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ABC transporters in Mycoplasma hyopneumoniae and Mycoplasma synoviae: insights into evolution and pathogenicity. Repositório Alice
NICOLÁS, M. F.; BARCELLOS, F. G.; HESS, P. N.; HUNGRIA, M..
ABC transporters represent one of the largest superfamilies of active membrane transport proteins (MTPs) with a highly conserved ATPase domain that binds and hydrolyzes ATP, supplying energy for the uptake of a variety of nutrients and for the extrusion of drugs and metabolic wastes. The complete genomes of a non-pathogenic (J) and pathogenic (7448) strain of Mycoplasma hyopneumoniae, as well as of a pathogenic (53) strain of Mycoplasma synoviaehave been recently sequenced. A detailed study revealed a high percentage of CDSs encoding MTPs in M. hyopneumoniaestrains J (13.4%), 7448 (13.8%), and in M. synoviae53 (11.2%), and the ABC systems represented from 85.0 to 88.6% of those CDSs. Uptake systems are mainly involved in cell nutrition and some might be...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Transportadores ABC.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/467160
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Análise estrutural do plasmídio simbiótico de Rhizobium tropici CFN299. Repositório Alice
BINDE, D. R.; HUNGRIA, M.; CHUEIRE, L. M. de O.; LUCAS, I. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; MARTINEZ-ROMERO, E.; BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F. da..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Plasmídio simbiótico.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/455089
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Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses. Repositório Alice
PEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P.; GRISARD, E. C.; HUNGRIA, M.; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZL-ELER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L. G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVES, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ, R. T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; TADRA-SFEIR, M. Z.; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WATANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. da C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO, R. de C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M..
The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Parana´ State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Plant recognition; Colonization; Nutrient; Herbaspirillum seropedicae.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/902450
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Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a specialized diazotrophic endophyte of tropical grasses. Repositório Alice
PEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P.; GRISARD, E. C.; HUNGRIA, M.; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZL-ERLER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L. G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVES, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ, R. T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; MICHELLE Z. TADRA-SFEIR; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WATANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. da C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO, R. de C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M..
The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Paraná State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Fixacao nitrogenio; Graminea tropical; Genome; Herbaspirillum seropedicae; Nitrogen fixation; Grasses.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/897676
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Genomic basis of broad host range and environmental adaptability of Rhizobium tropici CIAT 899 and Rhizobium sp. PRF 81 which are used in inoculants for common bean (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
ORMEÑO-ORRILLO, E.; MENNA, P.; ALMEIDA, L. G. P.; JAVIER OLLERO, F.; NICOLÁS, M. F.; RODRIGUES, E. P.; NAKATANI, A. S.; BATISTA, J. S. S.; CHUEIRE, L. M. de O.; SOUZA, R. C.; VASCONCELOS, A. T. R.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M.; MARTÍNEZ-ROMERO, E..
2012
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Fixação de nitrogênio; Nodulação; Beans; Nitrogen fixation; Nodulation.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/949496
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Identificação de QTL associados a fixação biológica do nitrogênio em soja. Repositório Alice
SANTOS, M. A. dos; NICOLÁS, M. F.; VEDOVATI, T. C. S.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja; Fixação de nitrogênio.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469113
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Identification of Discolobium species indigenous to the Brazilian Pantanal ecosystem by microsatellite (SSRs) markers. Repositório Alice
ELIAS NETO, N.; LOUREIRO, M. de F.; NICOLÁS, M. F.; MARIANOWSKI, T.; TORRES, A. R.; HUNGRIA, M..
2012
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Marcador genético; Biodiversidade; Ecossistema; Fixação de nitrogênio; Genetic markers; Biodiversity; Microsatellite repeats; Nitrogen fixation.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/949508
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Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. Repositório Alice
GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja; Inoculação; Bactéria; Genoma.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469110
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Panorama genômico de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (Semia 4080). Repositório Alice
PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; ANDRE, E.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bactéria; Genoma.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469085
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Sequenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici. Repositório Alice
BINDE, D. R.; CHUEIRE, L. M. de O.; LUCAS, I. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; MARTINEZ-ROMERO, E.; BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F. da; GARCIA, J. E.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biotecnologia; Bactéria.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469077
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Sequênciamento genômico e bioprospecção de genes de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (SEMIA 4080) utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro. Repositório Alice
PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; SOUZA, L. G. R. C.; HUNGRIA, M..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijoeiro.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/468837
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The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector. Repositório Alice
MARINOTTI, O.; CERQUEIRA, G. C.; ALMEIDA, L. G. P. de; FERRO, M. I. T.; LORETO, E. L. da S.; ZAHA, A.; TEIXEIRA, S. M. R.; WESPISER, A. R.; SILVA, A. A.; SCHLINDWEIN, A. D.; PACHECO, A. C. L.; SILVA, A. L. da C.; GRAVELEY, B. R.; WALENZ, B. P.; LIMA, B. de A.; RIBEIRAO, C. A. G.; NUNES-SILVA, C. G.; CARVALHO, C. R. de; SOARES, C. M. de A.; MENEZES, C. B. A. de; MATIOLLI, C.; CAFFREY, D.; ARAÚJO, D. A. M.; OLIVEIRA, D. M. de; GOLENBOCK, D.; GRISARD, E. C.; FANTINATTI-GARBOGGINI, F.; CARVALHO, F. M. de; BARCELLOS, F. G.; PROSDOCIMI, F.; MAY, G.; AZEVEDO JUNIOR, G. M. de; GUIMARÃES, G. M.; OLDMAN, G. H.; PADILHA, I. Q. M.; BATISTA, J. da S.; FERRO, J. A.; RIBEIRO, J. M. C.; FIETTO, J. L. R.; DABBAS, K. M.; CERDEIRA, L.; AGNEZ-LIMA, L. F.; BROCCHI, M.; CARVALHO, M. O. de; TEIXEIRA, M. de M.; MAIA, M. de M. D.; GOLDMAN, M. H. S.; SCHNEIDER, M. P. C.; FELIPE, M. S. S.; HUNGRIA, M.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA, M.; MONTES, A. M.; CANTAO, M. E.; VINCENTZ, M.; RAFAEL, M. S.; SILVERMAN, N.; STOCO, P. H.; SOUZA, R. C.; VICENTINI, R.; GAZZINELLI, R. T. G.; NEVES, R. de O.; SILVA, R.; ASTOLFI-FILHO, S.; MACIEL, T. E. F.; ÜRMÉNYI, T. P.; TADEI, W. P.; CAMARGO, E. P.; VASCONCELOS, A. T. R. de.
Anopheles darlingi is the principal neotropical malaria vector, responsible for more than a million cases of malaria per year on the American continent. Anopheles darlingi diverged from the African and Asian malaria vectors 100 million years ago (mya) and successfully adapted to the New World environment. Here we present an annotated reference A. darlingi genome, sequenced from a wild population of males and females collected in the Brazilian Amazon. A total of 10 481 predicted protein-coding genes were annotated, 72% of which have their closest counterpart in Anopheles gambiae and 21% have highest similarity with other mosquito species. In spite of a long period of divergent evolution, conserved gene synteny was observed between A. darlingi and A....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Genome.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/960215
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Uso de marcadores moleculares em soja visando identificar caracteres da fixação biológica do nitrogênio. Repositório Alice
ASAIM.; SANTOS, M. A. dos; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja; Fixação de nitrogênio; Marcador molecular.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469393
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