SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

Genetic diversity, population structure, and correlations between locally adapted zebu and taurine breeds in Brazil using SNP markers.

SILVA, M. V. G. B. da; OLIVEIRA JUNIOR, G.; REY, F. S. B.; GIACHETTO, P. F.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. S.; FERRAZ, J. B. S..

The aim of this work was to investigate, based on a high density BovineHD SNP array, the abundance and distributions of CNVs and CNVR in a Gyr cattle population from Brazil. Genotype data of representative bulls were recorded, totaling 476 Gyr animals. For CNV identification was used the PennCNV software and the CNVRs were determined by the CNVRuler software. A total of 26,672 CNVs were found, beingon average 62 CNV per animal. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes. Also, 1,898 CNVRs were detected on the autosomal chromosomes with 96% of these between 1.1 Kb to 100 Kb. The Ensembl's VEP tool, using the CNVRs information as input, found 913 coding regions, suggesting that exon regions were duplicated. In summary, the results help to...

Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Bovino; Polimorfismo de nucleotídeo único; Gado Zebu; Gado de corte; Cattle; Dairy cattle; Bos indicus; Single nucleotide polymorphism; Genomics.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007818

CAMPOS, B. M.; CARMO, A. S. do; EGITO, A. A. do; MARIANTE, A. da S.; ALBUQUERQUE, M. S. M. do; GOUVEIA, J. J. S. de; MALHADO, C. H. M.; VERARDO, L. L.; SILVA, M. V. G. B. da; CARNEIRO, P. L. S..

bitstream/item/181022/1/Campos2017-Article-GeneticDiversityPopulationStru.pdf

Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach.

Palavras-chave: Naturalized bovine; Conservation; Genomics; Introgression.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080451

MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B. da; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..

Background: Meat quality involves many traits, such as marbling, tenderness, juiciness, and backfat thickness, all of which require attention from livestock producers. Backfat thickness improvement by means of traditional selection techniques in Canchim beef cattle has been challenging due to its low heritability, and it is measured late in an animal?s life. Therefore, the implementation of new methodologies for identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) linked to backfat thickness are an important strategy for genetic improvement of carcass and meat quality. Results: The set of SNPs identified by the random forest approach explained as much as 50% of the deregressed estimated breeding value (dEBV) variance associated with backfat thickness,...

Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed.

Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Gado de corte; Metabolismo lipídico; Aprendizado de máquina; Inteligência artificial; Machine learning; Tecido adiposo subcutâneo; Single nucleotide polymorphism; Beef cattle; Lipid metabolism; Artificial intelligence; Subcutaneous fat.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/977539

MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B. da; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A..

Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances...

Mapeamento de QTLS para peso ao nascimento no cromossomo 14 de bovinos

Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Genome wide association studies; Desequilíbrio de ligação; Gado de corte; Beef cattle; Single nucleotide polymorphism; Linkage disequilibrium.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003463

Predição da resistência genética ao carrapato de bovinos Braford e Hereford a partir de um painel denso de marcadores moleculares.

MYTATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A..

2005

Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Produção de leite; Raças Holandesas; Marcador molécula.

Ano: 2005

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47156

Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro: resultado do Teste de Progênie - 12º Grupo.

CARDOSO, F. F.; GOMES, C. C. G.; OLIVEIRA, M. M. de; ROSO, V. M.; PICCOLI, M. L.; BRITO, F. V.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B. da; REGITANO, L. C. de A.; CAETANO, A. R.; AGUILAR, I..

O problema do carrapato bovino. A alternativa da seleção genômica. Resultados experimentais. Procedimentos para aplicação prática. Considerações finais.

Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Carrapato bovino; Rhipicephalus; Boophilus microplus.

Ano: 2011

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/945515

Programa nacional de melhoramento do Gir Leiteiro: resultado do teste de progênie - 13º grupo.

VERNEQUE, R. da S.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; SILVA, M. V. G. B. da; PAULA, L. R. de O.; LEDIC, I. L.; TAKAMURA, A. E..

2004

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Bovinos de leite; Gir Leiteiro; Melhoramento; Teste de progênie; Melhoramento genético.

Ano: 2004

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/594805

Programa nacional de melhoramento do gir leiteiro: sumário brasileiro de touros resultado do teste de progênie - maio 2007.

MARTINEZ, M. L.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; SILVA, M. V. G. B. da; LEDIC, I. L.; FERNANDES, A. R..

2005

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Bovino de leite; Melhoramento genéticon animal; Raça gir.

Ano: 2005

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/594929

Programa nacional de melhoramento do gir leiteiro sumário brasileiro de touros resultado do teste de progênie - maio 2008.

VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; PEIXOTO, M. G. C. D.; LEDIC, I. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; FERNANDES, A. R..

2007

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Bovino de leite; Melhoramento genéticon animal; Raça gir.

Ano: 2007

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/596681

VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERCESI FILHO, A. E.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; FERNANDES, A. R.; MACHADO, C. H. C..

0 sucesso de qualquer programa de melhoramento genético de rebanhos leiteiros depende basicamente do planejamento dos acasalamentos. Para que os acasalamentos possam ocorrer dentro dos objetivos estabelecidos pelo criador, é necessário que este disponha de informações confiáveis dos animais a serem acasalados. As informações sobre as produções das fêmeas podem ser obtidas rotineiramente no próprio rebanho, e em geral o criador sabe quais são as suas melhores vacas, principalmente pelo controle leiteiro. Todavia, o mesmo não ocorre com os touros, que contribuem com mais de 70% do progresso genético dos rebanhos, mas não manifestam a característica fenotipicamente.

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Bovino de leite; Melhoramento genético animal; Raça gir.

Ano: 2008

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/595990

Programa nacional de melhoramento do Gir Leiteiro: Sumário brasileiro de touros: resultado do teste de progênie - maio 2009.

VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERCESI FILHO, A. E.; MACHADO, M. A.; REIS FILHO, J. C.; SILVA, M. V. G. B. da; FERNANDES, A. R.; MACHADO, C. H. C..

2009

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Bovino de leite; Melhoramento genético animal; Raça gir.

Ano: 2009

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/595652

Programa nacional de melhoramento do gir leiteiro - Sumário brasileiro de touros - Resultados do teste de progênie - maio 2006.

Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá para Leite: resultados do Teste de Progênie, do Arquivo Zootécnico Nacional e do Núcleo Moet.

MARTINEZ, M. L.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; SILVA, M. V. G. B. da; MACHADO, M. A.; LEDIC, I. L.; FERNANDES, A. R..

2006

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Melhoramento Animal; Bovinos leiteiros - melhoramento.

Ano: 2006

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/595224

TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINEZ, M. L.; SILVA, M. V. G. B. da; PENNA, V. M.; PEIXOTO, M. G. C. D..

2006

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Raça Guzerá; Bovino de leite.

Ano: 2006

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/595688

Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá para Leite: resultados do Teste de Progênie, do Arquivo Zootécnico Nacional e do Núcleo Moet.

TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINEZ, M. L.; SILVA, M. V. G. B. da; PENNA, V. M.; PEIXOTO, M. G. C. D..

2005

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Raça Guzerá; Bovino de leite.

Ano: 2005

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/594928

Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá para Leite: resultados do Teste de Progênie, do Arquivo Zootécnico Nacional e do Núcleo Moet

Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds.

TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINEZ, M. L.; SILVA, M. V. G. B. da; PENNA, V. M..

2004

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Bovinos de leite; Raça Guzerá; Melhoramento; Teste de progênie; Núcleo Moet; Melhoramento genético.

Ano: 2004

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/594806

STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. da.

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