumn 1987 in four sites of bay of Bourgneuf. Mortalities, more important in spring, prove to be higher in the sectors North compared to the Southern sectors of bay of Bourgneuf. The performances of growth are rather weak when they are compared with other French oyster sectors. They however present a better production in the cattle-breeding areas located at the South of bay. The spring phase is marked by the formation of glucidic reserves, at the moment of the reheating of water, which is quickly transformed, in the majority of the sites, in lipids of reserves of the ovocytes, during the gamétogenèse. The state of fattening of Crassostrea gigas...
Tipo: Text Palavras-chave: Fattening; Oyster; Mortality; Growth; Bay of Bourgneuf; Crassostrea gigas; Engraissement; Huitre; Mortalité; Croissance; Baie de Bourgneuf; Crassostrea gigas.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1990/rapport-1646.pdf
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Determination of diet in Manila clams by spatial analysis of stable isotopes ArchiMer
Dang, C.; Sauriau, Pierre-guy; Savoye, N.; Caill-milly, Nathalie; Martinez, P.; Millaret, C.; Haure, Joel; De Montaudouin, X..
Spatial changes in the dietary regime of Ruditapes philippinarum from intertidal sediments of Arcachon Bay were depicted by analyzing stable isotope ratios in both its adductor muscles and potential trophic sources. Manila clams were collected from 50 sites in May to June 2006. Dietary reconstruction was based on the IsoSource mixing model, considering trophic enrichments of 3.5%. for carbon and 3.0%. for nitrogen, which were determined experimentally. delta C-13 and delta N-15 values, respectively, averaged -28.2 and 5.2 parts per thousand for riverine particulate organic matter (POM), -20.6 and 4.7 parts per thousand for inner bay phytoplankton, -21.0 and 5.6%. for outer bay phytoplankton, -16.8 and 4.8 parts per thousand. for microphytobenthos, -18.4...
Tipo: Text Palavras-chave: SW France; Arcachon Bay; Spatial variability; Mixing model; Trophic sources; C and N stable isotopes; Muscle; Ruditapes philippinarum.
Ano: 2009 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-6886.pdf
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Diversification de la production conchylicole. Approche d'une stratégie d'élevage de la palourde japonaise (Ruditapes philippinarum) dans la région de la baie de Bourgneuf ArchiMer
Baud, Jean-pierre; Hommebon, Prestal; Haure, Joel.
If clam growth is no longer an issue during the pre-growth phase in the Bourgneuf bay region, the two year growth phase shows several problems: in the south bay area, the growth of Ruditapes phi¿lippinarum clams is inconsistent and depends on oyster and mussel stocks. In fattening ponds raising standards only allow a 500g/m final biomass. This forces clam farmers to own large areas, which are currently hardly available in this region. The alternative would consist in fractioning the growth phase into two steps: half raising in tidal zones (half buried pots at 2000/ra) or in fattening ponds, under extensive conditions (200/m) or intensive (1000/m) by adding phytoplankton. Winter stocking, for all cases in fattening ponds, would prevent major stress in...
Tipo: Text Palavras-chave: Culture on estran; R. philippinarum; Bay of Bourgneuf; Culture en claire; Culture sur estran; R. philippinarum; Baie de Bourgneuf.
Ano: 1988 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1988/rapport-1594.pdf
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Effect of food supply on the detoxification in the blue mussel, Mytilus edulis, contaminated by diarrhetic shellfish toxins ArchiMer
Marcaillou-le Baut, Claire; Haure, Joel; Mondeguer, Florence; Courcoux, Anne; Dupuy, Beatrice; Penisson, Christian.
The objective of this study was to identify a possible effect of food on the acceleration of decontamination in blue mussels, Mytilus edulis, containing diarrhetic toxins belonging to the okadaic acid (OA) structural group. An experimental protocol was designed to describe and compare the decontamination kinetics and detoxification rates of naturally OA-contaminated mussels that had either received or not received food for three weeks. The protocol was applied in two trials (in June 2006 and June 2007, called Ker06 and Ker07), conducted one year apart on samples of mussels collected in the same area, at the same season. Okadaic acid (OA), the main lipophilic toxin produced by the toxic alga Dinophysis acuminata, was analysed over the course of the...
Tipo: Text Palavras-chave: Mussel; Feeding; Digestive gland; Depuration; Okadaic acid; Acyl esters; Marine lipophilic biotoxins; Mass spectrometry.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00025/13650/10883.pdf
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Effets de l'apport de phytoplancton (Skeletonema costatum) sur la croissance et les variations de la composition biochimique de la palourde japonaise Ruditapes philippinarum cultivée en marais ArchiMer
Baud, Jean-pierre; Haure, Joel; Garnier, Jacqueline.
A bulk production of phytoplankton (Skelelonema costatum) has been obtained in concrete tanks from saline groundwater. This was used in various concentrations to feed an intensive cultivation of the Manila clam (Ruditapes philippinarum) in ponds. No difference was observed in growth rates of molluscs, with food concentrations between 31 to 126 µg/l Chl a. However, the growth rates obtained from March to November with a food supplement were 1.5 times higher than those observed in the traditional, extensive cultivation. The biomass doubled and the increase in flesh dry weight was 2.5 times higher. The condition index reached a value of 100 in the intensive cultivation. During growth, the proximate composition analysis revealed that the lipid and carbohydrate...
Tipo: Text Palavras-chave: Ruditapes philippinarum; Skeletonema costatum; Elevage intensif; Claire; Croissance; Composition biochimique; Ruditapes philippinarum; Skeletonema costatum; Intensive rearing; Pond; Growth; Biochemical changes.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00039/14980/12307.pdf
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Effets d'un mélange de pesticides sur les hémocytes d'huître creuse, Crassostrea gigas. ArchiMer
Gagnaire, Beatrice; Geret, Florence; Haure, Joel; Martin, Jean-louis; Burgeot, Thierry; Thomas-guyon, Hélène; Renault, Tristan.
Shellfish industry is often realised in estuarine areas, subjected to pollutions due to agricultural activities. The harmful effects of pesticides on animals inhabiting these estuarine zones are poorly documented. Bivalve molluscs represent an interesting model because they are sedentary and they filter water intensively. Effects of pesticides on haemocytes functions were tested in Pacific oyster, Crassostrea gigas and analysed by flow cytometry. A combination of pesticide at environmental concentrations was tested in vivo. Animals used corresponded to two genetically selected populations produced in hatchery.
Tipo: Text Palavras-chave: Haemocytes; Flow cytometry; Pesticides; Crassostrea gigas.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-924.pdf
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Elevage intensif de la palourde japonaise Ruditapes philippinarum dans les marais atlantiques: faisabilité biologique ArchiMer
Baud, Jean-pierre; Glize, Philippe; Haure, Joel; Garnier, Jacqueline.
Dans un élevage Intensif en claires expérimentales de palourdes japonaises semées à la taille de 28 mm et aux densités de 100, 200 et 300/m2, différentes rations alimentaires de la diatomée Skeletonema costatum. cultivée à partir d'eau salée souterraine, ont été testées de mars à novembre 1988. Pour la densité 100/m2, le taux de croissance n'est pas significativement différent avec des concentrations de pigment dans l'eau injectée comprises entre 31 et 126 µg.l(1) de Chia. Toutefois celui-ci est 1,5 fois supérieur à celui observé dans la claire témoin. Avec 1.8 kg.m-2 la biomasse finale représente 2 fois la charge récoltée dans la claire extensive. Après analyse, la densité de 300/m2 semble être le meilleur compromis pour l'élevage intensif même si la...
Tipo: Text Palavras-chave: Aquaculture intensive; Palourde japonaise; Ruditapes philippinarum; Marais maritime; Zootechnie; Densité; Croissance; Biomasse; Production; Rendement.
Ano: 1991 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15885/13307.pdf
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