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Análise da expressão temporal de genes relacionados ao desenvolvimento das fibras em algodoeiro. Repositório Alice
PINHEIRO, M. P. N.; BATISTA, V. G. L.; MARTINS, N. F.; MELO FILHO, P. de A.; SANTOS, R. C. dos; LIMA, L. M. de.
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: ALGODÃO; GOSSYPIUM HIRSUTUM; CDNA; FISIOLOGIA DA REPRODUÇÃO; FUNÇÃO GÊNICA.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/930730
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Caracterização biológica e molecular de isolados de Apple stem grooving virus e construção de um clone infeccioso. Repositório Alice
SOUZA, E. B. de.
O Apple stem grooving virus (ASGV), espécie tipo do gênero Capillovirus, é conhecido como um vírus latente causador do acanelamento do lenho da macieira, devido ao principal sintoma observado em espécies suscetíveis, infecção podendo levar à perda de qualidade de frutos e queda na produtividade. O vírus já foi diagnosticado em diversas partes do mundo e atualmente, existem depositados no GenBank, dezoito sequências de genomas completos de isolados de ASGV, e várias sequências parciais principalmente da região da capa proteica. O presente trabalho está dividido em dois capítulos. O capítulo l teve como objetivo a caracterização biológica e molecular de dois isolados de ASGV (M219-3 e M220), e de forma mais específica, a clonagem e sequenciamento do genoma...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Malus domestica; ASGV-sequenciamento; Capillovirus Betaflexiviridae; Gibson Assembly; CDNA.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1060658
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Caracterização de blibliotecas substrativas de cDNA de genótipos suscetível e resistente de algodão (Gossypium hirsutum) infectados com Meloidogyne incognita. Repositório Alice
ROCHA, S. R.; PAES, N. S.; SALES, R. M. O. B.; SILVA, F. R.; GURGEL, F. L.; CARNEIRO, R. M. D.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; MEHTA, A..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Algodão; Gossypium hirsutum; CDNA; Genótipo suscetível; Genótipo resistentes.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188530
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Código de barras de ADN de las especies cubanas de peces dulceacuícolas. OceanDocs
Lara Lorenzo, A..
En el presente trabajo se realizó el análisis del código de barras ADN de 24 especies de la ictiofauna dulceacuícola cubana. Para ello, se secuenciaron 652pb del gen mitocondrial citocromo oxidasa I (COI) de 96 individuos provenientes de diferentes áreas geográficas y representativos, en la mayoría de los casos, de la distribución espacial de cada especie. En el análisis se utilizó la distancia genética Kimura 2 parámetros (K2P), considerando como cota superior el valor de 3%, para identificar los límites de divergencia entre especies. Complementariamente se llevó a cabo un análisis de agregación poblacional para identificar grupos poblacionales indicativos de linajes evolutivos independientes. El estimado promedio de divergencia genética entre...
Tipo: Theses and Dissertations Palavras-chave: CDNA; Genes; Fishes; Fish wastes.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/1834/5514
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Decifrando o genoma. Repositório Alice
CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARAES, C. T.; PAIVA, E..
Os genes, unidades biologicas que determinam as caracteristicas de um organismo, estao contidos em moleculas de DNA presentes no nucleo das celulas. Portanto, o estudo do DNA e de fundamental importancia para o entendimento de como as caracteristicas de um organismo sao formadas. Com o grande avanco alcancado pelas tecnicas de Biologia molecular nas ultimas decadas, hoje, somos capazes de isolar e sequenciar moleculas de DNA de maneira rotineira. A partir da otimizacao das tecnicas de sequenciamento, surgiram programas com o objetivo de sequenciar genomas inteiros. atualmente, estao depositados em bancos de dados mais de 3 milhoes de sequencias de DNA e, grande parte delas ainda nao tem sua funcao conhecida. O processo de caracterizacao da funcao genica...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Sequenciamento; CDNA; Genome; DNA sequency.
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/484108
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Evaluation of cellulolytic filamentous fungi phenotypes using randomly amplified cDNA with RAPD primers. Repositório Alice
OLIVEIRA, E. M. M.; BARROS, N. E. F.; FERREIRA, T. S.; OLIVEIRA, T. C.; TERZI, S. C.; DAMASO, M. C. T..
2010
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fungo filamentoso; Aspergillus niger; Enzima; CDNA; RAPD.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/878024
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Gene expression: a review on methods for the study of defense-related gene differential expression in plants. Repositório Alice
CASASSOLA, A.; BRAMMER, S. P.; CHAVES, M. S.; MARTINELLI, J. A.; GRANDO, M. F.; DENARDIN, N. D..
2013
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Transcriptomics; CDNA; Metabolic Routes; Plant Defense; Gene Expression; Molecular Biology.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981342
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Molecular cloning, expression and characterization of a serine proteinase from Japanese edible mushroom, Grifola frondosa: solving the structure - function anomaly of a reported aminopeptidase Electron. J. Biotechnol.
Islam,Mohammed M.
The N-terminal amino acid sequence of an aminopeptidase from Japanese edible mushroom, Grifola frondosa, was reported to have high similarity with that of a serine proteinase from basidiomycete, Agaricus bisporous (Nishiwaki and Hayashi, 2001). The full-length cDNA and the corresponding genomic DNA of the enzyme were cloned, based on the reported N-terminal amino acid sequence. The predicted open reading frame (ORF) of the cloned cDNA, encoding a product of 379 amino acids, was expressed in E. coli using pET expression vector. The expressed pro-enzyme (40 kDa) underwent autolysis to produce the mature protein (30 kDa) and a pro-peptide (10 kDa). The mature protein and the pro-peptide remained tightly bound to each other and could not be separated by Ni-NTA...
Tipo: Journal article Palavras-chave: 5'-RACE; CDNA; Genomic DNA; Maitake; Refolding.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000400010
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Possible involvement of CsTypA1 in reproductive organ development of cucumber (Cucumis sativus) National Institute of Agronomic Research
Barak, M.; Trebitsh, T..
Cucumber (Cucumis sativus) is a monoecious plant that is extensively studied with respect to floral sex determination. While the genetic background, hormonal and environmental factors are well characterized, the molecular mechanisms regulating unisexual flower development are not well understood. Initially a cucumber floral bud is bisexual and has the potential to develop into a male or female flower. Using differential cDNA-AFLP analysis between plant apices of monoecious (predominantly male) and gynoecious (female) cucumber plants, we isolated a cDNA that encodes a putative GTP binding protein tyrosine phosphorylated protein A (CsTypA1). TypA genes are widely distributed in plants and prokaryotes. Bacterial TypA proteins are involved in protein...
Tipo: Poster Palavras-chave: Flower development; Floral sex; Ovary; Cucumis sativus; Cucumber; CDNA; Sex determination.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/2174/282
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RNA fingerprinting using RAP-PCR identifies an EBAF homologue mRNA differentially expressed in rat oviduct Biocell
Valdecantos,Pablo A.; Argañaraz,Martín E.; Abate,Carlos M.; Miceli,Dora C..
As a step towards the identification of genes preferentially expressed in the oviduct during early rat embryo development, we isolated a cDNA fragment (Pr14) by using RNA arbitrarily primed PCR (RAP-PCR), being its expression restricted to oviduct and uterus; its mRNA is mainly expressed in oviduct during late luteal phase and early pregnancy. This fragment is 100% identical to a rat DNA sequence (Accession No. NW_047400) downstream the terminal exon of a Rattus norvegicus gene (Locus Link Accession No. LOC289316) similar to ebaf (endometrial bleeding-associated factor), a novel member of the Transforming Growth Factor superfamily. Northern analyses showed that this sequence hybridizes with 2.9 kb and 4.1 kb mRNAs in early pregnant rat oviducts. However,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Differential gene expression; Oviduct; RNA fingerprint; CDNA.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0327-95452004000300005
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Sequence Analysis of Three Major Antigens (P30, P23 and P22) of Virulent and Avirulent Strains of Toxoplasma gondii OAK
Maki, Yoshiyuki; Seng, Seyha; Kato, Mihoko; Hoshi, Yukihiro; Igarashi, Ikuo; Nagasawa, Hideyuki; Toyoda, Yutaka; Suzuki, Naoyoshi.
Palavras-chave: Toxoplasma gondii; SAG-1 (P30); CDNA.
Ano: 1996 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/250
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Suppression subtractive hybridization PCR isolation of cDNAs from a Caribbean soft coral Electron. J. Biotechnol.
Lopez,Jose V; Ledger,Angela; Santiago-Vázquez,Lory Z; Pop,Mihai; Sommer,Dan D; Ranzer,Llanie K; Feldman,Robert A; Russell,G. Kerr.
Transcriptomic studies of marine organisms are still in their infancy. A partial, subtracted expressed sequence tag (EST) library of the Caribbean octocoral Erythropodium caribaeorum and the sea fan Gorgonia ventalina has been analyzed in order to find novel genes or differences in gene expression related to potential secondary metabolite production or symbioses. This approach entails enrichment for potential non-“housekeeping” genes using the suppression subtractive hybridization (SSH) polymerase chain reaction (PCR) method. More than 500 expressed sequence tags (ESTs) were generated after cloning SSH products, which yielded at least 53 orthologous groups of proteins (COGs) and Pfam clusters, including transcription factors (Drosophila...
Tipo: Journal article Palavras-chave: CDNA; Erythropodium caribaeorum; EST; Gorgonia ventalina; Gorgonian; Sea fan.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582011000100008
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The lift pool method for isolation of cDNA clones from lambda phage libraries Electron. J. Biotechnol.
LeBlanc-Straceski,Janine; Sobrado,Pablo; Betz,Sharon; Zerfas,Julie; Morgan,Karen.
A PCR based strategy was developed to screen a Xenopus oocyte λgt10 cDNA library. The PCR-based lift pool (LP) method follows the same two tiered strategy as conventional screening of phage libraries by filter hybridization. Two rounds of plating, one at high density to detect the clone, and one at low density to purify the clone to homogeneity, are performed. In the first round, lysates from high density plates, termed plate pools (PP), serve as template for PCR. In the second round, phage particles adhering to plaque lifts of low density plates are washed off nitrocellulose filters to create LPs, which are used as template for PCR. The integrity of the plaques on the low-density plates is preserved. Once a positive LP has been identified,...
Tipo: Journal article Palavras-chave: CDNA; Lambda; Non-radioactive; PCR; Plaque; Screening.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582006000400012
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Validação da indução ao SCMV (Sugarcane Mosaic Virus) em plantas de milho via RNA interferente. Repositório Alice
ANDRADE, L. C. de S. S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; SOUZA, I. R. P. de; SABATO, E. de O.; ARAGAO, F. J. L.; CARNEIRO, N. P..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: CDNA; PCR; MRNA viral; Biotecnologia.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/932872
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アズキ品種のアスコルビン酸ペルオキシダーゼの比較 OAK
小嶋, 道之; 齋藤, 優介; 山下, 慎司; Kojima, Michiyuki; Yamashita, Shinji; Saito, Yusuke.
アズキ(Vigna angularis (Willd.) Ohwi et H.Ohashi:品種はエリモショウズ)に含まれるアスコルビン酸ペルオキシダーゼ(APX)をコードするcDNAの塩基配列を決定した。APXはアスコルビン酸を基質として細胞毒である過酸化水素を水に無毒化する酵素である。アズキAPX遺伝子の塩基数は1,076bpで,予想されるタンパク質のアミノ酸数は250,分子量は約27,000Daであった。アズキAPXのアミノ酸配列は,ササゲ,ダイズおよびエンドウのそれらと高い相同性を示し,順に98%,95%および92%であった。また、アズキ5品種の初生葉からAPXをコードするcDNAを調製して,塩基配列を比較した。その結果として,(1)エリモショウズのAPX遺伝子ORFから6 –10番目の塩基配列は“TGCTA”であったが,他の4品種のそれは“AGTAC”であること,(2)APX遺伝子ORFから61番目の塩基はエリモショウズ,斑小粒系-1およびトヨミダイナゴンでは“T”であったが,アカネダイナゴンおよびサホロショウズでは“C”であることを明らかにした。
Palavras-chave: アスコルビン酸ペルオキシダーゼ; アスコルビン酸; CDNA; アズキ; Ascorbate peroxidase(APX); Ascorbie acid; CDNA; Adzuki bean.
Ano: 2006 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/95
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