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Analyse moléculaire du génome du caféier Arabica : relations avec la valorisation des ressources génétiques IRD
Lashermes, Philippe; Combes, Marie-Christine; Herrera, J.C.; Noir, S.; Prakash, N.S.; Topart, P.; Anthony, F..
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; AMELIORATION GENETIQUE; CAFE; RESSOURCES GENETIQUES; ANALYSE GENETIQUE; GENOME; PHYLOGENIE; HEREDITE; RESISTANCE; MALADIE DES PLANTES; HYBRIDATION INTERSPECIFIQUE; BIOLOGIE MOLECULAIRE.
Ano: 2001 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010028489
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Anther culture of wheat (Triticum aestivum) adapted to dry areas of West Asia and North Africa IRD
Lashermes, Philippe; Engin, G.; Ortiz-Ferrara, G..
Tipo: Text Palavras-chave: CULTURE IN VITRO; BLE; ANDROCEE; HAPLOIDE; MILIEU DE CULTURE; HYBRIDE; ETUDE COMPARATIVE.
Ano: 1991 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010005255
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Combining ability of doubled haploids in Coffea canephora P. IRD
Lashermes, Philippe; Couturon, Emmanuel; Charrier, André.
Afin d'étudier leur aptitude à la combinaison, cinquante-cinq haploïde-doublées (HD) de #Coffea canephora$ ont été croisés avec soit des génotypes hétérozygotes soit des génotypes HD. Trois essais agronomiques ont été établis. Une vigueur hybride marquée est observée pour tous les caractères analysés dont la production. Des différences importantes sont mises en évidence entre HD produits à partir d'un même clone reflétant le haut niveau d'hétérozygotie des clones. L'analyse d'un plan factoriel de croisement indique que la variance génétique est essentiellement due aux effets additifs pour la production ainsi que pour la hauteur des arbres et la forme des feuilles. L'aptitude générale à la combinaison apparaît aussi prédominante pour le diamètre au collet...
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; CROISEMENT; VARIABILITE GENETIQUE; APTITUDE A LA COMBINAISON; ANALYSE DE VARIANCE; HAPLOIDE DOUBLE; CARACTERE AGRONOMIQUE; VIGUEUR.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41162
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Construction of a molecular linkage map in coffee IRD
Paillard, M.; Lashermes, Philippe; Pétiard, V..
Une carte de liaison génétique du caféier (#Coffea canephora$) totalisant 1402 cM a été établie sur la base d'une population de plantes haploïde-doublées. Des marqueurs RFLP comme des marqueurs utilisant la PCR (RAPD) ont permis la construction de 15 groupes de liaison. Des clones de DNA génomiques de caféier ainsi que des DNAc ont été utilisés. Au total, 47 RFLP et 100 RAPD sont positionnés sur la carte de liaison. Un niveau relativement faible de polymorphisme est observé. 81 % des marqueurs RAPD et 85 % des marqueurs RFLP présentent une ségrégation significativement non différente (P < 0.01) du ration 1:1. La disponibilité d'une carte de liaison moléculaire du caféier offre de nombreuses perspectives tant pour des études génétiques que pour...
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; RESSOURCES GENETIQUES; HAPLOIDE; ADN; METHODE D'ANALYSE; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE; RFLP.RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM; HAPLOIDE DOUBLE; CARTE GENETIQUE.
Ano: 1996 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010006514
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Doubled haploids of Coffea canephora : development, fertility and agronomic characteristics IRD
Lashermes, Philippe; Couturon, Emmanuel; Charrier, André.
Des haploïde-doublés (HD) de #Coffea canephora$ ont été développés en utilisant les embryons haploïdes qui apparaissent spontanément en association avec la polyembryonie. Les fréquences de graines polyembryonées et d'embryons haploïdes varient en fonction du génotype parental. Cependant la production d'un grand nombre de HD semble possible à partir de tous les génotypes. Plus de 750 HD produits à partir de différents génotypes ont été cultivés au champ et évalués pour plusieurs caractères agronomiques. Environ la moitié des génotypes HD n'ont pas survécu, suggérant un fort et négatif effet de l'homozygotie. La dépression de consanguinité est particulièrement sévère pour la vigueur végétative et les aspects liés à la reproduction. Pour plusieurs caractères...
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; CONSANGUINITE; DEVELOPPEMENT BIOLOGIQUE; CAFEIER; HAPLOIDE DOUBLE; POLYEMBRYONIE; FERTILITE; CARACTERE AGRONOMIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41163
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Genetic diversity for RAPD markers between cultivated and wild accessions of Coffea arabica IRD
Lashermes, Philippe; Trouslot, Pierre; Anthony, François; Combes, Marie-Christine; Charrier, André.
Des marqueurs RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) ont été utilisés avec succès pour analyser la diversité génétique parmi des accessions sauvages et cultivées de #Coffea arabica$. La base génétique étroite des cultivars est confirmée. En revanche, une relative large diversité est observée dans le matériel sauvage illustrant l'intérêt des prospections. Des résultats suggèrent une différenciation génétique Est-Ouest en Ethiopie qui constitue le centre primaire de diversification de #C. arabica$. L'important effet d'hétérosis observé chez des hybrides intergroupes pourrait être lié à cette différenciation génétique. La méthode RAPD apparaît performante pour l'étude de la variabilité génétique et la classification du germplasm de #C. arabica$. (Résumé...
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; RESSOURCES GENETIQUES; PLANTE SAUVAGE; PLANTE CULTIVEE; CULTIVAR; VARIABILITE GENETIQUE; POLYMORPHISME; HETEROSIS; RAPD.RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA.
Ano: 1996 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010004204
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ICARDA's strategy for biotechnology : objectives, organizational structure and areas of research IRD
Weigand, F.; Lashermes, Philippe.
Tipo: Text Palavras-chave: BIOTECHNOLOGIE; ORGANISME DE RECHERCHE; STRATEGIE DE RECHERCHE; RECHERCHE AGRONOMIQUE; SECHERESSE; AMELIORATION DES PLANTES; CULTURE IN VITRO; MARQUEUR MOLECULAIRE; TECHNIQUE RFLP; HYBRIDATION INTERSPECIFIQUE; TRANSFERT DE GENE; TEST ELISA.
Ano: 1991 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010025543
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Identification of polymorphisms in reference barley genotypes based on the polymerase chain reaction IRD
Lashermes, Philippe; Blake, T.; Ceccarelli, S..
La technique de réplication #in vitro$ (PCR) peut être utilisée pour détecter du polymorphisme de l'ADN. Quatre génotypes de référence d'orge ont été évalués pour leur polymorphisme après amplification spécifique de séquence du génome nucléaire. La ségrégation de marqueurs impliquant une PCR a été observée à l'intérieur d'une descendance F5. L'intérêt des marqueurs utilisant la PCR comme marqueur génétique chez l'orge est discuté. (Résumé d'auteur)
Tipo: Text Palavras-chave: COLLECTION BOTANIQUE; GERMOPLASME; IDENTIFICATION; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE; MARQUEUR GENETIQUE; CARACTERISATION GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41164
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Identification variétale et ressources génétiques chez le figuier (Ficus carica L.) : utilisation des marqueurs RAPD IRD
Khadari, B.; Lashermes, Philippe; Kjellberg, F..
L'idenfification de 21 échantillons de figuier (#Ficus carica$ L.) représentant différentes variétés cultivées a été réalisée par la technique RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA). Des amorces donnant des résultas reproductibles et révélant du polymorphisme au sein d'un sous-ensemble de quatre génotypes ont été préalablement sélectionnées. 19 marqueurs ont été obtenus par l'utilisation de 12 amorces et ont permis de caractériser 17 génotypes. L'analyse a mis en évidence une erreur d'étiquetage pour un échantillon et une synonymie pour deux autres. La reproductibilité des résultats, la stabilité au sein d'un clone et le polymorphisme suffisamment élevé font de ces marqueurs un outil efficace pour l'identification variétale chez le figuier. Les génotypes...
Tipo: Text Palavras-chave: RESSOURCES GENETIQUES; PLANTE FRUITIERE; IDENTIFICATION; CULTIVAR; METHODE D'ANALYSE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; POLYMORPHISME GENETIQUE; MARQUEUR MOLECULAIRE; RAPD.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:43194
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Improved anther culture method for obtaining direct regeneration in wheat (Triticum aestivum L.) IRD
Lashermes, Philippe.
Tipo: Text Palavras-chave: MULTIPLICATION VEGETATIVE IN VITRO; BLE; ANDROCEE; HAPLOIDE; MILIEU DE CULTURE; REGENERATION.
Ano: 1992 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010005226
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Inheritance and genetic mapping of self-incompatibility in Coffea canephora Pierre IRD
Lashermes, Philippe; Couturon, Emmanuel; Moreau, N.; Paillard, M.; Louarn, Jacques.
Le comportement en croisement de génotypes haploïde-doublés (HD) et hybrides de #Coffea canephora$ a été établi par des tests in vitro et des observations du seed-set. L'utilisation de HD offre l'opportunité de travailler avec des parents mâles et femelles génétiquement homogènes. La méthode (ABF) basée sur la fluorescence du bleu d'aniline a été utilisée pour observer l'accumulation de callose dans le pollen et le pistil. Des situations tranchées de compatibilité/incompatibilité sont observées et confirmées par l'analyse du seed-set. Le comportement en croisement de combinaisons hybrides corrobore celui observé chez les phénotypes HD. L'expression de l'auto-incompatibilité ne semble donc pas modifiée par la faible vigueur des HD. La distribution du...
Tipo: Text Palavras-chave: REPRODUCTION SEXUEE; HAPLOIDE; HYBRIDE; GENOTYPE; GENETIQUE; LOCUS; AUTOINCOMPATIBILITE; RFLP.RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM.
Ano: 1996 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010007016
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Inheritance and restriction fragment length polymorphism of chloroplast DNA in the genus Coffea L. IRD
Lashermes, Philippe; Cros, Joëlle; Combes, Marie-Christine; Trouslot, Pierre; Anthony, François; Hamon, Serge; Charrier, André.
CpDNA variation among 52 tree samples belonging to 25 different taxa of #Coffea$ and two species of #Psilanthus$ was assessed by RFLP analysis on both the total chloroplast genome and the atpB-rbcL intergenic region. Twelve variable characters were distinguished allowing the identification of 12 different plastomes. The low sequence divergence observed might suggest that #Coffea$ is a young genus. The results were in contradiction with the present classification into two genera. Additionally, cpDNA inheritance was studied in interspecific hybrids between #C. arabica$ and #C. canephora$, and in an intraspecific progeny of #C. canephora$, using PCR-based markers. Both studies showed exclusively maternal inheritance of cpDNA. (Résumé d'auteur)
Tipo: Text Palavras-chave: RESSOURCES GENETIQUES; ADN; VARIABILITE GENETIQUE; DIVERSITE SPECIFIQUE; PLASTE; RFLP.RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM.
Ano: 1996 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010007032
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Molecular analysis of genetic diversity and phylogenetic relationships in Coffea IRD
Cros, Joëlle; Lashermes, Philippe; Marmey, Philippe; Anthony, François; Hamon, Serge; Charrier, André.
Tipo: Text Palavras-chave: POLYMORPHISME GENETIQUE; EVOLUTION; PHYLOGENIE; TECHNIQUE DE POINTE; ANALYSE; ADN; PLASTE; CAFEIER; DIVERSITE GENETIQUE; RFLP.RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM; RAPD.RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE; MARQUEUR GENETIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39133
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On the use of doubled haploids in genetics and breeding of Coffea canephora P. IRD
Lashermes, Philippe; Charrier, André; Couturon, Emmanuel.
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; AMELIORATION GENETIQUE; AGRONOMIE; HAPLOIDE; VARIABILITE; ANALYSE DE DONNEES; SELECTION; HYBRIDATION; MULTIPLICATION VEGETATIVE; SEMENCE; HAPLOIDE DOUBLE; POLYEMBRYONIE; ETUDE AU CHAMP.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39136
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Origin and genetic diversity of Coffea arabica L. based on DNA molecular markers IRD
Lashermes, Philippe; Combes, Marie-Christine; Cros, Joëlle; Trouslot, Pierre; Anthony, François; Charrier, André.
Les relations phylogénétiques de 25 espèces de caféiers dont l'espèce tétraploïde #C. arabica$ ont été abordées au niveau de leur ADN génomique nucléaire et chloroplastique par l'utilisation de la variation de la longueur de fragments de restriction (RFLP) et la comparaison de leurs séquences. L'origine allotétraploïde de #C. arabica$ est supportée par l'importance du polymorphisme RFLP. L'étude du génome chloroplastique indique #C. eugenioides$ ou une espèce proche de #C. eugenioides$ comme parent femelle de #C. arabica$. L'étude de l'unité nucléaire codant pour l'ARN ribosomique conduit à une espèce du groupe canephoroides (#C. canephora$, #C. congensis$, #C. brevipes$) comme parent mâle. L'origine de #C. arabica$ apparaît comme un évènement récent de la...
Tipo: Text Palavras-chave: PHYLOGENIE; METHODE D'ANALYSE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; POLYMORPHISME GENETIQUE; PLANTE SAUVAGE; CULTIVAR; CAFE; ETUDE COMPARATIVE; MARQUEUR MOLECULAIRE; RFLP; RAPD.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:43196
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RAPD fingerprints for identification and genetic characterization of fig (Ficus carica L.) genotypes IRD
Khadari, B.; Lashermes, Philippe; Kjellberg, F..
L'identification de 21 accessions de figuier (#Ficus carica$ L.), représentant différentes variétés, a été tentée par la méthode "RAPD" (Random amplified polymorphism DNA). A la suite du test de 85 amorces sur 4 génotypes, 12 amorces ont pu être sélectionnées qui révèlent du polymorphisme. Les 19 marqueurs RAPD permettent l'identification de 17 profils de bandes. L'analyse met en évidence une erreur d'étiquetage pour une accession et confirme la synonymie des deux autres. La technique RAPD appliquée chez le figuier montre un niveau suffisant de polymorphisme pour la discrimination des génotypes, une bonne stabilité clonale et reproductibilité. La variabilité génétique observée au sein des génotypes de figuiers étudiés apparaît non structurée suggérant...
Tipo: Text Palavras-chave: METHODE D'ANALYSE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; GENOTYPE; VARIABILITE GENETIQUE; IDENTIFICATION; PLANTE FRUITIERE; MARQUEUR MOLECULAIRE; RAPD; FIGUIER.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:43197
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Screening for stress tolerant genotypes via microspore in vitro culture IRD
Lashermes, Philippe.
Tipo: Text Palavras-chave: CULTURE IN VITRO; SELECTION; CEREALE; ANDROCEE; VARIETE RESISTANTE; FACTEUR ABIOTIQUE; VARIABILITE GENETIQUE.
Ano: 1991 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010005243
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Toward the construction of a genetic map in coffee IRD
Lashermes, Philippe; Paillard, M.; Marmey, Philippe; Gavalda, Marie-Christine; Couturon, Emmanuel; Pétiard, V.; Charrier, André.
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; GENETIQUE; POLYMORPHISME GENETIQUE; GENOME; CARTE GENETIQUE; CAFEIER; MARQUEUR GENETIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39141
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Use of non-radioactive digoxigenin-labelled DNA probes for RFLP analysis in coffee IRD
Lashermes, Philippe; Combes, Marie-Christine; Cros, Joëlle.
Tipo: Text Palavras-chave: METHODE D'ANALYSE; GENOTYPE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; POLYMORPHISME GENETIQUE; CAFE; MARQUEUR MOLECULAIRE; RFLP.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:43195
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Use of random amplified DNA markers to analyse genetic variability and relationships of Coffea species IRD
Lashermes, Philippe; Cros, Joëlle; Marmey, Philippe; Charrier, André.
L'intérêt des "RAPDs" (Ramdom Amplification of Polymorhic DNA sequence) comme marqueur génétique chez les caféiers a été évalué. Des oligonucléotides ont été utilisés comme amorces pour l'amplification de séquence d'ADN génomique par la réaction de polymérisation en chaîne (PCR). Différentes accessions comprenant les principales espèces de caféiers ont été analysées. Une variation intra-spécifique a été facilement détectée chez #Coffea canephora$ et #Coffea liberica$. Par contre, les amorces testées n'ont pas permis de mettre en évidence du polymorphisme entre les différentes accessions de #C. arabica$. Un important polymorphisme inter-spécifique a été observé. Des relations génétiques entre espèces de caféiers ont pu être déduite à partir des degrés de...
Tipo: Text Palavras-chave: RESSOURCES GENETIQUES; VARIABILITE GENETIQUE; POLYMORPHISME; ANALYSE DE DONNEES; COLLECTION BOTANIQUE; RELATION INTERSPECIFIQUE; BIODIVERSITE; TECHNIQUE DE LABORATOIRE; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE; VARIATION INTRASPECIFIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39349
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