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| Registros recuperados: 33 | |
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| Elsen, J.M.; Mangin, B.; Goffinet, B.; Boichard, D.; Le Roy, P.. |
| Dans une série d’articles scientifiques, des modèles alternatifs pour la détection de (QTLs chez les animaux de ferme sont proposés et leurs propriétés sont évaluées par simulation. Ce premier article décrit le modèle de base utilisé, qui concerne des familles indépendantes de demi-germains de père, avec des phénotypes marqueurs mesurés sur deux ou trois générations et des phénotypes quantitatifs mesurés seulement sur la dernière génération. Les hypothèses sont données et l’expression de la vraisemblance décrite en détail. À partir de ce modèle de base, différentes alternatives ont été étudiées, incluant diverses modélisations des performances et la prise en compte de structures familiales avec de vrais germains. Leurs principales caractéristiques... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: MAXIMUM DE VRAISEMBLANCE QTL DETECTION; MAXIMUM LIKELIHOOD. |
| Ano: 1999 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007c16af24a&uri=/notices/prodinra1/2007/07/ |
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| Mangin, B.; Goffinet, B.; Le Roy, P.; Boichard, D.; Elsen, J.M.. |
| Dans ce papier, nous comparons quatre méthodes, qui permettent de résoudre le problème relatif à la phase inconnue des mâles aux marqueurs dans des familles de demi-germains, lorsque aucune information sur les grands-parents n’est disponible. Ces méthodes sont comparées, en utilisant l’approximation gaussienne de la vraisemblance à l’intérieur de chaque descendance à la place de la vraisemblance du mélange de distribution. Dans la première étude par simulation, les propriétés respectives du modèle gaussien et du modèle de mélange sont étudiées pour la méthode la plus simple de reconstruction des gamètes des mâles. Les deux modèles conduisent à des tests comparables au regard de leur puissance mais l’erreur quadratique moyenne d’estimation de... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: FAMILLE DE DEMI-FRERES; PHASE DE LINKAGE INCONNU; TEST DU RAPPORT DE VRAISEMBLANCE HALF-SIB FAMILIES; QTL DETECTION; UNKNOWN LINKAGE PHASE; GAUSSIAN APPROXIMATION; LOG-LIKELIHOOD RATIO TEST. |
| Ano: 1999 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200757228d08&uri=/notices/prodinra1/2007/07/ |
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| Le Mignon, G.; Blum, A.; Demeure, O.; Diot, C.; Le Bihan-Duval, E.; Le Roy, P.; Lagarrigue, S.. |
| De nombreux progrès ont été réalisés ces dernières années en génomique. Le développement de technologies à base de supports miniaturisés,permet aujourd’hui d’explorer les génomes tant au niveau de leur structure que de leur expression. Les puces à ADN permettentainsi de génotyper plusieurs milliers de marqueurs SNP d’un génome ou encore de mesurer le niveau d’expression de plusieursmilliers de gènes d’un tissu. Combiner l’information génotypique avec des mesures phénotypiques élémentaires (ARNm, protéines ouencore métabolites) ouvre de nouvelles perspectives dans l’étude du fonctionnement du vivant et a donné naissance à un nouveauconcept, la «génétique génomique». Cet article est centré sur les apports de la «génétique génomique» dans le contexte de la... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: génomique; QTL; EQTL; Puces à ADN; Animaux d’élevage. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2011b4761a7f&uri=/notices/prodinra1/2011/05/ |
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| Le Roy, P.; Elsen, J.M; Knott, S.. |
| Il est fréquent, en sélection, de tester sur descendance, des mâles, afin d’estimer leur valeur génétique. Les données recueillies dans ce but peuvent être utilisées afin de mettre en évidence un gène majeur. Elles sont constituées des n.m performances Yij de m descendants j de n mâles i. Ces données doivent être corrigées pour l’effet polygénique du père (Ui) sur ses descendants. Quatre tests statistiques de mise en évidence d’un tel gène majeur sont comparés. Le premier (ﺎSA pour "segregation analysis") est le rapport classique des vraisemblances sous Ho (pas de gène majeur) et sous H1 (existence d’un gène majeur). Les paramètres caractéristiques de la population (moyennes et écarts types intragénotype) sont estimés en maximisant la vraisemblance... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: ANALYSE DE SEGREGATION; TEST STATISTIQUE. |
| Ano: 1989 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200854cd7526&uri=/notices/prodinra1/2008/01/ |
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| Du, Z.Q.; Vincent-Naulleau, S.; Gilbert, H.; Vignoles, F.; Créchet, F.; Shimogiri; Yasue; Leplat, J.J.; Bouet, S.; Gruand, J.; Horvak; Milan, D.; Le Roy, P.; Geffrotin, C.. |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: Swine Melanoma; QTL; MC1R; Comparative Mapping; Cancer Genetics. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007e9f8459f&uri=/notices/prodinra1/2008/01/ |
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| Du, Z.Q.; Vincent-Naulleau, S.; Gilbert, H.; Vignoles, F.; Créchet, F.; Shimogiri; Yasue; Leplat, J.J.; Bouet, S.; Gruand, J.; Horak; Milan, D.; Le Roy, P.; Geffrotin, C.. |
| Human cutaneous melanoma is a complex trait inherited in about 10% of cases. Although 2 high-risk genes, CDKN2A and CDK4, and 1 low risk gene, MC1R, have been identified, susceptibility genes remain to be discovered. Here, we attempted to determine new genomic regions linked to melanoma using the pig MeLiM strain, which develops hereditary cutaneous melanomas. We applied quantitative trait loci (QTL) mapping method to a significant genome-wide scan performed on 331 backcross pigs derived from this strain. QTLs were detected at chromosome-wide level for a melanoma synthetic trait corresponding to the development of melanoma. The peak positions on Sus scrofa chromosomes (SSC) were at 49.4 and 88.0 cM (SSC1), 56.0 cM (SSC13), 86.5 cM(SSC15) and 39.8 cM... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: SWINE MELANOMA; QUANTITATIVE TRAIT LOCI; MC1R; COMPARATIVE MAPPING; CANCER GENETICS. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200896d37e33&uri=/notices/prodinra1/2011/02/ |
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| Tribout, T.; Iannuccelli, N.; Druet, T.; Gilbert, H.; Riquet, J.; Gueblez; Mercat; Bidanel, J.P.; Milan, D.; Le Roy, P.. |
| A genome-wide scan was performed in Large White and French Landrace pig populationsin order to identify QTL affecting reproduction and production traits. The experimentwas based on a granddaughter design, including five Large White and three French Landracehalf-sib families identified in the French porcine national database. A total of 239 animals(166 sons and 73 daughters of the eight male founders) distributed in eight families were genotypedfor 144 microsatellite markers. The design included 51 262 animals recorded for productiontraits, and 53 205 litter size records were considered. Three production and three reproductiontraits were analysed: average backfat thickness (US_M) and live weight (LWGT) at the endof the on-farm test, age of candidates... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: QUANTITATIVE TRAIT LOCUS; PIG; COMMERCIAL POPULATION; PRODUCTION TRAIT; REPRODUCTION TRAIT. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008cc972a9f&uri=/notices/prodinra1/2009/12/ |
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| Abasht, B.; Pitel, F.; Lagarrigue, S.; Le Bihan-Duval, E.; Le Roy, P.; Demeure, O; Vignoles; Simon, J.; Cogburn, L.; Aggrey, S.; Vignal, A.; Douaire, M.. |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: MEAT-TYPE CHICKENS; QUANTITATIVE TRAIT LOCI; FATNESS QTL; QTL x SEX INTERACTION. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007f0c3f523&uri=/notices/prodinra1/2009/12/ |
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| Le Roy, P.; Legault, C.; Gruand, J.; Ollivier, L.. |
| Une expérience de sélection sur la prolificité est menée depuis 1973 au Centre d’Insémination Artificielle porcine de l’INRA, à Rouillé (Vienne). Une lignée de verrats Large White (appelés H) est créée par sélection de truies de prolificité extrême (dites « hyperprolifiques ») dans une grande population et accouplement de leur fils à d’autres truies hyperprolifiques de la même population. Par ce système de croisement en retour, répété chaque année, le niveau génétique espéré des verrats H atteint progressivement celui des femelles hyperprolifiques. L’efficacité de ce plan de sélection est évaluée par comparaison, dans des élevages de production, de filles de verrats H à des truies d’une autre lignée Large White, utilisée comme témoin (T). Au total,... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: HERITABILITE REALISEE; TAILLE DE PORTEE; EFFET MATERNEL. |
| Ano: 1987 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008c74cd9f9&uri=/notices/prodinra1/2011/02/ |
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| Sanchez, M.P.; Iannuccelli, N.; Basso, B.; Bidanel, J.P.; Billon, Y.; Gandemer, G.; Gilbert, H.; Larzul, C.; Legault, C.; Riquet, J.; Milan, D.; Le Roy, P.. |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: QTL; Intramuscular fat content; Fatty acid composition. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20075242859a&uri=/notices/prodinra1/2009/12/ |
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| Sanchez, M.P.; Iannuccelli, N.; Basso, B.; Bidanel, J.P.; Billon, Y.; Gandemer, G.; Gilbert, H.; Larzul, C.; Legault, C.; Riquet, J.; Milan, D.; Le Roy, P.. |
| Background: Improving pork quality can be done by increasing intramuscular fat (IMF) content. This trait is influenced by quantitative trait loci (QTL) sought out in different pig populations. Considering the high IMF content observed in the Duroc pig, it was appealing to determine whether favourable alleles at a major gene or QTL could be found. The detection was performed in an experimental F2 Duroc × Large White population first by segregation analysis, then by QTL mapping using additional molecular information. Results: Segregation analysis provided evidence for a major gene, with a recessive Duroc allele increasing IMF by 1.8% in Duroc homozygous pigs. However, results depended on whether data were normalised or not. After Box-Cox... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: DETECTION OF QTL; SEGREGATION ANALYSIS; INTRAMUSCULAR FAT MEASUREMENTS; MOLECULAR ANALYSES; STATISTICAL ANALYSES. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007d8cfb116&uri=/notices/prodinra1/2011/04/ |
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| Sanchez, M.P.; Iannuccelli, N.; Basso, B.; Bidanel, J.P.; Billon, Y.; Gandemer, G.; Gilbert, H.; Larzul, C.; Legault, C.; Riquet, J.; Milan, D.; Le Roy, P.. |
| Background: Improving pork quality can be done by increasing intramuscular fat (IMF) content. This trait is influenced by quantitative trait loci (QTL) sought out in different pig populations. Considering the high IMF content observed in the Durocpig, it was appealing to determine whether favourable alleles at a major gene or QTL could be found. The detection wasperformed in an experimental F2 Duroc × Large White population first by segregation analysis, then by QTL mapping usingadditional molecular information.Results: Segregation analysis provided evidence for a major gene, with a recessive Duroc allele increasing IMF by 1.8% in Durochomozygous pigs. However, results depended on whether data were normalised or not. After Box-Cox transformation,... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: QUANTITATIVE TRAIT LOCI; FATTY ACID COMPOSITION. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008399a868b&uri=/notices/prodinra1/2011/02/ |
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| Lafosse, M.; Gorini, C.; Le Roy, P.; Alonso, B.; D'Acremont, E.; Ercilla, G.; Rabineau, Marina; Vazquez, J. T.; Rabaute, A.; Ammar, A.. |
| In active basins, tectonics can segment the continental shelf and control its stratigraphic architecture and physiography. Segmentation can explain the local evolution and morphology of the continental shelf because of sea-level variations, local tectonic segmentation and hydrodynamic processes. Here we investigate the tectonically active Morocco continental margin (southern Alboran Sea) using high-resolution seismic profiles and multibeam bathymetric data. The active faults bounding the transtensive Nekor basin triggered the segmentation of the shelf into three sectors showing different subsidence rates: a western sector corresponding to an extensive fault relay, a central sector corresponding to the subsiding Al-Hoceima Bay and an eastern sector... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Seismic stratigraphy; Active tectonic; Pleistocene; Continental shelf; Swath bathymetry; Geomorphology; Western Mediterranean. |
| Ano: 2018 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00451/56232/57812.pdf |
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| Lagarrigue, S.; Pitel, F.; Carre, W; Abasht, B.; Le Roy, P.; Neau, A.; Amigues, Y.; Sourdioux, M.; Simon, J.; Cogburn, L.; Aggrey, S.; Leclercq, B.; Vignal, A.; Douaire, M.. |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: QUANTITATIVE TRAIT LOCUS; ABDOMINAL FAT; BREAST MUSCLE; CHICKEN. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200798a3f74b&uri=/notices/prodinra1/2011/06/ |
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| Goffinet, B.; Beckmann, J.; Boichard, D.; Causse, M.; Charcosset, A.; Chevalet, C.; Christophe, C.; Colleau, J.J.; Demenais, F.; Durel, C.E.; Elsen, J.M.; Foulley, J.L.; Gallais, A.; Gotz, K.U.; Hospital, H.; Kremer, A.; Lorieux, M.; Lefort-Buson, M.; Le Roy, P.; Loisel, P.; Mangin, B.; Maurice, A.; Perrier, X.; Pons, O.; Rebaï, A.; Rodolphe, F.; San Cristobal, M.; Vu Tien Khang, J.. |
| Nous présentons ici les travaux s’inscrivant dans le cadre du projet «Mathématiques et marqueurs moléculaires», en abrégé «MMM». Ces travaux ont pour objet l’identification et l’utilisation de gènes contrôlant des caractères quantitatifs - ou QTL (quantitative trait loci) - à partir de l’information issue des phénotypes, de la généalogie et de marqueurs moléculaires. Une première partie concerne la mise en évidence de gènes à effet majeur et l’utilisation de ces gènes en sélection, à partir d’informations phénotypiques (mesures sur le caractère dont le contrôle génétique est recherché) et généalogiques (relations de parenté entre individus de la population mesurée). La deuxième partie concerne l’utilisation conjointe de ces informations... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: MAXIMUM DE VRAISEMBLANCE; CARACTERE QUANTITATIF; SELECTION DIRIGEE; AMELIORATION DES PLANTES; CARTE GENETIQUE. |
| Ano: 1994 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9400023110039598&uri=/notices/prodinra1/2007/11/ |
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| Gilbert, H.; Le Roy, P.. |
| A new multiple trait strategy based on discriminant analysis was studied for efficientdetection of linked QTL in outbred sib families, in comparison with a multivariate likelihoodtechnique. The discriminant analysis technique describes the segregation of a linear combinationof the traits in a univariate likelihood. This combination is calculated for each pair of positionsdepending on the inheritance of the pairs of QTL haplotypes in the progeny. The gainsin power and accuracy for position estimations of multiple trait methods in grid searches wereevaluated in reference to single trait detections of linked QTL. The methods were applied tosimulated designs with two correlated traits submitted to various effects from the linked QTL.Multiple trait strategies... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: QTL DETECTION; LINKED QTL; MULTIPLE TRAIT; SIB FAMILIES; SIMULATIONS. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008f13e17f3&uri=/notices/prodinra1/2009/12/ |
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