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Análises da expressão gênica por PCR quantitativo em tempo real (QPCR) de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. Repositório Alice
VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; FREIRE, L. P.; HEIMBECK, I. G. R.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRAO, M. A. G.; SILVA, V. A.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
A seca é uma das principais limitações climáticas à produção do cafeeiro. A importância dessa limitação deve aumentar, em função das mudanças reconhecidas no clima global e, também, porque a cafeicultura vem sendo expandida para regiões marginais onde a baixa pluviosidade e temperaturas desfavoráveis se constituem grandes limitações à produção do café. A seca induz diversas respostas fisiológicas e moleculares nas plantas, incluindo alterações da expressão gênica, visando atingir ajuste osmótico, a indução de reparadores de sistemas moleculares e a expressão de diversas proteínas protetoras. Existem diversas formas de se avaliar a expressão gênica em plantas submetidas ao estresse hídrico. Uma técnica amplamente utilizada nos últimos anos, para a análise...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea canephora; Expressão gênica; Gene candidato; Seca; Coffea canephora; Candidate genes; Drought; Gene expression.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903864
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Construção de macroarranjos de DNA, a partir do unigene café, para a identificação de genes de interesse agronômico. Repositório Alice
VINECKY, F.; BRITO, K. M.; VIEIRA, N. G.; FERREIRA, D. L. A.; SALES, R. M. O. B.; SILVA, F. R.; ANDRADE, A. C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Café; Unigene; Macroarranjos de DNA; Construção.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188500
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Different molecular mechanisms account for drought tolerance in Coffea canephora var. Conilon. Repositório Alice
VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; FREIRE, L. P.; VINECKY, F.; ELBELT, S.; SILVA, V. A.; MATTA, F. M. da; FERRAO, M. A. G.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
bitstream/item/179852/1/Vieira2013-Article-DifferentMolecularMechanismsAc.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Candidate gene; Real-time quantitative PCR; Coffea Canephora; Drought; Gene expression; Water potential.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/974852
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Ensaio de déficit hidríco de Setaria viridis transformada com o gene órfão CcUNK8 de Coffea canephora. Repositório Alice
DUARTE, K. E.; VIEIRA, N. G.; RÊGO, E. C. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO, A. P.; CUNHA, B. A. D. B. da; MOLINARI, H. B. C.; KOBAYASHI, A. K.; SOUSA, C. A. de; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
As plantas respondem e se adaptam as condições de estresses com uma série de alterações morfológicas, fisiológicas e moleculares. Ao nível molecular, a expressão diferencial de genes para tolerar as condições adversas é um bom indicativo da resposta da planta ao meio ambiente. Encontrar a função destes genes pode facilitar o entendimento da relação planta-ambiente. No intuito de entender os processos que levam algumas plantas a terem uma maior tolerância à seca, ocorreram avanços na descoberta e descrição de genes envolvidos neste processo. Algumas destas sequencias não possuem nenhuma similaridade com sequencias depositadas nos bancos de dados públicos, e são denominadas ?no hits ? ou genes órfãos. O gene CcUNK8 (UNKnown) foi previamente identificado em...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene órfão; Estresse abiótico; Expressão gênica; Gene expression orphan genes; Coffea canephora; Seca; Coffea canephora; Abiotic stress; Drought.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1041178
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Expression of candidates genes for drought tolerance related to ABA signaling in roots of C. Canephora. Repositório Alice
COSTA, T. S.; MELO, J. A. T.; CARNEIRO, F. A.; VIEIRA, N. G.; RÊGO, E. C. S.; LIMA, E. A.; COTTA, M. G.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C..
2015
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffee.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1041805
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Identificação e caracterização de genes órfãos ('NO HITS') de café (Coffea spp.). Repositório Alice
VIEIRA, N. G..
Coffee is one of the most important agricultural commodities worldwide. Breeding programs aimed at introducing new characters to produce novel varieties with superior agronomic traits, such as, uniform flowering, yield, grain size, beverage quality, lower caffeine content, as well as, disease and drought resistance have been ongoing for several decades. However, with a large number of gene sequences available in Coffea spp. databases, the identification and characterization of novel genes with unknown function (no hits) are feasible and necessary. The aim of this study was to identify and functionally characterize no hits found in coffee databases, using in silico analysis and qPCR gene expression. For in silico analyses, no hits were identified by...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Estresse; Expressão gênica; Cafe; Base de dados.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1067199
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Identification of candidate genes for drought tolerance in coffee by high-throughput sequencing in the shoot apex of different Coffea arabica cultivars. Repositório Alice
MOFATTO, L. S.; CARNEIRO, F. de A.; VIEIRA, N. G.; DUARTE, K. E.; VIDAL, R. O.; ALEKCEVETCH, J. C.; COTTA, M. G.; VERDEIL, J-L.; LAPEYRE-MONTES, F.; LARTAUD, M.; LEROY, T.; DE BELLIS, F.; POT, D; RODRIGUES, G. C.; ALSARELLA CARAZZOLLE, M.; PEREIRA, G. A. G.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P..
BACKGROUND: Drought is a widespread limiting factor in coffee plants. It affects plant development, fruit production, bean development and consequently beverage quality. Genetic diversity for drought tolerance exists within the coffee genus. However, the molecular mechanisms underlying the adaptation of coffee plants to drought are largely unknown. In this study, we compared the molecular responses to drought in two commercial cultivars (IAPAR59, drought-tolerant and Rubi, drought-susceptible) of Coffea arabica grown in the field under control (irrigation) and drought conditions using the pyrosequencing of RNA extracted from shoot apices and analysing the expression of 38 candidate genes. RESULTS: Pyrosequencing from shoot apices generated a total of 34.7...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Candidate gene; Coffee; Differential gene expression; RNA-Seq; Real-time PCR (RT-qPCR); Drought; Coffea arabica.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1043710
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Molecular responses of coffee plants to drought stress. Repositório Alice
MARRACCINI, P.; VIEIRA, N. G.; DUARTE, K. E.; AQUINO, S. O.; CARNEIRO, F. A.; COSTA, T. S.; SUJII, P. S.; VINECKY, F.; ALEKCEVETCH, J. C.; ALVES, G. S. C.; LEROY, T.; BELLIS, F. de; FERRÃO, M. A. G.; DAMATTA, F. M.; POT, D.; SILVA, V. A.; RODRIGUES, G. C.; ANDRADE, A. C..
With the aim to investigate the molecular mechanisms underlying drought tolerance in coffee plants of C. canephora and C. arabica, qPCR experiments identified more than 80 candidate genes (CGs) presenting differential gene expression between drought-tolerant and drought-susceptible clones/cultivars cultivated under different (with or without) irrigation conditions.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tolerância à seca; Café; Water stress; Coffea; Drought tolerance.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979069
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RBCS1 expression in coffee: coffea orthologs, coffea arabica homeologs, and expression variability between genotypes and under drought stress. Repositório Alice
MARRACCINI, P.; FREIRE, L. P.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; VINECKY, F.; ELBELT, S.; RAMOS, H. J. O.; MONTAGNON, C.; VIEIRA, L. G. E.; LEROY, T.; POT, D.; SILVA, V. A.; RODRIGUES, G. C.; ANDRADE, A. C..
Background: In higher plants, the inhibition of photosynthetic capacity under drought is attributable to stomatal and non-stomatal (i.e., photochemical and biochemical) effects. In particular, a disruption of photosynthetic metabolism and Rubisco regulation can be observed. Several studies reported reduced expression of the RBCS genes, which encode the Rubisco small subunit, under water stress. Results: Expression of the RBCS1 gene was analysed in the allopolyploid context of C. arabica, which originates from a natural cross between the C. canephora and C. eugenioides species. Our study revealed the existence of two homeologous RBCS1 genes in C. arabica: one carried by the C. canephora sub-genome (called CaCc) and the other carried by the C. eugenioides...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Café; Expressão gênica; Sequência genética; Genética molecular; Coffea arabica; Coffea canephora; Gene expression; Molecular genetics.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/905604
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