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Caracterização molecular de cultivares de cebola com marcadores microssatélites PAB
Santos,Carlos Antonio Fernandes; Oliveira,Valter Rodrigues; Rodrigues,Marciene Amorim; Ribeiro,Hugo Leonardo Coelho.
O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. Para visualização da similaridade genética, utilizou-se o dendrograma UPGMA gerado da matriz de distâncias do coeficiente de Jaccard, com base em 40 alelos de 13 locos SSR. O DNA total foi extraído pelo método CTAB 2x, e os produtos de PCR foram analisados em géis de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. O número de pares de bases foi estimado pelo método da mobilidade inversa, com base em regressão de produtos de tamanho conhecido. A média da heterozigosidade dos locos SSR foi 0,58. Os 40 alelos dos 13 locos SSR foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Allium cepa; Dendrograma; Similaridade; SSR.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000100007
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Marker-assisted selection of maintainer lines within an onion tropical population Scientia Agricola
Santos,Carlos Antonio Fernandes; Leite,Daniela Lopes; Oliveira,Valter Rodrigues; Rodrigues,Marciene Amorim.
The traditional onion (Allium cepa) hybrid production requires the development of maintainer and male sterile lines and also a pollinator line with good specific combination ability. We report the identification of maintainer and male-sterile onion lines within the Brazilian 'Baia Periforme' derived population, 'Alfa São Francisco', associating random field pairing of male-fertile plants with selected male-sterile plants and PCR-based marker system monitoring S, T and N-cytoplasms. Male-sterile plants produced flowers with light green anthers which were easily detected in the field. A frequency of 2.0% of male-sterile plants was estimated in the 'Alfa São Francisco' sampled population. Male-sterile plants produced the 5'cob-marker 180-bp and the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Allium cepa; CMS; 'Alfa São Francisco'; Tropical hybrid.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162010000200015
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Preliminary characterization of Psidium germplasm in different Brazilian ecogeographic regions PAB
Santos,Carlos Antonio Fernandes; Castro,José Mauro da Cunha e; Souza,Flavio de França; Vilarinho,Aloísio Alcântara; Ferreira,Francisco Ricardo; Pádua,Juliano Gomes; Borges,Rita Mércia Estigarribia; Barbieri,Rosa Lia; Souza,Aparecida das Graças Claret de; Rodrigues,Marciene Amorim.
The objective of this work was to characterize 119 accessions of guava and 40 accessions of "araçá" sampled in 35 Brazilian ecoregions, according to the International Union for the Protection of New Varieties of Plants (UPOV) descriptors. The majority of "araçá" accessions presented wide spacing of leaf veins, while guava accessions presented medium to close spacing. Most fruits of "araçá" accessions were classified as small, contrasting with medium to large fruits of guava accessions. Most of "araçá" accessions (91%) presented white flesh fruit color, while 58% of guava accessions presented pale pink, pink and dark pink colors. Fruit differences among wild and cultivated Psidium species indicate fruit as the most altered trait under artificial selection.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Psidium guajava; Araçá; Guava.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000300020
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Similaridade genética de acessos de mangueira de diferentes origens geográficas avaliadas por marcadores AFLP Rev. Bras. Frutic.
Santos,Carlos Antonio Fernandes; Lima Neto,Francisco Pinheiro; Rodrigues,Marciene Amorim; Costa,João Gomes da.
As relações genéticas de 105 acessos de diferentes origens geográficas do banco de germoplasma de mangueira da Embrapa foram determinadas com base no marcador AFLP, de forma a orientar trabalhos de melhoramento e manejo de recursos genéticos da espécie para a região Semi-Árida brasileira. Foram ainda incluídos dois acessos de duas espécies do gênero Mangifera, como "outgroup". O DNA dos acessos foi extraído pelo método do CTAB, as reações de AFLP foram realizadas para os iniciadores EcoRI/MseI e as bandas polimórficas foram analisadas para construção de fenograma, baseando-se no coeficiente de similaridade de Jaccard. Foram obtidas 157 e 54 bandas de AFLP polimórficas e monomórficas, respectivamente, em 13 combinações de iniciadores. O valor co-fenético do...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mangifera indica; Divergência; Germoplasma de manga.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452008000300029
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Similaridade genética entre acessos de goiabeiras e araçazeiros baseada em marcadores moleculares AFLP Rev. Bras. Frutic.
Corrêa,Luiz Claudio; Santos,Carlos Antonio Fernandes; Lima,Giuseppina Pace Pereira; Rodrigues,Marciene Amorim; Costa,Tuany Priscila Pereira.
Espécies do gênero Psidium, como goiabeira e araçazeiros, são economicamente importantes e têm como área de diversidade genética primária o Brasil. Foram determinadas as relações genéticas, com base no marcador AFLP, para acessos do Banco Ativo de Germoplasma (BAG) de Psidium da Embrapa Semiárido, para orientar trabalhos de melhoramento e de manejo de recursos genéticos do gênero. Foram analisados 88 acessos, sendo 64 de goiabeira e 24 de araçazeiros, coletados em dez Estados brasileiros, adotando-se para agrupamento o dendrograma UPGMA, considerando a matriz de similaridade do coeficiente de Jaccard de 149 bandas polimórficas de AFLP de 16 combinações dos iniciadores EcoRI e MseI. A análise da variância de dados moleculares foi realizada considerando a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Psidium; Banco ativo de germoplasma; Melhoramento vegetal; AMOVA.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452011000300021
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Variabilidade genética do umbuzeiro no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP PAB
Santos,Carlos Antonio Fernandes; Rodrigues,Marciene Amorim; Zucchi,Maria Imaculada.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a distribuição da variabilidade genética do umbuzeiro (Spondias tuberosa), no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP, para subsidiar estratégias de prospecção e conservação da espécie. Foram analisados 68 indivíduos de umbuzeiro de 15 ecorregiões, pelo dendrograma UPGMA e pela dispersão em escala multidimensional (MDS), com o coeficiente de Jaccard de 141 bandas polimórficas de AFLP. A análise da variância molecular foi realizada pela decomposição total entre e dentro das regiões ecogeográficas. O dendrograma apresentou valor cofenético de 0,96, e o gráfico MDS apresentou 0,25 para a falta de ajustamento. A variabilidade genética do umbuzeiro foi estimada em 0,3138, o que indica grande variação entre os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Spondias tuberosa; Análise multivariada; Análise de variância molecular; Dendrograma; Escala multidimensional.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000800013
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