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A novel genome-wide microsatellite resource for species of Eucalyptus with linkage-to-physical correspondence on the reference genome sequence. Repositório Alice
GRATTAPAGLIA, D.; MAMANI, E. M. C.; SILVA JUNIOR, O. B.; FARIA, D. A..
bitstream/item/137574/1/Grattapaglia-et-al-2015-Molecular-Ecology-Resources.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Ancestry informative markers; Microsatellites; Simple sequence repeats; Eucalyptus Grandis; Eucalyptus globulus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1034895
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Descoberta e genotipagem de SNPs em cajueiro via sequencimento de representações genômicas reduzidas. Repositório Alice
SILVA JUNIOR, O. B.; LIRA, M.; BUSO, G. S. C.; AMARAL, Z. P. S.; GRATTAPAGLIA, D..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise molecular; SNPs; SSR.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002751
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Quantitative genetic parameters for growth and wood properties in Eucalyptus 'urograndis' hybrid using near-infrared phenotyping and genome-wide SNP-based relationships. Repositório Alice
LIMA, B. M. de; CAPPA, E. P.; SILVA JUNIOR, O. B.; GARCIA, C.; MANSFIELD, S. D.; GRATTAPAGLIA, D..
bitstream/item/201801/1/journal.pone.0218747.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetic Research; Genomics; Cellulose.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1112117
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Root transcriptome analysis of wild peanut reveals candidate genes for nematode resistance. Repositório Alice
GUIMARAES, P. M.; GUIMARAES, L. A.; MORGANTE, C. V.; SILVA JUNIOR, O. B.; ARAUJO, A. C. G.; MARTINS, A. C. Q.; SARAIVA, M. A. P.; OLIVEIRA, T. N.; TOGAWA, R. C.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; BERTIOLI, D. J.; BRASILEIRO, A. C. M..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arachis hypogaea; Peanut.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1030792
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Root transcriptome analysis of wild peanut reveals candidate genes for nematode resistance. Repositório Alice
GUIMARAES, P. M.; GUIMARAES, L. A.; MORGANTE, C. V.; SILVA JUNIOR, O. B.; ARAUJO, A. C. G.; MARTINS, A. C. Q.; SARAIVA, M. A. P.; OLIVEIRA, T. N.; TOGAWA, R. C.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; BERTIOLI, D. J.; BRASILEIRO, A. C. M..
Wild peanut relatives (Arachis spp.) are genetically diverse and were adapted to a range of environments during the evolution course, constituting an important source of allele diver-sity for resistance to biotic and abiotic stresses. The wild diploid A.stenosperma harbors high levels of resistance to a variety of pathogens, including the root-knot nematode (RKN)Meloidogyne arenaria through the onset of the Hypersensitive Response (HR). In order to identify genes and regulators triggering this defense response, a comprehensive root tran-scriptome analysis during the first stages of this incompatible interaction was conducted using Illumina Hi-Seq. Overall, eight cDNA libraries were produced generating 28.2 GB, which were de novo assembled into 44,132...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arachis hypogaea; Diplóide selvagem; Nematóide das galhas; Gene regulador; Planta resistente; Peanut; Melhoramento de planta; Peanut relatives; Arachis spp.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035460
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Sugarcane giant borer transcriptome analysis and identification of genes related to digestion. Repositório Alice
FONSECA, F. C. de A.; FIRMINO, A. A. P.; MACEDO. L. L. P. de; COELHO, R. R.; SOUSA JÚNIOR, J. D. A. de; SILVA JUNIOR, O. B.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GÓIS, L. A. B. de; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de.
Sugarcane is a widely cultivated plant that serves primarily as a source of sugar and ethanol. Its annual yield can be significantly reduced by the action of several insect pests including the sugarcane giant borer (Telchin licus licus), a lepidopteran that presents a long life cycle and which efforts to control it using pesticides have been inefficient. Although its economical relevance, only a few DNA sequences are available for this species in the Gen-Bank. Pyrosequencing technology was used to investigate the transcriptome of several developmental stages of the insect. To maximize transcript diversity, a pool of total RNA was extracted from whole body insects and used to construct a normalized cDNA database. Sequencing produced over 650,000 reads,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Broca gigante; Praga; Controle biológico.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1023363
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The genome of Eucalyptus grandis. Repositório Alice
MYBURG, A. A.; GRATTAPAGLIA, D.; TUSKAN, G. A.; HELLSTEN, U.; HAYES, R. D.; GRIMWOOD, J.; JENKINS, J.; LINDQUIST, E.; BAUER, D.; BAUER, D.; GOODSTEIN, D. M.; DUBCHAK, I.; POLIAKOV, A.; MIZRACHI, E.; KULLAN, A. R. K.; HUSSEY, S. G.; PINARD, D.; MERWE, K. van der; SINGH, P.; JAARSVELD, I. van; SILVA JUNIOR, O. B.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS, M. R.; FARIA, D. A.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; YANG, X.; RANJAN, P.; TSCHAPLINSKI, T. J.; YE, C.-Y.; LI, T.; STERCK, L.; VANNESTE, K.; MURAT, F.; SOLER, M.; SAN CLEMENTE, H.; SAIDI, N.; CASSAN-WANG, H.; DUNAND, C.; HEFER, C. A.; BORNBERG-BAUER, E.; KERSTING, A. R.; VINING, K.; AMARASINGHE, V.; RANIK, M.; NAITHANI, S.; ELSER, J.; BOYD, A. E.; LISTON, A.; SPATAFORA, J. W.; DHARMWARDHANA, P.; RAJA, R.; SULLIVAN, C.; ROMANEL, E.; ALVES-FERREIRA, M.; KULHEIM, C.; FOLEY, W.; CAROCHA, V.; PAIVA, J.; KUDRNA, D.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PASQUALI, G.; BYRNE, M.; RIGAULT, P.; SPOKEVICIUS, A.; JONES, R. C.; STEANE, D. A.; VAILLANCOURT, R. E.; POTTS, B. M.; JOUBERT, F.; BARRY, K.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; STRAUSS, S. H.; JAISWAL, P.; GRIMA-PETTENATI, J.; SALSE, J.; PEER, Y. van de; ROKHSAR, D. S.; SCHMUTZ, J..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Eucalyptus grandis; Secondary metabolism; Genome evolution; Phylogenomics; Biofuels.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006198
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