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Archaeal ammonium-oxidizers and nirS-type denitrifiers dominate the rhizosphere of leguminous trees in Brazilian semiarid soils. Repositório Alice
TAKETANI, R. G.; LANÇONI, M. D.; KAVAMURA, V. N.; MELO, I. S. de.
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Archaeal ammonium-oxidizers; NirS-type; Brazilian semiarid soils; Rizosfera; Leguminosa; Sulfolobus virus SIRV-1.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918325
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Atividade antitumoral de biomoléculas obtidas de Fusarium oxysporum, um endofítico de Combretum leprosum, planta nativa do semiárido brasileiro. Repositório Alice
SANTOS, S. N.; FERRARIS, F. K.; KAVAMURA, V.; TAKETANI, R. G.; LANÇONI, M. D.; DINI-ANDREOTE, F.; HENRRIQUES, M. das G. M. O.; MELO, I. S. de.
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Semiárido brasileiro; Fusarium oxysporum; Combretum; Antineoplastic agents.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/917605
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Bactérias celulolíticas de sedimento de manguezal. Repositório Alice
SOARES-JÚNIOR, F. L.; MELO, I. S. de; TAKETANI, R. G.; DIAS, A. C. F.; DINI-ANDREOTE, F..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mangue; Cellulolytic microorganisms.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/917537
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Biodiversidade e bioprospecção de micro-organismos na Caatinga. Repositório Alice
MELO, I. S. de; MORAES, L. A. B.; QUEIROZ, S. C. do N. de; MENDES, R.; FIORE, M. de F.; PELLIZARI, V. H.; TAKETANI, R. G.; MELO, S.; SOUZA, A. O. de; KAVAMURA, V.; SANTOS, S. N.; OLIVEIRA, V. M.; NAKAYAMA, C. R..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caatinga; Biodiversidade; Microrganismo; Semiarid zones; Biodiversity; Microorganisms.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1011720
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Bulk and rhizosphere bacterial communities of the Caatinga vegetation: drought effects. Repositório Alice
KAVAMURA, V. N.; SANTOS, S. N.; ANDREOTE, F. D.; TAKETANI, R. G.; MELO, I. S. de.
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bulk and rhizosphere bacterial communities; Caatinga vegetation; Drought effects; Caatinga; Rhizosphere bacteria.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918321
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Change in enzymatic activity of microbial communities on the seasonal differences in soils the of biomes caatinga and atlantic forest. Repositório Alice
BONONI, L.; VASCONCELLOS, R. L. F.; TAKETANI, R. G.; VILELA, E. S. D.; MOITINHO, M. A.; MELO, I. S. de.
Abstract: The average global temperature has increased and will continue increasing, with forecast of up to 5.8° C by the end of this century as a result of the increase in the concentration of greenhouse gases in the atmosphere. Due to these increased temperature, some biomes may introduce features of arid and semi-arid environments in the coming years. The patterns of water availability in the soil can select groups of microorganisms with physiological strategies to tolerate these seasonal changes. Nutrient availability for plants becomes limited when the aqueous part of the soil is low in the dry period. On the other hand, in irrigated soils the concentration of nutrients available associated with mineralization increases rapidly. Environmental...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arid environments; Seasonality; Soil microbiota; Caatinga; Dry environmental conditions; Enzyme activity; Soil microorganisms.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037853
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Co-occurrence patterns of litter decomposing communities in mangroves indicate a robust community resistant to disturbances. Repositório Alice
TAKETANI, R. G.; MOITINHO, M. A.; MAUCHLINE, T.; MELO, I. S. de.
Abstract: Background. Mangroves are important coastal ecosystems known for high photosynthetic productivity and the ability to support marine food chains through supply of dissolved carbon or particular organic matter. Most of the carbon found in mangroves is produced by its vegetation and is decomposed in root associated sediment. This process involves a tight interaction between microbial populations, litter chemical composition, and environmental parameters. Here, we study the complex interactions found during litter decomposition in mangroves by applying network analysis to metagenomic data.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Litter decomposition; Mangue; Planta; Decomposição; Bactéria; Mangrove forests; Metagenomics.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1098904
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Deep into to the bacterial communities living in sheep rumen. Repositório Alice
ROMAGNOLI, E. M.; NATEL, A. S.; FAGUNDES, G. G.; DURRER, A.; TAKETANI, R. G.; LOUVANDINI, H; ABDALLA, A. L.; MENDES, R..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fiber; DNA; Gene; Bagasse; Sugarcane.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/982549
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Descoberta da dinâmica do microbioma da rizosfera de mandacaru na caatinga. Repositório Alice
FERREIRA, C.; TAKETANI, R. G.; SILVA, J. L. da; GAVA, C. A. T.; LOPES, L. D.; MELO, I. S. de; MENDES, R..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mandacaru; Rizosfera.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/982550
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Diversidade e composição microbiana em esponjas marinhas do Arquipélago de São Pedro e São Paulo. Repositório Alice
SOUZA, D. T.; SILVA, F. P.; PANSA, C. C.; KAVAMURA, V. N.; TAKETANI, R. G.; MELO, I. S. de.
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Comunidade microbiana; Esponjas marinhas.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010903
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Draft genome sequence of Bacillus sp. strain CMAA 1185, a cellullolytic bacterium isolated from Stain House Lake, Antarctic Peninsula. Repositório Alice
SANTOS, S. N.; KAVAMURA, V. N.; TAKETANI, R. G.; VASCONCELLOS, R. L. F.; ZUCCHI, T. D.; MELO, I. S. de.
The aim of this study was to report the genome sequence of the cellulolytic Bacillus sp. strain CMAA 1185, isolated from Stain House Lake, Antarctica.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bactéria; Genoma; Cellulolytic microorganisms; Genome; Antarctica.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039600
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Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain BrMgv02-JM63, a chitinolytic bacterium isolated from oil-contaminated mangrove soil in Brazil. Repositório Alice
MARCON, J.; TAKETANI, R. G.; DINI-ANDREOTE, F.; MAZZERO, G. I.; SOARES JUNIOR, F. L.; MELO, I. S. de; AZEVEDO, J. L.; ANDREOTE, F. D..
Here, we report the draft genome sequence and the automatic annotation of Bacillus thuringiensis strain BrMgv02-JM63. This genome comprises a set of genes involved in the metabolism of chitin and N-acetylglucosamine utilization, thus suggesting the possible role of this strain in the cycling of organic matter in mangrove soils.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bacillus thuringiensis; Genoma; Mangue; Nucleotide sequences; Genome; Mangrove soils.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/997160
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Draft genome sequence of plant growth-promoting drought-tolerant Bacillus sp. strain CMAA 1363 isolated from the Brazilian Caatinga biome. Repositório Alice
KAVAMURA, V. N.; SANTOS, S. N.; TAKETANI, R. G.; VASCONCELLOS, R. L. F.; MELO, I. S. de.
The strain of Bacillus sp. CMAA 1363 was isolated from the Brazilian Caatinga biome and showed plant growth-promoting traits and ability to promote maize growth under drought stress. Sequencing revealed genes involved in stress response and plant growth promotion. These genomic features might aid in the protection of plants against the negative effects imposed by drought.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Growth promotion; Bacillus cereus; Estimulante de crescimento vegetal; Bacilo; Cacto.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1073617
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Draft genome sequence of Pseudomonas sp. strain CMAA 1215, a plant growth-promoting bacterium isolated from a Brazilian mangrove. Repositório Alice
VASCONCELLOS, R. L. F.; MENDES, R.; TAKETANI, R. G.; ZUCCHI, T. D.; MELO, I. S. de.
The aim of this study was to sequence the genome of the plant growth-promoting Pseudomonas sp. strain CMAA 1215, an osmotolerant bacterium isolated from mangrove soil.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pseudomonas sp; Regulador de crescimento; Genoma; Nucleotide sequences.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979521
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Drought constrains the rhizosphere´s bacterial diversity in the semiarid over a broad landscape. Repositório Alice
TAKETANI, R. G.; LANÇONI, M. D.; KAVAMURA, V. N.; DURRER, A.; MELO, I. S. de.
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Semi-árido; Seca; Bactéria; Bacterial communities.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010895
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Dynamic of microbial community during distinct stages of organic matter decomposition in sediments from mangroves of São Paulo state. Repositório Alice
MOITINHO, M. A.; YOSHIURA, C. A.; BONONI, L.; VASCONCELLOS, R. L. F.; MELO, I. S. de; TAKETANI, R. G..
Abstract: Mangroves are ecosystems located at coastline areas in tropical and subtropical conditions that are under tide influences. They are recognized as productive regions and have a high export of organic matter (OM) for the adjacent coastal waters. Bacterial communities present in these environments perform primordial functions on the cycling of nutrients and thereby on maintaining your important processes. Therefore, the purpose of this study was to assess the dynamics and phylogenetic diversity of the bacterial community in threes of São Paulo mangroves, during different stages of decomposition plant material. At the same time, the intention was to correlate this event with the emission of greenhouse gases (GHG). Microcosms were constructed with...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microorganisms; Plant degradation; Greenhouse gases; Ecological soccessions.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037803
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Dynamics of cacti rhizosphere bacterial communities in the Brazilian semiarid climate. Repositório Alice
KAVAMURA, V. N.; FERREIRA, C.; TAKETANI, R. G.; MELO, I. S. de; MENDES, R..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bactéria; Cacto; Cacti and succulents; Bacterial communities.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010894
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Efeito do aquecimento global sobre a comunidade microbiana do solo. Repositório Alice
MENDES, R.; TAKETANI, N. F.; TAKETANI, R. G..
A relação entre as comunidades microbianas do solo e o aquecimento global pode ser vista de duas formas. Na primeira, os microrganismos contribuem para a emissão de gases de efeito estufa, sendo os principais atores nos processos de ciclagem de nutrientes e de fluxos globais de CO2, CH4 e N2. Na segunda, é importante entender como o aquecimento global, resultado das mudanças climáticas, afeta a comunidade microbiana do solo. Considerando que a elevação do CO2, temperatura e precipitação são fatores importantes que influenciam as comunidades do solo, neste capítulo serão discutidos seus efeitos na comunidade microbiana do solo de forma geral e nos patógenos existentes nos solos no contexto do aquecimento global.
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Mudança climática; Solo; População microbiana; Clima; Efeito estufa; Soil biota; Climate change.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1087839
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Endo- and exoglucanase activities in bacteria from mangrove sediment. Repositório Alice
SOARES JUNIOR, F. L.; DIAS, A. C. F.; FASANELLA, C .C.; TAKETANI, R. G.; LIMA, A. O. S.; MELO, I. S. de; ANDREOTE, F. D..
The mangrove ecosystem is an unexplored source for biotechnological applications. In this unique environment, endemic bacteria have the ability to thrive in the harsh environmental conditions (salinity and anaerobiosis), and act in the degradation of organic matter, promoting nutrient cycles. Thus, this study aimed to assess the cellulolytic activities of bacterial groups present in the sediment from amangrove located in Ilha do Cardoso (SP, Brazil). To optimize the isolation of cellulolytic bacteria,enrichments in two types of culture media (tryptone broth and minimum salt medium), both supplementedwith 5% NaCl and 1% of cellulose, were performed. Tests conducted with the obtained colonies showed a higher occurrence of endoglycolytic activity (33...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave:  Cellulose; Endo-1; 4-B-D-glucanase Exo-1; 4-B-D-glucanase Salinity.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981473
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Genome sequence of Streptomyces caatingaensis CMAA 1322, a new abiotic stress-tolerant actinomycete isolated from dried lake bed sediment in the Brazilian Caatinga Biome. Repositório Alice
SANTOS, S. N.; GACESA, R.; TAKETANI, R. G.; LONG, P. F.; MELO, I. S. de.
The genome sequence of the first Streptomyces species isolated from the Brazilian Caatinga is reported here. Genes related to environmental stress tolerance were prevalent and included many secondary metabolic gene clusters.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Streptomyces caatingaensis; Fungo; Genoma; Caatinga; Actinomiceto; Actinomyces; Genome; Semiarid zones.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039594
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