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Analyse structurale et transcriptionnelle des rétrotransposons du génome de la vigne, Vitis vinifera L. Inra
Moisy, C..
Les variétés de vigne (Vitis vinifera L.) sont composées d’un ensemble de clones, tous issus de la même et unique plante propagée par multiplication végétative sur de longues périodes. Ce processus doit en principe assurer la transmission du patrimoine génétique de la plante mère à la plante fille, cependant des mutations spontanées peuvent apparaître et être, dans certains cas, à l’origine de nouveaux génotypes. Les éléments transposables, par la variabilité génétique que peut générer leur mobilité, sont une source potentielle de mutation. Dans un contexte général de compréhension des mécanismes biologiques qui participent à l’évolution des génomes au cours des cycles de multiplication végétative, l’objectif de la thèse est d’étudier la structure et la...
Tipo: Thesis Palavras-chave: TVV1; VINE-1; GRET1; DIVERSITE INTRA-VARIETALE; RETROTRANSPOSON; ELEMENTS MOBILES; STRESS; TRANSCRIPTION; RT-PCR.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009f41483eb&uri=/notices/prodinra1/2009/02/
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Characterization of ten novel Ty1/copia-like retrotransposon families of the grapevine genome Inra
Moisy, C.; Garrison, K.; Meredith, C. P.; Pelsy, F..
BACKGROUND: Retrotransposons make a significant contribution to the size, organization and genetic diversity of their host genomes. To characterize retrotransposon families in the grapevine genome (the fourth crop plant genome sequenced) we have combined two approaches: a PCR-based method for the isolation of RnaseH-LTR sequences with a computer-based sequence similarity search in the whole-genome sequence of PN40024.RESULTS: Supported by a phylogenic analysis, ten novel Ty1/copia families were distinguished in this study. To select a canonical reference element sequence from amongst the various insertions in the genome belonging to each retroelement family, the following screening criteria were adopted to identify the element sequence with: (1)...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RETROTRANSPOSON TY1-COPIA Ty1; RETROTRANSPOSON; COPIA-LIKE; GRAPEVINE; GENOME; PCR-BASED; RNASEH-LTR; GENETIC.
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20089e1922fe&uri=/notices/prodinra1/2009/11/
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