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An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A..
Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: MicroRNAs; Residual Feed Intake; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102149
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An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A..
Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: RFI; MiRNA; Gado Nelore; Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099755
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Armazenamento de dados de genotipagem e fenotipagem para estudos de genética animal. Repositório Alice
OLIVEIRA, G. B. de; HIGA, R. H..
O que propomos é um banco de metadados que possa conter as informações de marcadores, fenótipos e genótipos de diferentes especies e armazenados em diferentes repositórios, garantido assim o acesso e centralização das informações e sua utilização pelos pesquisadores de melhoramento genético animal.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Banco de dados genérico; Armazenamento de dados genéticos; Melhoramento genético animal; Generic database; Generic data storage; Single nucleotide polymorphism; Animal breeding.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1031147
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Avaliação da longevidade de adultos da joaninha predadora Cryptolaemus montrouzieri criada com a dieta extrato de levedura Bionis® YE MF e açúcar, no substrato grão de milho estourado. Repositório Alice
SILVA, A. P. da; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, G. B. de; FANCELLI, M.; NASCIMENTO, A. S. do.
bitstream/item/205984/1/Avaliacao-da-longevidade-de-adultos-da-joaninha-predadora-Cryptolaemus.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Joaninha; Açúcar; Milho.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115738
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Banco de dados de genótipos para melhoramento genético animal. Repositório Alice
OLIVEIRA, G. B. de; DIAS, V. F.; PODESTÁ, E. V.; CORRÊA, J. L.; HIGA, R. H..
Neste trabalho, propomos um de banco de dados e sistemas associados para armazenar genótipos baseado no Sistema de Gerenciamento de Banco de Dados (SGBD) PostgreSQL, linguagem de programação C ,Python e a ferramenta Django para o desenvolvimento da interface.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Banco de dados; Melhoramento genético animal; Genetic improvement.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/996261
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Evidence of miRNA regulation of intramuscular fat deposition in beef cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, G. B. de; CESAR, A. S. M.; FELÍCIO, A. M.; KAPPELER, B. I. G.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Gado de corte; Beef cattle.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057034
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Gene network regulated by microRNAs suggests modulation of fat deposition in cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, G. B. de; CESAR, A. S. M.; FELICIO, A. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
2016
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genética; Rede genética; Genética animal; Animal genetics.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057153
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Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. Repositório Alice
CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; REECY, J. M.; POLETI, M. D.; OLIVEIRA, P. S. N.; OLIVEIRA, G. B. de; MOREIRA, G. C. M.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. L.; KOLTES, J. E.; Fritz-Waters, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; BEIKI, H.; GEISTLINGER, L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L..
Background: Integration of high throughput DNA genotyping and RNA-sequencing data allows for the identification of genomic regions that control gene expression, known as expression quantitative trait loci (eQTL), on a whole genome scale. Intramuscular fat (IMF) content and carcass composition play important roles in metabolic and physiological processes in mammals because they influence insulin sensitivity and consequently prevalence of metabolic diseases such as obesity and type 2 diabetes. However, limited information is available on the genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. Thus, our hypothesis was that eQTL analyses could identify putative regulatory regions and transcription factors (TFs) associated with...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; EQTL; Ácidos graxos; Doenças metabólicas; Expression quantitative trait loci; Gene expression; Fatty acids; Mammals; Metabolic diseases.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102203
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miRNAs related to fatty acids composition in Nellore cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N. de; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; TIZIOTO, P. C.; POLETI, M. D.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Adipogenesis; Gene regulation.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066405
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Preferência de Cryptolaemus montrouzieri (Col.: Coccinellidae) sobre ninfas de Maconellicoccus hirsutus (Hemip.: Pseudococcidae) e ovos de Ceratitis capitata (Dip.: Tephritidae). Repositório Alice
SILVA, D. M. da; SILVA, U. T. F. da; NASCIMENTO, A. S. do; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, G. B. de; GAMA, F. de C.; PARANHOS, B. A. J..
bitstream/item/206240/1/Preferencia-de-Cryptolaemus-montrouzieri-Col.-Coccinellidae-sobre-ninfas-de.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Joaninha; Praga de Planta.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115991
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Produção de pimenta-longa (Piper aduncum L. e Piper hispidinervum C. DC.) no Ceará. Infoteca-e
PEREIRA, R. de C. A.; RODRIGUES, T. H. S.; OLIVEIRA, G. B. de; BEZERRA, M. G. A..
2012
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pimenta-longa.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/951724
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Software para recuperação automatizada de anotações funcionais em estudos de associação genômica ampla. Repositório Alice
ALMEIDA, R. C. de; OLIVEIRA, G. B. de; HIGA, R. H..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Associação genômica ampla; Polimorfismo de nucleotídeo único; Genômica animal; Computer software; Single Nucleotide Polymorphisms.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981928
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