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Análise bayesiana de modelos trivariados linear e Poisson na avaliação genética do tamanho de leitegada em suínos de raça Landrace. Repositório Alice
VENTURA, H. T.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S.; FIGUEIREDO, E. A. P. de.
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética; Reprodução; Cadeia de Markov-Monte Carlo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/937742
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Armazenamento de goiabas 'Paluma' sob refrigeração e em condição ambiente, com e sem tratamento com cera de carnaúba. Repositório Alice
RIBEIRO, V. G.; ASSIS, J. S. de; SILVA, F. F.; SIQUEIRA, P. P. X.; VILARONGA, C. P. P..
Objetivou-se com o presente trabalho avaliar os efeitos de coberturas de cera de carnaúba Premium citrus na conservação de goiabas 'Paluma', armazenadas sob refrigeração e em condição ambiente, pelo período de 12 dias. As características avaliadas foram perda de massa, dfeterioração, teores de sólidos solúveis totais (SST), acidez titulável (AT), teor de ácido ascórbico, clorofila total e firmeza da polpa. Revestimento com cera de carnaúba diminuiu a perda de massa e a degradação de clorofila das goiabas, contudo sua aplicação propiciou aumento de vida útil apenas para as frutas mantidas sob condição ambiente.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Amadurecimento; Guava; Postharvest; Goiaba; Pós-Colheita; Psidium Guajava.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/156699
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Características e estabilidade no armazenamento de sucos tropicais mistos com elevada capacidade antioxidante. Infoteca-e
WURLITZER, N. J.; DIONISIO, A. P.; LIMA, J. R.; BORGES, M. de F.; GARRUTI, D. dos S.; BARROS, M. E. S.; MODESTO, A. L. G.; ARAUJO, I. M. da S.; NASCIMENTO, M. L. C. do; PAIVA, M. S. L.; SILVA, F. F..
2016
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Suco; Frutas tropicais; Vida-de-prateleira; Capacidade antioxidante total; Suco; Frutas tropicais; Vida-de-prateleira; Capacidade antioxidante total.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1058504
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Comparison of dimensionality reduction methods to predict genomic breeding values for carcass traits in pigs. Repositório Alice
AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; GLÓRIA, L. S..
A significant contribution of molecular genetics is the direct use of DNA information to identify genetically superior individuals. With this approach, genome-wide selection (GWS) can be used for this purpose. GWS consists of analyzing a large number of single nucleotide polymorphism markers widely distributed in the genome; however, because the number of markers is much larger than the number of genotyped individuals, and such markers are highly correlated, special statistical methods are widely required. Among these methods, independent component regression, principal component regression, partial least squares, and partial principal components stand out. Thus, the aim of this study was to propose an application of the methods of dimensionality reduction...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Quadrados mínimos parciais; Componente de regressão independente; Componente principal de regressão; Componente principal parcial; Partial least squares; Independent component regression; Principal component regression; Partial principal component.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030362
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Diferentes embalagens e ambientes na conservação de sementes de pinhão-manso. Repositório Alice
ANDREO-SOUZA, Y.; OLIVEIRA, D. A. B.; LIRA, M. A. P.; PEREIRA, A. L.; ARAÚJO, M. N.; SILVA, P. P.; REIS, R. C. R.; SILVA, F. F.; DANTAS, B. F..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pinhão-manso; Semente; Armazenamento; Conservação; Embalagem.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662164
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Effective procedures for the determination of As, Cd, Cu, Fe, Hg, Mg, Mn, Ni, Pb, Se, Th, Zn, U and rare earth elements in plants and foodstuffs. Repositório Alice
PANIZ, F. P.; PEDRON, T.; FREIRE, B. M.; TORRES, D. P.; SILVA, F. F.; BATISTA, B. L..
bitstream/item/194977/1/Daiane-Placido-15-AM-2018-plants-foodstuff-RRE-final.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Earth elements in plants.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107467
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Effects of using phenotypic means and genotypic values in GGE biplot analyses on genotype by environment studies on tropical maize (Zea mays). Repositório Alice
GRANATO, I. S. C.; FRITSCHE-NETO, R.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F..
The objective of this study was to examine the effects of the type and intensity of nutritional stress, and of the statistical treatment of the data, on the genotype x environment (G x E) interaction for tropical maize (Zea mays). For this purpose, 39 hybrid combinations were evaluated under low- and high-nitrogen and -phosphorus availability. The plants were harvested at the V6 stage, and the shoot dry mass was estimated. The variance components and genetic values were assessed using the restricted maximum likelihood/best linear unbiased prediction method, and subsequently analyzed using the GGE biplot method. We observed differences in the performances of the hybrids depending on both the type and intensity of nutritional stress. The results of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Maize; Nitrogen-use efficiency; Phosphorous-use efficiency; Mixed model; Principal component; Modelo mixto; Zea mays; Milho; Nutriente mineral; Corn; Nutrient use efficiency.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072717
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Epigenética: mecanismos, herança e implicações no melhoramento animal. Repositório Alice
PAIVA, J. T.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, R. T.; OLIVEIRA, H. R.; SILVA, H. T.; CAETANO, G. C.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F..
A epigenética é definida como mudanças na expressão gênica que podem ser herdadas e que não alteram a sequência do DNA. Existem dois mecanismos epigenéticos principais, a metilação do DNA e a modificação de histonas. Também se destaca o imprinting genômico, o qual está relacionado com a regulação gênica quando apenas um alelo (herdado do pai ou da mãe) se expressa. A herança epigenética transgeracional consiste da herança de marcas epigenéticas através de células germinativas, que controla os padrões de expressão gênica e são passados de uma geração para a outra. Dentro do programa de melhoramento animal é importante avaliar a extensão com que a herança epigenética transgeracional também afeta a eficiência da seleção. Uma melhor compreensão dos mecanismos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Epigenoma; Expressão gênica; Histona; Transgeracional; Epigenome; Transgenerational; Metilação; Melhoramento Genético Animal; Gene expression; Methylation; Histones.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110162
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Estimação de parâmetros genéticos para tamanho de leitegada em suínos da raça Landrace com a utilização de um modelo tricaracterístico. Repositório Alice
VENTURA, H. T.; LOPES, P. S.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; SILVA, F. F..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética; Suíno; Leitegada; Landrace; Reprodução.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/937737
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Estimating additive and dominance variances for complex traits in pigs combining genomic and pedigree information. Repositório Alice
COSTA, E. V.; DINIZ, D. B.; VERONEZE, R.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; GUIMARÃES, S. E. F.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S..
Knowledge of dominance effects should improve genetic evaluations, provide the accurate selection of purebred animals, and enable better breeding strategies, including the exploitation of heterosis in crossbreeds. In this study, we combined genomic and pedigree data to study the relative importance of additive and dominance genetic variation in growth and carcass traits in an F2 pig population. Two GBLUP models were used, a model without a polygenic effect (ADM) and a model with a polygenic effect (ADMP). Additive effects played a greater role in the control of growth and carcass traits than did dominance effects. However, dominance effects were important for all traits, particularly in backfat thickness. The narrow-sense and broad-sense heritability...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; Seleção genômica ampla; Métodos de seleção; Herdabilidade; Dominance; Genetic parameters; Polygenic effect; Piau pigs.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1021860
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Genomic prediction for additive and dominance effects of censored traits in pigs. Repositório Alice
SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; SILVA, F. F..
Age at the time of slaughter is a commonly used trait in animal breeding programs. Since studying this trait involves incomplete observations (censoring), analysis can be performed using survival models or modified linear models, for example, by sampling censored data from truncated normal distributions. For genomic selection, the greatest genetic gains can be achieved by including non-additive genetic effects like dominance. Thus, censored traits with effects on both survival models have not yet been studied under a genomic selection approach. We aimed to predict genomic values using the Cox model with dominance effects and compare these results with the linear model with and without censoring. Linear models were fitted via the maximum likelihood method....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: GBLUP; Modelo mixto; Censored data; Mixed model; Survival models; Porco; Suíno; Swine; Animal breeding.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072712
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Genomic selection for slaughter age in pigs using the Cox frailty model. Repositório Alice
SANTOS, V. S.; MARTINS FILHO, S.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARAES, S. E. F.; GLORIA, L. S.; SILVA, F. F..
The aim of this study was to compare genomic selection methodologies using a linear mixed model and the Cox survival model. We used data from an F2 population of pigs, in which the response variable was the time in days from birth to the culling of the animal and the covariates were 238 markers [237 single nucleotide polymorphism (SNP) plus the halothane gene]. The data were corrected for fixed effects, and the accuracy of the method was determined based on the correlation of the ranks of predicted genomic breeding values (GBVs) in both models with the corrected phenotypic values. The analysis was repeated with a subset of SNP markers with largest absolute effects. The results were in agreement with the GBV prediction and the estimation of marker effects...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Dado censurado; Modelo mixto; Polimorfismo; Censured data; Mixed model; Polymorphism.
Ano: 2015 URL: http://dx.doi.org/10.4238/2015.October.19.5
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Genotype by environment interaction for tick resistance of Hereford and Braford beef cattle using reaction norm model. Repositório Alice
MOTA, R. R.; TEMPELMAN, R. J.; LOPES, P. S.; AGUILAR, I.; SILVA, F. F.; CARDOSO, F. F..
The cattle tick is a parasite that adversely affects livestock performance in tropical areas. Although countries such as Australia and Brazil have developed genetic evaluations for tick resistance, these evaluations have not considered genotype by environment (G*E) interactions. Genetic gains could be adversely affected, since breed-stock comparisons are environmentally dependent on the presence of G*E interactions, particularly if residual vari-ability is also heterogeneous across environments. The objective of this study was to infer upon the existence of G*E interactions for tick resistance of cattle based on various models with different assumptions of genetic and residual variability.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bovino; Gado de corte; Gado Hereford; Carrapato.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039996
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Influência de diferentes níveis de secagem em sementes de pinhão manso. Repositório Alice
ANDRÉO-SOUZA, Y.; LIRA, M. A. P.; OLIVEIRA, D. A. B.; PEREIRA, A. L.; ARAÚJO, M. N.; SILVA, P. P.; REIS, R. C. R.; SILVA, F. F.; DANTAS, B. F..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pinhão-manso; Semente; Qualidade fisiológica; Secagem.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662167
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Multi-trait and repeatability models for genetic evaluation of litter traits in pigs considering different farrowings. Repositório Alice
COSTA, E. V.; VENTURA. H. T.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; SILVA, F. F.; GLÓRIA, L. S.; GODINHO, R. M.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S..
Abstract: We aimed to compare multi-trait and repeatability models to estimate genetic parameters for the traits number of piglets born alive (NBA) and alive at 3 week of age (NP3), litter weight at birth (LW0) and at 3 week of age (LW3), and mean piglet weight at birth (MW0) and at 3 week of age (MW3), considering the first three farrowings of Landrace sows. Heritability (h2) estimates showed an increasing pattern up to the third farrowing for LW0 and MW3. For NBA, NP3, LW3, and MW0 h2 increased from the first to the second and decreased from the second to the third farrowing. In general, heritability estimated in the repeatability model was lower than the mean of the estimates in the multi-trait model. The traits LWO, MW0, and MW3 presented high genetic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pig; REML; Melhoramento genético animal; Suíno; Parâmetro genético; Swine; Animal breeding.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060926
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Multi-trait BLUP model indicates sorghum hybrids with genetic potential for agronomic and nutritional traits. Repositório Alice
ALMEIDA FILHO, J. E.; TARDIN, F. D.; GUIMARAES, J. F. R.; RESENDE, M. D. V.; SILVA, F. F.; SIMEONE, M. L. F.; MENEZES, C. B. de; QUEIROZ, V. A. V..
The breeding of sorghum, Sorghum bicolor (L.) Moench, aimed at improving its nutritional quality, is of great interest, since it can be used as a highly nutritive alternative food source and can possibly be cultivated in regions with low rainfall. The objective of the present study was to evaluate the potential and genetic diversity of grain-sorghum hybrids for traits of agronomic and nutritional interest. To this end, the traits grain yield and flowering, and concentrations of protein, potassium, calcium, magnesium, sulfur, iron, manganese, and zinc in the grain were evaluated in 25 grain-sorghum hybrids, comprising 18 experimental hybrids of Embrapa Milho e Sorgo and seven commercial hybrids. The genetic potential was analyzed by a multi-trait best...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Biofortificação; Modelo misto; Sorghum bicolor; Biofortification.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1043468
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New accuracy estimators for genomic selection with application in a cassava (Manihot esculenta) breeding program. Repositório Alice
AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F.; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F.; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; OLIVEIRA, E. J. de.
ABSTRACT. Genomic selection is the main force driving applied breeding programs and accuracy is the main measure for evaluating its efficiency. The traditional estimator (TE) of experimental accuracy is not fully adequate. This study proposes and evaluates the performance and efficiency of two new accuracy estimators, called regularized estimator (RE) and hybrid estimator (HE), which were applied to a practical cassava breeding program and also to simulated data. The simulation study considered two individual narrow sense heritability levels and two genetic architectures for traits. TE, RE, and HE were compared under four validation procedures: without validation (WV), independent validation, ten-fold validation through jacknife allowing different markers,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Seleção genômica; Genomic prediction; Accuracy estimator; Cross-validation; Manihot esculenta; Mandioca; Melhoramento vegetal; Cassava; Plant breeding.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072711
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Nodulação do feijão-caupi em função da aplicação de três águas de farinheira. Repositório Alice
SCHWENGBER, J. A. M.; SILVA, F. F.; SMIDERLE, O. J.; SCHWENGBER, D. R..
2010
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação Biológica de Nitrogênio.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/882272
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Oviposition of fruit flies (Diptera: Tephritidae) and its relation with the pericarp of citrus fruits. Repositório Alice
DIAS, N. P.; NAVA, D. E.; GARCIA, M. S.; SILVA, F. F.; VALGAS, R. A..
bitstream/item/166406/1/Dori-Nava-1519-6984-bjb-1519-6984167661.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Anastrepha fraterculus; Ceratitis capitata; Citrus peel structure; Epicarp; Mesocarp.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079203
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Quintais agroflorestais e reprodução social: reflexões a partir de um monitoramento econômico no Assentamento Fazenda Pirituba, Itapeva-SP. Repositório Alice
CANUTO, J. C.; RAMOS FILHO, L. O.; SILVA, F. F.; MATHEUS, F. A..
Resumo: Este estudo representa um esforço para entender melhor a estrutura e funcionamento dos quintais agroflorestais (QA) do Assentamento Pirituba. Com base em dados da produção entregue ao Programa de Aquisição de Alimentos, na qual os QA contribuem com cerca de 80% do volume comercializado, foi realizado um monitoramento econômico em 2013, cobrindo 8 parâmetros (grupos de produtos), com dados de 7 entregas mensais (repetições). Buscou-se estabelecer diversas relações: o peso econômico de cada grupo, a diversidade e sazonalidade. A diversidade total de produtos entregues foi de 91 espécies/variedades, corroborando o caráter altamente biodiverso dos QA. As frutas representam o principal grupo, com 58% do valor total comercializado. Em nível de espécie,...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sistemas biodiversos; Programa de aquisição de alimentos; Itapeva; Biodiverse systems; Food purchase program; Agricultura familiar; Agrossilvicultura; Assentamento; Agricultura sustentável; Agroforestry; Family farm; Food purchasing.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035813
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