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16S rRNA gene-based identification of microbiota associated with the parthenogenetic troglobiont sand fly Deanemyia maruaga (Diptera, Psychodidae) from central Amazon, Brazil BJM
Sousa,Katianne Barbosa Alves de; Silva,Túllio Romão Ribeiro da; Alencar,Ronildo Baiatone; Baton,Luke Anthony; Naveca,Felipe Gomes; Shimabukuro,Paloma Helena Fernandes.
Bacteria associated with the parthenogenetic troglobiont sand fly Deanemyia maruaga were characterized by sequencing cloned 16S rDNA PCR products. Eleven novel partial 16S rDNA sequences, with varying degrees of similarity to Actinobacteria, were identified. None of the sequences identified had homology to those known from parthenogenesis-inducing bacteria.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Bat guano; Parthenogensis; Sand flies; Troglobiont.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822013000100047
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Ação de actinobactérias da Caatinga no controle de Aspergillus niger produtor de enzimas, ácido cítrico e micotoxinas. Repositório Alice
DIOGO, M. S.; GOULART, A. P.; FONTANA, J.; LEME, M. M. P.; MELO, I. S. de; DIOGO, M. S.; GOULART, A. P.; FONTANA, J.; LEME, M. M. P.; MELO, I. S. de.
Resumo: Aspergillus niger é um fungo de grande importância devido à sua patogenicidade, rodução de micotoxinas, exploração biotecnológica e por ser um organismo eucarioto. Ele é considerado um patógeno oportunista que se propaga de forma eficaz em diferentes ambientes, causando danos a diversas culturas agrícolas. Assim, o objetivo desse trabalho foi avaliar a capacidade de actinobactérias provenientes de solos secos do bioma Caatinga em inibir o crescimento de A. niger. O experimento foi realizado na Embrapa Meio Ambiente, em duas etapas. A primeira etapa consistiu no isolamento e purificação de 117 actinobactérias selecionadas de amostras de solo seco e rizosférico do bioma Caatinga. Na segunda etapa foi realizado o teste de inibição do desenvolvimento...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Actinomiceto; Bactéria; Aspergillus Niger; Controle Biológico; Caatinga; Aflatoxina; Actinobacteria; Fungal diseases of plants; Biological control; Aflatoxins.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126342
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Actinobacteria from brazilian cerrado soil: potential biocontrol agent to soybean and wheat diseases. Repositório Alice
HOYOS, H. A. V.; CASTELIANI, A. G. B.; MORAIS, J. F. A.; CHIARAMONTE, J. B.; MELO, I. S. de.
Abstract: The Cerrado biome, located in the Middle West region of Brazil, has showed a significant increase in soybean (Glycine maxx L. Merrill) and wheat (Triticuma estivum L.) production. In these crops the fungi Sclerotinia sclerotiorum and Magnaphorte grisea constitute severe phytosanitary problems, once they commonly inhabit the soil favored by their latency structures. These fungi are responsible for great economic losses during the entirely crop production cycle. The soil is considered a complex habitat due to the extensive variety of physical, chemical and microbiological processes, and is essential for different forms of life, once this ecosystem offers great support to the maintenance of microbiological diversity. Actinobacteria, one of the main...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Magnaphorte grisea; Biological control; Sclerotinia sclerotiorum; Actinobacteria.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037837
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Antibiosis of actinomycetes from Paullina cupana var. sorbilis (mart.) Ducke against fungi pathogenic. Repositório Alice
LIOTTI, R. G.; MELLO, I. S.; PIETRO-SOUZA, W.; FIGUEIREDO, M. I. S.; SILVEIRA, B. A. V.; SILVA, F. A.; BICHARA, K. P. A.; ALMEIDA, E. G.; SILVA, G. F.; SOARES, M. A..
Guarana (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native species of economic and social importance in Brazil serving the domestic and international demands. This culture is attacked by Colletotrichum guaranicola Albuq. and Fusarium decencellulare Brick, causal agents of anthracnose and overbudding, respectively. Actinomycetes are bacteria that may produce secondary metabolites with antibacterial and antifungal potential. The isolation of endophytic with antibiosis agaist pathogenic fungi is the first step in biological control and bioprospecting antimicrobial compounds programs.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Paullinia cupana; Guaraná; Actinobacteria; Antagonism; Colletotrichum guaranicola; Fusarium decencellulare; Fungo.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1029950
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Antifungal activity of the isolated from caatinga actinobacteria in control of Pythium aphanidermatum. Repositório Alice
PAMPLONA, R. de C. de A.; VILELA, E. S. D.; PANSA, C. C.; CASTELIANI, A. G. B.; MOITINHO, M. A.; MELO, I. S. de.
The Caatinga is a biome located in a semiarid region of northeastern Brazil. It consists of various ecosystems, presented a unique environmental system of this country. Because it is an environment with unique characteristics, recent studies have revealed the private wealth of this biome in terms of microbial biodiversity. Microorganisms found in this habitat may present specific mechanisms to ensure their survival in this environment that provides extreme conditions, such as temperature changes, intense solar radiation and hydrous stress. Because of these different mechanisms used by different microorganisms, becomes an enabling environment to search for new enzymes and bioactive substances produced by these organisms can present different...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caatinga; Pythium aphanidermatum; Actinobacteria.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037848
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Atividade antifúngica e antibacteriana de actinobactérias isoladas do Bioma Caatinga. Repositório Alice
COSTA, F. E. C.; PAIVA, L. F.; PEREIRA, J. S.; FERRARI, A.; SARAIVA, G. K. V.; TEIXEIRA-LOYOLA, A. B. A.; MELO, I. S. de.
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Actinobactérias isoladas; Atividade antifúngica e antibacteriana; Bioma Caatinga; Caatinga; Actinobacteria; Bacteria.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/919677
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Biodiversidade de actinobactérias da rizosfera de plantas da Caatinga. Repositório Alice
LINS, M. R. da C. R.; SILVA, J. J. R. da; TENÓRIO, R. R.; SOARES, E. C. de L.; LINS, C. V.; DINIZ, C. C.; MELO, J. G. da S.; SILVA, J. M.; LIMA, G. M. de S.; MELO, I. S. de.
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caatinga; Rizosfera; Actinobacteria.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/917527
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Bioprospecting of culturable actinobacteria from soil and rhizosphere as potential inhibitors of Sclerotinia sclerotiorum. Repositório Alice
VARGAS-HOYOS, H. A.; CHIARAMONTE, J. B.; SANTOS, S. N.; QUEIROZ, S. C. do N. de; MELO, I. S. de.
White mold, caused by S. sclerotiorum, is one important disease of soybean crops (Glicyne Max. (L)Merrill.) with considerable yield losses. Absence of effective control and resistance of the fungus to commercial fungicides make this phytopathogen a serious problem in tropical regions. Streptomyces species turn out to be potential candidates for agricultural applications due to their biotechnological features. The goal of this research was bioprospecting Streptomyces sp. for biocontrol of white mold. In order to evaluate the antifungal activity, six pre-selected isolates: S. rishiriensis (3AS4), S. albolungus (3BS4), S. champavatti (CanV2 39), S. violascens (CanV2 06f) and S. covourensis (1AS2a, 1AS2c) were used. They were grown for 2 weeks at 28 ºC at 135...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Actinobacteria; Controle biológico; Biocontrol.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1071846
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Characterization and phylogenetic affiliation of Actinobacteria from tropical soils with potential uses for agro-industrial processes. Repositório Alice
DORNELAS, J. C. M.; FIGUEIREDO, J. E. F.; ABREU, C. S. de; LANA, U. G. P.; OLIVEIRA, C. A.; MARRIEL, I. E..
Secondary metabolites produced by Actinobacteria of tropical soils represent a largely understudied source of novel molecules with relevant application in medicine, pharmaceutical and food industries, agriculture, and environmental bioremediation. The present study aimed to characterize sixty-nine Actinobacteria isolated from compost and tropical soils using morphological, biochemical, and molecular methods. All the isolates showed high variation for morphological traits considering the color of pigments of the aerial and vegetative mycelium and spore chain morphology. The enzymatic activity of amylase, cellulase, and lipase was highly variable. The amylase activity was detected in 53 (76.81%) isolates. Eighteen (Streptomyces curacoi) and ACSL 6 (S....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Morphological traits; Identificação molecular; Actinomiceto; Atividade enzimática; Actinobacteria; Enzyme activity; Molecular identification.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076062
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Characterization and phylogenetic affiliation of actinobacteria of biotechnological interest isolated from tropical soils. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. M. D.; ABREU, C. S.; FIGUEIREDO, J. E. F.; LANA, U. G. P.; OLIVEIRA, C. A.; GOMES, E. A.; STOIANOFF, M. A. R.; MARRIEL, I. E..
bitstream/item/166034/1/Characterization-phylogenetic.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Actinomiceto; Enzima; Actinobacteria; Enzymes.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078785
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Composition of bacterial community in enrichment cultures of shale by-products from Irati Formation, Brazil BJM
Goes,Kelly Campos Guerra Pinheiro de; Lovato,Gisele Milani; Andrade,Diva S..
ABSTRACT We examined microbial communities from enriched fine and retorted shale particles using sequencing of V4 variable region of 16S rRNA. High number of microbial genera was found in both enriched shale by-products that were dominate by Actinobacteria, Firmicutes and Proteobacteria, showing differences due to microbial colonization after the pyrolysis process.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Firmicutes; Fine shale particles; Proteobacteria; Retorted shale.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822018000400742
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Draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1 (Thermomonosporaceae) and in silico evidence of its functional role in filter cake biomass deconstruction Genet. Mol. Biol.
Omori,Wellington P.; Pinheiro,Daniel G.; Kishi,Luciano T.; Fernandes,Camila C.; Fernandes,Gabriela C.; Gomes-Pepe,Elisângela S.; Pavani,Claudio D.; Lemos,Eliana G. de M.; Souza,Jackson A. M. de.
Abstract The filter cake from sugar cane processing is rich in organic matter and nutrients, which favors the proliferation of microorganisms with potential to deconstruct plant biomass. From the metagenomic data of this material, we assembled a draft genome that was phylogenetically related to Thermomonospora curvata DSM 43183, which shows the functional and ecological importance of this bacterium in the filter cake. Thermomonospora is a gram-positive bacterium that produces cellulases in compost, and it can survive temperatures of 60 ºC. We identified a complete set of biomass depolymerizing enzymes in the draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1, such as α-amylase, catalase-peroxidases, β-mannanase, and arabinanase, demonstrating the potential of this...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Pectin; Hemicellulose; Crystalline cellulose; Orthologous genes.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572019000100145
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Draft genome sequence of Streptomyces sp. strain F1, a potential source for glycoside hydrolases isolated from Brazilian soil BJM
Melo,Ricardo Rodrigues de; Persinoti,Gabriela Felix; Paixão,Douglas Antonio Alvaredo; Squina,Fábio Márcio; Ruller,Roberto; Sato,Helia Harumi.
ABSTRACT Here, we show the draft genome sequence of Streptomyces sp. F1, a strain isolated from soil with great potential for secretion of hydrolytic enzymes used to deconstruct cellulosic biomass. The draft genome assembly of Streptomyces sp. strain F1 has 69 contigs with a total genome size of 8,142,296 bp and G + C 72.65%. Preliminary genome analysis identified 175 proteins as Carbohydrate-Active Enzymes, being 85 glycoside hydrolases organized in 33 distinct families. This draft genome information provides new insights on the key genes encoding hydrolytic enzymes involved in biomass deconstruction employed by soil bacteria.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Glycoside hydrolases; Streptomyces; Draft genome sequence; Soil bacteria.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822017000400612
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Effect of nickel in the degradation of oil in soils contaminated with petroleum and nickel. Repositório Alice
TAKETANI, N. F.; TAKETANI, R. G.; LEITE, S. G. F.; MELO, I. S. de; LIMA-RIZZO, A. C.; ANDREOTE, F. D.; CUNHA, C. D. da.
Abstract: The pollution originated from the petrochemical industry is currently one of the main environmental concerns. Most of this is due to the high volume of toxic hydrocarbons that are produced and transported around the globe. However, this industry is also associated with toxic metals that are minor components of petroleum and used during refining processes. Here we have evaluated the impact of nickel in the biodegradation of crude oil in natural soils. We have assessed bacterial community profiles in these samples using ion torrent 16S rRNA gene sequencing and Real-Time PCR quantification and shotgun metagenome sequencing. We have found that the contamination with oil and nickel reduced the bacterial abundance compared with only soil. There was...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Metagenome; Metal contamination; Hydrocarbon remediation; Contaminação; Poluição do Solo; Petróleo; Níquel; Bactéria; Metagenomics; Soil pollution; Petroleum; Actinobacteria; Decontamination.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125486
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Effect of sulfonylurea tribenuron methyl herbicide on soil Actinobacteria growth and characterization of resistant strains BJM
Rachedi,Kounouz; Zermane,Ferial; Tir,Radja; Ayache,Fatima; Duran,Robert; Lauga,Béatrice; Karama,Solange; Simon,Maryse; Boulahrouf,Abderrahmane.
ABSTRACT Repeated application of pesticides disturbs microbial communities and cause dysfunctions on soil biological processes. Granstar® 75 DF is one of the most used sulfonylurea herbicides on cereal crops; it contains 75% of tribenuron-methyl. Assessing the changes on soil microbiota, particularly on the most abundant bacterial groups, will be a useful approach to determine the impact of Granstar® herbicide. For this purpose, we analyzed Actinobacteria, which are known for their diversity, abundance, and aptitude to resist to xenobiotic substances. Using a selective medium for Actinobacteria, 42 strains were isolated from both untreated and Granstar® treated soils. The number of isolates recovered from the treated agricultural soil was fewer than that...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bacterial diversity; Actinobacteria; Granstar® herbicide; Resistance; 16S rRNA genes.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822018000100079
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Identificação de actinobacterias patogênicas em queijo por PCR e MALDI-TOF. Repositório Alice
BACANELLI, G. M.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; OLARTE, L.; VERBISCK, N. V.; SILVA, M. R.; ARAUJO, F. R..
No Brasil é comum o consumo de queijo do tipo Minas artesanal produzido a partir de leite cru, contudo este fato pode representar risco para a saúde pública, pois muitos microorganismos patogênicos têm sido identificados nestes produtos. O objetivo deste trabalho foi identificar actinobactérias patogênicas em queijo por métodos de PCR e MALDI-TOF. Foram analisadas 54 amostras de queijo tipo Minas oriundos da região do Serro de Minas Gerais, Brasil.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Leite; Saúde Pública; Bactéria Patogênica; Gene; Queijo de Minas; Actinobacteria.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1098794
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Identification and in vitro antagonistic activity of actinobacteria against Pantoea ananatis, the causal agent of maize white spot disease. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. M. D.; LANA, U. G. P.; FIGUEIREDO, J. E. F.; ABREU, C. S.; OLIVEIRA, C. A.; COTA, L. V.; GOMES, E. A.; STOIANOFF, M. A. R.; MARRIEL, I. E..
bitstream/item/166030/1/Identification-vitro.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Doença foliar; Doença de planta; Controle biológico; Actinomiceto; Biological control; Foliar diseases; Actinobacteria.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078781
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In vitro evaluation of novel crude extracts produced by actinobacteria for modulation of ruminal fermentation R. Bras. Zootec.
Alves,Bruna Gomes; Martins,Cristian Marlon de Magalhães Rodrigues; Peti,Ana Paula Ferranti; Moraes,Luiz Alberto Beraldo de; Santos,Marcos Veiga dos.
ABSTRACT We evaluated the inclusion of two crude extracts produced by Streptomyces genus on in vitro dry matter and organic matter digestibility (IVDMD; IVOMD), cumulative gas production, volatile fatty acids (VFA), and methane (CH4) and ammoniacal nitrogen (NH3-N) concentration. The experimental design was randomized blocks with three blocks and four treatments: AMC (1.2 mg/25 mL ruminal inoculum), Caat (1.2 mg/25 mL ruminal inoculum), negative control (no inclusion of extracts), and positive control (sodium monensin, 1.7 mg/25 mL ruminal inoculum). Ruminal fluid samples were collected from three multiparous Holstein dairy cows fitted with ruminal cannula and incubated in a 24-h fermentation assay. There was no effect of crude extract inclusion in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Extracts; In vitro fermentation; Monensin.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982019000100721
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Influência da temperatura e meios de cultura na atividade antimicrobiana produzida por actinobactérias isoladas da rizosfera de Licania rigida Benth da caatinga nordestina - Brasil. Repositório Alice
COSTA, E. P.; SOARES, E. C. de L.; LUCIO, D. F.; GODOY, M. F.; MELO, I. S. de; ARAÚJO, J. M.; PORTO, A. L. F..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Influência da temperatura; Caatinga; Rizosfera; Temperatura; Actinobacteria; Licania; Antimicrobial agents.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/917617
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Microrganismos endofíticos de mandioca de áreas comerciais e etnovariedades em três estados brasileiros. Repositório Alice
TEIXEIRA, M.A.; MELO, I.S. de; VIEIRA, R.F.; COSTA, F.E.C.; HARAKAVA, R..
O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento da diversidade de microrganismos endofíticos, em plantas de mandioca (Manihot esculenta Crantz) coletadas de áreas comerciais, no Estado de São Paulo, e de etnovariedades dos estados do Amazonas e Bahia e, também, avaliar seu potencial para fixar N atmosférico e para produzir ácido indolacético. Nos três estados, foram identificadas 47 espécies de microrganismos pertencentes a 27 gêneros. Bacillus spp. foi o mais freqüente em todas as regiões. O maior número de gêneros foi encontrado em plantas provenientes do Estado do Amazonas, que apresenta a maior diversidade de microrganismos endofíticos. Amplificações por PCR do gene nifH foram avaliadas em espécies bacterianas pertencentes às -Proteobacteria....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Manihot esculenta; Bacillus; Actinobacteria; Fixação de nitrogênio; Ácido indolacético; Nitrogen fixation; Indol-acetic acid.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/120712
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