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Amélioration des productions phytoplanctoniques en écloserie de mollusques : caractérisation des microalgues fourrage ArchiMer
Robert, Rene; Chretiennot-dinet, Marie-josèphe; Kaas, Raymond; Martin-jezequel, Véronique; Moal, Jeanne; Le Coz, Jean-rene; Nicolas, Jean-louis; Bernard, Eudes; Connan, Jean-paul; Le Dean, Loic; Le Gourrierec, Gaetane; Leroy, Bertrand; Quere, Claudie.
in mollusc hatcheries. Consequently, we assessed themost commonly used species to establish their growth and size profiles, their cytomorphological, biochemical, biomolecular identification as well as their cytometer signs, and also their ability to grow under extreme conditions of temperature and salinity. This work aimed at matching the conformity of the strains used in Argenton (dispatched to most of the French commercial hatcheries) to those of a referenced culture collection. A previous screening preceded this study, because of the 45 species and/or clones held originally, Argenton kept no more than 15 species. As most of the latter are also represented in referenced collection, our strains are therefore correctly identified. On the other hand, the...
Tipo: Text Palavras-chave: Ecological limits; Biomolecular profile; Flow cytometry; Biochemical composition; Cytomorphology; Phytoplankton; Mollusc; Hatchery; Ecotolérance; Profil biomoléculaire; Cytométrie en flux; Composition biochimique; Cytomorphologie; Phytoplancton; Mollusques; Ecloserie.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/rapport-1546.pdf
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Caractérisation morphologique et physiologique des microalgues utilisées pour la nutrition larvaire de l'huître creuse, Crassostrea gigas ArchiMer
Le Gourrierec, Gaétane.
En aquaculture, sur une cinquantaine d'algues testées, seulement une douzaine présente un réel intérêt en écloserie-nurserie de bivalves (Chrétiennot-Dinet et al, 1986). Le premier but de notre travail est de caractériser 11 espèces de microalgues au cytomètre en flux afin de fournir un outil descriptif, facilement réutilisable, de ces espèces et d' évaluer l' influence de l'état physiologique et de la méthode de fixation sur les signatures cytométriques. Les paramètres mesurés au cytomètre en flux sont la FSC, la FL3 et la SSC liées respectivement à la taille, la fluore scence et la structure des cellules phytoplanctoniques. Les résultats montrent que les signatures sont extrêmement variables entre espèces et à l' intérieur d' une espèce. Seules, deux...
Tipo: Text Palavras-chave: Microalgues; Cytométrie en flux; Caractérisation; Viabilité cellulaire; Larves d'huîtres.
Ano: 2002 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00448/55962/57446.pdf
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Étude chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, des anomalies génomiques provoquées par l'exposition à des concentrations environnementales de diuron : caractérisation des atteintes, étude de leur héritabilité et conséquences pour la survie et la croissance des naissains ArchiMer
Barranger, Audrey.
The aims of this PhD were to determine (1) the effects of the herbicide diuron on the genome of the oyster, Crassostrea gigas, (2) the possible transmission to the offspring of damaged DNA and (3) its consequences on oyster physiology. The genotoxicity of diuron and the vertical transmission of DNA damage were highlighted after parental exposure to environmental concentrations of diuron during the gametogenesis. Primary DNA lesions were detected in both somatic cells and germ cells of exposed genitors. Detection of the oxidized base 8-oxodGuo in gonads shows that exposure to diuron led to an oxidative stress which likely explains the observed DNA strand breaks in spermatozoa. The transmission of these DNA damage was confirmed by fluorescent in situ...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Herbicide; Diuron; Génotoxicité; Effets trans-générationnels; Cytogénétique; Test des comètes; Cytométrie en flux; Crassostrea gigas; Herbicide; Diuron; Genotoxicity; Trans-generational effects; Cytogenetic; Comet assay; Flow cytometry.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00271/38237/36419.pdf
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Etude comparative en cytométrie en flux des fonctions estérases et du métabolisme oxydatif d'hémocytes d'huîtres saines, parasitées, sensibles et résistantes au protozoaire Bonamia ostrea ArchiMer
Cochennec, Nathalie; Garcia, Sandrine; Bedier, Edouard.
In order to fight Bonamiosis, the applicable means are very limited and mostly based on a quick and precocious diagnostic aimed at avoiding the propagation of the disease and a rise in the "resistance" through genetic selection. Various works are conducted in order to understand the oysters' defence mechanisms against this parasite, and then to develop new prophylaxis and fighting methods. In our laboratory, we focus on cellular compartments, the circulating haemocytes, in which B. ostreae multiplies, and their interaction with the parasite.
Tipo: Text Palavras-chave: Protozoaire; Huître; Hémocytes; Cytométrie en flux; Bonamia ostreae; Biologie cellulaire.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3275.pdf
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Etude de la viabilité du parasite Bonamia ostreae, agent de la bonamiose chez l'huître plate Ostrea edulis, en fonction des facteurs environnementaux (salinité, température, milieux) par cytométrie en flux ArchiMer
Bond, Celine.
L'huître plate, Ostrea edulis, espèce indigène des côtes européennes est présente de la Norvège à la baie d'Agadir au Maroc ainsi que sur le pourtour méditerranéen et en Mer Noire. Actuellement, la production Française d'huître plate, qui a essentiellement lieu en Bretagne, est de 1 500 tonnes contre 120 000 tonnes pour l'huître creuse Crassostrea gigas. Les travaux développés s'inscrivent dans le cadre de l'étude de la survie du parasite Bonamia ostreae par cytométrie en flux. Des huîtres fortement infectées ont été utilisées pour les purifications de parasites. Les parasites obtenus ont été conservés dans différents milieux et soumis à des conditions environnementales choisies (salinité, température). Les analyses de viabilité des cellules parasitaires...
Tipo: Text Palavras-chave: Huîtres plates; Ostea edulis; Bonamia ostreae; Survie; Cytométrie en flux; Salinité; Température.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14460/11762.pdf
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Etude des interactions entre l'huître plate Ostrea edulis et le parasite Bonamia ostreae en cytométrie en flux et en hybridation soustractive suppressive (SSH) ArchiMer
Morga, Benjamin.
The French ostreiculture history highlights the fragility of its production caused by stocks overexploitation and diseases. Particularly, the flat oyster production decreased a lot after the appearance of two parasitic diseases: marteilliose and bonamiose. The bonamiose is due to a parasite Bonamia ostreae. The study of interactions between the parasite and oysters hemocytes with flow cytometry allowed to identify modifications of hemocytes activities wh en active parasite is present. On the other hand, inactive parasite does not induce modification for the same hemocyte's activities. Finally, a new study approach, subtractive and suppressive hybridization, has been undertaken in order to identify genes expressed by hemocytes and parasites during in vitro...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître plate; Ostrea edulis; Maladie; Bonamia ostrea; Interaction; Cytométrie en flux; SSH; Flat oyster; Ostrea edulis; Disease; Bonamia ostreae; Interaction; Flow cytometrY; Subtractive and suppressive hybridization.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00426/53790/54698.pdf
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Métabolisme énergétique du spermatozoïde d'huître creuse (Crassostrea gigas) ArchiMer
Boulais, Myrina.
The present study aims at describing the energy metabolism of Pacific oyster, Crassostrea gigas, spermatozoon. The main objectives are: (1) describing the kinetic of cellular and biochemical characteristics of Pacific oyster spermatozoon during its movement phase, (2) identifying the metabolic pathways to produce energy and their substrates, (3) determining the involvement of energy metabolism in fertilization success. The results showed the long duration (ranging 24 to 72h) of the movement of Pacific oyster spermatozoon and the maintenance of a high intracellular ATP content until the end of the movement phase. The role of oxidative phosphorylation (OXPHOS) in ATP production was highlighted. Alternative ATP producing pathways might contribute to sustain...
Tipo: Text Palavras-chave: Fécondation; Sperme; Analyse du mouvement; Métabolisme énergétique; RMN; Cytométrie en flux; Crassostrea gigas; Reproduction; Fertilization; Sperm; Movement analysis; Energetic metabolism; NMR; Flow cytometry.
Ano: 2014 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00498/60940/64334.pdf
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Optimisation des approches de gynogenèse chez l'huître creuse, Crassostrea gigas en utilisant l'inactivation du sperme par les UV ArchiMer
Assati, Sabrina.
La gynogenèse est un mode de reproduction dans lequel l'action du spermatozoïde se limite à l'activation de l'ovocyte. Le génome mâle est inactivé génétiquement suite à une irradiation aux rayons UV. Il y a deux gynogenèses : la méïogynogenèse et la mitogynogenèse. Le but de cette étude a été d'optimiser les paramètres induisant ces deux gynogenèses. Les traitements d'inactivation du sperme ainsi que de rétablissement de la diploïdie ont été optimisés. Le traitement aux rayons UV le mieux adapté à l'inactivation du sperme est de 40 secondes. L'agent antimitotique permettant efficacement l'induction de la diploïdie est la CB. La viabilité des individus issus de gynogenèse a été démontrée. Les naissains issus de méïogynogenèse et mitogynogenèse sont arrivés...
Tipo: Text Palavras-chave: Gynogenèse; Méïogynogenèse; Mitogynogenèse; Crassostrea gigas; Cytochalasine B; 6-DMAP; Cytométrie en flux; Lignée clonale; Irradiation UV.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00369/48022/48108.pdf
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TOPHYPAC. Tolérance des communautés phytoplanctoniques aux phytosanitaires dans le panache de la Charente. Programme Évaluation et réduction des risques liés à l’utilisation des Pesticides ArchiMer
Stachowski-haberkorn, Sabine; Guesdon, Stephane; Bechemin, Christian; Chiffoleau, Jean-francois; Brach-papa, Christophe; Soudant, Philippe; Beker, Beatriz; Jadas-hécart, Alain.
TOPHYPAC is a field study that was conducted in the Charente river estuary (Marennes-Oléron bay). The main goal was to assess the possible impact of chemical contamination with copper and pesticides on phytoplankton communities. Physical, chemical (nutrients, metals and pesticides) and biological (phytoplankton community) parameters were monitored in the field during three years, from 2011 to 2014. In 2012 and 2013, field sampling was coupled with experimental exposure of phytoplankton communities to copper and to an herbicide cocktail, after transportation to the lab: the effects were assessed using photosynthesis endpoint and cellular densities. TOPHYPAC allowed to set the framework of Charente estuary contamination with pesticides: herbicides glyphosate...
Tipo: Text Palavras-chave: Continuum eau douce/eau côtière; Pesticides; Métaux; Communautés phytoplanctoniques; Efficacité de photosynthèse; PICT; Tolérance; Cytométrie en flux; Toxicité chronique; Freshwater/coastal water continuum; Pesticides; Metals; Phytoplankton communities; Photosynthesis efficiency; PICT; Tolerance; Flow cytometry; Chronic toxicity.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00300/41115/40289.pdf
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Traitement des données phytoplanctoniques et pigmentaires disponibles dans les DOMs. Analyse préliminaire des nouvelles données acquises et proposition de nouvelles acquisitions et approches complémentaires. Livrable 3 : Bilan de ce qui a été fait sur l’état des lieux et identification des besoins prioritaires dans chaque DOM. Proposition de stratégies à suivre (approches, techniques, etc.). Rapport final ArchiMer
Gailhard-rocher, Isabelle; Artigas, Luis Felipe; Belin, Catherine.
Missions, expertises, participations à des réunions et visio-conférences, travaux collaboratifs et échanges se sont succédé pendant l'année 2011 entre les experts de métropole et les correspondants dans les DOMs. Une mission, qui a eu lieu aux Antilles en mars 2011, ainsi que la participation aux COPILs de Guadeloupe et de Martinique fin 2011, ont permis d'échanger sur les résultats du suivi et des évaluations provisoires de l’état des masses d'eau, de proposer les ajustements nécessaires, et de préparer l'intégration des données DCE dans Quadrige². Une proposition écrite pour l'amélioration du plan de surveillance 2012 en Martinique a également été faite, suivie d'effet. A La Réunion, l'expertise étant assurée par la station Ifremer locale, les contacts...
Tipo: Text Palavras-chave: Outre mer; Martinique; Guadeloupe; La Réunion; Guyane Phytoplancton; Chlorophylle; Cytométrie en flux.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56063/57586.pdf
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Utilisation conjointe de FlowCAM / ZooPhytoImage et de la cytométrie en flux. Premiers résultats et perspectives. Action 9. FlowCam ZooPhytoImage. Livrable n° 4. Rapport final, 23 septembre 2014 ArchiMer
Ali, Nour; Wacquet, Guillaume; Didry, Morgane; Hamad, Denis; Artigas, Luis Felipe; Grosjean, Philippe.
The goal of this study is to investigate about the possibility of coupling measurements made by image analysis from the FlowCAM with Zoo/PhytoImage with data obtained with a flux cytometer (pulse-shape-recording Scanning Flow Cytometry) on the same samples gathered in current monitoring networks in the eastern Channel and southern North Sea. In this preliminary study, we collected a series of samples off Boulogne-sur-Mer (SRN-REPHY monitoring system run by IFREMER) and along a transect in the Baie St-Jean (Wimereux-Slack) run by LOG. All these samples were digitized with a FlowCAM and measured with a scanning flow cytometer (CytoSense). The complete analysis with the FlowCAM and Zoo/PhytoImage is detailed in the present report. In order to get a better...
Tipo: Text Palavras-chave: Manche – Mer du Nord; Phytoplancton; Analyse d'image; Classification supervisée; Cytométrie en flux; Eastern English Channel and southern North Sea; Phytoplankton; Image analysis; Machine learning; Scanning Flow Cytometry.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00363/47442/47470.pdf
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