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Common virulence factors and genetic relationships between O18 : K1 : H7 Escherichia coli isolates of human and avian origin Inra
Moulin-Schouleur, M.; Schouler, C.; Tailliez, P.; Kao, M.R.; Brée, A.; Germon, P.; Oswald, E.; Mainil, J.; Blanco, M.; Blanco, J..
Extraintestinal pathogenic (ExPEC) Escherichia coli strains of serotype 018:K1:H7 are mainly responsible for neonatal meningitis and sepsis in humans and belong to a limited number of closely related clones. The same serotype is also frequently isolated from the extraintestinal lesions of colibacillosis in poultry, but it is not well known to what extent human and avian strains of this particular serotype are related. Twenty-two ExPEC isolates of human origin and 33 isolates of avian origin were compared on the basis of their virulence determinants, lethality for chicks, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) patterns, and classification in the main phylogenetic groups. Both avian and human isolates were lethal for chicks and harbored similar virulence...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VIRULENCE; CAPSIDE.
Ano: 2006 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008476ee533&uri=/notices/prodinra1/2009/03/
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Essai de classification des phytovirus par leur protéine capsidaire IRD
Fauquet, Claude.
L'utilisation simultanée des statistiques multivariées et des analyseurs automatiques de protéines a permis de choisir la composition en acides aminés des protéines capsidaires de virus de plantes comme critère de classification. Une classification multidimensionnelle des virus de plantes pris dans leur ensemble ou par sous-groupes est proposée, ainsi qu'un tableau des distances de tous les virus entre eux. Ce seul critère permet de classer les virus dans un hyper-espace multidimensionnel, apportant ainsi une notion de continuum dans le monde des virus. Nous pouvons aisément y retrouver la classification, habituellement utilisée pour les virus de plantes. Les analyses discriminantes mettent en évidence le fait qu'il y a eu co-évolution entre les propriétés...
Tipo: Text Palavras-chave: MICROORGANISME; PHYTOVIRUS; CAPSIDE; PLANTE HOTE; ACIDE AMINE; CLASSIFICATION; ANALYSE MULTIVARIABLE; STRUCTURE; TRANSMISSION; DENDROGRAMME; SEROLOGIE; PROTEINE CAPSIDAIRE; CLASSIFICATION MULTIDIMENSIONNELLE.
Ano: 1987 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:24203
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Folding of the rabbit hemorrhagic disease virus capsid protein and delineation of N-terminal domains dispensable for assembly Inra
Laurent, S.; Kut, E.; Remy-Delaunay, S.; Rasschaert, D..
 Rabbit hemorrhagic disease virus (RHDV) and European brown hare syndrome virus (EBHSV) are caliciviruses that produce severe symptoms and are lethal to rabbits and hares. The folding of the capsid protein was studied by determination of the antigenic pattern of chimeric capsid proteins, composed of regions from RHDV and EBHSV capsid proteins. The anti-RHDV monoclonal antibody (MAb) E3, which is known to bind an external conformational epitope, recognized the RHDV C-terminal region. The anti-RHDV MAb A47, which binds a buried epitope, recognized the RHDV N-terminal region. Using a pGEX expression library, we more precisely mapped the MAb A47 epitope on a 31 residues length peptide, between residue 129 and 160 of the VP60, confirming its location in the...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CAPSIDE; MALADIE HEMORRHAGIQUE DU LAPIN.
Ano: 2002 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB0200010738094298&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Migration des virus dans la plante. Revue bibliographique Inra
Nono-Womdim, R.; Gebre-Selassie, K.; Marchoux, G..
Afin de générer une infection, un virus doit migrer dans sa plante hôte. Il existe 2 formes de migration des virus dans la plante : la migration à courte distance et la migration à longue distance. La migration à courte distance s’effectue de cellule à cellule. Au cours de ce processus, le virus migre des cellules infectées aux cellules adjacentes par les plasmodesmes. Plusieurs résultats indiquent que ce type de transport est sous le contrôle partiel du virus. En effet, chez différents phytovirus tels que le TMV, le TRV, le CPMV, l’AMV, le CaMV..., une ou plusieurs protéines, ayant une fonction de transport et dont les mécanismes d’action sont discutés, ont été caractérisées. La migration à longue distance qui s’effectue par les vaisseaux conducteurs est...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PROTEINE DE TRANSPORT; TISSU CONDUCTEUR; PROTEINE VIRALE; CAPSIDE; COMPLEMENTATION; PLANTE HOTE.
Ano: 1993 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9400024202038152&uri=/notices/prodinra1/2009/11/
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Nucleotide sequence of the 3'terminal region of the genome of four Lettuce mosaic virus isolates from Greece and Yemen Inra
Revers, F.; van der Vlugt, R.A.A.; Souche, S.; Lanneau, M.; Lot, H.; Candresse, T.; Le Gall, O..
 Lettuce mosaic virus (LMV) is an economically important Potyvirus causing a severe disease of commercial lettuce crops. Based on molecular data, three phylogenetic groups of isolates have previously been discriminated, reflecting their geographical origin (Western Europe-California, Greece, or Yemen). Sequence information for the entire coat protein domain was only available for one of the Western Europe-California phylogenetic group. We have now sequenced the 3′ terminal region of the genome LMV-Gr4, -Gr5 and -GrB, isolates which belong to the Greek phylogenetic group and of LMV-Yar, the sole known representative of the third LMV phylogenetic group. The region sequenced encodes the last 62 amino-acids of the polymerase and the entire coat protein of the...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: POTYVIRUS; CAPSIDE; VIRUS DES VEGETAUX; MALADIE DES PLANTES; SEQUENCE NUCLEOTIDIQUE; CEE; CEE.
Ano: 1999 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9900011950079457&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Polymorphisme des régions capside et 3’NTR de 3 isolats tunisiens du virus Y de la pomme de terre (PVY) Inra
Fakhfakh, H.; Makni, M.; Robaglia, C.; Elgaaied, A.; Marrakchi, M..
En Tunisie, le virus Y de la pomme de terre (PVY) occasionne des pertes importantes sur la production des cultures maraîchères, en particulier le piment. Le séquençage de la région 3’ non codante (3’NTR) et de la région codant pour la protéine capside (CP) de 2 isolats de PVY d’origine piment et d’un isolat d’origine pomme de terre semble indiquer une corrélation entre les manifestations symptomatologiques de ces isolats et leurs propriétés moléculaires. La structure secondaire potentielle de l’ARN viral au niveau de la région 3’NTR montre des différences entre les 3 isolats. L’analyse de la séquence de la région codant pour la protéine capside suggère qu’un phénomène de recombinaison serait à l’origine de l’isolat d’origine piment PVY-P21.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: POLYMORPHISME; CAPSIDE; PVY; CULTURE MARAICHERE; SEQUENCAGE; ISOLAT; SEQUENCE NUCLEOTIDIQUE; RECOMBINAISON; ARN VIRAL; EXPRESSION DES GENES SECONDARY STRUCTURE.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20105a144ce0&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Typologie des virus de plantes en bâtonnet d'après la composition en acides aminés de leur protéine de capside : virus IRD
Desbois, D.; Vidal, G.; Fargette, Denis; Fauquet, Claude.
Tipo: Text Palavras-chave: BLE; PHYTOVIRUS; TYPOLOGIE; TAXONOMIE; ACIDE AMINE; CAPSIDE; PROTEINE; CLASSIFICATION HIERARCHIQUE; ETUDE REGIONALE; VIRUS EN BATONNET RIGIDE; TOBAMOVIRUS; TOBRAVIRUS; HORDEIVIRUS; FUROVIRUS.
Ano: 1989 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010022165
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