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A 454 multiplex sequencing method for rapid and reliable genotyping of highly polymorphic genes in large-scale studies Inra
Galan, M.; Guivier, E.; Caraux, G.; Charbonnel, N.; Cosson, J.F..
Background: High-throughput sequencing technologies offer new perspectives for biomedical, agronomical and evolutionary research. Promising progresses now concern the application of these technologies to large-scale studies of genetic variation. Such studies require the genotyping of high numbers of samples. This is theoretically possible using 454 pyrosequencing, which generates billions of base pairs of sequence data. However several challenges arise: first in the attribution of each read produced to its original sample, and second, in bioinformatic analyses to distinguish true from artifactual sequence variation. This pilot study proposes a new application for the 454 GS FLX platform, allowing the individual genotyping of thousands of samples in one...
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010d836c75&uri=/notices/prodinra1/2010/12/
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A farm model placing vegetation diversity at the core of the livestock production system organization Inra
Martin, G.; Duru, M.; Martin-Clouaire, R..
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: VEGETATION DIVERSITY; LIVESTOCK PRODUCTION SYSTEM ORGANIZATION;  .
Ano: 2007 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200959dd1b0&uri=/notices/prodinra1/2011/02/
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A l'école buissonnière de la biodiversité administrée et pâturée Inra
Meuret, M.; Micoud, A..
Des politiques publiques européennes visent depuis 15 ans à faire contribuer les activités agricoles, et en particulier l’élevage, à la protection de la biodiversité dans l’espace rural (Opérations Locales Agri-Environnementales, Mesures Agri-Environnementale, Natura 2000). Elles provoquent la rencontre de deux "mondes", techniciens agricoles et naturalistes, jusqu’alors dissociés. Elles exigent de combiner des savoirs fort distincts, mais aussi d’inventer des pratiques, afin de bâtir des cahiers des charges où objectifs et moyens font sens aux yeux de chacun. Menée en Ardèche et dans la Loire, notre recherche a porté sur la conservation et la restauration par le pâturage des pelouses et des landes embroussaillées, espace issus de la déprise agricole et à...
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  .
Ano: 2006 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20097d41cdae&uri=/notices/prodinra1/2010/06/
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A LTR copia retrotransposon and Mutator transposons interrupt Pgip genes in cultivated and wild wheats Inra
Di Giovanni, M.; Cenci, A.; Janni, M.; D'Ovidio, R.
Polygalacturonase-inhibiting proteins (PGIPs) are leucine-rich repeat (LRR) proteins involved in plant defence. Wheat pgip genes have been isolated from the B (Tapgip1) and D (Tapgip2) genomes, and now we report the identification of pgip genes from the A genomes of wild and cultivated wheats. By Southern blots and sequence analysis of BAC clones we demonstrated that wheat contains a single copy pgip gene per genome and the one from the A genome, pgip3, is inactivated by the insertion of a long terminal repeat copia retrotranspon within the fourth LRR. We demonstrated also that this retrotransposon insertion is present in Triticum urartu and all the polyploidy wheats assayed, but is absent in T. monococcum (Tmpgip3), suggesting that this insertion took...
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  .
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009bb334785&uri=/notices/prodinra1/2009/03/
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A multilayer transport model of soil water isotopologues in the root zone: applications for the simulation of 18O/16O signals from wood cellulose and soil CO2 efflux Inra
Ogée, J.; Wingate, L.; JOUANGUY, J.; Bosc, A.; Sartore, M.; Burlett, R.; Bert, D.; Lambrot, C.; Bakker, M.R.; Achat, D..
Tipo: Meeting Paper Palavras-chave:  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20101c99f22f&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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A quantitative assessment of the determinants of the net energy value of biofuels Inra
Bureau, J.C.; Disdier, A.C.; Gauroy, C.; Treguer, D..
Plusieurs études se sont intéressées à la balance énergétique nette des biocarburants et ont évalué les réductions d'émissions de gaz à effet de serre permises par la substitution des biocarburants aux carburants fossiles. Ces études obtiennent des résultats très différents, avec des balances nettes allant de très positives à négatives. Notre étude examine un large échantillon de ces études, sélectionne les principaux paramètres employés et les convertit en unités de mesure comparables. Cette information est ensuite utilisée pour identifier les principaux déterminants des différences en termes de valeur énergétique observées entre les études. Notre approche s'appuie sur des statistiques descriptives et des estimations économétriques basées sur la...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: BIOFUELS; NET ENERGY VALUE; META-ANALYSIS  VALEUR ENERGETIQUE NETTE; META-ANALYSE;  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20102d29f79f&uri=/notices/prodinra1/2011/06/
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A study of drought-induced photosynthesis and stomatal limitations using carbon and oxygen isotope signals in tree-ring cellulose Inra
Herfurth, D..
Tipo: Thesis Palavras-chave:  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20104a994702&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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A whole farm approach based on farm management practices data coupled with crop and grassland mechanistic models Inra
Fiorelli, J.L.; Drouet, J.L.; Duretz, S.; Gabrielle, B.; Cellier, P.; Blanfort, V.; Capitaine, M.; Boisdon, I.; Soussana, J.F..
Les émissions de gaz à effet de serre surviennent à différents niveaux dans le fonctionnement des exploitations agricoles et il est donc incontournable de combiner cycles des éléments et fonctionnement de la ferme dans une approche intégrée globale à l'exploitation. FarmSim est un cadre de simulation permettant d'estimer les émissions en prenant en compte les pratiques agricoles au moyen de modèles dynamiques pour la conduite des prairies et des cultures
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: GAZ A EFFET DE SERRE; CYCLE DES ELEMENTS; APPROCHE INTEGREE;  .
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009ebefb720&uri=/notices/prodinra1/2011/04/
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Accompanying farmers in the search of technical alternatives for Organic Rice Production in Camargue, south of France Inra
Lopez Ridaura, S.; Mouret, J.C.; Hammond, R..
Tipo: Conference Paper Palavras-chave:  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2011d223a938&uri=/notices/prodinra1/2011/04/
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Agriculture biologique et qualité de l'eau : une évaluation des effets de la reconception de systèmes de polyculture élevage Inra
Barataud, F.; Foissy, D.; Burel, E.; Beaudoin, N.; Garnier, J.; Billen, G..
Tipo: Conference Paper Palavras-chave:  .
Ano: 2011 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2011d3bfcbb9&uri=/notices/prodinra1/2011/04/
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Agriculture biologique: quels atouts pour nourrir l'humanité ? Inra
Bellon, S..
Tipo: Meeting Paper Palavras-chave:  .
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009618795e2&uri=/notices/prodinra1/2011/02/
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Alimentation animale. Il y a de bonnes choses à manger derrière la clôture (2) Inra
Meuret, M.. (Interviewé); Nouzille-Fabre d’Anne, C.. (Intervieweur).
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  .
Ano: 2007 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009aedc2e76&uri=/notices/prodinra1/2011/04/
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Alliances et partenaires dans l'activation des compétences des coopératives agricoles Inra
Filippi, M.D.; Triboulet, P..
Peu de travaux se sont intéressés à l’influence de l’espace sur les processus de création et de circulation des compétences entre les organisations. L’objectif de cet article est d’examiner le rôle joué par les modalités de mise en relation des acteurs dans la construction des compétences au niveau local. Mobilisant la littérature sur les alliances stratégiques, nous analysons des études de cas de projets innovants donnant lieu à la création d’une société jointe et impliquant des coopératives agricoles de Midi-Pyrénées (France). Nous proposons une grille d’analyse des partenariats selon le type d’activités et mettons en évidence les différents facteurs liés à l’activation de la proximité géographique et aux compétences mises en jeu aux différents stades du...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ALLIANCE; COMPETENCE; COOPERATIVE AGRICOLE; PROXIMITE GEOGRAPHIQUE ALLIANCE; COMPETENCIES; AGRICULTURAL; GEOGRAPHICAL PROXIMITY; INNOVATION; MIDI PYRENNES;  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2011ead7749a&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Amendements organiques et maraîchage biologique sous abri : résultats en 5ème année d'expérimentation Inra
Bressoud, F.; Pares, L..
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  .
Ano: 2007 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009561d1cdd&uri=/notices/prodinra1/2010/09/
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Analyse des effets du changement climatique sur les interactions eau x azote pour un système prairial Inra
Durand, J.L.; Bernard, F.; Brisson, N.; Ripoche, D.; Déqué, M..
Tipo: Conference Paper Palavras-chave:  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2011423081a1&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Analyse des sources d’incertitudes et de variabilités Inra
Allard, D.; Brisson, N..
Tipo: Conference Paper Palavras-chave:  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20116483df8&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Anticipation et pilotage de l'irrigation Inra
Bergez, J.E.; Carreras, O.; Garcia, F..
Tipo: Book Chapter Palavras-chave: MAIS; ZEA MAYS ; ALEA CLIMATIQUE ; PILOTAGE D'IRRIGATION; ESPACE RURAL; PROCESSUS DECISIONNEL; IRRIGATION; PARTAGE DE LA RESSOURCE; METEO FRANCE; ARVALIS INSTITUT DU VEGETAL; INTELLIGENCE ARTIFICIELLE; ERGONOMIE; EXPERTISE; ;  .
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010986f25a3&uri=/notices/prodinra1/2010/08/
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Approvisionnement en viande de la ville de Garoua (Nord Cameroun) : recomposition des systèmes d'élevage et changements dans la filière Inra
Djamen, P.; Lossouarn, J.; Havard, M..
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: GAROUA; NORD CAMEROUN;  .
Ano: 2006 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007bfa4bff1&uri=/notices/prodinra1/2011/03/
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Arabidopsis plants acclimate to water deficit at low cost through changes of carbon usage: an integrated perspective using growth, metabolite, enzyme, and gene expression analysis Inra
Hummel, I.; Pantin, F.; Sulpice, R.; Piques, M.; Rolland, G.; Dauzat, M.; Christophe, A.; Pervent, M.; Bouteillé, M.; Stitt, M.; Gibon, Y.; Muller, B..
Growth and carbon (C) fluxes are severely altered in plants exposed to soil water deficit. Correspondingly, it has been suggested that plants under water deficit suffer from C shortage. In this study, we test this hypothesis in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) by providing an overview of the responses of growth, C balance, metabolites, enzymes of the central metabolism, and a set of sugar-responsive genes to a sustained soil water deficit. The results show that under drought, rosette relative expansion rate is decreased more than photosynthesis, leading to a more positive C balance, while root growth is promoted. Several soluble metabolites accumulate in response to soil water deficit, with K+ and organic acids as the main contributors to osmotic...
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  .
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010b164e296&uri=/notices/prodinra1/2010/12/
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Arabidopsis TONNEAU1 proteins are essential for preprophase band formation and interact with centrin Inra
Azimzadeh, J.; Nacry, P.; Christodoulidou, A.; Drevensek, S.; Camilleri, C.; Amiour, N.; Parcy, F.; Pastuglia, M.; Bouchez, D..
Plant cells have specific microtubule structures involved in cell division and elongation. The tonneau1 (ton1) mutant ofArabidopsis thaliana displays drastic defects in morphogenesis, positioning of division planes, and cellular organization.These are primarily caused by dysfunction of the cortical cytoskeleton and absence of the preprophase band ofmicrotubules. Characterization of the ton1 insertional mutant reveals complex chromosomal rearrangements leading tosimultaneous disruption of two highly similar genes in tandem, TON1a and TON1b. TON1 proteins are conserved in landplants and share sequence motifs with human centrosomal proteins. The TON1 protein associates with soluble andmicrosomal fractions of Arabidopsis cells, and a green fluorescent...
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  .
Ano: 2008 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200973462ff3&uri=/notices/prodinra1/2009/03/
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