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A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice
SANTOS, M. de L.; ALVES, G. S. C.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T..
bitstream/item/171242/1/Resumo50CBFito-0637.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: E guineensis; E oleifera; NBS-LRRs; Biotic stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085646
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A large-scale analysis of resistance gene analogs (RGAs) encoding NBS domains in the genus Elaeis. Repositório Alice
SANTOS, M. de L.; SANTOS, M. de L.; COTTA, M. G.; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; ALVES, A. A.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T..
bitstream/item/173848/1/CBFITO-ePoster637.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: NBS-LRR; Elaeis guineenses; Elaeis oleífera; Biotic stress.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088997
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A novel immunochromatographic strip test for rapid detection of Cry1Ac and Cry8Ka5 proteins in genetically modified crops. Repositório Alice
SANTOS, V. O.; PELEGRINI, P. B.; MULINARI, F.; MOURA, R. S.; CARDOSO, L. P. V.; BÜHRER-SÉKULA, S.; MILLER, R. N. G.; PINTO, E. R. C.; GROSSI-DE-SA, M. F..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetically modified; Crop.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1031352
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Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: isolation, RFLP marker development, and physical mapping. Repositório Alice
MILLER, R. N. G.; BERTIOLI, D. J.; BAURENS, F. C.; SANTOS, C. M. R.; ALVES, P. C.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J..
bitstream/item/177893/1/SP-19674-ID-30995.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata Colla; Banana; Doença; Praga; Resistência.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190719
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Analysis of phylogeny, distribution, and pathogenicity of Botryosphaeriaceae species associated with gummosis of Anacardium in Brazil, with a new species of Lasiodiplodia. Repositório Alice
BRITO NETTO, M. S.; LIMA, W. G.; CORREIA, K. C.; SILVA, C. de F. B. da; THON, M.; MARTINS, R. B.; MILLER, R. N. G.; MICHEREFF, S. J.; CÂMARA, M. P. S..
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Agressividade; Caju; Fruta tropical; ITS; Agressiveness; Cashew; Tropical fruit; ITS.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072039
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Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G..
bitstream/item/183671/1/Midorikawa-et-al-2018-Frontiers-in-Bioengineering-and-Biotechnology.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Carbohydrate-active enzymes; XlnR; Sugar transporters; ClrA; Aspergillus tamarii; Transcriptome; Lignocellulose; Bioethanol.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096563
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Characterization of Aspergillus flavus strains from Brazilian Brazil nuts and cashew by RAPD and ribosomal DNA anlysis. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; PINHEIRO, M. R. R.; VIDIGAL, B. S.; ARRUDA, M. C.; COSTA, F. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RIBEIRO, S. G.; FREIRE, F.; MILLER, R. N. G..
bitstream/item/177841/1/SP-19618-ID-30903.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Controle; Micotoxins; Aspergillus Flavus.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190632
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Characterization of Aspergillus species on Brazil nut from the Brazilian Amazonian region and development of a PCR assay for identification at the genus level. Repositório Alice
MIDORIKAWA, G. E. O.; SOUZA, M. de L. M. de; SILVA, O. F.; DIAS, J. do S. A.; KANZAKI, L. I. B.; HANADA, R. E.; MESQUITA, R. M. L. C.; GONCALVES, R. C.; ALVARES, V. de S.; BITTENCOURT, D. M. de C.; MILLER, R. N. G..
Brazil nut is a protein-rich extractivist tree crop in the Amazon region. Fungal contamination of shells and kernel material frequently includes the presence of aflatoxigenic Aspergillus species from the section Flavi. Aflatoxins are polyketide secondary metabolites, which are hepatotoxic carcinogens in mammals. The objectives of this study were to identify Aspergillus species occurring on Brazil nut grown in different states in the Brazilian Amazon region and develop a specific PCR method for collective identification of member species of the genus Aspergillus. Results:Polyphasic identification of 137 Aspergillus strains isolated from Brazil nut shell material from cooperatives across the Brazilian Amazon states of Acre, Amapá and Amazonas revealed five...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Castanha do brasil; Amazônia; Doença de planta; Castanha do pará; Bertholletia excelsa; Fungo; Identificação; Aspergillus flavus; Aflatoxina; Plant diseases and disorders; Brazil nuts; Fungi; Pathogen identification; Enfermedades y desórdenes de las plantas; Nuez del Brasil; Identificación de patógenos.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/987473
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Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. Repositório Alice
MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y..
Banana is a nutritionally important crop across tropical and sub-tropical countries in sub-Saharan Africa, Central and South America and Asia. Although cultivars have evolved from diploid, triploid and tetraploid wild Asian species of Musa acuminata (A genome) and Musa balbisiana (B genome), many of today's commercial cultivars are sterile triploids or diploids, with fruit developing via parthenocarpy. As a result of restricted genetic variation, improvement has been limited, resulting in a crop frequently lacking resistance to pests and disease. Considering the importance of molecular tools to facilitate development of disease resistant genotypes, the objectives of this study were to develop polymorphic microsatellite markers from BAC clone sequences for...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Banana; Musa sp.; Varieties; Marcador molecular; Melhoramento genetico vegetal.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/860025
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Comparative proteomics and gene expression analysis in Arachis duranensis reveal stress response proteins associated to drought tolerance. Repositório Alice
CARMO, L. S. T.; MARTINS, A. C. Q.; MARTINS, C. C. C.; PASSOS, M. A. S.; SILVA, L. P. da; ARAUJO, A. C. G. de; BRASILEIRO, A. C. M.; MILLER, R. N. G.; GUIMARAES, P. M.; REIS, A. M. dos.
bitstream/item/192427/1/1-s2.0-S187439191830352X-main.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arachis duranensis; Proteomic profile; Transcript expression; QRT-PCR; Drought tolerance.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105765
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DATAMusa - a database for ortholog genes from Musa. Repositório Alice
TOGAWA, R. C.; SANTOS, C. M. R.; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MARTINS, N. F..
2010
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Armazenamento de dados; Anotação de genes; Resposta ao stress; Musa acuminata; EST; Montagem; Genes transcritos.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/884025
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DataMusa: banco de dados de genômica de Musa spp. Infoteca-e
SOUZA JÚNIOR, M. T.; SANTOS, C. M. R.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R. da; TOGAWA, R. C.; CASSIANO, L. P.; ALMEIDA, E. R. P. de; COELHO, M. C. F.; CAETANO, A. R.; CIAMPI, A. Y.; MOTA, M.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G..
A Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB) e o Centro Francês de Pesquisa Agrícola para o Desenvolvimento Internacional (CIRAD) iniciaram, em 2002, o projeto de pesquisa intitulado "Análise da Estrutura Primária do Genoma A de Musa acuminata", financiado pelo Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento (CNPq), e com o objetivo de desenvolver as bases de um programa de genômica e biotecnologia de banana no Brasil. Este projeto resultou na criação do DATAMusa, um banco de dados de genômica de banana composto de informações de Genômica Estrutural (seqüências de clones de uma biblioteca de BAC), de Transcriptoma (Expressed Sequence Tags - ESTs) e de Análogos de Genes de Resistência (Resistance Genes Analogs -...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Banana; DataMusa; Transcriptoma; Musa acuminata.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/175827
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Development of expressed sequence tag and expressed sequence tag-simple sequence repeat marker resources for Musa acuminata. Repositório Alice
PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. de O.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. de C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MATSUMOTO, T.; AZEVEDO, V. C. R.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; CAVALCANTE, M. de J. B.; BAURENS, F. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PIGNOLET, L.; ABADIE, C.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G..
Banana (Musa acuminata) is a crop contributing to global food security. Many varieties lack resistance to biotic stresses, due to sterility and narrow genetic background. The objective of this study was to develop an expressed sequence tag (EST) database of transcripts expressed during compatible and incompatible banana-Mycosphaerella fijiensis (Mf) interactions. Black leaf streak disease (BLSD), caused by Mf, is a destructive disease of banana. Microsatellite markers were developed as a resource for crop improvement.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Plátano; Marcador microssatélite; Melhoramento genético vegetal; Banana; Musa acuminata; Marcador genético; Variedade resistente; Doença de planta; Melhoramento vegetal; Fungo; Sigatoka negra; Mycosphaerella fijiensis; Plant breedind; Bananas; Genetic markers; Microsatellite repeats; Plant diseases and disorders; Firomejoramiento; Fungi; Black sigatoka; Bananos; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Enfermedades y desórdenes de las plantas.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953929
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Estimation of genetic structure of a Mycosphaerella musicola population using inter-simple sequence repeat markers. Repositório Alice
PEIXOUTO, Y. S.; BRAGANÇA, C. A. D.; ANDRADE, W. B.; FERREIRA, C. F.; HADDAD, F.; OLIVEIRA, S. A. S. de; BRITO, F. S. D.; MILLER, R. N. G.; AMORIM, E. P..
Among the diseases affecting banana (Musa sp), yellow Sigatoka, caused by the fungal pathogen Mycosphaerella musicola Leach, is considered one of the most important in Brazil, causing losses throughout the year. Understanding the genetic structure of pathogen populations will provide insight into the life history of pathogens, including the evolutionary processes occurring in agrosystems. Tools for estimating the possible emergence of pathogen variants with altered pathogenicity, virulence, or aggressiveness, as well as resistance to systemic fungicides, can also be developed from such data. The objective of this study was to analyze the genetic diversity and population genetics of M. musicola in the main banana-producing regions in Brazil. A total of 83...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Banana; Marcado genético; Doenlça de planta; Genetic markers; Plant diseases.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027411
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Expressão diferencial de genes em Pleurotus pulmonarius associados a degradação enzimática e destoxificação da torta de pinhão-manso. Repositório Alice
GOMES, T. G.; ALVES, G. S. C.; HADI, S. I. I. A.; COSTA, M. M. do C.; MENDONCA, S.; MILLER, R. N. G.; SIQUEIRA, F. G. de.
bitstream/item/184260/1/EnPI-2018-8.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Transcritoma; NGS; Pré-tratamento biológico; Macrofungos; Jatropha Curcas.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097269
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Background and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076414
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Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G..
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata; Meloidogyne incognita; Root-knot nematode; Biotic stress; Transcriptome; Monocotyledons.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074046
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Genômica estrutural de Musa acuminata ssp. burmannicoides var. Calcutta 4. Infoteca-e
SOUZA JÚNIOR, M. T.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; TOGAWA, R. C.; MILLER, R. N. G.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P..
O projeto de pesquisa intitulado "Análise da Estrutura Primária do Genoma A de Musa acuminata", financiado pelo Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento (CNPq), e executado pela Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, em parceria com a Universidade Católica de Brasília (UCB) e o Centro Francês de Pesquisa Agrícola para o Desenvolvimento Internacional (CIRAD), no período de fevereiro de 2002 a junho de 2005, resultou na criação do DATAMusa. O DATAMusa é um banco de dados de genômica de banana composto de informações de genômica estrutural, de transcriptoma e de análogos de genes de resistência. A parte referente a genômica estrutural é resultado da produção e caracterização de cinco clones de BAC, selecionados utilizando-se sonda do projeto...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Musa acuminata; Banana; Genoma.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/175819
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Insights into the Musa genome: syntenic relationships to rice and between Musa species. Repositório Alice
LESCOT, M.; PIFFANELLI, P.; CIAMPI, A. Y.; RUIZ, M.; BLANC, G.; LEEBENS MACK, J.; SILVA, F. R. da; SANTOS, C. M. R.; D'HONT, A.; GARSMEUR, O.; VILARINHOS, A. D.; KANAMORI, H.; MATSUMOTO, T.; RONNING, C. M.; CHEUNG, F.; HAAS, B. J.; ALTHOFF, R.; ARBOGAST, T.; HIRE, E.; PAPPAS JUNIOR, G.; SASAKI, T.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G.; GLASZMANN, J. C.; TOWN, C. D..
bitstream/item/177904/1/SP-19673-ID-30993.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa species; Banana; Zingiberaceae; Zingiberales.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190612
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Large scale transcriptome analysis of wild peanut (Arachis stenosperma) inoculated with Passalora personata, the causal agent of late leaf spot. Repositório Alice
MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SILVA, A. K.; GALHARDO, I. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; MILLER, R. N. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Amendoim silvestre; Arachis stenosperma; Passalora personata; Mancha foliar; Doença; Amendoim.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903297
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