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A 3K Axiom SNP array from a transcriptomewide SNP resource sheds new light on the genetic diversity and structure of the iconic subtropical conifer tree Araucaria angustifolia (Bert.) Kuntze. Repositório Alice
SILVA, P. I. T.; SILVA JUNIOR, O. B.; RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A.; AGUIAR, A. V.; GRATTAPAGLIA, D..
High-throughput SNP genotyping has become a precondition to move to higher precision and wider genome coverage genetic analysis of natural and breeding populations of non-model species. We developed a 44,318 annotated SNP catalog for Araucaria angustifolia, a grandiose subtropical conifer tree, one of the only two native Brazilian gymnosperms, critically endangered due to its valuable wood and seeds. Following transcriptome assembly and annotation, SNPs were discovered from RNA-seq and pooled RAD-seq data. From the SNP catalog, an Axiom® SNP array with 3,038 validated SNPs was developed and used to provide a comprehensive look at the genetic diversity and structure of 15 populations across the natural range of the species. RNA-seq was a far superior source...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Araucária Angustifólia.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124676
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Caracterização genética de populações naturais de Ilex paraguariensis St. Hil. Repositório Alice
WENDT, S. N.; SOUSA, V. A.; QUOIRIN, M.; STURION, J. A.; SANTOS E. C. S..
Ilex paraguariensis, popularmente conhecida como erva-mate, é uma espécie de grande importância econômica, social e cultural para a região Sul do Brasil. Devido à composição química das folhas, possui diversas aplicações industriais, destacando-se a produção de bebidas. A despeito da sua expressão socioeconômica, existe pouca informação sobre a biologia e a variabilidade genética das populações naturais. Estes conhecimentos são essenciais aos programas de melhoramento e de conservação dos recursos genéticos. Marcadores bioquímicos (isoenzimas) são amplamente utilizados nos estudos da genética de populações florestais, pois oferecem diversas vantagens, destacando-se a expressão codominante, que permite distinguir genótipos homozigotos de heterozigotos. O...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Erva mate; Ilex paraguariensis; Estrutura genética; Isoenzimas.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/308766
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Fenologia reprodutiva de erva-mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). Repositório Alice
SOUSA, V. A.; DAROS T. L.; STURION, J. A..
A erva mate (Ilex paraguariensis St. Hil.) ocorre nos estados sul do Brasil e países limítrofes, como a Argentina e Paraguai. Sua importância sócio-econômica está na utilização e exploração das suas propriedades fitoquímicas, como bebida estimulante e produção de fármacos. Devido à crescente demanda, a formação de novos ervais de alta produtividade é imprescindível. O conhecimento da variabilidade genética constitui-se em uma importante ferramenta para o sucesso de programas de melhoramento e conservação do germoplasma da espécie. A mesma encontra-se intimamente ligada ao sistema reprodutivo que, de certa forma, define a participação efetiva dos indivíduos na reprodução. A erva-mate apresenta dioicia críptica, constituindo-se, portanto, em uma espécie...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Erva mate; Ilex paraguariensis; Florescimento; Frutificação; Pólen.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/307109
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Variação genética de uma população natural de Araucaria angustifolia (Bert) O. Ktze. Repositório Alice
BORTULLUCI, D.; SOUSA, V. A.; RIGONI, D..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Isoenzima; Genética de populações; Pinheiro-do-Paraná.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/315613
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