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16s rDNA-metagenomic sequencing of bone lesions caused by femoral head necrosis in broilers. Repositório Alice
ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; RHOADS, D. D.; AL-RUBAYE, A.; WIDEMAN, R. F.; LEDUR, M. C..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Galinha; Animal genetics; Chickens.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1014240
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A SNP in the BMP3 gene associated with carcass traits in broilers. Repositório Alice
NEIS, K. L.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; KAWSKI, V. L.; FORNARI, M. B.; LOPES, L. dos S.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNP; Frango de corte; Carcarça; Polimorfismo genético; Broiler chickens; Genetic polymorphism; Chicken carcasses.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/970454
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Age effects on gene expression related to the bacterial chondronecrosis with osteomyelitis in broiler. Repositório Alice
CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; PANDOLFI, J. R. C.; SETTLES, M.; LEDUR, M. C..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene expression; Proteomics; Metabolomics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037119
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Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Repositório Alice
SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
bitstream/item/147026/1/Souza-et-al-2016.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nelore; Expressão alélica diferencial; Maciez da carne; Gado Nelore; Alleles.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052240
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Ammonia removal from swine wastewater by simultaneous nitrification-denitrification processes within a photobioreactor. Repositório Alice
MEZZARI, M. P.; SILVA, M. L. B. da; VIANCELLI, A.; IBELLI, A. M. G.; KUNZ, A.; SOARES, H. M..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioquímica do solo; Suinocultura; Nitrificação; Desnitrificação; Pig farming; Soil biochemistry; Desnitrification; Nitrification.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/969259
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Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F..
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise estatística; Análise de componentes principais - PCA..
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/885652
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Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F..
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise estatística; Análise de componentes principais - PCA; Gene expression; Algorithms; Statistical analysis; Principal component analysis.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/883623
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Análise de associação entre marcadores moleculares no cromossomo 3 de ovinos e resistência aos nematódeos gastrintestinais. Repositório Alice
GOUVEIA, J. J. S.; SANTIAGO, A. C.; IBELLI, A. M. G.; FREITAS, A. R. de; OLIVEIRA, M. C. de S.; GIGLIOTI, R.; ESTEVES, S. N.; REGITANO, L. C. de A..
A ovinocultura brasileira tem experimentado considerável crescimento nos últimos anos (cerca de 17% entre 2003 e 2006). Porém, apresenta números pouco significativos quando comparado ao cenário mundial. Uma das principais causas de prejuízos desta exploração é a infecção por nematódeos gastrintestinais. Em razão disso, a descoberta de marcadores moleculares para resistência a endoparasitas em ovinos tem recebido grande atenção por parte dos pesquisadores, e diversos estudos vêm sendo conduzidos em várias partes do mundo e com diversas raças. No Brasil, entretanto, estes estudos são insipientes. O objetivo deste trabalho foi verificar associação entre marcadores tipo microssatélite do cromossomo três de ovinos e a resistência aos nematódeos...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ovinos; Nematódeos gastrintestinais; Marcadores moleculares.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/33079
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Análise de conjunto de genes de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; IBELLI, A. M. G.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A..
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de conjuntos de genes para dados de experssão gênica, conforme utilizada no escopo da RGA. Na seção 2 é apresentado o procedimento correspondente à análise de GSA proposta por (EFRON; TIBSHIRANI, 2007), utilizado na RGA. Um exemplo completo, incluindo principais comandos do correspondente script R é apresentado na seção 3.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise de genes; Bioinformatics; Gene expression.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/920185
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Análise de métodos para a conservação de RNA. Repositório Alice
SOUZA, J. R. T; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A..
Amostras de RNA com elevado grau de pureza e integridade são necessárias em diversos métodos de análise da expressão gênica. Em virtude da possibilidade de degradação enzimática, métodos eficazes de extração e armazenamento dessas amostras são necessários. Existem hoje no mercado reagentes que permitem a extração e a purificação de RNA de diversas amostras, com rapidez e eficiência, pois contêm simultaneamente desnaturantes, como o isotiocianato de guanidina, que impedem a ação enzimática, e solventes orgânicos que isolam o RNA do DNA e das proteínas. O objetivo deste projeto foi comparar a qualidade e integridade de RNA extraídos a partir de tecidos armazenados em RNAlater. e de tecidos crioliofilizados, e testar diferentes métodos de armazenamento para...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RNA; Métodos de conservação; Crioliofilização.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/48100
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Análise por componentes principais, de medidas fisiológicas de bovinos submetidos a teste de tolerâncias ao calor. Repositório Alice
ALENCAR, M. M. de; RIBEIRO, A. R. B.; FREITAS, A. R. de; REGITANO, L. C. de A.; IBELLI, A. M. G..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Calor; Comportamento; Medidas fisiológicas.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/578866
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Associação de um SNP no gene da calmodulina com características de integridade da tíbia em frangos de corte. Repositório Alice
CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; ONO, R. K.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C..
bitstream/item/169581/1/final8645.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Integridade óssea; CALM; Cálcio; Frango de corte; Genética animal; Polimorfismo genético.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083259
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Associação do receptor da adiponectina com cortes nobres e características relacionadas à deposição de gordura em uma linhagem paterna de frangos de corte. Repositório Alice
CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNP; Gordura abdominal; ADIPOR 1; Frango de corte.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/968188
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Associação entre microssatélite localizado no cromossomo OAR3 e peso ao abate de ovinos pertencentes a três grupos genéticos. Repositório Alice
GOUVEIA, J. J. S.; SANTIAGO, A. C.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; ESTEVES, S. N.; BARIONI JUNIOR, W.; REGITANO, L. C. de A..
A ovinocultura tem uma enorme importância em várias regiões do mundo e isso pode ser demonstrado pelo volume de produção e de dinheiro gerado por esta atividade. Apesar de o Brasil apresentar excelentes condições ambientais e mercado bastante favorável, a produção nacional ainda é desprezível no contexto mundial. A baixa produtividade brasileira na ovinocultura se deve, ao menos em parte, ao baixo potencial genético do rebanho nacional. Algumas características importantes que poderiam ser usadas nos programas de melhoramento genético apresentam baixa herdabilidade, difícil mensuração ou correlações negativas com outras características. Nesse contexto, a genética molecular, através da identificação das regiões cromossômicas responsáveis pelo controle das...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ovino; Associação; Cromossomo; Peso; Crescimento; Grupo Genético.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/48711
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Associação entre polimorfismos de única base (SNP) dos genes PPARGC1A e PSMC1 com espessura de gordura subcutânea em animais da raça Canchim. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; GASPARIN, G.; IBELLI, A. M. G.; OLIVIERA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismos; Genes; Raça Canchim; Espessura de gordura.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/573412
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Association between a SNP of IL2 gene and gastrointestinal resistance in goat Repositório Alice
BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; MALAGO JUNIOR, W.; GIGLIOTI, R.; IBELLI, A. M. G.; COUTINHO, R.; CARRILHO, E.; ZAROS, L. G.; VIEIRA, L. da S.; REGITANO, L. C. de A..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Goat; Gastrointestinal resitance; Gene; Association.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/904725
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Association of an InDel in the ghrelin gene with performance traits in a paternal broiler line. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; FONGARO, G.; TESSMANN, A. L.; RIBEIRO, J. B.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Growth hormone; Frango de corte; Polimorfismo genético; Hormônio; Broiler chickens; Somatotropim; Genetic polymorphism.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/970440
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Association of apolipoprotein B and adiponectin receptor 1 genes with carcass, bone integrity and performance traits in a paternal broiler Line. Repositório Alice
CRUZ, V. A. R. da; SCHENKEL, F. S.; SAVEGNAGO, R. P.; GRUPIONI, N. V.; STAFUZZA, N. B.; SARGOZAEL, M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P..
Apolipoprotein B (APOB) and Adiponectin Receptor 1 (ADIPOR1) are related to the regulation of feed intake, fat metabolism and protein deposition and are candidate genes for genomic studies in birds. In this study, associations of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) g.102A>T (APOB) and g.729C>T (ADIPOR1) with carcass, bone integrity and performance traits in broilers were investigated. Genotyping was performed on a paternal line of 1,454 broilers. The SNP detection was carried out by PCR-RFLP technique using the restriction enzymes HhaI for the SNP g.729C>T and MslI for the SNP g.102A>T. The association analyses of the two SNPs with 85 traits were performed using the restricted maximum likelihood (REML) and Generalized Quasi-Likelihood...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Frango de corte; Carcaça; Genética animal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1025860
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Association of Apolipoprotein B gene with carcass, performance, and organ traits in a paternal broiler line. Repositório Alice
CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; CHUD, T. C. S.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético animal.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1014223
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Association of RUNX2 and TNFSF11 genes with production traits in a paternal broiler line. Repositório Alice
GRUPIONI, N. V.; STAFUZZA, N. B.; CARVAJAL, A. B.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P..
Abstract: Intense selection for production traits has improved the genetic gain of important economic traits. However, selection for performance and carcass traits has led to the onset of locomotors problems and decreasing bone strength in broilers. Thus, genes associated with bone integrity traits have become candidates for genetic studies in order to reduce the impact of bone disorders in broilers. This study investigated the association of the RUNX2 and TNFSF11 genes with 79 traits related to performance, carcass composition, organs, and bone integrity in a paternal broiler line. Analyses of genetic association between single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and traits were carried out using the maximum likelihood procedures for mixed models. Genetic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Frango de corte; Animal breeding; Broiler chickens.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1069536
Registros recuperados: 131
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