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A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: DNA bovino; Expressão gênica; Gene expression in cattle; Gene expression regulation.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102174
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A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. Repositório Alice
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: DNA bovine; Gene expression in cattle; Gene expression regulation.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101203
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A single nucleotide polymorphism in NEUROD1 is associated with production traits in nelore beef cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. P. A.; TIZIOTO, P. C.; MALAGO JUNIOR, W.; NASCIMENTO, M. L. do; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; LANNA, D. P. D.; TULLIO, R. R.; MOURAO, G. B.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Feed efficiency and carcass characteristics are late-measured traits. The detection of molecular markers associated with them can help breeding programs to select animals early in life, and to predict breeding values with high accuracy. The objective of this study was to identify polymorphisms in the functional and positional candidate gene NEUROD1 (neurogenic differentiation 1), and investigate their associations with production traits in reference families of Nelore cattle. A total of 585 steers were used, from 34 sires chosen to represent the variability of this breed. By sequencing 14 animals with extreme residual feed intake (RFI) values, seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) in NEUROD1 were identified. The investigation of marker effects on...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Candidate gene; Feed efficiency; Bos Indicus; Body composition.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053741
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Adequação de épocas de semeadura de sorgo sacarino no município de Sinop- MT. Repositório Alice
JOANELLA, G. K.; SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; SPAZIANI, C.; TARDIN, F. D.; MAY, A.; SILVA, A. F. da.
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biocombustível; BRS 506; CMSXS 647; Sistema de produção.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/972693
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Adequação de populações de braquiária em consórcio com milho safrinha em espaçamento reduzido. Repositório Alice
SILVA, A. F. da; BEHLING, M.; SILVA, C. da; FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; JOANELLA, G. K.; SILVA, A. J. M. da; GONTIJO NETO, M. M..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho safrinha.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/972496
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Adubação foliar do algodoeiro com nitrato de potássio. Repositório Alice
BOGIANI, J. C.; SILVA, F. I. S. da; PERINA, F. J.; SOUZA, M. M. de.
O potássio (K) e o nitrogênio (N) são os nutrientes mais exigidos pelo algodoeiro. Para altas produtividades, é necessário que a planta acumule quantidade suficiente destes nutrientes nas folhas. Contudo, as características das novas cultivares co mo ciclo mais precoce, maturação concentrada e alto potencial produtivo, atrelado ao problema de ocorrência de veranicos prolongados em regiões como no oeste da Bahia que ocasionam menor potencial de absorção de N e K pelas raízes, estão proporcionando situações de perda do potencial produtivo por causa do pouco acúmulo de N e K nas folhas.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fertilizante foliar; Algodão; Nitrogênio.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1042554
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Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Repositório Alice
SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
bitstream/item/147026/1/Souza-et-al-2016.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nelore; Expressão alélica diferencial; Maciez da carne; Gado Nelore; Alleles.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1052240
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Allele-specific gene expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice
ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M..
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Allele-specific expression; Genome regulation; Genetic improvement.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1073455
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Análise de haplótipos em QTL associado ao conteúdo de ferro no músculo de bovinos Nelore. Repositório Alice
DINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: ABC; Bos indicus; Blocos de haplótipos; Minerais; QTL; Bovino; Nelore.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002861
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Association of KCNJ11 gene variants with tenderness in Nelore breed. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; MEIRELLES, S. L. C.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; ROSA, A. do N.; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; REGITANO, L. C. de A..
The KCNJ11 (potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 11) gene is located in BTA15, near a quantitative trait loci for meat tenderness. In this study, single nucleotide polymorphisms (SNPs) were described in KCNJ11 and associated with Warner ? Bratzler shear force (WBSF) at different aging times: 1 d after slaughter (WBSF0), after 7 d (WBSF7) and 14 d (WBSF14) of aging. Fourteen steers of Nelore breed, characterized as extreme for the distribution of WBSF0 in a half-sib population of 500 progenies from 32 sires, were selected for sequencing.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: KCNJ11; Gene variants; Nelore breed; Cattle; SNP; Meat.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/951696
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Atividade ovicida in vitro dos óleos essenciais das plantas Eucalyptus stageiriana, Carapa guianensis, Cymbopogon martinii, Hura crepitans na inibição da eclodibilidade de namatóides gastrintestinais. Repositório Alice
CHAVES, S. C.; SOUZA, M. M. de; CHAGAS, A. C. de S.; CAVALCANTE, A. C. R.; VIEIRA, L. da S..
Objetivou-se nesse trabalho avaliar o efeito ovicida in vitro dos óleos essenciais de quatro plantas: E.stageiriana, C.guianensis, C.martinii, H.crepitans. No teste de eclosão foram utilizados tratamentos nas concentrações 5%-2,5%-1,25%-0,625%-0,312%.Cada ensaio foi acompanhado de um controle positivo contendo TWEEN 80 (3%) e um controle negativo somente água e ovo. Nas plantas H.crepitans e C.martinii as concentrações de 5% e 2,5%, não houve contagem em função da impossibilidade de visualização do material. Os resultados obtidos demonstram que H.crepitans e do C. martinii apresentam eficácia superior a 90% sugerindo que esses bioativos apresentam potencial para serem investigados quanta a sua eficácia na redução da carga parasitária em testes ?In vivo?.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ochoó; Caprino; Doença animal; Nematódeo gastrintestinal; Controle; Anti-helmíntico; Fitoterapia; Haemonchus contortus; Óleo essencial; Planta medicinal; Eucalyptus stageiriana; Carapa guianensis; Andiroba; Cymbopogon martinii; Palma rosa; Hura crepitans; Eclodibilidade.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/868088
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Avaliação de desempenho de cultivares de milho em função da densidade de semeadura, no munícipio de Sinop-MT. Repositório Alice
SILVA, A. F. da; GONTIJO NETO, M. M.; SOUZA, M. M. de; FILIMBERTI, E. L.; JOANELLA, G. K.; SILVA, C. da; TARDIN, F. D..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho safrinha; Variedades; Zea mays.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/972509
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Avaliação de desempenho de cultivares de milho safrinha no município de Sinop-MT. Repositório Alice
SILVA, A. F. da; GONTIJO NETO, M. M.; TARDIN, F. D.; FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; JOANELLA, G. K.; CESAR DA SILVA.
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Variedades; Milho; Zea mays.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/972517
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Calcium and potassium content in beef: In fluences on tenderness and associations with molecular markers in Nellore cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; ROSA, A. do N.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Metal; Ionone; Shear force; Calpain; Calpastatin.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/983784
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Calcium and potassium content in beef: Influences on tenderness and associations with molecular markers in Nellore cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; ROSA, A. do N.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Metal; Ionone; Shear force; Calpain; Calpastatin; KCNJ11.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/977644
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Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas. Repositório Alice
FILIMBERTI, E. L.; SOUZA, M. M. de; SILVA, C. da; JOANELLA, G. K.; PETTER, F. A.; TARDIN, F. D.; MAY, A.; SILVA, A. F. da.
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioenergia; BRS 506; Sistemas de produção; Sorghum bicolor.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/972698
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Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas, no município de Sinop-MT. Repositório Alice
SILVA, A. F. da; SILVA, C. da; SOUZA, M. M. de; TARDIN, F. D.; BEHLING, M.; MAY, A..
A cultura do sorgo sacarino se destaca no cenário nacional como uma interessante alternativa para a produção de etanol. Porém, para que a cultura possa expressar todo o seu potencial produtivo é necessário que o arranjo de plantas seja realizado de maneira adequada. Objetivou-se com esse trabalho avaliar o comportamento do sorgo sacarino, cultivar BRS 506, em diferentes espaçamentos e densidade de semeadura, durante duas safras agrícolas, no município de Sinop-MT. O delineamento experimental adotado foi o de blocos ao acaso, em esquema fatorial 5x4x2, sendo cinco espaçamentos de entre linhas (0,5; 0,6; 0,7; 0,8; e1 x0,5 metros), quatro populações de planta (80.000; 100.000; 120.000; 140.000 plantas ha -1 ) e duas safras agrícolas (2011/2012 e 2012/2013),...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sorghum bicolor; BRS 506; Bioenergia.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006481
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Comportamento produtivo de sorgo sacarino em função do arranjo de plantas, no município de Sinop-MT. Repositório Alice
SILVA, A. F. da; SILVA, C. da; SOUZA, M. M. de; TARDIN, F. D.; BEHLING, M.; MAY, A..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sorghum bicolor; BRS 506; Bioenergia.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/992649
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Differentially expressed genes in genetically divergent Nellore steers for calcium content in the Longissimus dorsi muscle. Repositório Alice
AFONSO, J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O.; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; SILVA, J. V. da; BUSS, C. E.; GROMBONI, C. F.; MOURÃO, G. B.; NOGUEIRA, A. R. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
2016
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Calcium; RNA-Seq; Bos indicus; Bos indicus.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1056581
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Differentially expressed genes in Longissimus dorsi muscle of Nelore steers divergent for average daily gain. Repositório Alice
SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; NEUBERN, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RNA-seq; ADG; Gado Zebu; Zebu.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1056895
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