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	Provedor de dados 14 (21) Autor MANCINI, A. L. (21) HIGA, R. H. (14) NESHICH, G. (13) FALCAO, P. R. K. (11) YAMAGISHI, M. E. B. (6) BAUDET, C. (5) SANTOS, E. H. dos (4) FILETO, R. (2) FREITAS, E. M. de (2) MAZONI, I. (2) MOURA, M. F. (2) OLIVEIRA, S. R. de M. (2) VAZ, G. J. (2) ABREU, L. L. B. de (1) BARIONI, L. G. (1) DIAS, F. R. T. (1) FALCÃO, P. R. K. (1) GREGO, C. R. (1) JARDINE, J. G. (1) KUSER, P. R. (1) Mais... Palavra-chave Bioinformática (6) SMS (4) Java Protein Dossier (3) JPD (2) Proteína (2) Sting Millennium Suite (2) Agrupamento de dados (1) Algoritmo (1) Aminoácidos de proteínas (1) Análise de conservação (1) Análise multivariada (1) Biblioteca C++ (1) Bovino de corte (1) Café (1) Caminhos em Grafos (1) Cana de Açúcar (1) Ciência da computação (1) Cluster (1) Computer science (1) Contatos atômicos internos (1) Mais... Tipo do documento Folhetos (21) Ano 2023 (2) 2022 (1) 2018 (1) 2013 (1) 2012 (1) 2008 (1) 2006 (1) 2005 (1) 2004 (2) 2003 (2) 2002 (7) 2001 (1) Mais... País Brazil (21) Idioma Português (21)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 21 Primeira ... 1 2 ... Última Análise do grau de conservação de resíduos em proteínas com estrutura 3D resolvida utilizando o SMS. 14 HIGA, R. H.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.. HSSP e entropia relativa. Módulos do SMS para análise de conservação. Discussão e trabalhos futuros. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Proteínas; Análise de conservação; Resíduos em proteínas; Sting Millennim Suite; SMS; Homology Derived Secondary Structure of proteins; HSSP; Bioinformática. Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8641 Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida. 14 HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.. O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases de dados de sequências -Blast (Altschul et al., 1990, 1997) e para alinhamento múltiplo de sequências -ClustalW (Thompson et al., 1994) O critério para avaliação do mesmo é o grau de similaridade entre as medidas de Entropia Relativa, quando comparadas com os mesmos valores relatados pelo HSSP. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Processo para construção de alinhamento múltiplo. Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/5069 Apresentação gráfica de parâmetros protéicos utilizando o Java Protein Dossier. 14 HIGA, R. H.; BAUDET, C.; FALCAO, P. R. K.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.. Parâmetros apresentados pelo JPD. Sequência de resíduos. Contatos. Contatos internos. Contatos na interface. Estrutura secundária. Dupla ocupância. Fator de temperatura. Entropia relativa. Confiabilidade. Acessibilidade de resíduos. Ângulos de torsão. Potencial eletrostático. Curvatura na superfície. Hidrofobicidade. Analisando com maior detalhes os parâmetros apresentados. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Java Protein Dossier; JPD; Parâmetros protéicos; Bioinformática. Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8643 Arcabouço para desenvolvimento de simuladores de sistemas dinâmicos contínuos e hierárquicos. 14 MANCINI, A. L.; BARIONI, L. G.; SANTOS, E. H. dos; DIAS, F. R. T.; SANTOS, J. W. dos; ABREU, L. L. B. de; TININI, L. V. S.. Resumo. Um arcabouço (framework) orientado a objetos para o desenvolvimento de simuladores de sistemas dinâmicos contínuos com suporte à hierarquia é descrito. O arcabouço surgiu da necessidade de uma ferramenta para facilitar e padronizar o desenvolvimento de modelos de simulação baseados em processo em projetos de pesquisa na Embrapa. Um dos requisitos do desenvolvimento foi modularidade e simplicidade de código para facilitar o desenvolvimento de modelos por equipes multidisciplinares de pesquisa e implementação por grupos de estagiários/bolsistas com alta rotatividade. Também provê desempenho superior a ferramentas de modelagem típicas, que geralmente tem código interpretado. Modelos componentes, geralmente desenvolvidos por equipes de especialistas em... Tipo: Folhetos Palavras-chave: Software de simulação; Modelagem matemática; Simulação. Ano: 2013 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/981039 Cálculo de área acessível por solvente utilizando SURFV - definição de interface intramolecular pelo SMS. 14 HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.. Definição de superfície acessível por solvente. Cálculo de AS. Utilização de SURFV para cálculo da área da AS e identificação de interface. Discussão e trabalhos futuros. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Área acessível por solvente; Interface intramolecular; SURFV; SMS; Sting Millennium Suite. Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8640 Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS. 14 MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G.. Contatos interatômicos são definidos no contexto deste trabalho como as forças de atração ou de repulsão existentes entre átomos distintos. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Contatos atômicos internos; Software SMS; Proteína. Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8835 Correlação de atributos do solo com a produção de café para auxiliar a análise de variabilidade espacial. 14 MANCINI, A. L.; MOURA, M. F.; GREGO, C. R.; RODRIGUES, G. C.; RODRIGUES, C. A. G.. Este trabalho mostra o resultado após o emprego destas técnicas para identificar, a partir da análise de solo e da medição da condutividade elétrica de um talhão de café especial localizado em uma fazenda no sul de Minas Gerais, os atributos mais correlacionados com a produção amostrada em campo para o ano de 2022. Os mapas SOM (Self Organizing Map) e a análise de correlação simples mostraram-se ferramentas eficientes para selecionar os atributos, porém necessitando de análise manual/visual realizada pelos cientistas de dados (estes métodos não têm como objetivo direto a seleção de atributos). Tipo: Folhetos Palavras-chave: Análise multivariada; Geoestatística; Seleção de atributos; Variabilidade espacial; Café; Geostatistics; Multivariate analysis. Ano: 2023 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1161265 Criação de um núcleo para a pesquisa e descrição dos serviços oferecidos na área de Bioinformática estrutural. 14 FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.. Instalação e oferta de ferramentas.Computacionais sting millennium suite. (SMS) através da interface web. Criação de novos algoritmos e programas. Para análise estrutural das proteínas. Oferta de banco de dados públicos. Estabelecimento de um ambiente para.Pesquisa e oferta de serviços na área. De bioinformática. Formação de recursos humanos. Organização de cursos e congresso. Projetos em colaboração. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Bioinformática. Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8679 Estudo da função Gama e mapa auto-organizável como metodologia para validação e imputação de precipitação diária em séries temporais de estações meteorológicas. 14 MANCINI, A. L.; VICTORIA, D. de C.. Resumo - O uso da função Gama e de mapas auto-organizáveis são métodos descritos na literatura para compreensão do regime pluviométrico de uma região. Este trabalho relata o estudo destas ferramentas para validação e imputação de precipitação diária em séries históricas diárias de 18 estações meteorológicas em localidades diversas do Brasil. A função Gama não se mostrou eficaz para este propósito e o mapa auto-organizável teve resultados muito próximos comparados com o uso da média da precipitação. Mas considerando que é possível alterar o tamanho do mapa e incluir variações no vetor de entrada dos dados, novos estudos são necessários para verificar se é possível melhorar os resultados. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Métodos estatísticos; Agrupamento de dados; Precipitação; Validação de precipitação; Função Gama; Mapas auto-organizáveis; Precipitation validation; Statistical methods; Data clustering; Gamma function; Self-organizing maps. Ano: 2023 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1163381 Experiência de utilização de XML no SMS. 14 HIGA, R. H.; BAUDET, C.; FREITAS, E. M. de; SANTOS, G. F. dos; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.. XML e sua utilização em aplicações de bioinformática. Utilização de XML no módulo JPD do SMS. Discussão e trabalhos futuros. Tipo: Folhetos Palavras-chave: XML; SMS; Extensible Markup Language; Experiência de utilização de XML no SMS; Sting Millennium Suite; Bioinformática. Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8633 Grau de conservação de aminoácidos de proteínas: comparação entre entropia relativa e pressão evolucionária. 14 HIGA, R. H.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MOURA, M. F.; FILETO, R.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.. Este trabalho apresenta uma comparação entre essas duas medidas utilizadas para medir o grau de conservação de aminoácidos, entropia relativa e pressão evolucionária. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Aminoácidos de proteínas; Entropia relativa; Pressão evolucionária. Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8601 Guia prático para aplicação do método da diagnose da composição nutricional (CND): exemplo de uso na cultura da cana-de-açúcar. 14 TRASPADINI, E. I. F.; PRADO, R. M.; VAZ, G. J.; SILVA, F. C. da; MANCINI, A. L.; SILVA, G. P. da; SANTOS, E. H. dos; WADT, P. G. S.. Interpretação do estado nutricional. O cálculo do método CND. Média geométrica. Relação multivariada. Norma CND. Índice CND. Potencial de Resposta da planta a Adubação (PRA). Guia para cálculo e interpretação do estado nutricional da planta. Organização dos dados. Média da produtividade e classe produtiva. Cálculo do componente R. Média geométrica. Relação multivariada dos nutrientes. Relação multivariada dos nutrientes. Norma CND. Interpretação do Estado Nutricional. Exemplo de Interpretação do Estado Nutricional. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Nutrição Vegetal; Cana de Açúcar; Disease diagnosis; Plant nutrition; Sugarcane. Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1103108 Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. 14 YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.. Pockets. Identificando e visualizando pockets através do JPD. Aplicações. Conclusões. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Pockets; Superfície protéica; Java Protein Dossier; JPD; Estrutura de proteínas; Função de proteínas. Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/9102 Metodologias para estimativa de peso de bovinos Nelore em sistemas extensivos a partir de pesagens diárias. 14 HIGA, R. H.; VAZ, G. J.; MANCINI, A. L.; OLIVEIRA, C. C. de; SOUZA, K. X. S. de; VECHINI, G. C.; SPERANZA, E. A.. As principais contribuições deste documento estão relacionadas ao uso de diferentes abordagens presentes na literatura para estimar o peso futuro dos animais. Os resultados ainda são preliminares, mas mostram que é possível estimar o peso futuro dos bovinos com boa acurácia, desde que os dados fornecidos sejam confiáveis e representem a realidade que ocorre em campo. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Bovino de corte; Peso de animais; Gado Nelore; Pesagem. Ano: 2022 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1151152 Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. 14 FALCAO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G.. Este documento descreve o modelo molecular da proteína XF2234 e a análise preliminar da sua estrutura. O modelo foi construído por modelagem por homologia (ou modelagem comparativa) com a estrutura cristalográfica de uma proteína small heat shock de Triticum aestivum (trigo). A análise da estrutura tridimensional da proteína XF2234 tem o objetivo de contribuir para aumentar o conhecimento sobre o papel biológico das smHSPs, necessário para o combate à CVC. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Modelagem molecular; Heat shock; Proteínas celulares; Proteína; Xylella Fastidiosa. Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1372 Proposta de padronização de código-fonte C++ no escopo do projeto Pecus. 14 MANCINI, A. L.. Convenção, siglas. Notação. Siglas e acrônimos. Objetivo. Contexto. Introdução. Idioma. Nomenclatura. Tipos de dados. Constantes e enumerações. Variáveis. Funções. Arquivos fontes. Identação. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Linguagem de programação; Padronização codigo-fonte; Projeto Pecus; Ciência da computação; Computer science. Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/952229 Reconhecimento de padrões de pontes de hidrogênio – preliminares do desenvolvimento de uma metodologia baseada em TI para a predição da posição de átomos de hidrogênio em proteínas. 14 MANCINI, A. L.; ROMERO, R. A. F.. Os primeiros resultados do desenvolvimento de um novo método para a localização do átomo de hidrogênio contido em grupos hidroxila da cadeia lateral dos aminoácidos é apresentado neste artigo. Os métodos existentes utilizam campos de força para esse problema de localização. Os autores propõem uma abordagem computacional para esse problema, pelo reconhecimento de padrões de pontes de hidrogênio agrupados por similaridade em clusters. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Reconhecimento de padrões; Pontes de hidrogênio; Bioinformática; Cluster; Rede neural; Hidrogênio. Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/31819 Rotâmeros raros no Java Protein Dossier. 14 YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.. O objetivo deste trabalho é apresentar a metodologia usada para incorporar ao JPD a informação sobre os rotâmeros raros presentes em cada estrutura proteica. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Java Protein Dossier; Rotâmeros raros; Bioinformática. Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/3002 SMSLib - biblioteca C++ do Sting Millennium Suite. 14 HIGA, R. H.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; MATTIUZ, A. R.; FREITAS, E. M. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.. Organização lógica do SMS. Descrição da SMSLib. Leitura de arquivos PDB. Leitura de arquivos HSSP. Leitura de arquivos com parâmetros simples. Cálculo e leitura de contatos. Cálculo e leitura de Dihedral Angels. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Sting Milleninum Suite; SMS; SMSLib; Biblioteca C++. Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8637 Um algoritmo para geração de caminhos em grafos a partir de um vértice. 14 MANCINI, A. L.. Revisão de conceitos sobre Grafos. Algoritmo. Complexidade. Exemplos de execução. Código fonte. Tipo: Folhetos Palavras-chave: Algoritmo; Geração de dados; Proteinas; Caminhos em Grafos; DepthFirstSearch; DFS. Ano: 2001 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/8297 Registros recuperados: 21 Primeira ... 1 2 ... Última

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