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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/938894
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923298
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923169
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Adaptabilidade e estabilidade de acessos de uma coleção nuclear de arroz. Repositório Alice
BUENO, L. G.; VIANELLO, R. P.; RANGEL, P. H. N.; UTUMI, M. M.; CORDEIRO, A. C. C.; PEREIRA, J. A.; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; OLIVEIRA, J. P. de; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Variedade; Genótipo.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/922956
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Advances in common bean genome-wide analysis and impacts for the breeding programs. Repositório Alice
VIANELLO, R. P..
Conservation and knowledge of common bean genetic resources for sustainable management and proper utilization are of great importance to increase genetic gain in breeding programs. The Brazilian common bean core collection (CONFE) represents the genetic diversity of a large collection and presents a great potential to be widely explored to improve utilization of germplams for association analysis of agronomic traits and genome selection. In the last years, SNP markers have been increasingly developed based on the analysis of the accessions from CONFE, and applied for genetic analysis, investigation of the genetic structure along the domestication sites and breeding programs, as well as the identification of genomic regions related to traits of agronomic...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Association panel; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético; Beans; Molecular breeding; Genetic variation.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078882
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Alchemy Web: uma proposta de interface gráfica para o Sistema Alchemy. Infoteca-e
NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; BENÍCIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
A Embrapa Arroz e Feijão utiliza a plataforma de genotipagem BeadXpress Reader (Illumina), que utiliza a fluorescência como método de detecção. A interface gráfica foi construída utilizando-se a linguagem JavaScript. Para exemplificar o acesso e o uso do Alchemy Web, foram utilizados dados obtidos em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, através da plataforma BeadXpress (Illumina).
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Software; Interface gráfica; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984524
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An improved method for RNA extraction from common bean seeds and validation of reference genes for qPCR. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; BASSINELLO, P. Z.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
An RNA extraction method with high integrity and purity as well as the selection of adequate reference genes are prerequisites for gene expression analysis. For common bean seeds, there is no well-defined protocol that can be used in a laboratory routine for gene expression analysis. In this study, an extraction protocol for RNA from common bean seeds, which produced material with good integrity for qPCR (RIN ≥ 6.5), was optimized. In addition, 10 reference genes were evaluated under qPCR standard conditions using different tissue samples of common beans. Gene stabilities were analyzed using the delta-CT method, Bestkeeper, NormFinder and geNorm approaches. The genes β-tubulin and T197 were ranked as the most stable among the sample sets...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Gene normalization; Molecular breeding; Grain RNA extraction; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento; RNA; Beans; Molecular breeding; Gene expression.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076282
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Análise ampla do genoma funcional de feijoeiro em condições de deficiência hídrica. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; VIANELLO, R. P..
Esse estudo teve como objetivo desenvolver e sequenciar bibliotecas de cDNA a partir de diferentes tecidos e genótipos de feijão e analisar em resposta aos tratamentos específicos os níveis diferenciais de expressão gênica. Foram avaliados os genótipos fenotipicamente divergentes BAT477, caracterizado como tolerante à seca, e Pérola, como suscetível.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Deficiência hídrica; Genoma.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039617
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Análise da diversidade genética de acessos componentes da Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa. Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; VIANELLO, R. P.; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BORBA, T. C. de O..
O objetivo deste trabalho foi caracterizar, através de marcadores microssatélites, os acessos da CONFE (Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941647
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Análise da diversidade genética de variedades tradicionais de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites. Repositório Alice
PRADO, G. S.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
No Brasil, foi estabelecida, a partir da década de 70, uma rede de pesquisa com ênfase na conservação e uso dos recursos genéticos do feijoeiro comum. O banco de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão detém aproximadamente 17.345 acessos, dos quais 4.325 são variedades tradicionais (VTs). Esses acessos representam uma rica fonte de genes que conferem adaptação a diferentes ambientes, resistência a doenças e propriedades agronômicas diferenciadas que podem ser exploradas por meio de técnicas moleculares que fornecem medidas bastante eficientes e diretas da variabilidade genética existente dentro e entre os acessos. Esse estudo teve como objetivo a avaliação da variabilidade genética de VTs de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites (SSRs).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984476
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Análise da diversidade genética e estruturação populacional entre marcadores SSRs e SNPs em germoplasma de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
FARIA, B. M. S. de; MENEZES, I. P. P. de; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi avaliar o poder de informação genética dos marcadores SSRs e SNPs para aplicações no melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Germoplasma; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964150
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Análise das proteínas de reserva do arroz silvestre Oryza glumaepatula e de linhagens interespecíficas Oryza sativa x O. glumaepatula. Repositório Alice
SARTORI, D. E. L.; SANTOS, K. F. D'E. N.; MARTIN, C. C. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo quantificar e determinar os perfis proteicos totais e das frações proteicas no endosperma do grão de 70 linhagens desenvolvidas a partir dos cruzamentos interespecíficos.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Oryza glumaepatula; Proteína de reserva; Cruzamento interespecífico; Arroz Silvestre; Arroz; Oryza Sativa; Proteína; Cruzamento.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1104202
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Análise de associação genômica ampla (GWAS) da produtividade em arroz sob déficit hídrico. Repositório Alice
PANTALIÃO, G. F.; BORBA, T. C. de O.; GUIMARÃES, C. M.; NARCISO, M. G.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Esse trabalho objetivou detectar, via genotipagem por sequenciamento (GBS), marcadores SNPs polimórficos em 175 acessos de arroz de terras altas componentes da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa) e associá-los à produtividade sob déficit hídrico, identificando regiões genômicas que poderiam estar relacionadas a esse caráter.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mapeamento associativo; Genotipagem por sequenciamento; Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022477
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Análise de associação genômica ampla (GWAS) para tolerância à seca em feijoeiro comum. Repositório Alice
VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; MORAIS JUNIOR, O. P. de; MENDONÇA, J. A.; SARTORI, D. E. L.; LIMA, LUANN V. V. O.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; ZUCCHI, M. I.; VIANELLO, R. P..
O objetivo deste estudo foi identificar locos genéticos associados à tolerância à seca através da análise de associação genômica ampla (GWAS).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Resistência a seca; Deficiencia hídrica; Phaseolus vulgaris.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078828
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Análise de associação quanto à produtividade e seus caracteres componentes em linhagens e cultivares de arroz de terras altas. Repositório Alice
MENDES, C. dos A.; BORBA, T. C. de O.; BUENO, L. G.; CRUZEIRO, G. A. V.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi identificar, por meio da análise de mapeamento associativo, os marcadores moleculares relacionados à produtividade do arroz de terras altas e aos seus caracteres componentes. Foram usadas 113 linhagens e cultivares de arroz de terras altas, da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa, com reduzido vínculo genético entre si. Os seguintes caracteres componentes da produtividade foram avaliados: número de panículas por metro, número de grãos por panícula e peso de 100 grãos. Dos 115 marcadores utilizados, 25 (21,7%) associaram-se significativamente a um ou mais caracteres. Entre os 29 SSR ("simple sequence repeats") colocalizados em QTL ("quantitative trait loci") de produtividade de arroz, 12 foram associados aos caracteres avaliados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coleção nuclear; Desequilíbrio de ligação; Genômica funcional; Mapeamento associativo; Seleção assistida por marcadores; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético; Germoplasma; Marcador genético.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1001903
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Análise de polimorfismo de locos microssátelites em feijoeiro comum. Repositório Alice
TEIXEIRA, C. de J. V.; PEREIRA, H. S.; MELO, L. C.; VIANELLO, R. P.; BORBA, T. C. de O..
Nesse estudo foi avaliada a geração F5:6 do cruzamento Pérola x Bat477, cultivares contrastantes para a características de tolerância a seca. Foi avaliado, quanto ao polimorfismo, um conjunto superior a 500 marcadores, porém o polimorfismo existente entre os parentais é pequeno e gira em torno de 10%.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Polimorfismo.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/923181
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Análise de QTL para produtividade baseada em linhas puras recombinantes de arroz. Repositório Alice
SILVA, D. R. A.; VIANELLO, R. P.; MENDONÇA, J. A.; CORDEIRO, A. C. C.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve por objetivo identificar genes associados à produtividade por meio da genotipagem por sequenciamento e uma posterior análise de QTL.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: QTL; Arroz; Oryza sativa; Gene.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066155
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Análise de SSRs para retrocruzamento assistido visando introgressão do transgene de resistência ao VMDF. Repositório Alice
MOTA, A. P. S.; MENEZES, I. P. P. de; SOUZA, T. L. P. O. de; FARIA, J. C. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi o de identificar marcadores microssatélites (SSRs) polimórficos entre as cultivares Pérola e BRS Pontal, doadoras do evento 5.1, e as cultivares BRS Estilo, BRS Ametista, BRS Notável e BRS Esplendor, receptoras do transgene, bem como outras cultivares potenciais incluindo BRS Embaixador, Rudá, BRS Agreste, And 277, BRS MG Tesouro, BRSMG Realce, CNFP10729, BRS 9435 Cometa, BRS Horizonte e BRS Esteio.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Virus; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941377
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Análise do transcriptoma de arroz (Oryza sativa) cultivado sob déficit hídrico. Repositório Alice
SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; CARNEIRO, N. P..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene; Genética vegetal; Plant genetics; Plant-water relations; Transcriptome.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974343
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Análise do transcriptoma de arroz (Oryza sativa) cultivado sob déficit hídrico. Repositório Alice
SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; CARNEIRO, N. P..
Neste trabalho analisamos a expressão dos genes relacionados à resposta ao déficit hídrido em tecido foliar de duas cultivares brasileiras de arroz de terras altas, a cultivar tolerante Douradão e a cultivar sensível BRS Primavera. Pela análise de RNA-seq foram identificados em Douradão 27.618 transcritos, sendo 24.090 (87,2%) homólogos ao banco de dados de arroz, enquanto que para BRS Primavera dos 27.221 transcritos 23.663 (86,9%) apresentaram homologia no banco de dados.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Deficiência hídrica.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964157
Registros recuperados: 107
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