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Adaptabilidade e estabilidade da produção de borracha e seleção em progênies de seringueira. Repositório Alice
VERARDI, C. K.; RESENDE, M. D. V. de; COSTA, R. B. da; GONÇALVES, P. de S..
Os objetivos deste trabalho foram determinar a interação genótipo x ambiente e a estabilidade e adaptabilidade da produção de borracha em progênies de seringueira (Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Müll. Arg.), bem como estimar o ganho genético com a seleção dos materiais mais produtivos. Foram utilizadas três populações de progênies de meios-irmãos de seringueira, cultivadas em três municípios do Estado de São Paulo. Os experimentos foram instalados em delineamento de blocos ao acaso com 22 progênies, 6 repetições e 10 plantas por parcela, com espaçamento de 1,5x1,5 m. Aos três anos de idade, as progênies foram avaliadas quanto à produção de borracha seca utilizando-se o teste precoce de produção Hamaker Morris-Mann. As análises de estabilidade e...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Hevea brasiliensis; BLUP; Interação genótipo x ambiente; Modelo misto; REML; Seleção genética; Borracha; Produção; Seringueira; Progênie.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/580002
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Alternativas de análise de ensaios em látice no melhoramento vegetal PAB
BUENO FILHO,JÚLIO SÍLVIO DE SOUSA; VENCOVSKY,ROLAND.
Compararam-se diferentes formas de análise de experimentos em blocos incompletos, abordadas como casos particulares de modelos mistos, quais sejam: (a) análise intrablocos, em que apenas o efeito do erro experimental é suposto aleatório; (b) análise interblocos (látice), com efeitos de blocos supostos aleatórios; (c) análise BLUP, com os efeitos de tratamentos supostos aleatórios, e (d) modelo aleatório. Além disso, montou-se a ANAVA, considerando duas alternativas: (e) usando o quadrado médio de tratamentos ajustados para blocos e o quadrado médio do erro efetivo do látice; (f) tomando as repetições como blocos completos. Um exemplo de análise de um teste de progênies de Eucalyptus grandis (Hill) Maiden ilustra as implicações da escolha dos modelos para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelos lineares; Delineamentos experimentais; Blocos incompletos parcialmente balanceados; Modelos mistos; BLUP.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2000000200004
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Aplicação do melhor predator linear não-viesado (BLUP) no método de seleção entre e dentro de progênies de meios irmãos na população de milho CMS-39. Repositório Alice
PACHECO, C.A.P.; RIBEIRO JUNIOR, J.I.; CRUZ, C.D..
1996
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Selecao; Metodo; BLUP; SEDPMI; Zea mays; Maize; Selection; Method.
Ano: 1996 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/472836
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Avaliação genética de indivíduos e progênies de cupuaçuzeiro no Estado do Pará e estimativas de parâmetros genéticos. Repositório Alice
ALVES, R. M.; RESENDE, M. D. V. de.
O presente trabalho relata a avaliação genotípica de progênies de cupuaçuzeiro, no Estado do Pará, para os caracteres número de frutos (NF) em quatro safras, intensidade de ocorrência de vassoura- de-bruxa na inflorescência (VBI) e nos frutos (VBF), e peso de vassoura-de-bruxa (PVB). Apresenta também estimativas de parâmetros genéticos que permitem inferir sobre o controle genético e nível de variabilidade genética presente no material avaliado. Todos os caracteres apresentaram considerável variabilidade genética, com coeficientes de variação genética variando de 27% a 88% no âmbito de progênie e de 38% a 123% no âmbito individual. Isto revela excelentes possibilidades para a seleção nessa população experimental híbrida. As estimativas de herdabilidade...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Theobroma grandiflorum; Cupuaçuzeiro; Herdabilidade; Repetibilidade; Método de seleção; REML; BLUP.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/314931
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Avaliação genética de indivíduos e progênies de cupuaçuzeiro no Estado do Pará e estimativas de parâmetros genéticos. Repositório Alice
ALVES, R. M.; RESENDE, M. D. V. de..
O presente trabalho relata a avaliação genotípica de progênies de cupuaçuzeiro, no Estado do Pará, para os caracteres número de frutos (NF) em quatro safras, intensidade de ocorrência de vassoura- de-bruxa na inflorescência (VBI) e nos frutos (VBF), e peso de vassoura-de-bruxa (PVB). Apresenta também estimativas de parâmetros genéticos que permitem inferir sobre o controle genético e nível de variabilidade genética presente no material avaliado. Todos os caracteres apresentaram considerável variabilidade genética, com coeficientes de variação genética variando de 27% a 88% no âmbito de progênie e de 38% a 123% no âmbito individual. Isto revela excelentes possibilidades para a seleção nessa população experimental híbrida. As estimativas de herdabilidade...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Theobroma grandiflorum; Cupuaçuzeiro; Herdabilidade; Repetibilidade; Método de seleção; REML; BLUP.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/409964
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Combining ability among apomictic and sexual parents of Urochloa humidicola. Repositório Alice
FIGUEIREDO, U. J. de; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; NUNES, J. A. R..
The diallel cross constitutes an informative genetic design for choosing genitors and crosses in breeding programmes since it provides estimates of general (GCA) and specific (SCA) combining abilities. Because the breeding programme for Urochloa humidicola ([Rendle] Morrone & Zuloaga; syn. Brachiaria humidicola [Rendle] Schweick) at Embrapa Beef Cattle is recent, these estimates are still unknown. Thus, the aim of this study was to obtain the estimates of GCA and SCA from the partial diallel cross design between sexual and apomictic parents. The crosses involved nine sexual and ten apomictic parents. Seventy‐one full‐sib progenies were obtained and evaluated in an incomplete block design, using all parents and the cv. BRS Tupi as a...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: BLUP; Partial diallel; Brachiaria Humidicola; Apomixis; Hybrids.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117791
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Comparação de metodologias de seleção sob oscilação genética Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Carneiro,P.L.S.; Malhado,C.H.M.; Affonso,P.R.A.M.; Euclydes,R.F.; Carneiro,A.P.S.; Cunha,E.E.; Souza,L.G.R..
Determinou-se o número adequado de repetições na comparação de métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares, com diferentes tamanhos efetivos e sob diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados, usando simulação com o programa GENESYS. Para comparar os diferentes métodos de seleção utilizaram-se populações com tamanhos efetivos de 18,18 (TE1) e de 66,66 (TE2) e uma, 10 e 30 repetições por geração, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Para as situações com apenas uma repetição, os resultados apresentaram incoerências, independentemente do tamanho efetivo (TE1 ou TE2) ou do sistema de acasalamento (RAA - reprodutores acasalados aleatoriamente, EIC - exclusão de irmãos completos ou EICMI - exclusão de irmãos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Marcador molecular; Tamanho efetivo de população; Sistema de acasalamento.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000400024
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Comparação de métodos de seleção em populações simuladas de frangos de corte PAB
Oliveira,Claudine Gonçalves de; Cunha,Elizângela Emídio; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Euclydes,Ricardo Frederico; Malhado,Carlos Henrique Mendes.
Populações de frangos de corte foram simuladas utilizando-se o programa GENESYS, com o objetivo de avaliar a seleção com base no método da melhor predição linear não-viesada (BLUP - best linear unbiased prediction), a seleção individual para três tamanhos efetivos de população e três sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados. Simulou-se um genoma constituído de uma característica quantitativa, com valor de herdabilidade igual a 0,30, em seleção praticada durante 15 gerações consecutivas, com 30 repetições por geração. Para um mesmo tamanho efetivo e sistema de acasalamento, o BLUP foi sempre superior à seleção individual nas 15 gerações de seleção avaliadas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Seleção individual; Sistemas de acasalamento; Tamanho efetivo de população.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005001000004
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Computing algorithm for dairy sire evaluation on several lactations considered as the same trait Inra
Bonaiti, B.; Briend, M..
Une méthode de calcul est proposée pour l’indexation des taureaux laitiers sur plusieurs lactations, considérées comme un seul caractère, quand le modèle d’analyse doit tenir compte des effets troupeau-année (HY), d’environnement autres que HY (ENV), vache et père. Après une présentation des équations conduisant aux estimations des différents effets et des méthodes de résolution, quelques améliorations sont proposées : 1) Une méthode est décrite pour l’absorption des équations vache. 2) Au lieu de recourir à l’absorption des équations HY, qui. serait trop longue, il est possible d’obtenir les solutions correspondantes aux effets HY, ENV et père par une procédure itérative. 3) En exprimant les performances antérieures en écart aux effets HY et ENV,...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VALEUR GENETIQUE; BLUP; BOVINS LAITIERS; ALGORITHME DE CALCUL.
Ano: 1986 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008cdf5fc12&uri=/notices/prodinra1/2008/01/
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Critere optimal de selection. Quelques resultats generaux. Inra
Goffinet, B.; Elsen, J.M..
Dans l’axe du travail de COCHRAN (1951) appliqué à l’amélioration génétique des animaux, on donne les méthodes de sélection qui maximisent l’espérance de la valeur des retenus, dans diverses situations expérimentales : informations inégales et variables sur les candidats, nombre de mâles mis en testage aléatoire, existence d’effets élevage ou année, etc. On montre que, dans toutes ces situations, la méthode classique consistant à sélectionner les individus dont l’indice dépasse un seuil se généralise. Ce seuil est unique pour tous les candidats et l’indice obtenu est l’espérance conditionnelle de la valeur génétique sachant l’information sur le candidat ; cette dernière étant « orthogonalisée » par rapport aux effets fixes.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CRITERE DE SELECTION; PROGRES GENETIQUE; BLUP.
Ano: 1984 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB8607227001842&uri=/notices/prodinra1/2008/02/
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Desempenho genotípico de linhagens de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos Bragantia
Borges,Vanderley; Soares,Antonio Alves; Reis,Moizés Souza; Resende,Marcos Deon Vilela; Cornélio,Vanda Maria Oliveira; Leite,Natália Alves; Vieira,Antonio Rodrigues.
Avaliou-se o desempenho de genótipos de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos. Foram utilizados dados de produtividade de grãos dos ensaios de valor de cultivo e uso (VCU) do programa cooperativo de melhoramento de arroz de terras altas, desenvolvido em Minas Gerais, no período de 1997/1998 a 2007/2008. Realizou-se análise de deviance para verificar a significância dos efeitos de genótipos e suas interações com locais e anos, obtendo-se a estabilidade e a adaptabilidade genotípicas, com os métodos da média harmônica dos valores genotípicos. Os efeitos de genótipos, genótipos x locais e genótipos x anos foram estatisticamente significativos (p<0,05). As linhagens e cultivares mais estáveis foram: Curinga-3, CNA 8983, Guarani,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; REML; BLUP; Estabilidade genotípica; Adaptabilidade.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052010000400008
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Early assessment of first year height data from five Acacia mearnsii (black wattle) sub populations in South Africa using REML/BLUP. Repositório Alice
DUNLOP, R. W.; RESENDE, M. D. V. de.; BECK, S. L..
Recent research has shown, Acacia mearnsii (black wattle) to be a source of high quality pulp. This led to a change in the emphasis in the breeding programme at the Institute for Commercial Forestry Research, from improving bark yield and quality, to improving timber yield and quality while maintaining an acceptable bark quality. A Multiple Population Breeding Strategy was implemented to cater for these changes. Five sub-populations were established across different sites in KwaZulu- Natal and were determined by origin of seed. Each sub-population was established as a progeny trial with a seedling seed orchard adjacent to it. The management of the seed orchards will be determined according to the performance of the families within the progeny trials. This...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Acácia mearnsii; BLUP; REML.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/312021
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Early selection in sugarcane family trials via BLUP and BLUPIS procedures. Repositório Alice
OLIVEIRA, R. A. de; DAROS, E.; RESENDE, M. D. V. de; BESPALHOK FILHO, J. C.; José Luis Camargo Zambon; RUARO, L..
The objective of this study was to compare early selection in sugarcane families through the best linear unbiased prediction (BLUP) and simulated individual best linear unbiased prediction (BLUPIS) procedures. We tested 80 full-sib families in an incomplete block experimental design. Statistical analyses were performed using the mixed model methodology. The following traits were determined from the first rattoon: tons of stalks per hectare (TSH), percentage of soluble solids w/w in the juice (Brix), and tons of brix per hectare (TBH). Variance components were estimated by restricted maximum likelihood (REML), and the genotypic values of the families were predicted by BLUP and BLUPIS. The BLUPIS procedure suggested the selection of 30 families with a total...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Saccharum; Cana de açucar; Melhoramento vegetal; Modelo misto; Seleção de famílias; Famílias de irmãos-germanos; Plant breeding; Mixed models; Family selection; Full-sib families; BLUP; BLUPIS.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974624
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Ecriture des équations du BLUP multicaractères Inra
Foulley, J.L.; Calomiti, S.; Gianola, D..
Cet article formalise l’écriture des équations du BLUP multicaractères dans la situation où tous les caractères sont affectés par les mêmes facteurs de variation. Deux cas sont distingués selon que l’information sur les caractères est complète ou non. En présence d’un seul facteur aléatoire et quand tous les caractères sont contrôlés, le problème se simplifie beaucoup grâce à une transformation canonique des données (ou directement des seconds-membres) et revient à calculer le BLUP unicaractère de chacune des variables canoniques. Dans le cas d’information incomplète, on est conduit à subdiviser l’échantillon en ensembles d’individus homogènes entre eux quant aux caractères contrôlés et tels que les résiduelles du modèle relatives aux variables...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: BLUP; ECRITURE D'EQUATION; MULTICARACTERE; FACTEUR DE VARIATION.
Ano: 1982 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008995b4af&uri=/notices/prodinra1/2008/03/
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Efeito da conexidade de dados sobre a acurácia dos testes de progênie e performance R. Bras. Zootec.
Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Dados simulados foram utilizados para verificar o efeito da conexidade sobre a acurácia dos testes de progênie e performance. O genoma simulado foi constituído de uma característica quantitativa governada por 500 locos. Simulou-se o efeito de rebanho (9 rebanhos) significativo a 5% de probabilidade pelo teste F. Foram simulados arranjos de dados com 0, 15, 30, 60, 90 e 100% de conexidade para herdabilidades 0,10; 0,30; e 0,60 e para diferentes tamanhos de progênie (9, 54 e 90 progênies/reprodutor). A cada geração foram selecionados nove machos e o número de fêmeas selecionadas variou de acordo com o número de progênies considerado em cada arranjo de dados. A seleção foi efetuada em dez gerações, sendo este processo repetido por 30 vezes. O uso de dados com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; BLUP; Seleção e simulação.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000200007
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Efeito da conexidade de dados sobre o valor fenotípico médio e a variância genética aditiva R. Bras. Zootec.
Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Dados simulados foram utilizados para verificar o efeito da conexidade sobre o valor fenotípico médio e a variância genética aditiva. O genoma simulado foi constituído de uma característica quantitativa governada por 500 locos. Simulou-se o efeito de rebanho (9 rebanhos) significativo a 5% de probabilidade pelo teste F. Foram simulados arranjos de dados com 0, 15, 30, 60, 90 e 100% de conexidade para herdabilidades 0,10; 0,30; e 0,60 e para diferentes tamanhos de progênie (9, 54 e 90 progênies/reprodutor). A cada geração foram selecionados nove machos e o número de fêmeas selecionadas variou de acordo com o número de progênies considerado em cada arranjo de dados. A seleção foi efetuada em dez gerações, sendo este processo repetido por 30 vezes. O uso de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; BLUP; Seleção e simulação.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000200006
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Efeito da seleção errônea de machos sobre ganhos genéticos, utilizando-se simulação R. Bras. Zootec.
Carneiro,Paulo Luiz Souza; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Carneiro,Antônio Policarpo Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Populações simuladas foram usadas para verificar o efeito de erros na seleção de machos sobre estimativas de ganhos genéticos, ao longo de dez gerações de seleção, usando o BLUP. Cinco níveis de erros na seleção de machos (0, 5, 10, 15 e 20%) e três herdabilidades (0,10; 0,30; e 0,60) foram trabalhados. Vinte machos e 200 fêmeas foram selecionados pelo BLUP. Após a seleção dos 20 machos em cada geração, 1, 2, 3 e 4 reprodutores foram substituídos por outros aleatoriamente. Os valores fenotípicos e a eficiência do BLUP com erro, em relação ao BLUP sem erro, foram reduzidos com o aumento no nível de erro. A redução dos ganhos genéticos, em função da inclusão deste tipo de erro, não apresentou, aparentemente, associação com a herdabilidade da característica.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Ganho genético; Seleção; Simulação.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35981999000200007
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Efeito da violação de pressuposições da metodologia de modelos mistos na avaliação genética animal Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Fonseca,R.; Euclydes,R.F.; Torres,R.A.; Ribeiro Júnior,J.I.; Lopes,P.S.; Silva,M.A..
Estudos de simulação foram conduzidos para verificar o efeito da violação de pressuposições da metodologia de modelos mistos, variâncias genéticas conhecidas sem erro e distribuição normal dos erros aleatórios sobre os ganhos genéticos obtidos durante 10 gerações de seleção. Outros parâmetros, como valor fenotípico e acurácia, também foram avaliados. Inicialmente, foi simulado um genoma constituído de uma única característica quantitativa governada por 500 locos. O genoma foi utilizado na construção de uma população-base, na qual a característica quantitativa possuía herdabilidade inicial de 0,10. Para se obter uma estrutura de parentesco a partir das populações-base, foi gerada uma população inicial a partir da qual o processo de seleção teve início e os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Metodologia de modelos mistos; Pressuposições; Variância genética aditiva; Distribuição dos erros aleatórios.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352001000100020
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Efeito de erros de pedigree na seleção R. Bras. Zootec.
Carneiro,Paulo Luiz Souza; Euclydes,Ricardo Frederico; Silva,Martinho de Almeida e; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Carneiro,Antônio Policarpo Souza; Torres Filho,Rodolpho de Almeida.
Dados simulados com cinco níveis de erros de pedigree (0, 5, 10, 15 e 20%) e três herdabilidades (0,10; 0,30; e 0,60) foram usados para verificar o efeito de erros de pedigree na seleção por 10 gerações consecutivas. Os maiores valores fenotípicos e de eficiência sobre a seleção individual, em geral, foram obtidos com o BLUP sem erro, seguidos daqueles com 5, 10, 15 e 20% de erro. A superioridade média em ganho genético do BLUP por geração, nos vários níveis de erros, sobre a seleção individual, decresceu com o aumento da herdabilidade da caraterística. Na medida em que se elevaram os níveis de erros, o BLUP apresentou maior redução no ganho genético para as características com menores herdabilidades.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Ganho genético; Seleção individual; Simulação.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35981999000200008
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Efeito do tamanho de grupos contemporâneos na predição dos valores genéticos. Repositório Alice
MARTINS, W. M. de O.; CARNEIRO JUNIOR, J. M..
Um dos principais objetivos da avaliação animal consiste na predição dos valores genéticos individuais para uma determinada característica. Entretanto, nem sempre, os melhores fenótipos representam as melhores opções genéticas de um rebanho. No intuito de contornar essa dificuldade, metodologias estatísticas foram desenvolvidas, culminando coma utilização das Equações de Modelos Mistos de Henderson, para obtenção do BLUP (Melhor Preditor Linear Não Viesado). Para obtenção de valores genéticos com maior acurácia, tão importante quanto a utilização desta metodologia, é a perfeita identificação e estruturação dos grupos de contemporâneos. Uma das principais dificuldades encontradas na formação de grupos de contemporâneos é a definição do tamanho ideal, de...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; Avaliação genética; Bovino; BLUP; Grupos contemporâneos; Valores genéticos.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/510524
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