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Análise da variabilidade genética de acessos de Psidium spp. (Myrtaceae) avaliados quanto à reação a Meloidogyne enterolobii¹ Rev. Bras. Frutic.
Almeida,Eduardo José; Wickert,Ester; Santos,Jaime Maia; Martins,Antonio Baldo Geraldo.
Este trabalho teve por objetivo a caracterização molecular de 13 acessos de Psidium spp. (Myrtaceae) identificados previamente quanto à reação ao nematoide da goiabeira. A extração do DNA das amostras foi executada conforme o protocolo de Shillito e Saul (1988). Os marcadores moleculares do tipo fAFLP, foram obtidos utilizando-se do 'fAFLP Regular Plant Genomes Fingerprinting Kit' (Applied Biosystems do Brasil Ltda.) onde foram testadas 24 combinações seletivas de primers, das quais 18 apresentaram amplificação que gerou 272 marcadores polimórficos. Para a análise dos marcadores, foram utilizados os softwares GeneScan (ABI Prism versão 1.0) e Genotyper (ABI Prism versão 1.03), e os dados coletados foram transformados em matriz binária que foi analisada no...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Resistência de plantas a doenças; Fruta tropical; Psidium guajava; Nematoide de galha; Marcadores genéticos.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452012000200027
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Bacterial diversity of soil under eucalyptus assessed by 16S rDNA sequencing analysis PAB
Silveira,Érico Leandro da; Pereira,Rodrigo Matheus; Scaquitto,Denilson César; Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Val-Moraes,Silvana Pómpeia; Wickert,Ester; Carareto-Alves,Lúcia Maria; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Studies on the impact of Eucalyptus spp. on Brazilian soils have focused on soil chemical properties and isolating interesting microbial organisms. Few studies have focused on microbial diversity and ecology in Brazil due to limited coverage of traditional cultivation and isolation methods. Molecular microbial ecology methods based on PCR amplified 16S rDNA have enriched the knowledge of soils microbial biodiversity. The objective of this work was to compare and estimate the bacterial diversity of sympatric communities within soils from two areas, a native forest (NFA) and an eucalyptus arboretum (EAA). PCR primers, whose target soil metagenomic 16S rDNA were used to amplify soil DNA, were cloned using pGEM-T and sequenced to determine bacterial diversity....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic diversity; Metagenomic; Microbial communities.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006001000008
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Caracterização de genótipos de Citrus spp. através de marcadores RAPD Ciência Rural
Bastianel,Marinês; Dornelles,Ana Lúcia Cunha; Machado,Marcos Antonio; Wickert,Ester; Maraschin,Simone de Farias; Della Coletta Filho,Helvécio; Schäfer,Gilmar.
Em programas de melhoramento de citros, a caracterização adequada dos recursos genéticos disponíveis é de grande importância, principalmente devido às características biológicas da cultura, como a heterozigosidade, a embrionia nucelar e o longo ciclo reprodutivo. A facilidade com que ocorrem hibridações (interespecíficas e intergenéricas) e a embrionia nucelar favoreceram a formação e a preservação de novas combinações, classificadas como espécies. Neste estudo, marcadores RAPDs foram utilizados para analisar 15 acessos de Citrus spp., sendo quatro variedades de laranjeiras doce (C. sinensis Osbeck), quatro tangerineiras (C. reticulata Blanco, C. nobilis Loureiro, C. sunki Loureiro e C. deliciosa Tenore), uma laranjeira azeda (C. aurantium L.), um...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citrus; Melhoramento; Diversidade.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782001000500004
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Caracterização de três genótipos de umezeiro (Prunus mume Sieb. et Zucc.) por marcadores RAPD Rev. Bras. Frutic.
Mayer,Newton Alex; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo; Pereira,Fernando Mendes; Wickert,Ester.
Um projeto de pesquisa visando à utilização de clones de umezeiro (Prunus mume Sieb. et Zucc.) como porta-enxertos para pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] está sendo conduzido na FCAV/UNESP, Câmpus de Jaboticabal-SP, com promissoras perspectivas de sucesso. Três genótipos de umezeiro foram selecionados de acordo com características agronômicas desejáveis para esta finalidade. A distinção dos três genótipos entre si, baseada exclusivamente em características morfológicas, apresenta limitações. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho foi identificar marcadores RAPD capazes de diferenciar e caracterizar os Clones 05, 15 e a cv. Rigitano (Clone 10) de umezeiro, utilizando-se das cultivares Aurora-1 e Okinawa de pessegueiro como outgroup. Dos 220...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Frutas de caroço; Porta-enxerto; Marcadores moleculares.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452008000400034
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Diversidade genética em maracujazeiro-amarelo utilizando marcadores moleculares fAFLP Rev. Bras. Frutic.
Ganga,Rita Maria Devós; Ruggiero,Carlos; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo; Grili,Gisele Ventura Garcia; Gonçalves,Michele Mantovani; Chagas,Edvan Alves; Wickert,Ester.
Marcadores moleculares fAFLP foram utilizados para estimar a diversidade genética entre 36 acessos de maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa Deg.) coletados em 18 estados do Brasil. Os resultados obtidos permitiram concluir que os marcadores fAFLP se mostraram consistentes na avaliação da variabilidade genética, detectando e quantificando a ampla divergência genética entre os 36 acessos analisados, bem como a não-formação de estruturação geográfica. Tais resultados podem auxiliar na definição de estratégias mais eficientes a serem utilizadas em programas de melhoramento de maracujá-amarelo.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Maracujá; Passiflora edulis f. flavicarpa Deg.; Variabilidade genética.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452004000300029
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Diversidade genética entre progênies e matrizes de rambutan Rev. Bras. Frutic.
Andrade,Renata Aparecida de; Wickert,Ester; Martins,Antonio Baldo Geraldo; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
O rambutan é uma frutífera exótica que apresenta alto potencial de mercado, e suas mudas podem ser obtidas por sementes ou vegetativamente. A produção de mudas via sementes é rotineiramente feita no Estado de São Paulo, tendo-se alta variabilidade no pomar, além de demorar mais tempo para entrar em produção. Embora caracteres morfológicos sejam amplamente usados na diferenciação de variedades, as técnicas moleculares permitem a comparação e a identificação genética dos materiais. Diante disso, o presente trabalho foi realizado, comparando progênies e plantas-matrizes de rambutan, por fAFLP. As análises foram realizadas no Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Plantas, do Departamento de Tecnologia - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias -...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Nephelium lappaceum; FAFLP; Polimorfismo.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452012000200040
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Evaluation of Xylella fastidiosa genetic diversity by fAFPL markers Rev. Bras. Frutic.
Kishi,Luciano Takeshi; Wickert,Ester; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
The first phytopathogenic bacterium with its DNA entirely sequenced is being detected and isolated from different host plants in several geographic regions. Although it causes diseases in cultures of economic importance, such as citrus, coffee, and grapevine little is known about the genetic relationships among different strains. Actually, all strains are grouped as a single species, Xylella fastidiosa, despite colonizing different hosts, developing symptoms, and different physiological and microbiological observed conditions. The existence of genetic diversity among X. fastidiosa strains was detected by different methodological techniques, since cultural to molecular methods. However, little is know about the phylogenetic relationships developed by...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: FAFLP; Xylella fastidiosa; Genetic diversity; DNA fingerprinting.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452008000100037
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Marcadores fAFLP na caracterização de três genótipos de umezeiro selecionados como porta-enxertos para pessegueiro PAB
Wickert,Ester; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo; Pereira,Fernando Mendes; Mayer,Newton Alex.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética existente em três genótipos de umezeiro (Clone 05, cv. Rigitano e Clone 15) e identificar marcadores moleculares fAFLP (fluorescent Amplified Fragment Lenght Polymorphism) passíveis de serem utilizados na discriminação dos três genótipos de umezeiro selecionados como porta-enxertos para pessegueiro. Foram utilizadas 24 diferentes combinações de primers seletivos fAFLP que geraram 648 marcas, das quais 272 foram diferenciadoras dos três genótipos entre si. As marcas diferenciadoras permitiram o agrupamento dos clones de umezeiro de acordo com sua similaridade através do Método da Distância e algorítmo Neighbour Joining. As mesmas marcas foram utilizadas para calcular a distância genética...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Prunus mume; Prunus persica; Marcador molecular.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007001200011
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Molecular characterization of bacterial populations of different soils BJM
Pereira,Rodrigo Matheus; Silveira,Érico Leandro da; Scaquitto,Denilson César; Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Val-Moraes,Silvana Pompéia; Wickert,Ester; Carareto-Alves,Lúcia Maria; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Until recently, few studies were carried out in Brazil about diversity of bacterial soil communities. Aiming to characterize the bacterial population in the soil through 16S rRNA analysis, two types of soil have been analyzed: one of them characterized by intensive use where tomato, beans and corn were cultivated (CS); the other analyzed soil was under forest (FS), unchanged by man; both located in Guaíra, São Paulo State, Brazil. Using specific primers, 16S rRNA genes from metagenomic DNA in both soils were amplified by PCR, amplicons were cloned and 139 clones from two libraries were partially sequenced. The use of 16S rRNA analysis allowed identification of several bacterial populations in the soil belonging to the following phyla: Acidobacteria,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Metagenome; Microbial diversity; 16S rRNA.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822006000400007
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Nitrogen assimilation in Citrus based on CitEST data mining Genet. Mol. Biol.
Wickert,Ester; Marcondes,Jackson; Lemos,Manoel Victor; Lemos,Eliana G.M..
Assimilation of nitrate and ammonium are vital procedures for plant development and growth. From these primary paths of inorganic nitrogen assimilation, this metabolism integrates diverse paths for biosynthesis of macromolecules, such as amino acids and nucleotides, and the central intermediate metabolism, like carbon metabolism and photorespiration. This paper reports research performed in the CitEST (Citrus Expressed Sequence Tag) database for the main genes involved in nitrogen metabolism and those previously described in other organisms. The results show that a complete cluster of genes involved in the assimilation of nitrogen and the metabolisms of glutamine, glutamate, aspartate and asparagine can be found in the CitEST data. The main enzymes found...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Nitrogen assimilation; Citrus; CitEST datamining.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000500009
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Reação de variedades e clones de laranjas a Xylella fastidiosa Rev. Bras. Frutic.
Souza,Paulo Sergio de; Goes,Antonio de; Stuchi,Eduardo Sanches; Jaimes,Elena Paola González; Wickert,Ester; Silva,Simone Rodrigues da; Donadio,Luiz Carlos.
A clorose variegada dos citros (CVC) é uma doença grave, causada por Xylella fastidiosa. As medidas usuais de controle mostram-se pouco eficientes ou práticas e com alto custo. Dessa forma, o uso de variedades resistentes e/ou tolerantes desponta como a alternativa mais eficiente, razão pela qual se julgou oportuna a realização deste trabalho. O presente estudo teve como objetivo avaliar o comportamento de variedades e clones de laranjas introduzidas em relação a X. fastidiosa. Foram estudados 59 variedades e clones de laranjas doces e 2 de laranjas azedas introduzidos da França, Itália e Portugal. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados (DBC), com 62 tratamentos e 4 repetições, incluindo a variedade 'Pêra', como padrão. Cada parcela...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citros; CVC; Bactéria; Tolerância; Doença.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452006000100040
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Relações filogenéticas e diversidade de isolados de Guignardia spp oriundos de diferentes hospedeiros nas regiões ITS1-5,8S-ITS2 Rev. Bras. Frutic.
Wickert,Ester; Goes,Antonio de; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo; Souza,Andressa de; Silveira,Érico Leandro da; Pereira,Fernanda Dias; Rinaldo,Davi.
Fungos do gênero Guignardia são frequentemente isolados em diferentes espécies de plantas, sendo muitas vezes caracterizados como fungos endofíticos. Entretanto, algumas espécies deste fungo, a exemplo de G. citricarpa e G. psidii, são causadores de importantes doenças que afetam culturas agrícolas, como a Mancha-Preta dos Citros (MPC) e a podridão dos frutos de goiabeira, respectivamente. Também são apontados como causadores de manchas foliares em diferentes espécies de frutíferas e também em outras culturas. Este trabalho teve o objetivo de isolar, identificar e caracterizar a diversidade genética existente entre isolados de Guignardia oriundos de citros, mangueira, goiabeira, eucaliptos, jabuticabeira e pitangueira através da análise da sequência de DNA...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fungos endofíticos; Patogênicos; Variabilidade genética.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452009000200010
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Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira Rev. Bras. Frutic.
Zaccaro,Ronaldo Posella; Carareto-Alves,Lucia Maria; Travensolo,Regiane Fátima; Wickert,Ester; Lemos,Eliana Gertrudes Macedo.
O gênero Fusarium é responsável por doenças em diversas plantas economicamente importantes. Entre estas doenças, destaca-se a malformação da mangueira, causada pelo fungo Fusarium subglutinans. O objetivo deste trabalho foi desenvolver oligonucleotídeos iniciadores para reação em cadeia da polimerase (PCR), específicos para o fungo F. subglutinans da mangueira. A amplificação de DNA de oito Fusarium spp. de diferentes hospedeiros, usando o oligonucleotídeo randômico UBC-41 (TTAACCGGGG), produziu um fragmento de aproximadamente 1.300 pb somente para o fungo da mangueira. Tendo em vista que padrões de bandeamento por RAPD não são considerados confiáveis devido à baixa reprodutibilidade dos resultados, o fragmento diferencial foi eluído do gel de agarose,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oligonucleotídeos iniciadores; Mangifera indica; Marcadores moleculares; RAPD-PCR.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452007000300029
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