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Genome-wide mapping of loci explaining variance in scrotal circumference in Nellore Cattle Repositório Alice
UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S.; NEVES, H. H. R.; CARVALHEIRO, R.; MATOS, M. C.; ZAVAREZ, L. B.; ITO, P. K. R. K.; O'BRIEN, A. M. P.; SOLKNER, J.; PORTO-NETO, L. R.; SCHENKEL, F. S.; McEWAN, J.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSELL, C. P.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide; Race Nellore; Nellore cattle - reproductive performance; Gado de corte; Raça Canchim.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/986515
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Low levels of taurine introgression in the current Brazilian Nelore and Gir indicine cattle populations. Repositório Alice
O'BRIEN, A. M. P.; HÖLLER, D.; BOISON, S. A.; MILANESI, M.; BOMBA, L.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MÉSZÁROS, G.; AJMONE-MARSAN, P.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bovine reproduction.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1017843
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Strategies for single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping to enhance genotype imputation in Gyr (Bos indicus) dairy cattle: Comparison of commercially available SNP chips. Repositório Alice
BOISON, S. A.; SANTOS, D. J. A.; UTSONOMIYA, A. H. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; O'BRIEN, A. M. P.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J.; SILVA, M. V. G. B..
Genotype imputation is widely used as a cost-effective strategy in genomic evaluation of cattle. Key determinants of imputation accuracies, such as linkage disequilibrium patterns, marker densities, and ascertainment bias, differ between Bos indicus and Bos taurus breeds. Consequently, there is a need to investigate effectiveness of genotype imputation in indicine breeds. Thus, the objective of the study was to investigate strategies and factors affecting the accuracy of genotype imputation in Gyr (Bos indicus) dairy cattle. Four imputation scenarios were studied using 471 sires and 1,644 dams genotyped on Illumina BovineHD (HD-777K; San Diego, CA) and BovineSNP50 (50K) chips, respectively. Scenarios were based on which reference high-density single...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Imputation; Gyr; Beagle; FImpute.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1036928
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