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Aflatoxins: contamination, analysis and control. Repositório Alice
DORS, G. C.; CALDAS, S. S.; FEDDERN, V.; BEMVENUTI, R.H.; HACKBART, H. C. S.; SOUZA, M. M.; OLIVEIRA, M. S.; BUFFON, J. G.; PRIMEL, E, G.; FURLONG, E. B..
2011
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Aflatoxinas; Contaminação; Alimento; Análise; Controle.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/907418
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Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Allele; Specific expression analysis; Bovine muscle tissue.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1029313
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Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C..
Imprinted genes have been target of many studies, mainly in human and mouse, and lately in bovines due to the interest of understanding the epigenetic mechanisms underlying important meat quality phenotypes and the possibility of applying it in animal breeding programs in the future. Genomic DNA from 146 steers was genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip in order to identify heterozygous individuals with known allele origin.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Genoma; Bioinformatics; Gene expression; Genome.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035220
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Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C..
Imprinted genes have been target of many studies, mainly in human and mouse, and lately in bovines due to the interest of understanding the epigenetic mechanisms underlying important meat quality phenotypes and the possibility of applying it in animal breeding programs in the future. Genomic DNA from 146 steers was genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip in order to identify heterozygous individuals with known allele origin.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; Genoma; Bioinformatics; Genome; Gene expression.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035029
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Analysis of transferability of microsatellite primers (SSR) in wild Passiflora species and intraspecific genetic diversity in Passiflora alata. Repositório Alice
SILVA, M. A. A.; SOUZA, M. M.; SILVA, G. S.; MELO, C. A. F.; CORRÊA, R. X.; ARAÚJO, I. S.; CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. da.
ABSTRACT. The genus Passiflora L. is the most representative of Passifloraceae, with over 500 known species, among which 150-200 originated from Brazil. In addition to the great commercial importance of this genus for the fruit market, many of the species have exotic flowers with a huge diversity of colors and can thereby be exploited as ornamental plants. This study was aimed at investigating the transferability of microsatellite primers in wild Passiflora species (P. cacao, P. cincinnata, P. glandulosa, P. gibertii, and P. mucronata) and characterizing 29 P. alata accessions using microsatellite primers that were previously developed in a library enriched with microsatellites from P. edulis f. flavicarpa for P. alata. The interspecies cross-amplification...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Marcador microsatelite; Transferabilidade de primers; Marcador genético; Maracujá; Flor; Melhoramento genético vegetal; Passiflora alata; Genetic variation; Microsatellite repeats; DNA primers.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1008509
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Association study of a cast gene snp with meat tenderness in bos indicus cattle. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cast gene snp; Meat tenderness; Bos indicus cattle.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/904844
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Complex pattern of CAST allelic expression in bovine muscle tissue. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; ZERLOTINI, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Polimorfismo de nucleotídeo único; Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007540
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Estabilidade de produção do algodoeiro cultivado sob diferentes palhadas para cobertura do solo. Repositório Alice
BOGIANI, J. C.; FERREIRA, A. C. de B.; BORIN, A. L. D. C.; PERINA, F. J.; SIVA, F. I. S. da; SOUZA, M. M..
Nos últimos anos, a região oeste da Bahia vem enfrentando problemas sérios de veranicos prolongados com quedas de produtividade do algodoeiro. Quando e stes veranicos ocorrem em estádios de alta demanda de agua pela planta, os prejuízos são ainda maiores. Alternativas como o uso de cobertura do solo com biomassa podem minimizar estes problemas, pois podem diminuir as perdas de água por evaporação, e consequentemente aumentar a eficiência do uso da água do solo pelas culturas. Frente a esta realidade, o objetivo deste trabalho foi de avaliar a estabilidade de produção do algodoeiro cultivado sob diferentes condições de cobertura do solo com biomassa seca.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biomassa seca; Semeadura direta; Planta de cobertura; Plantio direto.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1042658
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Evolução da produção agrícola nas microrregiões do Bioma Cerrado. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; VILELA, M. de F.; CHAIB FILHO, H..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mapeamento.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662455
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First record of Eucoilinae (Hymenoptera: Figitidae), parasitoids of African fig fly Zaprionus indianus Gupta (Diptera: Drosophilidae), in the Caatinga biome. Repositório Alice
SANTOS, W. G. N.; FERNANDES, E. C.; SOUZA, M. M.; GUIMARAES, J. A.; ARAUJO, E. L..
Este trabalho relata a ocorrência de eucoilineos (Hymenoptera: Figitidae), parasitoides da Mosca-africana-do-figo Zapriomis indianus Gupta (Diptera: Drosophilidae). no bioma Caatinga semiárido Brasileiro.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Eucoilinae; Mosca frugívora; Inimigo natural; Praga; Inseto; Biodiversity.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1060095
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Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes. Repositório Alice
TIZIOTO, P.; COUTINHO, L. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; ROSA, C. O.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOUZA, M. M.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; CHAVES, A. S.; LANNA, D. P. D.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. A..
Background: Efficiency of feed utilization is important for animal production because it can reduce greenhouse gas emissions and improve industry profitability. However, the genetic basis of feed utilization in livestock remains poorly understood. Recent developments in molecular genetics, such as platforms for genome-wide genotyping and sequencing, provide an opportunity to identify genes and pathways that influence production traits. It is known that transcriptional networks influence feed efficiency-related traits such as growth and energy balance. This study sought to identify differentially expressed genes in animals genetically divergent for Residual Feed Intake (RFI), using RNA sequencing methodology (RNA-seq) to obtain information from genome-wide...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Transcriptoma; Sequenciamento genético; Bioinformática; Bos indicus; RFI; Feed efficiency; Zebu; Feed conversion; Transcriptomics; Bioinformatics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1034697
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Influência do espaçamento entre linhas e da relação entre espaçamento-altura na podridão de maçãs do algodoeiro. Repositório Alice
PERINA, F. J.; BOGIANI, J. C.; SILVA, F. I. S.; SOUZA, M. M.; FERREIRA, A. C. de B.; BORIN, A. L. D. C..
A podridão de maçãs é um dos problemas fitossanitários mais importantes para a cultura do algodoeiro no Brasil. Sob condições de elevada umidade e precipitação pluviométrica no período de abertura ou formação das maçãs, essa enfermidade provoca prejuízos expressivos. A podridão de maçãs pode ocorrer tanto antes como após sua abertura, e é caracterizada pela ação de um complexo de agentes patogênicos primários e secundários, sendo registra dos mais de uma centena de microrganismos associados.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Apodrecimento de maçã; Altura de planta; Adensamento.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1042710
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Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; ZERLOTINI, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A..
ABSTRACT: The NNAT gene plays a role on adipogenesis, brain development and insulin secretion. NNAT is described as paternal imprinted in bovine fetal tissue, but it is still underexplored in adult tissues. In order to improve the understanding of NNAT expression, muscle from Nellore was used to assess its allelic expression. Genomic DNA from 38 steers was genotyped for identification of heterozygous individuals with known allele origin. Total mRNA from muscle was extracted and sequenced by HiScanSQ, and afterwards the reads of each allele were counted for each animal. A total of 8 reciprocal heterozygous had more than 10 reads for the chosen SNP. All animals showed monoallelic expression, being 5 with paternal allele expressed, while 7 had the G allele...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Neuronatin; Zebu; Genomic imprinting.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006155
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Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. de A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Imprint; Neuronatin.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/997977
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MyoD1 expression levels affect meat tenderness in Nellore beef cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M.; MALAGO JUNIOR, W.; DONATONI, F. A. B.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; QPCR; Shear force; Gene expres.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/998063
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Positional candidate genes for residual intake and gain in Nelore beef cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; NASCIMENTO, M. L. do; SOUZA, M. M.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P.; SONSTEGARD, T.; MOURÃO, G. B.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Feed efficiency; SNPs.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/998065
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PRUNE2 gene has a potential effect on residual feed intake in Nellore cattle. Repositório Alice
LIMA, A. O. D.; OLIVEIRA, P. S. N.; TIZIOTO, P. C.; SOMAVILLA, A. L.; DINIZ, W. J. S.; SILVA, J. V. D.; ANDRADE, S. C. S.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; SOUZA, M. M.; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; BUSS, C. E.; MUDADU, M. de A.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Residual feed intake (RFI) can increase the profitability of producers, reduce methane emission and land allocation to livestock production. However, this trait has late and costly measurements. Identifying gene expression changes combined with polymorphisms that affect residual feed intake variation is important for identify target regulatory polymorphisms that can be used in animal breeding programs. Diverse studies performed by our research group in a Nellore population, such as genome-wide association (GWA), association weight matrix (AWM) and RNA-seq analysis of liver tissue have been pointed Prune homolog 2 (Drosophila) (PRUNE2) as a potential candidate gene influencing feed efficiency. For this reason, we select this gene for a more detailed...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Functional gene enrichment; Genética; Gado Nelore; Gado de corte; Genetics; Haplotypes; Feed conversion; Beef cattle.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066412
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