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De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Repositório Alice
SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M..
Acidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: RNA sequencing; Urochloa genus; Aluminum; Brachiaria decumbens; Molecular markers.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079489
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De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Repositório Alice
SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de A.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA. R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L..
bitstream/item/166628/1/Nepomuceno-plant-2017.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Brachiaria decumbens; Graminea forrageira; Sequence analysis; Genetic markers; Urochloa decumbens.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079563
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Família defensiva de peptídeos antimicrobianos em Urochloa. Repositório Alice
SHIRAKAWA, K. T.; CHIARI, L.; PEREIRA, R. M..
O capim-braquiária é muito utilizado no Brasil, principalmente no cerrado, como forrageira devido a sua alta adaptabilidade a variados solos, como solos ácidos ou pobres em nutrientes; e apresenta alta cobertura e produção de biomassa. Os peptídeos antimicrobianos são moléculas proteicas pequenas produzidas por todos os seres vivos como parte do sistema imune inato para combater infecções e patógenos. Peptídeos antimicrobianos vegetais possuem um amplo espectro de atividades antimicrobianas contra fitopatógenos e a grande maioria deles é ativa contra fungos, enquanto alguns são inibidores de bactérias e insetos herbívoros. Deste modo, o objetivo deste trabalho foi verificar e identificar a presença de peptídeos antimicrobianos da família das defensinas em...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Transcriptoma; AMPs; Gramínea.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1012042
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