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A brazilian soybean database. Repositório Alice
NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F..
Soybean is a legume with large economic importance in the international market, with a world production of almost two hundred and ten million tons in the 2008/2009 harvest. Brazil appears as the second largest producer, with about twenty-five percent of the world production. In 2007, the Brazilian Soybean Genome Consortium (GENOSOJA) was established with the goal of integrating several institutions currently working with soybean genomics in Brazil. The project has an initiative to search for new treats to improve the soybean production process, emphasizing in stresses that affect the national production, like the occurrence of droughts, pests attacks and the Asian Rust disease. Among the objectives of GENOSOJA is the creation of a relational database,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soybean.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/874417
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Algoritmo computacional para determinar o perfil mínimo de marcadores moleculares que discriminam um conjunto de cultivares. Infoteca-e
SILLA, P. R.; PASSIANOTTO, A. L. L.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. O.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C.; BINNECK, E..
2010
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Marcadores moleculares.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/859385
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Análise da expressão de genes relacionados a estresses em soja em resposta ao fungo Phakopsora pachyrhizi. Repositório Alice
BRITO JÚNIOR, S. L.; MARCELINO, F. C.; POLIZEL, A. L.; STOLF, R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; BORÉM, A.; ABDELNOOR, R. V..
Com o objetivo de avançar o conhecimento sobre o mecanismo molecular de defesa da soja frente à ferrugem asiática, avaliou-se por meio da técnica de PCR em tempo real, a expressão de genes supostamente envolvidos no mecanismo de defesa da planta. O experimento foi conduzido em sala climatizada e para a análise de expressão gênica, foram coletadas amostras de RNAs de folhas da soja inoculadas com o patógeno e falso-inoculadas (água) em um genótipo tolerante (PI 230970) e um genótipo suscetível (Embrapa 48) a Phakopsora pachyrhizi. Foram observadas expressões diferenciais de genes relacionados a espécies reativas de oxigênio, produção de fitoalexinas bem como genes envolvidos na liberação de elicitores. Dentre os genes avaliados, destacou-se um que codifica...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/461893
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Análise do acúmulo de transcritos de ?-3-dessaturases em genótipos de soja contrastantes para o teor de ácido linolênico. Repositório Alice
PINTO, M. O.; GOOD-GOD, P. I. V.; MARCELINO, F. C.; SILVA, D. F.; PIOVESAN, N. D.; MOREIRA, M. A.; BARROS, E. G..
Os ácidos graxos poliinsaturados, como linoléico e linolênico, são os principais responsáveis pela alta instabilidade oxidativa a altas temperaturas do óleo destinado a frituras e à fabricação de biodiesel. A biossíntese de ácidos graxos poliinsaturados é catalisada pelas dessaturases. A -6-dessaturase converte ácido oléico (18:19) a linoléico (18:29,12) e a -3-dessaturase produz ácido linolênico (18:39,12,15) a partir de 18:29,12. Três genes principais (GmFAD3A, GmFAD3B e GmFAD3C) foram caracterizados como responsáveis pela produção de -3-dessaturase em soja. Os mecanismos precisos de regulação da produção de ácido linolênico ainda não são muito claros, o que dificulta o processo de obtenção de genótipos com baixo conteúdo desse ácido graxo. A análise...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/874066
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Biblioteca subtrativa de raízes de soja em resposta à inoculação de Bradyrhizobium japonicum. Repositório Alice
CARVALHO, G. A. B. de; BATISTA, J. S. da S.; MARCELINO, F. C.; HUNGRIA, M..
A soja é de grande importância, principalmente devido ao seu elevado teor proteico, razão pela qual apresenta grande exigência em nitrogênio, que pode ser totalmente suprida pelo processo da fixação biológica de nitrogênio. O estabelecimento da simbiose soja-Bradyrhizobium sp. gera inúmeros benefícios e estudos avançados de genética podem auxiliar no desvendamento de etapas críticas, permitindo a melhoria do processo. Uma ferramenta importante para essa estratégia é a prospecção de genes. Neste trabalho construiu-se uma biblioteca subtrativa de cDNA de raízes de soja inoculadas com Bradyrhizobium japonicum. Os clones foram sequenciados e procedeu-se à montagem, resultando em 3.776 sequências diferencialmente expressas. As sequências foram então...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; Prospecção de genes; Soja; Fixação de nitrogênio; Soybeans; Nitrogen fixation.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/904543
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Desenvolvimento de cultivares de soja adaptadas às várias regiões ecológicas e aos vários sistemas de produção. Repositório Alice
TOLEDO, J. F. F. de; NEPOMUCENO, A. L.; ALMEIDA, A. M. R.; VILARINHO, A. A.; PIPOLO, A. E.; GARCIA, A.; OLIVEIRA, A. B. de; FARIAS NETO, A. L. de; ARIAS, C. A. A.; MELO, C. L. P. de; CAMPO, C. B. H.; MOREIRA, C. T.; GODOY, C. V.; KLEPKER, D.; LIMA, D. de; KRZYZANOWSKI, F. C.; MARCELINO, F. C.; CARNEIRO, G. E. de S.; MANDARINO, J. M. G.; MOREIRA, J. U. V.; COSTAMILAN, L. M.; DOMIT, L. A.; MIRANDA, L. C.; OLIVEIRA, M. A. de; OLIVEIRA, M. F. de; TEIXEIRA, M. do R. de O.; MEYER, M. C.; TEIXEIRA, M. C. C.; PANIZZI, M. C. C.; KASTER, M.; ARANTES, N. E.; MELO FILHO, O. L.; SMIDERLE, O. J.; RODRIGUES, O.; BERTAGNOLLI, P. F.; SOUZA, P. I. de M.; SOARES, R. M.; MONTÁLVAN del AGUILA, R.; ABDELNOOR, R. V.; BROGIN, R. L.; GIANLUPPI, V.; DIAS, W. P..
2008
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Soja; Variedade; Melhoramento vegetal; Soybeans; Plant breeding; Cultivars.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469104
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Desenvolvimento de sistema de genotipagem molecular, baseado em marcadores microssatélites, para determinar a identidade genética de cultivares de tabaco. Repositório Alice
RIBEIRO, C. A. G.; TANURE, J. P. M.; MACIEL, T. E. F.; VILAÇA, S. T.; MARCELINO, F. C.; BARROS, E. G..
O desenvolvimento de sistemas de identificação molecular para determinar e rastrear a identidade genética de um cultivar vegetal representa um grande desafio frente aos sistemas de certificação e proteção de variedades utilizados no país, até então fundamentados em descritores fenotípicos. Além disso é uma questão estratégica para empresas detentoras de germoplasma, interessadas no desenvolvimento de ferramentas que permitam o monitoramento de pureza varietal e o rastreamento de materiais ao longo da cadeia produtiva e comercial. Entretanto, a utilização de análises de DNA para a proteção varietal ainda é limitada pela inexistência de sistemas padronizados e robustos de avaliação molecular para a maioria das espécies, a exemplo do que acontece para...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tabaco.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/873997
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Desenvolvimento e validação do sistema de genotipagem molecular de cultivares de soja via sequenciador automático com marcadores microssatélites. Repositório Alice
PASSIANOTTO, A. L. de L.; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja; Marcador molecular; Marcador genético; Soybeans; Genetic markers.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/574969
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Detecção de céluas viáveis de listeria monocytogenes por EMA-PCR. Repositório Alice
PAULA, R. A. de; FREITAS, R. F. F. e; GUIMARAES, M. F. M.; MARCELINO, F. C.; ARCURI, E. F..
Listeria monocytogenes é considerada um dos maiores problemas de segurança alimentar, sendo que um baixo número de células pode ser capaz de iniciar a infecção em pessoas susceptíveis. Vários kits, baseados em análises de DNA, permitem a detecção desta bactéria, porém estes testes apresentam limitações uma vez que qualquer molécula de DNA alvo, tanto de células viáveis quanto de células mortas presentes numa amostra, pode ser amplificada. O corante EMA (Brometo de Etídeo Monoazida) tem sido recentemente utlizado para discriminar células viáveis de inviávies para análise em PCR.O EMA liga-se covalentemente ao DNA de células mortas impedindo a sua amplificação pela DNA Polimerase.O objetivo deste trabalho foi determinar a concentração de EMA necessária para...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Contaminação bacteriana; Higiene de alimento; Bacteria; Bacteria; Food and Human Nutrition; Bacterial infections.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/577771
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Determinação de perfis genéticos de cultivares de soja desenvolvidos pela Embrapa. Repositório Alice
PASSIANOTTO, A. L. de L.; SILLA, P. R.; MARIN, S. R. R.; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C..
2010
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Glycine max.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/874003
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Diversity and ecology of rhizobial strains used in commercial inoculants in Brazil. Repositório Alice
HUNGRIA, M.; MENNA, P.; CHUEIRE, L. M. de O.; MENDES, I. de C.; BANGEL, E. V.; BARCELLOS, F. G.; BATISTA, J. S. S.; RIBEIRO, R. A.; BINDE, D. R.; REIS JUNIOR, F. B. dos; OLIVEIRA, L. R.; RODRIGUES, E. P.; MARCELINO, F. C.; CAMPO, R..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/574317
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Efeito da inoculação da estirpe CPAC 15 de Bradyrhizobium japonicum na expressão gênica de raízes de soja. Repositório Alice
CARVALHO, G. A. B de; BATISTA, J. S. da S.; MARCELINO, F. C.; HUNGRIA, M..
A estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079) de Bradyrhizobium japonicum é utilizada em inoculantes comerciais para a cultura da soja (Glycine max (L.) Merrill) no Brasil, devido à capacidade de fornecer todo o nitrogênio necessário para atingir altos rendimentos de grãos pelo processo de fixação biológica do nitrogênio, dispensando o uso de fertilizantes nitrogenados e resultando em uma grande economia de divisas para o País e de custos para o agricultor. Devido à importância da simbiose da soja com a CPAC 15, este trabalho objetivou analisar o efeito da inoculação com essa estirpe na expressão gênica das raízes de soja. Sementes de soja foram desinfestadas e germinadas por três dias, enquanto as bactérias foram cultivadas em meio de cultura para rizóbios até a fase...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microbiologia.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918520
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Estratégias de engenharia genética para tolerância à seca em plantas através da expressão de fatores de transcrição. Repositório Alice
NEPOMUCENO, A. L.; FUGANTI, R.; KANAMORI, N.; PEREIRA, S. dos S.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C..
2011
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Proteínas DREB; Resistência a seca; Drought tolerance.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/901269
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Estudos in vivo do papel de inserções AT(n) da região promotora do gene Gmhsp17.6-L na regulação de genes em soja. Repositório Alice
LOPES, V. S.; FUGANTI, R.; BARBOSA, J. F.; DE CARVALHO, M. C. C. G.; MARIN, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C..
2009
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica em soja; Soja; Melhoramento genético vegetal; Sobeans; Plant breeding.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/574928
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Expressão dos genes nodC, nodW e nopP em Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 avaliada por RT-qPCR. Repositório Alice
BORTOLAN, S.; BARCELLOS, F. G.; MARCELINO, F. C.; HUNGRIA, M..
Resumo - O objetivo deste trabalho foi avaliar a expressão, por RT-qPCR, dos genes de nodulação nodC e nodW e do gene nopP da estirpe CPAC 15, que provavelmente atuam na infecção das raízes da soja. Foram realizados dois experimentos. No primeiro, a expressão dos genes foi avaliada nas células após a incubação com genisteína por 15 min, 1, 4 e 8 horas. Os resultados revelaram que os três genes apresentaram maior expressão imediatamente após o contato com o indutor (15 min). No segundo experimento, a bactéria foi cultivada na presença de indutores (genisteína ou exsudatos de sementes de soja) por 48 horas. A expressão dos três genes foi maior na presença de genisteína, com valores de expressão para nodC, nodW e nopP superiores ao controle. Os resultados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genes de nodulação; Sistema de secreção tipo III; Glycine max; Flavonoide.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662038
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Expressão dos genes nodC, nodW e nopP em Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 avaliada por RT-qPCR. Repositório Alice
BORTOLAN, S.; BARCELLOS, F. G.; MARCELINO, F. C.; HUNGRIA, M..
Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar a expressão, por RT-qPCR, dos genes de nodulação nodC e nodW e do gene nopP da estirpe CPAC 15, que provavelmente atuam na infecção das raízes da soja. Foram realizados dois experimentos. No primeiro, a expressão dos genes foi avaliada nas células após a incubação com genisteína por 15 min, 1, 4 e 8 horas. Os resultados revelaram que os três genes apresentaram maior expressão imediatamente após o contato com o indutor (15 min). No segundo experimento, a bactéria foi cultivada na presença de indutores (genisteína ou exsudatos de sementes de soja) por 48 horas. A expressão dos três genes foi maior na presença de genisteína, com valores de expressão para nodC, nodW e nopP superiores ao controle. Os resultados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genes de nodulação; Sistema de secreção tipo III.; Nodulation genes; Type III secretion system; Soja; Flavonóide; Fixação de nirogênio; Nodulação; Soybeans; Flavonoids; Gene expression; Nitrogen fixation; Nodulation.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/631360
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Ferramentas biotecnológicas aplicadas à cultura da soja. Infoteca-e
MARCELINO, F. C.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L..
2007
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/470325
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Genetic diversity of Brazilian triticales evaluated with genomic wheat microsatellites. Repositório Alice
COSTA, C. T. da; ALBUQUERQUE, A. C. S.; NASCIMENTO JUNIOR, A. do; MARCELINO, F. C.; PEREIRA, J. F..
2007
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: X Triticosecale; Índice de polimorfismo; Transferabilidade; Heterozigosidade; Número efetivo de alelos; Freqüência alélica; Polymorphism information content; Transferability; Heterozygosity; Number of alleles; Frequency of alleles.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/822347
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Genetic diversity of Brazilian triticales evaluated with genomic wheat microsatellites. Repositório Alice
COSTA, C. T. da; ALBUQUERQUE, A. C. S.; NASCIMENTO JUNIOR, A. do; MARCELINO, F. C.; PEREIRA, J. F..
The objective of this work was to determine the genetic variability available for triticale (X Triticosecale Wittmack) crop improvement in Brazil. Forty-two wheat genomic microsatellites were used to estimate the molecular diversity of 54 genotypes, which constitute the base of one of the major triticale breeding programs in the country. Average heterozygosity was 0.06 and average and effective number of alleles per locus were 2.13 and 1.61, respectively, with average allelic frequency of 0.34. The set of genomic wheat microsatellites used clustered the genotypes into seven groups, even when the germplasm was originated primarily from only two triticale breeding programs, a fact reflected on the average polymorphic information content value estimated for...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: X Triticosecale; Índice de polimorfismo; Transferabilidade; Heterozigosidade; Número efetivo de alelos; Freqüência alélica.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/450744
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Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. Repositório Alice
KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERÃO, M.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: MicroRNAs.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/913711
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