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Molecular evolution and phylogeography of infectious hematopoietic necrosis virus with a focus on its presence in France over the last 30 years ArchiMer
Bellec, Laure; Louboutin, Lenaig; Cabon, Joelle; Castric, Jeanne; Cozien, Joelle; Thiery, Richard; Morin, Thierry.
Infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) is among the most important pathogens affecting the salmonid industry. Here, we investigated the molecular evolution and circulation of isolates from 11 countries or regions all over the world, with a special focus on the epidemiological situation in France. The phylogeography, time to the most recent common ancestor (TMRCA) and nucleotide substitution rate were studied using 118 full-length glycoprotein gene sequences isolated from 9 countries (5 genogroups) over a period of 47 years. The TMRCA dates back to 1943, with the L genogroup identified as the likely root (67 %), which is consistent with the first report of this pathogen in the USA. A Bayesian inference approach was applied to the partial...
Tipo: Text Palavras-chave: Infectious hematopoietic necrosis virus; Evolutionary dynamics; Dates of divergence; Phylogeography; Molecular epidemiology.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00399/51015/51832.pdf
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Recherche de moyens de dépistage et de prévention de la nodavirose du bar ArchiMer
Coeurdacier, Jean-luc; Breuil, Gilles; Pepin, Jean-francois; Mouchel, Olivier; Fauvel, Christian; Laporte, Florent; Thiery, Richard; Castric, J; Raymond, Jean-christophe; Baudin Laurencin, Félix.
Ce rapport clôture une collaboration, entreprise courant 97, entre l’Agence Nationale pour la Valorisation de la Recherche (ANVAR), l’Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments(AFSSA), le Syndicat National des Aquaculteurs Marins (SFAM) et l’Institut Français de Recherche pour l’Exploitation de la Mer (IFREMER). Deux lignées de nodavirus infectant le bar ont été mises en évidence avec une pathogénie variable selon l'âge et les facteurs extérieurs. Ce virus s’est montré d’une résistance exceptionnelle aux facteurs tant physiques que chimiques. Les diagnostics existants ont été adaptés ou réabordés sous un angle différent. Une étude épidémiologique a été réalisée chez les producteurs. La vaccination par peptides synthétiques a permis de sélectionner...
Tipo: Text
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27874/26120.pdf
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