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Molecular characterization of global maize breeding germplasm based on genome-wide single nucleotide polymorphisms Repositório Alice
LU, Y.; YAN, J.; GUIMARAES, C. T.; TABA, S.; HAO, Z.; GAO, S.; CHEN, S.; LI, J.; ZHANG, S.; VIVEK, B. S.; MAGOROKOSHO, C.; MUGO, S.; MAKUMBI, D.; PARENTONI, S. N.; SHAH, T.; RONG, T.; CROUCH, J. H.; XU, Y..
Characterization of genetic diversity is of great value to assist breeders in parental line selection and breeding system design. We screened 770 maize inbred lines with 1,034 single nucleotide polymorphism (SNP) markers and identified 449 high-quality markers with no germplasm-specific biasing effects. Pairwise comparisons across three distinct sets of germplasm, CIMMYT (394), China (282), and Brazil (94), showed that the elite lines from these diverse breeding pools have been developed with only limited utilization of genetic diversity existing in the center of origin. Temperate and tropical/subtropical germplasm clearly clustered into two separate groups
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Milho; Zea mays; Melhoramento genético vegetal.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/580235
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The draft genome of whitefly Bemisia tabaci MEAM1, a global crop pest, provides novel insights into virus transmission, host adaptation, and insecticide resistance. Repositório Alice
CHEN, W.; HASEGAWA, D. K.; KAUR, N.; KLIOT, A.; PINHEIRO, P. V.; LUAN, J.; STENSMYR, M. C.; ZHENG, Y.; LIU, W.; SUN, H.; XU, Y.; LUO, Y.; KRUSE, A.; YANG, X.; KONTSEDALOV, S.; LEBEDEV, G.; FISHER, T. W.; NELSON, D. R.; HUNTER, W. B.; BROWN, J. K.; JANDER, G.; CILIA, M.; DOUGLAS, A. E.; GHANIM, M.; SIMMONS, A. M.; WINTERMANTEL, W. M.; LING, K.-S.; FEI, Z..
Background: The whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) is among the 100 worst invasive species in the world. As one of the most important crop pests and virus vectors, B. tabaci causes substantial crop losses and poses a serious threat to global food security. Results: We report the 615-Mb high-quality genome sequence of B. tabaci Middle East-Asia Minor 1 (MEAM1), the first genome sequence in the Aleyrodidae family, which contains 15,664 protein-coding genes. The B. tabaci genome is highly divergent from other sequenced hemipteran genomes, sharing no detectable synteny. A number of known detoxification gene families, including cytochrome P450s and UDP-glucuronosyltransferases, are significantly expanded in B. tabaci. Other expanded gene families,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Polyphagy; Whitefly; Draft genome; Bemisia tabaci; Mosca branca; Praga de planta; Plant pests; Virus transmission; Insecticide resistance.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1058708
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