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A brazilian soybean database. Repositório Alice
NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F..
Soybean is a legume with large economic importance in the international market, with a world production of almost two hundred and ten million tons in the 2008/2009 harvest. Brazil appears as the second largest producer, with about twenty-five percent of the world production. In 2007, the Brazilian Soybean Genome Consortium (GENOSOJA) was established with the goal of integrating several institutions currently working with soybean genomics in Brazil. The project has an initiative to search for new treats to improve the soybean production process, emphasizing in stresses that affect the national production, like the occurrence of droughts, pests attacks and the Asian Rust disease. Among the objectives of GENOSOJA is the creation of a relational database,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soybean.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/874417
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De novo assembly of tung tree seeds transcriptome. Repositório Alice
GALLI, V.; MESSIAS, R. da. S.; SILVA, S. D. dos A. e; MARGIS, R..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seeds.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1005830
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Expressão de dgat2 ao longo do desenvolvimento de sementes de tungue (Vernicia fordii). Repositório Alice
BUSS, J. H.; GALLI, V.; LABONDE, J.; MESSIAS, R.; SILVA, S. D. dos A. e; MARGIS, R..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tungue.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946748
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Expression of an osmotin-like protein from Solanum nigrum confers drought tolerance in transgenic soybean. Repositório Alice
WEBER, R. L. M. W.; WIEBKE-STROHM, B.; BREDEMEIER, C.; MARGIS-PINHEIRO, M.; BRITO, G. G. de; RECHENMACHER, C.; BERTAGNOLLI, P. F.; SÁ, M. E. L. de; CAMPOS, M. de A.; AMORIM, R. M. S. de; BENEVENTI, M. A.; MARGIS, R.; GROSSI-DE SA, M. F.; BODANESE-ZANETTINI, M. H..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Abiotic stress; Bombardment; Drought tolerance; Genetic transformation; Glycine max; Osmotin; Water deficit.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1012379
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Expression profile of oil genes in tung seeds. Repositório Alice
GALLI, V.; MESSIAS, R. da. S.; SILVA, S. D. dos A. e; MARGIS, R..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seeds.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1005833
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Identification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine. Repositório Alice
COSTENARO-DA-SILVA, D.; PASSAIA, G.; HENRIQUES, J. A. P.; MARGIS, R.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F..
Sultanine grapevine (Vitis vinifera L.) is one of the most important commercial seedless table-grape varieties and the main source of seedlessness for breeding programs around the world. Despite its commercial relevance, little is known about the genetic control of seedlessness in grapes, remaining unknown the molecular identity of genes responsible for such phenotype. Actually, studies concerning berry development in seedless grapes are scarce at the molecular level. We therefore developed a representational difference analysis (RDA) modified method named Bulk Representational Analysis of Transcripts (BRAT) in the attempt to identify genes specifically associated with each of the main developmental stages of Sultanine grapevine berries. A total of 2400...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Uva sem semente; Expressão gênica; RDA; Desenvolvimento da baga; PCR em tempo real; Uva de mesa; Identificação genética; Viticultura; Uva; Biologia molecular; Genética.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/873059
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Identification and expression analysis of genes associated with the early berry development in the seedless grapevine (Vitis vinifera L.) cultivar Sultanine. Repositório Alice
COSTENARO-DA-SILVA, D.; PASSAIA, G.; HENRIQUES, J. A. P.; MARGIS, R.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F..
Sultanine grapevine (Vitis vinifera 1.) is one ofthe most important commercial seedless table-grape varieties and the main source of seedlessness for breeding programs around the world
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; Desenvolvimento da baga; PCR em tempo real; Identificação gênica; RDA; Uva sem semente; Viticultura; Uva; Genética; Biologia molecular.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/873344
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Identification of conserved micrornas and transcript targets in Vernicia fordii seeds by high-throughput sequencing. Repositório Alice
GALLI,; MESSIAS, R. da. S.; SILVA, S. D. dos A. e; MARGIS, R..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seeds.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1005853
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Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. Repositório Alice
KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERÃO, M.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: MicroRNAs.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/913711
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Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. Repositório Alice
KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERAO, M. P.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R..
Background: Small RNAs (19-24 nt) are key regulators of gene expression that guide both transcriptional and posttranscriptional silencing mechanisms in eukaryotes. Current studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) act in several plant pathways associated with tissue proliferation, differentiation, and development and in response to abiotic and biotic stresses. In order to identify new miRNAs in soybean and to verify those that are possibly water deficit and rust-stress regulated, eight libraries of small RNAs were constructed and submitted to Solexa sequencing. Results: The libraries were developed from drought-sensitive and tolerant seedlings and rust-susceptible and resistant soybeans with or without stressors. Sequencing the library and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja; Deficiência hídrica; Gene marcador; Soybeans; Gene expression; Soil water deficit.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/911802
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The use of microRNAs as universal reference genes in quantitative PCR. Repositório Alice
KULCHESKI, F. R.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; MARGIS, R..
Reverse transcription quantitative real-time PCR (RT-qPCR) is a robust and widely applied technique used to investigate gene expression. However, for correct analysis and interpretation of results, the choice of a suitable gene to use as an internal control is a crucial factor. These genes, such as housekeeping genes, should have a constant expression level in different tissues and across different conditions. The advances in genome sequencing have provided high-throughput gene expression analysis and have contributed to the identification of new genes, including microRNAs (miRNAs). The miRNAs are fundamental regulatory genes of eukaryotic genomes, acting on several biological functions. In this study, miRNA expression stability was investigated in...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/874076
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