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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuse du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches - Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - Synthèse finale ArchiMer
Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Huvet, Arnaud; Chollet, Bruno; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Actions menées de 1994 à 1998 au sein du conservatoire de souches : 1. Résultats des importations, acclimatation et hybridation. a) Rappel des conditions d'introduction de nouvelles souches. L'importation de toute espèce est conditionnée par les résultats d'une enquête préliminaire dont l'objet est de rechercher les exigences écologiques de l'espèce et la situation épidémiologique dans son milieu d'origine. Le travail du LGP et de ses partenaires a été partagé en différentes actions: 1. Recherche de contacts dans divers pays étrangers, en vue de l'importation d'huîtres présentant des caractéristiques intéressantes. 2. Importation : L'importation se fait selon les normes du CIEM (Conseil International pour l'Exploration de la Mer) : contrôles pathologiques...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Marqueurs moléculaire; Marqueurs populations; Crassostrea.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15520/12907.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches. Amélioration de la qualité chez l'huître creuse Crassostrea gigas par sélection de souches performantes - Rapport année 1996 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Collet, Bertrand; Cornette, Florence; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Chollet, Bruno; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Les objectifs pour l'année 1996 étaient les suivants: Poursuivre les premières reproductions des espèces pour lesquelles nous disposons de géniteurs GO. L'objectif est toujours de limiter le stockage d'animaux importés en produisant une descendance simultanément à des témoins C. gigas qui serviront de comparaison. Tenter des hybridations inter-spécifiques des différents taxons présents au sein du conservatoire en fonction des connaissances disponibles dans la littérature sur ce sujet (voir pour revue Gaffney et Allen, 1993). • Importer de nouvelles souches ou espèces. Élargir la gamme des espèces présentes au sein du conservatoire de souches (les capacités d'accueil de la salle de quarantaine étant Limitée).
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Crassostrea; Sélection génétique; Saccostrea commercialis.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15516/12903.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches. Contrat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - 1ère partie : rapport année 1994 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Launey, Sophie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Heurtebise, Serge; Gerard, Andre.
Le laboratoire IFREMER "Génétique Aquaculture et Pathologie" (GAP) (La Tremblade et Bouin) a entrepris des actions de recherche sur ces différents points. L'Unité de Recherche en Génétique, en collaboration avec tous Ies membres du Réseau Génétique Mollusques (REGEMO) a axé une partie de ses travaux sur l'acclimatation et l'hybridation de différentes espèces du genre Crassostrea. Ces recherches ont débuté avec le soutien du Conseil Général de Charente-Maritime depuis 1992 sur des essais d'acclimatation de C. virginica, l'huître creuse américaine. En prolongement de cette étude, l'URGE a proposé à la région Poitou Charentes un programme de recherche plus vaste sur l'ensemble des espèces d'huîtres creuses. Le contrat de plan Etat-Région a été signé en...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Crassostrea; Saccostrea; Génétique population.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15517/12904.pdf
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Apport de la génétique pour une meilleure connaissance des populations naturelles et une amélioration des populations cultivées d'huîtres plates et creuses ArchiMer
Lapegue, Sylvie.
In the framework of the French diploma "Habilitation à Diriger des Recherches", Sylvie Lapègue's synthesis of research includes ten years (1998-2007) of work in bivalve genetics, and mainly cupped and flat oysters. This research has been developed in (1) flat oyster population genetics at the European level and cupped oyster populations and species genetics at a global scale, (2) the characterization of a cytogenetic particularity observed in oysters that corresponds to a high rate of aneuploidy in somatic cells, and (3) more recently in the use of molecular markers for the construction or improvement of genetic maps, allowing (4) the identification of areas of the genome related to the resistance to summer mortality in the Pacific oyster and the...
Tipo: Text Palavras-chave: Ostrea; Crassostrea; Oysters; QTLs; Genetic maps; Breeding; Aneuploidy; Population genetics; Ostrea; Crassostrea; Huître; QTLs; Cartes génétiques; Amélioration; Aneuploïdie; Génétique des populations.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-3478.pdf
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Coliform density in oyster culture waters and its relationship with environmental factors PAB
Mignani,Luciene; Barbieri,Edison; Marques,Helcio Luis de Almeida; Oliveira,Ana Julia Fernandes Cardoso de.
The objective of this work was to evaluate the total and thermotolerant coliform densities in the oyster culture water of Cananeia, SP, Brazil, correlating these densities with environmental variables and tidal variations. Superficial water samples were collected in two tide conditions (spring and neap) from three areas of Cananéia municipality (Mandira, Itapitangui and Cooperostra). The three studied areas showed good conditions for the culture regarding coliform densities. The two tidal conditions differed significantly as to total coliform concentration; however, the same procedure was not performed for thermotolerant coliforms. No correlation was observed between water temperature, pH, and concentrations of total and thermotolerant coliforms. Coliform...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Crassostrea; Contamination; Microbiology; Principal component analysis; Total and thermotolerant coliforms.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000800007
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Développement et utilisation des marqueurs génétiques hypervariables chez les espèces marines. Rapport de synthèse 1995-1998 ArchiMer
Bonhomme, Francois; Gerard, Andre.
L'objectif scientifique de l'Unité de Recherche Marine n0 16 est de partager les savoir faire conceptuels et méthodologiques des deux équipes, pour faire aboutir des programmes appliqués ou fondamentaux dans le domaine de la génétique des organismes marins. Ces programmes concernent plus particulièrement le développement et l'utilisation des marqueurs génétiques fournis par les techniques de biologie moléculaire dans les programmes suivants: Chez les huîtres des genres Ostrea et Crassostrea : Le modèle prioritaire de l'URM sera les huîtres Crassostrea et Ostrea. Pour des raisons historiques, les recherches sur Ostrea sont plus avancées et donneront des résultats plus rapidement. 1-Sélection assistée par marqueurs chez Ostrea edulis et Crassostrea gigas...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Marqueur génétique; Biologie moléculaire; Sélection génétique; Ressource génétique; Recrutement; Bivalvia; Crassostrea; Ostrea; Pisces; Dicentrarchus labrax; Génotypage.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15459/12834.pdf
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Insights on the association between somatic aneuploidy and ostreid herpesvirus 1 detection in the oysters Crassostrea gigas, C. angulata and their F1 hybrids ArchiMer
Batista, Frederico M.; Lopez-sanmartin, Monserrat; Boudry, Pierre; Navas, Jose I.; Ruano, Francisco; Renault, Tristan; Fonseca, Vera G.; Leitao, Alexandra.
Cytogenetic abnormalities associated with viral infections, including from viruses of the Herpesvirales order, have been reported in vertebrate species. Ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1) has been detected worldwide during mortality outbreaks of the Pacific oyster Crassostrea gigas. On the other hand, a high proportion of aneuploid cells in somatic tissues have been observed in C. gigas. In this study, we analysed the putative association between aneuploidy levels and the detection of OsHV-1 in gills of C. gigas, the Portuguese oyster C. angulata and their F1 hybrids cultured in Ria Formosa (Portugal). OsHV-1 was detected by PCR in 5.4% of the total of oysters analysed (n = 111) namely in 11.1%, 8.0% and 1.7% of C. gigas, C. angulata and F1 hybrid...
Tipo: Text Palavras-chave: Aneuploidy; Ostreid herpesvirus 1; Oyster; Crassostrea.
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00215/32581/35759.pdf
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Les infections virales associées aux épizooties des huîtres du genre Crassostrea ArchiMer
Comps, Michel.
Des infections virales ont été décrites chez les huîtres portugaises Crassostrea angulata des côtes françaises successivement affectées par la maladie des branchies et par la mortalité massive de 19670. Ultérieurement, un nouveau virus a été trouvé chez Crassostrea gigas durant des mortalités dans la Baie d'Arcachon. Les virus impliqués ont des caractéristiques similaires pour ce qui concerne la taille, la morphologie, l'ultrastructure et la morphogénèse intracytoplasmique. Dans le cas des virus de mortalité, les cellules infectées du tissu interstitiel renferment une inclusion cytoplasmique et des granulations basophiles correspondant à un stroma virogène et à des particules. Les vibrions matures de structure icosaèdre mesurent 380 nm. Ils sont limités...
Tipo: Text Palavras-chave: Virologie; Infection virale; Huîtres creuses; Crassostrea.
Ano: 1983 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12659/9525.pdf
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Morphological and Morphometric Aspects of Crassostrea rhizophorae (Guilding, 1828) Oocytes in Three Stages of the Gonadal Cycle International Journal of Morphology
Ferreira,M. A. P.; Paixão,L. F.; Alcântara-Neto,C. P.; Santos,S. S. D.; Rocha,R. M..
Crassostrea rhizophorae (Guilding, 1828) is one of the tropical species of oysters cultivated on the Brazilian shore. Despite its high commercial value, there is no information on the gonadal characteristics during the reproductive stages of this species. The objective of this work was to analyze the morphology and morphometry of Crassostrea rhizophorae oocytes and follicles in three stages of the gonadal cycle. Were analized histological sections of gonads considering that the oocytes presented visible nuclei and nucleoli, it was observed three gonadal cycle stages: early gametogenesis, growth and maturation. In the early gametogenesis stage, follicles and oocytes presented diameters of 180.29 (± 41.91) and 18.66 (± 6.85) µm, respectively, and presence of...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Crassostrea; Oocyte; Gonad; Morphology.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-95022006000400023
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Ontogeny and water temperature influences the antiviral response of the Pacific oyster, Crassostrea gigas ArchiMer
Green, Timothy; Montagnani, Caroline; Benkendorff, Kirsten; Robinson, Nick; Speck, Peter.
Disease is caused by a complex interaction between the pathogen, environment, and the physiological status of the host. Determining how host ontogeny interacts with water temperature to influence the antiviral response of the Pacific oysters, Crassostrea gigas, is a major goal in understanding why juvenile Pacific oysters are dying during summer as a result of the global emergence of a new genotype of the Ostreid herpesvirus, termed OsHV-1 μvar. We measured the effect of temperature (12 vs 22 °C) on the antiviral response of adult and juvenile C. gigas injected with poly I:C. Poly I:C up-regulated the expression of numerous immune genes, including TLR, MyD88, IκB-1, Rel, IRF, MDA5, STING, SOC, PKR, Viperin and Mpeg1. At 22 °C, these immune genes showed...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea; OsHV-1; Water temperature; Antiviral response; Herpesvirus.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00162/27318/25674.pdf
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Origine et développement des cellules germinales chez l'huître creuse Crassostrea gigas : Intérêt pour le contrôle de la reproduction en écloserie. ArchiMer
Fabioux, Caroline.
A comprehensive knowledge of Crassostrea gigas oyster reproduction processes is essential to optimize controlled reproduction in hatchery. This study aimed to determine the origin and the mechanisms of annual renewal of germ cells, still unknown in oysters, and the influence of temperature and photoperiod parameters on the regulation of the reproductive cycle. We characterized an orthologue of the vasa gene, the Oyvlg (Oyster vasa-like gene), the first germ cell specific marker isolated in molluscs. This marker was used to study C. gigas germline development. Oyster germ cells appeared specified during early development from mesentoblast 4d, as primordial germ cells (PGCs) determined by maternal cytoplasmic determinants, including Oyvlg mRNA. In adult...
Tipo: Text Palavras-chave: Controlled reproduction; Regulation; Oyster vasa like gene; Gametogenesis; Germ cells; Crassostrea; Reproduction contrôlée; Régulation; Oyster vasa like gene; Gamétogenèse; Cellules germinales; Crassostrea.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/these-1380.pdf
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OsHV-1 countermeasures to the Pacific oyster’s anti-viral response ArchiMer
Green, Timothy J.; Rolland, Jean-luc; Vergnes, Agnes; Raftos, David; Montagnani, Caroline.
The host-pathogen interactions between the Pacific oyster (Crassostrea gigas) and Ostreid herpesvirus type 1 (OsHV-1) are poorly characterised. Herpesviruses are a group of large, DNA viruses that are known to encode gene products that subvert their host’s antiviral response. It is likely that OsHV-1 has also evolved similar strategies as its genome encodes genes with high homology to C. gigas inhibitors of apoptosis (IAPs) and an interferon-stimulated gene (termed CH25H). The first objective of this study was to simultaneously investigate the expression of C. gigas and OsHV-1 genes that share high sequence homology during an acute infection. Comparison of apoptosis-related genes revealed that components of the extrinsic apoptosis pathway (TNF) were...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea; Anti-viral response; Apoptosis; Interferon-like; Poly I:C.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00279/39048/37610.pdf
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Overwiew on molecular tools in bivalve shellfish aquaculture ArchiMer
Boudry, Pierre; Saavedra, Carlos.
Dr. Boudry presented an overview of the current development of molecular tools in shellfish bivalves, focussing on the recent development in oysters, species to which the most efforts are dedicated. This review was prepared together with Dr. Saavedra (Mollusc Research Group, Torre de la Sal, Spain) within the Fish and Shellfish group of the EU Network of Excellence "Marine Genomics Europe". Searches in DNA sequence databank ("GenBank") show that 4% are microsatellite sequences, 23% are mitochondrial sequences and the remaining 73 % other nuclear sequences. Among these, 75% concern oyster (Crassostrea) species, 15% mussel (Mytilus) species and 10% scallop (Argopecten) species. Some of these sequences were targeted as candidate genes related to known...
Tipo: Text Palavras-chave: QTLs; Mitochondrial geneome; Crassostrea virginica; Crassostrea gigas; Crassostrea; Shellfish bivalves; Molecular tools; Genetic.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/acte-3480.pdf
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Parasitas em ostras de cultivo (Crassostrea rhizophorae e Crassostrea gigas) da Ponta do Sambaqui, Florianópolis, SC Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Sabry,R.C.; Magalhães,A R.M..
Estudou-se a presença de parasitas e realizaram-se exames macroscópicos e histológicos em ostras (Crassostrea rhizophorae e Crassostrea gigas) cultivadas. Entre agosto de 2002 a maio de 2003, 30 indivíduos adultos de cada espécie foram coletados sazonalmente, totalizando 240 ostras. Os animais, provenientes de desova em laboratório, foram mantidos em lanternas de cultivo, em sistema suspenso tipo espinhel, com densidade de 40 ostras/andar. A cada coleta era registrada a mortalidade das ostras, a temperatura e a salinidade da água. A temperatura variou de 19 a 28,5°C e a salinidade, 31 a 35‰. A mortalidade foi de 48,3% para C. gigas e 70,8% para C. rhizophorae. A infestação pelo poliqueta Polydora websteri em C. gigas foi 100% durante todo o período e em C....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ostra; Crassostrea; Histopatologia; Parasita.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352005000800010
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Phylogénie moléculaire des huîtres du genre Crassostrea. Approche par les techniques de restriction enzymatique et de séquençage ArchiMer
Delandes, Hélène.
En France, ainsi que dans de nombreux autres pays, l'histoire de l'ostréiculture est émaillée d'une succession de phases de développement, de surexploitation et d'apparition de maladies qui perturbent lourdement la profession. Depuis la disparition massive de l'huître portugaise, Crassostrea angulata, victime entre 1969 et 1971 d'une épidémie virale et l'effondrement de l'élevage de l'huître plate Ostrea edulis dû à deux parasitoses, la marteiliose et la bonamiose, l'ostréiculture française connaît actuellement une situation de monoculture de l'huître creuse japonaise Crassostrea gigas, suite à l'introduction de l'espèce entre 1971 et 1975 (Grizel & al. 1991). Pour tenter de remédier à cette situation de monoculture, qui reste une des inquiétudes...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique population; Phylogénie moléculaire; Huîtres creuses; Crassostrea; Acclimation.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14380/11670.pdf
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Rapport de mission International Conference on Shellfish Restoration, 2011, Stirling (Ecosse) ArchiMer
Mazurie, Joseph.
The 14th International Conference on Shellfish Restoration (ICSR) comes this year to the United Kingdom for the first time in its 26 years history. The conference will be held at the University of Stirling in the heart of Scotland and its title and theme will be “Shellfish: our undervalued resource”. The theme of the conference, “Shellfish: our undervalued resource”, reflects the UK perception of shellfish as something that is good to eat, often in upmarket restaurants. Shellfish fisheries and aquaculture are indeed a very important part of the UK economy; shellfish reefs however form an ecosystem that provides myriad benefits (“ecosystem services”) many of which have been lost through acute fishing pressures, disease, pollution and other factors. On a...
Tipo: Text Palavras-chave: Coquillages; Restauration; Récif; Chesapeake; Crassostrea; Service écosystémique; Shellfish; Restoration; Reefs; Chesapeake; Wadden Sea; Marine; Crassostrea.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00045/15590/12992.pdf
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Ressources génétiques et phylogéographie des huîtres creuses Crassostrea gigas et C. angulata : variabilité, différenciation et adaptation des populations naturelles et introduites ArchiMer
Huvet, Arnaud.
L 'huître creuse japonaise Crassostrea gigas et portugaise C. angulata ont été respectivement décrites par Thunberg (1793) et Lamarck (1819). Mais les similitudes morphologiques et l 'homogénéité des fréquences allozymiques entre populations ont conduit de nombreux auteurs à proposer l'existence d'une seule et mênle espèce. L'analyse récente d'un gène mitochondrial a pennis de déterminer l'origine asiatique de C. angulata, soulignant l'intérêt de l'étude de la différenciation génétique et phénotypique entre les deux taxons. La notion biologique d'espèce a tout d'abord été examinée. Des croisements de 1ère et 2ème génération ont montré la viabilité et fertilité des hybrides. L'analyse de la compétition spennatique par marqueurs microsatellites ne montre pas...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique des populations; Crassostrea; Isolement reproducteur; Marqueurs moléculaires; Écophysiologie; Aquaculture.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14564/11867.pdf
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Taxonomie et phylogéographie des huîtres creuses dans l'Atlantique Sud ArchiMer
Boutet, Isabelle.
L'étude de la taxonomie des huîtres est longtemps restée basée sur des critères morphologiques (forme de la coquille et description des organes) et géographiques. Ces considérations sont relativement peu fiables en particulier au niveau interspécifique du fait de la plasticité des caractères morphologiques d'une part de des introductions d'espèces étrangères sur les lieux de culture d'autre part. La biologie moléculaire est donc, depuis quelques années, un outil très utilisé pour différencier les espèces d'huîtres. La phylogéographie des huîtres de la région sud-atlantique a ainsi pu être étudiée grâce à différentes méthodes de recherche du polymorphisme réalisées sur le fragment mitochondrial 16S. La PCR-RFLP, la SSCP et le séquençage ont été utilisés...
Tipo: Text Palavras-chave: Taxonomie; Huîtres creuses; Crassostrea; Phylogéographie; ADN.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14365/11656.pdf
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The molecular phylogeny of oysters based on a satellite DNA related to transposons ArchiMer
Lopez Flores, Inmaculada; De La Herran, R; Garrido Ramos, M; Boudry, Pierre; Ruiz Rejon, C; Ruiz Rejon, M.
We have analysed a centromeric satellite DNA family that is conserved in several commercial and non-commercial oyster species (Ostrea edulis, O. stentina, Crassostrea angulata, C gigas, C gasar, C ariakensis, C virginica and C sikamea). This satellite DNA family is composed of AT-rich repeat sequences of 166+/-2 bp and presents a 9-bp motif similar to the mammalian CENP-B box. The homology of oyster HindIII satellite DNA with satellite DNAs from other bivalves and its relation to a part of a mobile element suggest the existence of an ancient transposable element as a generating unit of satellite DNA in bivalve molluscs. Taking advantage of its degree of conservation in oyster species, we have used this element as a taxonomic marker. This marker clearly...
Tipo: Text Palavras-chave: Satellite DNA origin; Genetic identification; CENP B box; Crassostrea; Ostrea.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/publication-761.pdf
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Traitement de l''eau par ultraviolets, application a la purification des coquillages ArchiMer
Cailleres, J.
The germicide properties of ultra-violet radiation in a wave length ranging from 100 to 400 mm were already discovered back in the late 19th century. These properties specific to UV-C radiation (200-280 mm) result from its action on the nucleic acids of the micro-organisms. Each micro-organism, depending on its composition, therefore presents a specific sensitivity to this radiation.
Tipo: Text Palavras-chave: France; Escherichia coli; Crassostrea; Bivalvia; Bacteria; Ultraviolet radiation; Self purification; Shellfish culture.
Ano: 1992 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1992/acte-1629.pdf
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