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Análise da diversidade genética e estruturação populacional entre marcadores SSRs e SNPs em germoplasma de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
FARIA, B. M. S. de; MENEZES, I. P. P. de; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi avaliar o poder de informação genética dos marcadores SSRs e SNPs para aplicações no melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Germoplasma; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964150
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Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: isolation, RFLP marker development, and physical mapping. Repositório Alice
MILLER, R. N. G.; BERTIOLI, D. J.; BAURENS, F. C.; SANTOS, C. M. R.; ALVES, P. C.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J..
bitstream/item/177893/1/SP-19674-ID-30995.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Musa acuminata Colla; Banana; Doença; Praga; Resistência.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190719
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Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata VAR. Calcutta 4, An. Repositório Alice
MILLER, R. N. G; ALVES, P. C. S.; SANTOS, C. M. R.; COELHO, M. C. F.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; BERTIOLI, D. J..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento vegetal.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/186589
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Analysis of the leaf transcriptome of Musa acuminata during interaction with Mycosphaerella musicola: gene assembly, annotation and marker development. Repositório Alice
PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. O. de; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C. de; AZEVEDO, V. C. R.; BRASILEIRO, A. C. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MILLER, R. T N. G..
Background: Although banana (Musa sp.) is an important edible crop, contributing towards poverty alleviation and food security, limited transcriptome datasets are available for use in accelerated molecular-based breeding in this genus. 454 GS-FLX Titanium technology was employed to determine the sequence of gene transcripts in genotypes of Musa acuminata ssp. burmannicoides Calcutta 4 and M. acuminata subgroup Cavendish cv. Grande Naine, contrasting in resistance to the fungal pathogen Mycosphaerella musicola, causal organism of Sigatoka leaf spot disease. To enrich for transcripts under biotic stress responses, full length-enriched cDNA libraries were prepared from whole plant leaf materials, both uninfected and artificially challenged with pathogen...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Banana; Fungo; Musa Acuminata; Mycosphaerella Musicola; Transcriptome; Microsatellite repeats.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/964212
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Desenvolvimento e análise de polimorfismo de microssatélites tetra e pentanucleotídeos em três espécies de Eucalyptus. Repositório Alice
SANSALONI, C. P.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Eucalyptus; Polimorfismo; Microssatélites tetra; Pentanucleotídeos.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188535
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Genetic variation and recombination of RdRp and HSP 70h genes of Citrus tristeza virus isolates from orange trees showing symptoms of citrus sudden death disease. Repositório Alice
GOMES, C. P. C.; NAGATA, T.; JESUS JÚNIOR, W. C. de, BORGES NETO, C. R.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; MARTIN, D. P..
bitstream/item/177890/1/SP-19685-ID-31027.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus tristeza; Orange; Laranja; Variação Genética.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190757
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Genome-wide discovery and validation of Eucalyptus small RNAs reveals variable patterns of conservation and diversity across species of Myrtaceae. Repositório Alice
PAPPAS, M. de C. R.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Deep sequencing; Eucalyptus; Genome mapping; Interspecific variability; Micro RNAs; Myrtaceae; Small RNAs.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037850
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Mapeamento de microssatélites derivados de EST em cruzamentos intra e interespecíficos de Eucalyptus. Repositório Alice
SENA, J. S.; PÁDUA, J. G.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Eucalyptus; Mapeamento de microssatélites.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188563
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Spring is coming: genetic analyses of the bud break date locus reveal candidate genes from the cold perception pathway to dormancy release in apple (Malus x domestica Borkh.) Repositório Alice
MIOTTO, Y. E.; TESSELE, C.; CZERMAINSKI, A. B. C.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. da S.; SARTOR, T.; CATTANI, A. M.; DELATORRE, C. A.; ALENCAR, S. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRYNBERG, P.; OLIVEIRA, P. R. D. de; KVITSCHAL, M. V.; DENARDI, F.; BUFFON, V.; REVERS, L. F..
Chilling requirement (CR) for bud dormancy completion determines the time of bud break in apple (Malus × domestica Borkh.). The molecular control of bud dormancy is highly heritable, suggesting a strong genetic control of the trait. An available Infinium II SNP platform for genotyping containing 8,788 single nucleotide polymorphic markers was employed, and linkage maps were constructed in a F1 cross from the low CR M13/91 and the moderate CR cv. Fred Hough. These maps were used to identify quantitative trait loci (QTL) for bud break date as a trait related to dormancy release. A major QTL for bud break was detected at the beginning of linkage group 9 (LG9). This QTL remained stable during seven seasons in two different growing sites. To increase mapping...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bud dormancy; Linkage mapping; MdoFLC; MdoICE1; MdoPRE1; Apples; Chilling requirement.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1109789
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Spring is coming: genetic analyses of the bud break date locus reveal candidate genes from the cold perception pathway to dormancy release in apple (Malus x domestica Borkh.) Repositório Alice
MIOTTO, Y. E.; TESSELE, C.; CZERMAINSKI, A. B. C.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. da S.; SARTOR, T.; CATTANI, A. M.; DELATORRE, C. A.; ALENCAR, S. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRYNBERG, P.; OLIVEIRA, P. R. D. de; KVITSCHAL, M. V.; DENARDI, F.; BUFFON, V.; REVERS, L. F..
bitstream/item/195614/1/fpls-10-00033.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bud dormancy; Linkage mapping; MdoFLC; MdoICE1; MdoPRE1; Apples; Chilling requirement.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108014
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Transcription profile of soybean-root-knot nematode interaction reveals a key role of phythormones in the resistance reaction. Repositório Alice
BENEVENTI, M. A.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SÁ, M. E. L. de; FIRMINO, A. A. P.; AMORIM, R. M. S. de; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, M. C. M. da; SILVA, J. P. da; CAMPOS, M. de A.; LOPES, M. J. C.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GROSSI DE SÁ, M. F..
bitstream/item/156230/1/art3A10.11862F1471-2164-14-322.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Root-knot nematode; Pyrosequencing; Plant?pathogen interaction; Hormone; Glycine Max; Transcriptome.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/979805
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Transcriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development. Repositório Alice
SILVA, D. C. da; FALAVIGNA, V. da S.; FASOLI, M.; BUFFON, V.; PORTO, D. D.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEZZOTTI, M.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F..
The Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Proteina; Vitis vinifera L; Análise fitogenética; Variação genética; Uva; Genética; Gene; Gene; Grapevine; Phylogenetic analysis; Sequences.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1062145
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Transcriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development. Repositório Alice
SILVA, D. C. da; FALAVIGNA, V. da S.; FASOLI, M.; BUFFON, V.; PORTO, D. D.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEZZOTTI, M.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F..
The Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Videira; Corvina; Pinot Noir; Desenvolvimento da semente; Uva; Genética; Gene; Conservação; Gene; Grapevine; Diversification of grapevine; Flower; Berry; Seed development.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1061878
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Transcriptome analysis in cotton Boll Weevil (Anthonomus grandis) and RNA interference in insect pests. Repositório Alice
FIRMINO, A. A. P.; FONSECA, F. C. de A.; MACEDO, L. L. P. de; COELHO, R. R.; SOUZA JÚNIOR, J. D. A. de; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA, M. C. M. da; ENGLER, G.; GROSI DE SÁ, M. F..
bitstream/item/156236/1/journal.pone.0085079.PDF
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Anthonomus Grandis; Cotton.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/979898
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