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Allelic diversity in populations of Solanum lycocarpum A. St.-Hil (Solanaceae) in a protected area and a disturbed environment Acta Botanica
Moura,Tânia Maria de; Sebbenn,Alexandre Magno; Martins,Karina; Moreno,Maria Andreia; Oliveira,Giancarlo Conde Xavier; Chaves,Lázaro José; Kageyama,Paulo Yoshio.
This study aimed to compare the genetic diversity of populations of Solanum lycocarpum A.St.-Hil between natural and human disturbed environments, with the assumption that protected areas have greater genetic diversity than disturbed areas. For this study, two populations were sampled in Goiás State, Brazil. One was located in a conservation unit, Serra de Caldas Novas State Park, in the Caldas Novas municipality. The other was located in a pasture area in the municipality of Morrinhos. The two populations are 41 km apart. We sampled 60 individuals from each population, which were genotyped with five microsatellite loci (SSR). The highest number of alleles was recorded in the population of the conservation unit, where we found 11 exclusive and five rare...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cerrado; Gene flow; Conservation genetics; Genetic diversity.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062011000400023
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Diversidade genética em coleções amazônicas de germoplasma de cupuaçuzeiro [Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schum.] Rev. Bras. Frutic.
Alves,Rafael Moysés; Silva,Carlos Rogério de Sousa; Silva,Maria Suellem da Conceição; Silva,Darly Caroline de Souza; Sebbenn,Alexandre Magno.
Este trabalho teve por finalidade avaliar a diversidade genética e o parentesco de 24 acessos de Theobroma grandiflorum, introduzidos de três unidades da Embrapa, objetivando sua utilização como genitores no programa de hibridação da espécie. Os marcadores genéticos utilizados foram lócus heterólogos de microssatélites desenvolvidos para cacaueiro. Foram encontrados 45 alelos na população estudada. O número médio efetivo de alelos por lócus (2,33) foi menor do que o número médio de alelos por lócus (3,21), indicando que muitos alelos têm baixa frequência. A heterozigosidade observada nos lócus polimórficos variou de 0,33 a 1,00 com média de 0,54 e a heterozigosidade esperada variou entre 0,48 a 0,76 com média de 0,54. O índice de fixação médio entre lócus...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Microssatélite; Endogamia; Diversidade genética.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452013000300019
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Diversidade genética, endogamia e fluxo gênico em pequena população fragmentada de Copaifera langsdorffii Rev. Bras. Bot.
Carvalho,Ana Cristina Magalhães de; Moraes,Selma Maria Bozite de; Stranghetti,Valéria; Alzate-Marin,Ana Lilia; Sebbenn,Alexandre Magno.
O objetivo deste trabalho foi investigar a taxa de imigração e a distância de dispersão de pólen e sementes em uma pequena população fragmentada de Copaifera langsdorffii Desf., com base no polimorfismo de oito locos microssatélites. Foram mapeadas e genotipadas todas as 47 árvores adultas e 65 subadultas existentes no fragmento. Adultos tinham um total número menor de alelos (142) do que subadultos (164), sendo 20 alelos exclusivos aos adultos e 41 aos subadultos. Adultos tinham significativamente menor diversidade genética e maior endogamia (Â = 17,75 ± 0,51; Âe = 8,97 ± 0,27; ^F = 0,191 ± 0,017) do que subadultos (Â = 20,5 ± 0,65; Âe = 10,86 ± 0,29; ^F = 0,119 ± 0,013). O poder de exclusão do primeiro parente foi alto para o conjunto de locos nos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Análise de parentesco; Espécies arbóreas tropicais; Tamanho efetivo.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042010000400008
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Estimative of genetic parameters in progeny test of Pinus caribaea Morelet var. hondurensis Barret & Golfari by quantitative traits and microsatellite markers Bragantia
Tambarussi,Evandro Vagner; Sebbenn,Alexandre Magno; Moraes,Mário Luiz Teixeira de; Zimback,Léo; Palomino,Edwin Camacho; mori,Edson seizo.
The aims of this work were to estimate the coefficient of relatedness within families and the genetic parameters for growth related traits in a progeny test from an open-pollinated variety of Pinus caribaea Morelet hondurensis Barret & Golfari, established in Mato Grosso do Sul State, Brazil. The experimental design was the triple 10 x 10 lattice, with 96 families, three replicates, and ten plants per plot. Fourteen years after planting, the trial was measured for the following traits: total height, diameter at breast height (DBH), and true volume. The estimation of coefficients of relatedness within family from microsatellite loci indicated that families are true half-sibs (^r xy = 0.253). Thus, the additive genetic variance (σ2A) can be estimated...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pinus; Tree breeding; Genetic parameters; Microsatellite markers; Coefficient of relatedness.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052010000100006
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Inheritance and linkage relationships of allozyme variants of ilex paraguariensis St. Hil BABT
Wendt,Simone Neumann; Sousa,Valderês Aparecida de; Sebbenn,Alexandre Magno; Sturion,José Alfredo; Luíz,Felipe; Santos,Elisa Caroline da Silva; Quoirin,Marguerite.
Eighteen enzyme systems were examined in Ilex paraguariensis St. Hil. using starch gel electrophoresis. Seven out of 12 active isozyme systems revealed one or more polymorphic loci (PGI, GOT, MR, G-6PDH, MDH, NDH, and 6-PGDH). However, the segregation and linkage analyses were performed only for PGI, GOT, G-6PDH and 6-PGDH systems. Gene segregation at these loci was regular, except for a few trees that showed segregation distortion. Weak linkage disequilibrium between loci was detected, but it was not enough to influence the multilocus estimate.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Erva-mate (matê); Electrophoresis; Loci; Allele; Segregation.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132009000600016
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Mating system in Myracrodruon urundeuva (Anarcadiaceae): implications for conservation genetics Rev. Bras. Bot.
Gaino,Ana Paula Silva Campos; Moraes,Mario Luiz Teixeira de; Moreira,Juliana Prado; Cardin,Laila Toniol; Moraes,Marcela Aparecida; Silva,Alexandre Marques da; Freitas,Miguel Luiz Menezes; Sebbenn,Alexandre Magno.
The aims of this study were to investigate the mating system of a fragmented population of the dioecious tropical tree Myracrodruon urundeuva Allemão, using five microsatellite loci and the mixed mating and correlated mating models. The study was conducted in the Estação Ecológica de Paulo de Farias (436 ha), where the population occupies about 142 ha. The mating system was estimated using 514 open-pollinated offspring, collected from 30 seed-trees. Estimates of the multilocus outcrossing rate confirm that the species is dioecious (t m = 1.0). Low levels of mating among relatives were detected in the population (1 - t s = 0.020). The estimate of paternity correlation (r p(m)) indicated that offsprings were composed of mixtures of half-sibs and full-sibs,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Correlated matings; Fragmentation; Microsatellite; Variance effective population size.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042011000400008
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Mating system parameters in a high density population of andirobas in the Amazon forest PAB
Campos,Tatiana de; Cunha,Marcia Oliveira da; Sousa,Adna Cristina Barbosa de; Teixeira,Renata Beltrão; Raposo,Andrea; Sebbenn,Alexandre Magno; Wadt,Lucia Helena de Oliveira.
The objective of this work was to estimate the mating system parameters of a andiroba (Carapa guianensis) population using microsatellite markers and the mixed and correlated mating models. Twelve open‑pollinated progeny arrays of 15 individuals were sampled in an area with C. guianensis estimated density of 25.7 trees per hectare. Overall, the species has a mixed reproductive system, with a predominance of outcrossing. The multilocus outcrossing rate (t m = 0.862) was significantly lower than the unity, indicating that self‑pollination occurred. The rate of biparental inbreeding was substantial (t m ‑ t s = 0.134) and significantly different from zero. The correlation of selfing within progenies was high (r s = 0.635), indicating variation in the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Carapa guianensis; Allogamy; Conservation; Genetic breeding; Microsatellite; Population size.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000500006
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Sistema de reprodução em Caesalpinia echinata Lam. implantada em arboreto experimental Rev. Bras. Bot.
Giudice Neto,João Del; Sebbenn,Alexandre Magno; Kageyama,Paulo Y..
O sistema de reprodução de Caesalpinia echinata Lam.foi estudado por isoenzimas em arboreto, usando os modelos de cruzamentos mistos e cruzamentos correlacionados. Desvios do modelo misto de reprodução foram evidenciados pela heterogeneidade nas freqüências alélicas do pólen que fecundou as diferentes árvores. A taxa de cruzamento multiloco foi alta (t m= 0,969), indicando que a espécie é predominantemente alógama. A alta variação na taxa de cruzamento individual (tvariando de 0,77 a 1,00) indica que a espécie não é auto-incompatível. Diferença positiva e significativamente diferente de zero foi detectada entre as taxas de cruzamento multiloco e uniloco, sugerindo que ocorreram cruzamentos endogâmicos na população (t m - t s = 0,078). A correlação de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coancestria; Cruzamentos endogâmicos; Pau-brasil; Tamanho efetivo de variância; Taxa de cruzamento.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042005000200019
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