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An overview of the Weitzman approach to diversity Inra
Thaon d'Arnoldi, C.; Foulley, J.L.; Ollivier, L..
Un aperçu sur l’approche de la diversité selon Weitzman. La diversité d’un ensemble d’espèces, ou de races, est définie par Weitzman de façon récursive ; les données de départ sont les distances génétiques entre les éléments de l’ensemble pris deux à deux. L’algorithme de calcul de la diversité fournit, comme résultat intermédiaire, un arbre de classement des espèces en présence, qui est interprété comme une phylogénie du maximum de vraisemblance. La théorie est illustrée par un exemple d’application à 19 races bovines européennes, et les utilisations possibles de la méthode pour définir des stratégies optimales de conservation sont discutées brièvement.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CONSERVATION DU MATERIEL GENETIQUE.
Ano: 1998 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9800002005071572&uri=/notices/prodinra1/2007/08/
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Dix ans d’une expérience de sélection individuelle sur des verrats utilisés en insémination artificielle. II. Paramètres génétiques estimés Inra
Ollivier, L..
Les résultats recueillis entre 1966 et 1975 dans une expérience de sélection réalisée au centre d’insémination artificielle porcine I.N.R.A. de Rouillé (Vienne) sont analysés en vue d’estimer les héritabilités (h2) et corrélations génétiques (rA) relatives à des variables X mesurées sur les verrats - vitesse de croissance de 30 à 80 kg (X1) et épaisseur du gras dorsal à 80 kg (X3) - et à un ensemble de 22 variables Y mesurées sur des mâles castrés et des femelles abattus au poids vif de 100 kg. Les effectifs totaux sont de 850 pour X et 2 732 pour Y, tous ces individus étant issus de 94 pères (dont 85 eux-mêmes mesurés pour X). Le dispositif permet de calculer des covariances entre parent et descendant d’une part et entre demi-germains d’autre part....
Tipo: Journal Article Palavras-chave: HERITABILITE; CORRELATION GENETIQUE; CROISSANCE; CARCASSE; PORC.
Ano: 1983 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20088823f224&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Dix ans d'une experience de selection sur des verrats utilises en insemination artificielle. III - Parametres genetiques realises. Inra
Ollivier, L..
Les résultats recueillis entre 1966 et 1975 dans une expérience de sélection sur un indice à 2 caractères, au centre d’insémination artificielle porcine I.N.R.A. de Rouillé (Vienne), ont été analysés en vue d’estimer des paramètres génétiques réalisés concernant les 2 variables de l’indice de sélection - vitesse de croissance de 30 à 80 kg (X,) et épaisseur du gras à 80 kg (Xa) - et un ensemble de 14 variables (Y) différentes, pour lesquelles les réponses à la sélection avaient été précédemment estimées. A cette occasion, la méthode classique d’estimation des paramètres génétiques réalisés a été étendue au cas des populations avec recouvrement des générations successives. Connaissant la structure du réseau de migration des gènes entre les diverses...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: EXPERIENCE DE SELECTION; GENERATIONS IMBRIQUEES; PARAMETRE GENETIQUE; INDEX DE SELECTION.
Ano: 1985 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8808338007227&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Escherichia coli K88 adhesion : a comparison of Chinese and Large White piglets. Inra
Chapuis, J.P.; Duval-Iflah, Y.; Ollivier, L.; Legault, C..
Un essai comparatif a été réalisé sur 15 porcelets Large White et 12 porcelets Chinois, prélevés à la naissance de manière axénique, privés de colostrum et placés en isolateur sous film plastique. Après inoculation par voie orale de 2 souches de E. coli, l’une possédant l’antigène d’attachement K88 (K88+)l’autre dépourvue de cet antigène (K88-), les porcelets sont sacrifiés et 3 segments différents de l’intestin grêle sont prélevés sur chaque porcelet en vue de numérations des 2 souchesbactériennes, à la fois dans le contenu intestinal et sur la paroi. Le pourcentage de bactéries spécifiquement attachées à la paroi est ainsi estimé et la présence ou l’absence chez le porcelet du récepteur intestinal K88 peut en être déduite. Les résultats indiquent...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ADHESION BACTERIENNE; MICROFLORE.
Ano: 1984 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8702389005460&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Etude du groupe de liaison Hal, Phi et Pgd chez le Porc : disposition relative des trois locus et estimation des taux de recombinaison Inra
Guérin, G.; Ollivier, L.; Sellier, P..
Des croisements destinés à étudier la transmission des combinaisons alléliques aux locus de la sensibilité à l’halothane (Hal), de la phosphohexose isomérase (Phi) et de la 6-phosphogluconate déshydrogénase (Pgd) ont été réalisés dans un troupeau expérimental de porcs de Piétrain. Parmi les descendants de 54 croisements, 3 animaux ont reçu des combinaisons alléliques absentes chez leurs parents. Ces cas de recombinaison conduisent à proposer comme ordre le plus probable Hal - Phi - Pgd avec des distances de 0,73 cM (centimorgan) entre Hal et Phi, 0,56 cM entre Phi et Pgd, et 1,18 cM entre Hal et Pgd.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PORC DE PIETRAIN; GROUPE DE LIAISON HAL-PHI-PGD; TAUX DE RECOMBINAISON; ORDRE DE LOCUS PIETRAIN PIG; RECOMBINAISON RATES; LINKAGE MAP.
Ano: 1983 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008804552d6&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Étude génétique du syndrome de l’abduction des membres (splayleg) chez le porcelet nouveau-né 1. - Modèle multifactoriel à un seuil Inra
Sellier, P.; Ollivier, L..
Le syndrome de l’abduction des membres du porcelet nouveau-né a été observé entre 1973 et 1979 dans un élevage expérimental de l’I.N.R.A. Les 1 086 portées considérées appartiennent à huit types génétiques : deux lignées Large White ( LWt et LWs), deux lignées Piétrain (PA et PB) et les quatre croisements entre des mâles PA ou PB et des femelles LWt ou LWs. La fréquence de l’anomalie est environ deux fois plus élevée chez les mâles (5,1 p. 100) que chez les femelles (2,6 p. 100) et presque trois fois plus élevée, en moyenne, dans les lignées Piétrain que dans les lignées Large White. En faisant l’hypothèse que l’anomalie est due à une variable à seuil (le risque) et qu’elle n’apparaît que lorsque ce seuil est dépassé et en supposant que le...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SYNDROME DE L'ABDUCTION; MODELE MULTIFACTORIEL; PORCELET.
Ano: 1982 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20087537090&uri=/notices/prodinra1/2008/03/
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Expectation of variance due to mitochondrial genes from several mating designs Inra
Rothschild, M.F.; Ollivier, L..
La variation génétique due à l’ADN extra-nucléaire a généralement été ignorée en génétique animale. Des résultats récents confirment que l’hérédité mitochondriale est, d’une manière prédominante, d’origine maternelle chez les mammifères. Les progrès de la biotechnologie permettront vraisemblablement à l’avenir de manipuler le matériel nucléaire et extra-nucléaire de l’embryon. De ce fait, l’estimation de l’importance relative de la variation génétique directe, maternelle et mitochondriale peut servir à mieux évaluer l’intérêt de ces nouvelles techniques. Les espérances des composantes causales de variance dans des plans d’accouplements et d’adoptions croisées utilisés précédemment sont modifiées pour inclure la variation d’origine mitochondriale...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: HEREDITE MITOCHONDRIALE; VARIANCE; COVARIANCE GENETIQUE DIRECTES ET MATERNELLES.
Ano: 1987 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008fdc062b3&uri=/notices/prodinra1/2008/01/
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Experience de selection sur la croissance du tissu maigre chez le porc, avec des peres repetes : evolution genetique des caracteres soumis a la selection Inra
Canon, J.; Gruand, J.; Gutierrez, J.P.; Ollivier, L..
Une expérience de sélection sur la croissance du tissu maigre chez le porc Large White a été réalisée au centre d’insémination artificielle porcine de l’INRA à Rouillé (Vienne) entre 1965 et 1989. Au cours de cette période, 24 générations de verrats ont été sélectionnées sur un indice croissance-gras dorsal, et leurs descendances comparées à l’aide d’un dispositif expérimental de pères répétés. Cet article concerne l’analyse des 2 caractères mesurés sur les 2 987 verrats contrôlés au cours de l’expérience : le gain moyen quotidien (GMQ) de 30 à 80 (ou 85) kg de poids vif, et l’épaisseur moyenne du lard dorsal (LM) mesurée à 80 (ou 85) kg de poids vif. Un modèle mixte individuel univariate a été utilisé. Il inclut des effets de groupe génétique...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PERE REPETE; CROISSANCE MOLECULAIRE; MODELE INDIVIDUEL; EXPERIENCE DE SELECTION.
Ano: 1992 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300019292028814&uri=/notices/prodinra1/2007/12/
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Héritabilité réalisée pour la taille de portée dans la sélection de truies dites « hyperprolifiques » Inra
Le Roy, P.; Legault, C.; Gruand, J.; Ollivier, L..
Une expérience de sélection sur la prolificité est menée depuis 1973 au Centre d’Insémination Artificielle porcine de l’INRA, à Rouillé (Vienne). Une lignée de verrats Large White (appelés H) est créée par sélection de truies de prolificité extrême (dites « hyperprolifiques ») dans une grande population et accouplement de leur fils à d’autres truies hyperprolifiques de la même population. Par ce système de croisement en retour, répété chaque année, le niveau génétique espéré des verrats H atteint progressivement celui des femelles hyperprolifiques. L’efficacité de ce plan de sélection est évaluée par comparaison, dans des élevages de production, de filles de verrats H à des truies d’une autre lignée Large White, utilisée comme témoin (T). Au total,...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: HERITABILITE REALISEE; TAILLE DE PORTEE; EFFET MATERNEL.
Ano: 1987 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008c74cd9f9&uri=/notices/prodinra1/2011/02/
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Le déterminisme génétique de l’hypertrophie musculaire chez le Porc (*) Inra
Ollivier, L..
L’apparition du porc belge de Piétrain a suscité très tôt des spéculations quant à son origine Une hypothèse fréquemment avancée par les auteurs belges était que les éleveurs de Piétrain avaient détecté et sélectionné une mutation, car le développement musculaire exceptionnel de cette race pouvait difficilement s’expliquer par une sélection sur un caractère à déterminisme polygénique. Une expérience de croisement réalisée en France il y a une quinzaine d’annéessuggérait aussi l’existence d’un gène « majeur » responsable de l’hypertrophie musculaire du porc de Piétrain, telle qu’elle peut être jugée d’une part sur l’animal vivant par appréciation visuelle et d’autre part sur la carcasse soumise à une découpe. Enfin, la mise en évidence dans cette...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: DETERMINISME GENETIQUE; HYPERTROPHIE MUSCULAIRE; PORC DE PIETRAIN; CARTE CHROMOSOMIQUE; ENTITE.
Ano: 1980 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008b65d5141&uri=/notices/prodinra1/2008/04/
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Mass selection in livestock using limited testing facilities Inra
Ollivier, L..
Cet article traite de la maximisation du gain génétique annuel attendu en sélection massale quand la capacité de contrôle est limitée et ne permet pas de contrôler tous les candidats potentiels à la sélection. Dans une telle situation, on peut faire varier à la fois la proportion des reproducteurs sélectionnés sur leur résultat de contrôle et la répartition des places de contrôle entre les 2 sexes. Quand la capacité de contrôle est restreinte (cas 1), les mâles ont la priorité et le taux de sélection maximal à l’issue des contrôles est de 27%. Il vaut mieux alors utiliser des mâles non controlés, c’est-à-dire choisis au hasard, que des mâles se trouvant dans les 73% inférieurs. Cette situation prévaut tant que le rapport (k) des candidats contrôlés...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SELECTION MASSALE; REPONSE A LA SELECTION; INTENSITE DE SELECTION; INTERVALLE DE GENERATION.
Ano: 1990 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9100009638021860&uri=/notices/prodinra1/2007/12/
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On the use of animal models in the analysis of selection experiments Inra
Ollivier, L..
L’application du modèle animal à l’analyse des expériences de sélection permet en théorie une prise en compte de l’évolution des paramètres génétiques au cours de l’expérience. Des estimateurs explicites de l’héritabilité réalisée h2r (document ci-joint) sont présentés dans cet article pour le cas d’expériences de sélection sur une génération en dispositif équilibré. Des expressions sont données des espérances et des variances des estimateurs en fonction de l’héritabilité vraie, ainsi qu’une expression de la sensibilité des estimateurs à la valeur initiale de l’héritabilité. Cette sensibilité est généralement élevée, sauf pour des valeurs élevées de l’héritabilité vraie et/ou des tailles de famille très grandes. Cependant une méthode bayésienne...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: EXPERIENCE DE SELECTION; HERITABILITE REALISEE; MODELE ANIMAL BLUP; EVALUATION GENETIQUE.
Ano: 1999 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9900002342076083&uri=/notices/prodinra1/2007/07/
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Pig genetics : a review. Inra
Ollivier, L.; Sellier, P..
Une mise au point générale sur la génétique du porc est faite. Les principaux domaines couverts sont : caryotype et anomalies chromosomiques, couleur de la robe, anomalies héréditaires, résistance aux maladies, immunogénétique, polymorphismes biochimiques, « linkages » et synténies, caractères quantitatifs d’importance économique. Sur ce dernier point, une attention particulière est accordée aux influences connues de gènes marqueurs sur les caractères zootechniques. Des listes de gènes gouvernant la couleur de la robe, les groupes sanguins (antigènes érythrocytaires) et les variants électrophorétiques de protéines sériques et d’enzymes des cellules sanguines sont présentées dans des tableaux. Une liste de 29 anomalies génétiques qui peuvent être...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PORC; CARYOTYPE; CHROMOSOME; MARQUEUR.
Ano: 1982 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200871057e9f&uri=/notices/prodinra1/2008/03/
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Sélection sur la prolificité chez le porc. I. Résultats d’une expérience de sélection sur onze générations Inra
Bolet, G.; Ollivier, L.; Dando, P..
Une expérience de sélection a été entreprise par l’INRA en 1965 en vue d’évaluer la possibilité d’augmenter la prolificité du porc, en utilisant comme critère de sélection le nombre total (NT) de porcelets nés dans les deux premières portées de la truie. A partir d’une population de base de 10 mâles et 120 femelles de race Large White, 2 lignées ont été constituées, une lignée sélectionnée sur la prolificité maternelle intra-famille de père et une lignée témoin maintenue sans sélection. Une réponse faible et non significative de 0,024 ± 0,077 porcelet par génération pour NT a été obtenue sur les 11 générations de l’expérience avec une héritabilité réalisée pour NT de 0,04 ± 0,13. L’estimation obtenue par régression mère-fille (0,03 ± 0,08) est...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RACE PORCINE; FERTILITE; PROLIFICITE; EXPERIENCE DE SELECTION; PARAMETRE GENETIQUE.
Ano: 1989 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008d3179b0a&uri=/notices/prodinra1/2011/02/
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Theoretical aspects of applying sib-pair linkage tests to livestock species Inra
Gotz, K.; Ollivier, L..
Dans sa forme originelle, le test de liaison génétique de Haseman-Elston (HE), basé sur les couples de germains, est simple à calculer, mais statistiquement peu puissant. Avec des marqueurs hautement polymorphes, l’utilisation exclusive d’accouplements totalement informatifs (ie des accouplements permettant d’établir avec certitude le nombre de gènes d’origine identique pour n’importe quel couple de germains) peut être envisagée. Cet article examine, à l’aide de simulations, l’effet d’un système génétique hautement polymorphe (5 allèles également fréquents), d’une grande taille de fratrie (6 germains) et d’une structure d’élevage polygynique (25 femelles accouplées à chaque mâle) sur la puissance du test HE. Les simulations sont faites en supposant...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: LIAISON GENETIQUE; CARACTERE QUANTITATIF; POLYMORPHISME; BETAIL.
Ano: 1992 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300032578028489&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Une méthode générale d’estimation des paramètres génétiques dans un échantillon sélectionné, avec une application à une sélection sur un indice à trois caractères Inra
Ollivier, L.; Derrien, A..
L’estimation des paramètres génétiques d’une population, héritabilités et corrélations génétiques, à partir d’un échantillon repose sur de nombreuses hypothèses, qui concernent tant la population elle-même que l’échantillon qu’on en tire. La principale condition à laquelle doit satisfaire l’échantillon est d’être aléatoire, ce qui n’est pas le cas lorsque les individus mesurés, ou leurs parents, sont sélectionnés, situation fréquente chez les animaux d’élevage. Dans ce cas, les estimations obtenues par les techniques classiques de régression et d’analyse de variance peuvent être faussées et des corrections sont nécessaires pour tenir compte de la sélection. Lorsque la sélection se fait sur plusieurs caractères simultanément, combinés par exemple...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PARAMETRES GENETIQUES; ECHANTILLON SELECTIONNE; APPLICATION.
Ano: 1981 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008dee56ebd&uri=/notices/prodinra1/2008/05/
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Utilisation de la resistance genetique a la colibacillose K88 dans les schemas d'amelioration genetique du porc Inra
Ollivier, L.; Renjifo, X..
Les diarrhées colibacillaires, notamment celles dues à des souches d’E coli entéropathogènes pourvues de l’antigène K88, sont une cause majeure de mortalité chez le porcelet nouveau-né. L’existence d’une résistance génétique, liée à plusieurs marqueurs biochimiques, dont les bases sont brièvement rappelées ici, permet d’envisager de réduire par sélection l’incidence économique de la maladie. Cet article présente les conditions dans lesquelles une telle sélection pourrait s’intégrer dans les schémas courants d’amélioration génétique du porc. La plupart des populations porcines manifestent un polymorphisme pour les gènes de résistance à la colibacillose K88. Dans une population exposée à cette maladie, la mortalité du porcelet dépend de la fréquence...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RESISTANCE GENETIQUE AUX MALADIES; COLLIBACILLE; SCHEMA DE CROISEMENT; SELECTION NATURELLE.
Ano: 1991 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9200008923026516&uri=/notices/prodinra1/2007/12/
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