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A dynamic deterministic model to evaluate breeding strategies under mixed inheritance Inra
Manfredi, E.; Barbieri, M.; Fournet, F.; Elsen, J.M..
Un modèle déterministe et dynamique est proposé pour étudier l’utilisation conjointe des performances et des génotypes à un locus majeur pour la sélection des caractères exprimés dans un sexe. Le modèle prévoit la sélection des adultes au-delà de seuils de performances intra-génotype, des accouplements en fonction des génotypes et la présélection de jeunes mâles sur leur génotype. L’application présentée indique que la combinaison optimale des performances et des génotypes permet d’obtenir des meilleurs résultats, en terme de moyennes polygéniques, de fréquences génotypiques et du progrès génétique actualisé et cumulé, que la sélection classique ignorant l’informationgénotypique. Les avantages de la sélection combinée sont plus importants quand...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SELECTION DYNAMIQUE; GENE MAJEUR; MARQUEUR GENETIQUE; MODELISATION.
Ano: 1998 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007706b1da0&uri=/notices/prodinra1/2007/09/
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Approches statistiques de l'évaluation génétique des reproducteurs pour des caractères binaires a seuils Inra
Foulley, J.L.; Manfredi, E..
Cet article présente 3 méthodes statistiques d’estimation des paramètres de position et de dispersion relatifs au modèle à seuils applicable à des caractères à variation phénotypique binaire en structure de modèle mixte des facteurs de variation. Ces méthodes concernent : l’approche linéaire de Grizzle, Starmer et Koch (1969) et son extension bayésienne au modèle mixte; l’approche du modèle linéaire généralisé et de la quasi-vraisemblance de Gilmour, Anderson et Rae (1985-87) et enfin la méthode bayésienne du mode conjoint a posteriori (MAP) de Gianola et Foulley (1983). Différents aspects comparatifs de ces 3 méthodes sont abordés en discussion.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: QUASI VRAISEMBLANCE; REPRODUCTEUR; METHODE BAYESIENNE; MODELE LINEAIRE; MODELE MIXTE; CARACTERE A SEUIL.
Ano: 1991 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300032576028487&uri=/notices/prodinra1/2007/12/
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Character process model for semen volume in AI rams : evaluation of correlation structures for long and short-term environmental effects Inra
David, I.; Bodin, L.; Lagriffoul, G.; Manfredi, E.; Robert-Granié, C..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: Serial correlation; Longitudinal data; Semen; Sheep.
Ano: 2007 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007b5c10c71&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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Effect of including major gene information in mass selection: a stochastic simulation in a small population Inra
Fournet, F.; Elsen, J.M.; Barbieri, M.E.; Manfredi, E..
Sur la base d’un système d’équations de récurrence, la méthode du meilleur prédicteur linéaire sans biais appliquée à un modèle animal réduit (MAR) est présentée pour la sélection assistée par marqueur. Cette méthode est une version MAR de celle du modèle animal pour réduire à un le nombre d’équations par animal. Cette méthode MAR permet d’estimer simultanément les effets fixés et la valeur génétique globale, qui est la somme des effets génétiques additifs des locus de caractère quantitatif (QTL) non liés au locus marqueur et des effets additifs des QTL liés au locus marqueur. La valeur génétique globale des animaux sans descendance est prédite par un système d’équations reconstitué à partir du système principal. Un exemple numérique est donné...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SELECTION ASSISTEE PAR MARQUEUR; MODELE ANIMAL REDUIT; MEILLEUR PREDICTEUR LINEAIRE SANS BIAIS; VALEUR GENETIQUE ADDITIVE TOTALE; MATRICE DE PARENTE COMBINEE.
Ano: 1997 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9700007709065573&uri=/notices/prodinra1/2007/09/
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Effets du polymorphisme de la caseine alpha s1 caprine sur les performances laitieres : analyse intradescendance de boucs de race Alpine Inra
Mahe, M.F.; Manfredi, E.; Ricordeau, G.; Piacere, A.; Grosclaude, F..
Les effets sur les performances laitières des 5 principaux allèles du locus de la caséine (formule, voir document attaché) (appelés respectivement A, B, C, E, F), qui contrôlent le polymorphisme à effet quantitatif de cette lactoprotéine, ont été analysés dans la descendance de 5 boucs hétérozygotes de race Alpine. Ce polymorphisme n’a pas d’effets sur la quantité de lait. Par rapport à l’allèle «faible» (F), les allèles «forts» A et C ont, en revanche, un effet significatif sur le taux de protéines vraies (+2,5, +2,6 et 1,8 g/kg pour les 3 familles étudiées), le taux butyreux (+1,5, +2,2 et +1,1 g/kg) et la quantité de matière protéique vraie (+2,3, +2,0 et +1,5 kg). Par rapport à l’allèle «moyen» (E), l’allèle fort A a un effet significatif sur...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ANIMAL LAITIER; RENDEMENT LAITIER; POLYMORPHISME GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500008225043724&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Environmental and genetic variation factors of artificial insemination success in French dairy sheep Inra
David, I.; Robert-Granié; Manfredi, E.; Lagriffoul, G.; Bodin, L..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: DAIRY SHEEP; ARTFICIAL INSEMINATION; ENVIRONMENTAL VARIATION; GENETIC PARAMETERS; FERTILITY.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20083a721c8b&uri=/notices/prodinra1/2008/07/
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Fréquences alléliques de la caseine alphas1 chez les boucs d'insémination de race Alpine et Saanen de 1975 à 1994 Inra
Ricordeau, G.; Piacere, A.; Manfredi, E.; Amigues, Y..
Les fréquences alléliques en caséine ay ont été calculées à partir des 761 boucsd’IA nés de 1975 à 1994, dont 483 Alpins et 278 Saanen. Dans ces 2 races, le mêmeschéma de sélection a entraîné une évolution différente des fréquences alléliques.Chez les boucs Alpins de testage et améliorateurs, la fréquence de l’allèle « fort »A n’a cessé d’augmenter (0,70 en 1994) aux dépens des allèles E et F. Chez lesboucs Saanen, l’allèle E reste majoritaire et a même tendance à augmenter (0,69en 1994) aux dépens de l’allèle F, alors que la fréquence de l’allèle A augmentepeu. L’allèle « fort » B est rare dans les 2 races, mais tend à se fixer en race Alpine,alors que l’allèle « fort » C absent en race Saanen, tend à disparaître en raceAlpine. Cette évolution moins...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: FREQUENCE ALLELIQUE; APTITUDE FROMAGERE; POLYMORPHISME GENETIQUE.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9600007526054452&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Genetic analysis of milking ability in Lacaune dairy ewes Inra
Marie-Etancelin, C.; Manfredi, E.; Aurel, M.R.; Pailler, F.; Arhainx, J.M.; Ricard, E.; Lagriffoul, G.; Guillouet, P.; Bibé, B.; Barillet, F..
Abstract: The milking ability of Lacaune ewes was characterised by derived traits of milk flow patterns, in an INRA experimental farm, from a divergent selection experiment in order to estimate the correlated effects of selection for protein and fat yields. The analysis of selected divergent line effects (involving 34 616 data and 1204 ewes) indicated an indirect improvement of milking traits (+17% for maximum milk flow and -10% for latency time) with a 25% increase in milk yield. Genetic parameters were estimated by multi-trait analysis with an animal model, on 751 primiparous ewes. The heritabilities of the traits expressed on an annual basis were high, especially for maximum flow (0.54) and for latency time (0.55). The heritabilities were intermediate...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: DAIRY SHEEP; MILK FLOW; MILKING ABILITY; MILKING TRAIT; DIVERGENT SELECTION.
Ano: 2006 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008168c201d&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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Genetic analysis of milking ability in Lacaune dairy ewes Inra
Marie-Etancelin, C.; Manfredi, E.; Aurel, M.R.; Pailler, F.; Arhainx, J.M.; Ricard, E.; Lagriffoul, G.; Guillouet, P.; Bibé, B.; Barillet, F..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: DAIRY SHEEP; MILK FLOW; MILKING ABILITY; MILKING TRAIT; DIVERGENT SELECTION.
Ano: 2006 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20088dd59c65&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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Genetic and environmental effects on semen traits in Lacaune and Manech tête rousse AI rams Inra
David, I.; Druart, X.; Lagriffoul, G.; Manfredi, E.; Robert-Granié, C.; Bodin, L..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: Ram; Semen; Environmental factor.
Ano: 2007 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007cf9558e8&uri=/notices/prodinra1/2009/12/
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Genetic correlation between female fertility and milk yield in Lacaune Sheep Inra
David, I.; Astruc, J.M; Lagriffoul, G.; Manfredi, E.; Robert-Granié, C.; Bodin, L..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: FERTILITE; PRODUCTION LAITIERE; OVIN; CORRELATION GENETIQUE FERTILITY; MILK YIELD; SHEEP; GENETIC CORRELATION.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008d236ea30&uri=/notices/prodinra1/2008/11/
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Genetic parameters for twinning in the Maine Anjou breed Inra
Manfredi, E.; Foulley, J.L.; Gillard, P.; San Cristobal, M..
Cette étude vise à estimer les paramètres et les valeurs génétiques de la gémellité en race bovine Maine-Anjou. L’analyse du taux de vêlages gémellaires a été effectuée en traitant ce caractère comme un caractère tout-ou-rien à seuil soumis à des effets directs et foetaux en postulant une hérédité polygénique. Les facteurs de variation pris en compte étaient le rang de vêlage, l’interaction (année x saison de vêlage), le troupeau, le père du fœtus, le père de la vache et la vache intra-père. Le coefficient d’héritabilité a été estimé à 0,02 pour les effets foetaux et 0,13 pour les effets directs avec une corrélation de 0,36 entre les deux. Les valeurs génétiques transmises des taureaux ont été prédites sur l’échelle sous-jacente. Le meilleur...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: GEMELLITE; PARAMETRE GENETIQUE; REPRODUCTEUR; CARACTERE A SEUIL.
Ano: 1991 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9200008913026506&uri=/notices/prodinra1/2007/12/
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Genetic parameters of dairy traits in the Alpine and Saanen goat breeds Inra
Manfredi, E.; Bélichon, S.; Piacère, A..
Les paramètres génétiques des quantités de lait, de protéines et de matière grasse et les taux protéique et butyreux sont estimés pour les races Alpine et Saanen en utilisant un modèle animal. Les données correspondent aux premières lactations de 33 431 (Alpine) et 20 700 (Saanen) chèvres durant les campagnes 1996 et 1997. Les héritabilités varient de 0,32 à 0,40 pour les quantités et de 0,50 à 0,60 pour les taux. Les résultats marquants sont la corrélation génétique modérée (-0,17) entre la quantité de lait et le taux butyreux et la forte association (0,56) entre la quantité et le taux de matières grasses. Si les différences entre les paramètres génétiques des deux races sont faibles, elles suggèrent que le progrès génétique potentiel pour la...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CAPRINS; PRODUCTION LAITIERE; PARAMETRES GENETIQUES GOAT; DAIRY PRODUCTION; GENETIC PARAMETERS.
Ano: 1999 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007245a2577&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Génotype caséine αs1 et sélection des boucs sur descendance dans les races Alpine et Saanen Inra
Manfredi, E.; Ricordeau, G.; Barbieri, M.E.; Amigues, Y.; Bibé, B..
Cette étude, qui concerne 184 boucs de race Alpine et 96 de race Saanen nés de 1987 à 1990, indique que le pourcentage d’améliorateurs dépend du génotype caséine αs1. Dans ces races, le locus αs1 comporte 3 allèles forts regroupés sous l’appellation (A), 2 allèles faibles (E et F) et un allèle nul (O). Chez les Alpins, avec la sélection actuelle, on observe 49% d’améliorateurs chez les AA, 30% chez les AE, 28% chez les AF et aucun chez les AO et les non-porteurs d’allèles forts. Chez les Saanen, on observe 44% d’améliorateurs chez les hétérozygotes AE et AF, 36% chez les EE et 18% chez les EF et FF. Ces résultats démontrent l’intérêt du typage précoce des jeunes boucs pour éviter de mettre en testage des non-porteurs d’allèles forts.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CASEINE αS1; POLYMORPHISME GENETIQUE; PRODUCTION DE LAIT.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500007491052837&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Inference about multiplicative heteroskedastic components of variance in a mixed linear Gaussian model with an application to beef cattle breeding Inra
San Cristobal, M.; Foulley, J.L.; Manfredi, E..
Une méthode statistique est présentée, capable d’identifier les sources significatives d’hétérogénéité de variances résiduelles et génétiques dans un modèle linéaire mixte gaussien. La méthode est fondée sur un modèle structurel de décomposition du logarithme des variances. L’inférence concernant les paramètres de dispersion est basée sur la vraisemblance marginale obtenue après intégration des paramètres de position. Un test du rapport des vraisemblances utilisant la vraisemblance marginale est aussi proposé afin de tester des hypothèses sur différentes sources de variation. Une extension bayésienne de la procédure d’estimation des paramètres de dispersion est présentée; elle consiste en la maximisation de leur distribution marginale a posteriori,...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MODELE LINEAIRE MIXTE; HETEROSCEDASTICITE; TECHNIQUE BAYESIENNE; COMPOSANTE DE LA VARIANCE; SELECTION.
Ano: 1993 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500032262043068&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Influence du locus de la caséine αs1 sur les performances laitières et les paramètres génétiques des chèvres de race Alpine Inra
Barbieri, M.E.; Manfredi, E.; Elsen, J.M.; Ricordeau, G.; Bouillon, J.; Grosclaude, F.; Mahé, M.F.; Bibé, B..
L’influence du polymorphisme de la caséine αs1 sur les performances laitières et sur les paramètres génétiques a été étudiée sur 883 lactations de chèvres Alpine à la station caprine de Moissac. Les différences entre génotypes, les héritabilités et corrélations génétiques ont été estimées avec un modèle animal, en considérant les effets fixés de la date de mise bas, de la campagne, du numéro de lactation, du génotype caséine αs1 (AA, AE, AF, EE, EF, FF), et les effets aléatoires de l’environnement permanent et de la valeur génétique additive. L’allèle fort A a un effet significativement favorable (P < 0,01) sur le taux de protéines vraies (AA > AE, AF > EE, EF > Ff) et le taux butyreux (AA, AE, AF > EF et FF). Les chèvres AA ont...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: POLYMORPHISME CASEINE αs1; TAUX DE PROTEINE.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500007490052836&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Performance of genomic selection in mice Inra
Legarra, A.; Robert-Granié, C.; Manfredi, E.; Elsen, J.M..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: GENETIC EVOLUTION; SELECTION; LINKAGE DESEQUILIBRIUM; SNP; MARKER ASSISTED.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20083526791a&uri=/notices/prodinra1/2008/09/
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Phenotypic and genetic statistics of components of milk and two measures of somatic cell concentration Inra
Manfredi, E.; Everett, R.W.; Searle, R..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: HERITABILITIES; GENOTYPIC; PHENOTYPIC; MILK; LACTATION SCORE; CONCENTRATION; PROTEIN.
Ano: 1984 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010db49ab62&uri=/notices/prodinra1/2010/03/
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Potential gain from including major gene information in breeding value estimation Inra
Larzul, C.; Manfredi, E.; Elsen, J.M..
Le but de l’étude est de comparer l’application de deux indices dans le cas d’une sélection sur un caractère quantitatif soumis à l’effet d’un gène majeur. Dans le premier cas, l’indice ne prend pas en compte l’information sur le génotype au locus majeur (méthode standard) alors que le deuxième indice prend en compte cette information (méthode modifiée). Deux types de schémas sont considérés : sélection individuelle et sélection sur descendance. Le calcul du progrès génétique et de l’évolution des fréquences alléliques est réalisé pas à pas en considérant des générations chevauchantes. Tous les effets étudiés sur la supériorité de la méthode modifiée sur la méthode standard suggèrent de nombreuses interactions. Cependant, il ressort que la prise en...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: GAIN GENETIQUE; SELECTION; GENE MAJEUR.
Ano: 1997 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9800009381067764&uri=/notices/prodinra1/2007/09/
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