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A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. Repositório Alice
VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
The aim of this study was to analyze whole-genome re-sequencing data focusing on SNVs and InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds related to RFI. Thus, genes showing SNVs/InDels in TF binding sites (5' UTR variants) were used to search for TF related to feed intake and to generate a gene-TF network for RFI across two purebred and one admixed dairy cattle breeds. Moreover, we were able to perform a comparative analysis accessing similarities and dissimilarities at the genomic level across these breeds.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequência de dados; Single Nucleotide Variations (SNVs); Insertions/deletions (InDels); Whole-genome; Whole-genome re-sequencing data; Gado de Corte; Bos Indicus; Variação Genética; Cattle breeds.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105518
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Análise de genes diferencialmente expressos em resposta à infecção por Streptococcus agalactiae. Repositório Alice
CARVALHO, B. de O.; PEREIRA, H. P.; SEIBERLICK, O. S. G.; REIS, D. R. de L.; CARVALHO, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F..
Resumo: As doenças infectocontagiosas estão entre os problemas que mais acarretam prejuízos econômicos na pecuária brasileira e mundial, sendo a mastite a principal enfermidade acometida aos bovinos. A mastite pode ser definida como uma inflamação da glândula mamária que é causada, mais frequentemente, por micro-organismos patogênicos ambientais ou contagiosos. Podendo culminar na redução da quantidade e no comprometimento da qualidade do leite, podendo levar até a perda total da potencialidade secretora da glândula mamaria do animal infectado ou mesmo a sua morte. Estudos relacionados aos mecanismos de resposta e resistência de animais à mastite foram realizados a fim de contribuir para a compreensão dos mecanismos genéticos de resistência e resposta a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: CD 14; NFKBIA; PCR em tempo real; Resposta inflamatória; STAT3.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111976
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Análise eletroforética microluídica "Lab-on-a-chip" das proteinas do leite para detectar adulteração de leite bovino adicionado com soro. Repositório Alice
SANTOS, A. S. DE O; MEURER, V. M.; PINTO, I. S. B.; NASCIMENTO, L. S. DE Q.; BORGES, C. A. V.; EGITO, A. S. do; FURTADO, M. A. M.; MARTINS, M. F..
[Lab-on-a-chip microfluidic electrophoretic analisys of milk proteins to detect additional whey in bovine milk adulteration].
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Adulteração do leite; Métodos de análise; Identificação do leite; Caprino; Leite de cabra; Adulteração; Eletroforese; Análise química; Proteína; Goat milk; Cow milk; Feed adulteration; Electrophoresis; Milk protein; Analytical methods.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033593
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Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq Repositório Alice
SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R,; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P..
2017
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão diferencial; Bovinos de leite; Sequenciamento.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1072447
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Banco de DNA de Bovinos: avaliação de metodologias alternativas para extração de DNA. Repositório Alice
BRION, C. T.; SANTOS, L. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética molecular bovinos; DNA; Métodos de extração.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1034534
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Características físico-químicas e microbiológicas de queijo de coalho produzido no Ceará. Repositório Alice
COSTA, R. G. B.; SÁ, J. F. O. de; BORGES, M. de F.; MARTINS, M. F.; MOREIRA, G. de M. M.; COSTA JÚNIOR, L. C. G..
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Queijo coalho; Contaminação; Queijo coalho; Contaminação; Bactérias patogênicas.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1029289
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Comparação dos métodos manual e automatizado de extração de DNA no Laboratório de Genética Molecular. Repositório Alice
MARTINS, S. A. V.; FONSECA, I.; VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Material genético; Qualidade; Método automatizado.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1042766
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Controle de qualidade em queijo minas padrão : métodos físico-químicos, microbiológicos e moleculares. Repositório Alice
COSTA, R. G. B.; MARTINS, M. F.; MENDONÇA, J. F. M. DE; BORGES, M. DE F..
bitstream/item/206817/1/Livro-queijo-minas-2019.pdf
Tipo: Livro científico (ALICE) Palavras-chave: Produtos lácteos; Microbiologia alimentar; Segurança de alimentos.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116679
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Desempenho do girolando nos rebanhos do nordeste do Brasil. Infoteca-e
FREITAS, A. F. DE; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. dos; SILVA, M. V. G. B..
2014
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Cruzamento; Rusticidade; Precocidade; Produção de leite.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/991836
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Detecção de células viáveis de patógenos em queijo Minas Padrão pela técnica de PCR em Tempo Real. Repositório Alice
MENDONÇA, J. F. M. de; VIEIRA, F. de O.; FONSECA, I.; ARCURI, E. F.; RIBEIRO, J. B.; BORGES, M. de F.; MARTINS, M. F..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: EMA; Micro-organismos patogênicos; Derivados lácteos; QPCR; EMA; Micro-organismos patogênicos; Derivados lácteos; QPCR; Viabilidade.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1029283
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Detecção de células viáveis de Salmonella spp. em queijo Coalho pela técnica de PCR em Tempo Real. Repositório Alice
VIEIRA, F. de O.; MENDONÇA, J. F. M. de; FONSECA, I.; ARCURI, E. F.; RIBEIRO, J. B.; MARTINS, M. F..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: EMA-PCR; Metodologias moleculares; Segurança do alimento.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033998
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Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. Repositório Alice
ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B..
Guzerat is a dual-purpose breed recognized for important traits to its adaptation to adverse tropical environments such as resistance to parasites, heat tolerance and ability to intake forage with low nutritional value. Once genetic variation responsible for this traits has so far not been well characterized, the aim of this study was to identity single nucleotide variants (SNVs) and insertion/deletions (Indels) in Guzerat cattle breed from whole genome re-sequencing in order to characterize loss-of-function variants which could be associated with complex traits in this cattle breed.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Single nucleotide variants; Bioinformatics; Cattle.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1067540
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Detection of viable Salmonella Typhimurium and Staphylococcus aureus in coalho cheese by real-time PCR. Repositório Alice
MENDONÇA, J. F. M. DE; VIEIRA, F. DE O.; FONSECA, I.; RIBEIRO, J. B.; ARCURI, E. F.; BORGES, M. DE F.; BORGES, C. A. V.; SÁ, J. F. O. DE; MARTINS, M. F..
bitstream/item/206473/1/ART19051.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Lacticínios; Viabilidade celular; Agentes intercalantes de DNA; Doenças transmitidas por alimentos; Microrganismos patogênicos; Cell viability; Dairy products.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116341
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DNA proviral do Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) em sêmen durante infecção aguda e crônica. Repositório Alice
SOUZA, K. C.; ANDRIOLI, A.; PINHEIRO, R. R.; SIDER, L. H.; MARTINS, M. F.; MOTTA, I. G. B.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. S..
Resumo: Sabe-se que o Vírus da Artrite Encefalite Caprina (CAEV) é transmitido pela via reprodutiva, portanto, faz-se necessário um entendimento da dinâmica do CAEV no sêmen de reprodutores tanto na infecção aguda como em infecção crônica. Para a previsão da magnitude do CAEV no sêmen e o tempo de máximo risco da transmissão sexual do lentivírus. Para tanto, 11 reprodutores caprinos (n = 5) recentemente infectados e (n = 6) em fase crônica da infecção tiveram sêmen coletado ao longo de três meses. O DNA das amostras foi extraído utilizando QIAamp DNA mini kit (QIAgen, USA) de acordo com as instruções do fabricante. Dois rounds da reação em cadeia da polimerase nested (nPCR) foram realizados para amplificar um fragmento de 185pb do DNA proviral do CAEV com...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gag gene; Provirus; Recent infection; Caprino; Transmissão de Doença; Caprine arthritis encephalitis virus; Sexually transmitted diseases.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107403
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Efeito da temperatura das amostras de leite na concentração de cálcio solúvel e de beta-caseina: interferencia no teste de estabilidade frente ao etanol. Repositório Alice
COSTA, F. F.; BRITO, M. A. V. P. e; SOUZA, G. N. de; PEREIRA, D. B. C.; PINTO, I. S. B.; MARTINS, M. F..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Contaminação bacteriana; Etanol; Glandula mamaria; Qualidade bicrobiologica.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/986757
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Efeito de diferentes fontes energéticas da dieta sobre a produção de metano utilizando a técnica de fermentação ruminal ex situ (microrúmen). Repositório Alice
MARTINS, M. F.; SOLÓRZANO, L. A. R.; PERNA JÚNIOR, F.; BERNDT, A.; CASTRO, A. L. de; FERREIRA, F. A.; PINEDO, L. A.; RODRIGUES, P. H. M..
O objetivo do experimento foi avaliar o efeito de diferentes fontes energéticas da dieta sobre a fermentação ruminal em bovinos. O delineamento adotado foi o quadrado latino 3x3 replicado, com período de 16 dias e 3 tratamentos: Controle: Dieta de baixo extrato etéreo; Soja: Dieta de alto extrato etéreo (inclusão de 15% de soja grão); Polpa: Dieta de baixo extrato etéreo e alta participação de pectina (inclusão de 15% de polpa cítrica). As coletas de conteúdo ruminal foram realizadas no 16º dia experimental, sendo realizadas antes, 3, 6, 9 e 12 horas após a alimentação matinal. Utilizou-se a técnica de fermentação ruminal ex situ, a qual consiste em incubar frascos de penicilina contendo conteúdo ruminal sólido e líquido em banho termostático por 30min....
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ácidos graxos de cadeia curta; Fermentação ruminal; Gases de efeito estufa; Grãos de soja; Polpa cítrica.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/939510
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Effect of inclusion or non-inclusion of short lactations and cow and/or dam genetic group on genetic evaluation of Girolando dairy cattle. Repositório Alice
CANAZA-CAYO, A. W.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A.; MARTINS, M. F.; LOPES, P. S..
The objective of this study was to evaluate the effects of inclusion or non-inclusion of short lactations and cow (CGG) and/or dam (DGG) genetic group on the genetic evaluation of 305-day milk yield (MY305), age at first calving (AFC), and first calving interval (FCI) of Girolando cows. Covariance components were estimated by the restricted maximum likelihood method in an animal model of single trait analyses. The heritability estimates for MY305, AFC, and FCI ranged from 0.23 to 0.29, 0.40 to 0.44, and 0.13 to 0.14, respectively, when short lactations were not included, and from 0.23 to 0.28, 0.39 to 0.43, and 0.13 to 0.14, respectively, when short lactations were included. The inclusion of short lactations caused little variation in the variance...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetic group; Girolando; Heritability; Short lactation; Variance components.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1053168
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Estrutura populacional da raça Girolando. Repositório Alice
CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A..
O objetivo neste estudo foi avaliar a estrutura genética da população de bovinos da raça Girolando no Brasil. Analisou-se o arquivo de pedigree de 26.969 animais, composto de 3.031 machos e 23.938 fêmeas. A partir dos coeficientes estimados, pode-se concluir que a endogamia nos rebanhos da raça Girolando foi de pequena magnitude e que as práticas de acasalamento foram adequadas durante o período avaliado. No entanto, é importante continuar com o monitoramento desses coeficientes a fim de prevenir perda de variabilidade genética.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coeficiente de endogamia; Raça Girolando; Tamanho efetivo populacional.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006603
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Expressed sequenced tags profiling of resistant and susceptible Gyr x Holstein cattle infested with the tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Repositório Alice
NASCIMENTO, C.S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; MARTINS, M. F.; PEIXOTO, J. de O.; FURLONG, J.; PRATA, M. C. de A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LOPES, P. S..
Tick resistance in cattle is mainly found in zebu (Bos indicus) animals, although it is also present in some taurine (B. taurus) breeds. In order to characterize functional genes involved in tick resistance/susceptibility in cattle, two cDNA libraries were generated using skin tissues of selected Holstein x Gyr animals. A total of 2700 high-quality reads from both resistant and susceptible cDNA were assembled into 458 sequences (contigs) and 834 singletons, with a mean size of 447.7 nucleotides. Assignment of homologous proteins by BLASTX revealed 790 (61.1%) and 300 (23.2%) hits in resistant and susceptible cDNA, respectively; 121 of these hits matched bovine proteins. A total of 502 (38.9%) unique sequences were found to have no significant homology with...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genética; Bovino.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/919920
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Fraude no leite: leite de qualidade x qualidade de vida. Infoteca-e
MARTINS, M. F.; SANTOS, A. S. de O. dos; MEURER, V. M.; FURTADO, M. A. M.; EGITO A. S. do; PINTO, I. S. B.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B..
2013
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Comercialização; Formação do rebanho; Leite e derivados; Processo de produção controlado.
Ano: 2013 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/955862
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