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A campilobacteriose e tricomonose são doenças reemergentes? Infoteca-e
PELLEGRIN, A. O..
Epidemiologia; Prevalência e incidência no Brasil; Fatores e risco; Impactos econômicos; Diagnóstico; Controle.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Controle; Bovine; Disease; Campylobacter fetus venerealis; Tritichomonas foetus; Diagnostic; Control.; Bovino; Campilobacteriose; Doença; Diagnostico; Epidemiologia; Pecuária; Tricomonose.; Epidemiology..
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/810729
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A Rapid and Reliable Method for Molecular Detection of Fusarium guttiforme, the Etiological Agent of Pineapple Fusariosis BABT
Carnielli-Queiroz,Lorena; Fernandes,Patricia Machado Bueno; Fernandes,Antônio Alberto Ribeiro; Ventura,José Aires.
Abstract Pineapple (Ananas comosus var. comosus) fusariosis is an economically important fungal disease affecting the plant and its fruit. A rapid and reliable diagnosis is the base of integrated disease management practices. Fusariosis has resulted in quarantines for pineapple products in Central America, Africa and Asia. Difficulties diagnosing and correctly identifying the fungus Fusarium guttiforme, agent of the pineapple fusariosis, have led to the search for new methodologies, and for this we developed a new reliable molecular method to detect it. For diagnostic purposes, real-time PCR of elongation factor gene 1-α (ef1) was used to rapidly, specifically and sensitively diagnose F. guttiforme. A pathogenicity test was conducted with slips of the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diagnostic; Diseases; Quarantine; Real-time PCR.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132019000100219
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Amélioration du protocole de PCR quantitative pour la détection de l'OsHV1 chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, dans le cadre du projet TRIPLOFIMER et suivi d'individus lors du phénomène de mortalité estivale dans le cadre du projet AQUAFIRST ArchiMer
Riou, Antoine.
Depuis 1991, des épisodes de mortalités massives touchent les élevages ostréicoles français, notamment pour l'espèce Crassostrea gigas. Un des facteurs responsables de ces événements est le virus de l'Herpès de l'huître : Oyster Herpesvirus type 1 ou OsHV-1. Les travaux réalisés au cours de ce stage ont contribué dans un premier temps à l'amélioration du protocole d'analyse basé sur l'utilisation d'un appareil de Polymerase Chain Reaction (PCR) en temps résel, puis aux analyses et au suivi de la charge virale par cette technique, d'individus entrant dans le cadre des projets - TRIPLOMER et AQUAFIRST-UE. Cette approche permettra par la suite de réaliser des diganostics fiables de la maladie tout en précisant le nombre de copies ADN (Acide...
Tipo: Text Palavras-chave: Protocole; Herpes vrus; PCR quantitative; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Diagnostic.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14459/11761.pdf
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Bacterial diseases in marine bivalves ArchiMer
Travers, Marie-agnes; Miller, Katherine Boettcher; Roque, Ana; Friedman, Carolyn S..
Bivalve aquaculture is seriously affected by many bacterial pathogens that cause high losses in hatcheries as well as in natural beds. A number of Vibrio species, but also members of the genera Nocardia and Roseovarius, are considered important pathogens in aquaculture. The present work provides an updated overview of main diseases and implicated bacterial species affecting bivalves. This review focuses on aetiological agents, their diversity and virulence factors, the diagnostic methods available as well as information on the dynamics of the host-parasite relationship.
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio; Nocardia; Roseovarius; Rickettsia; Pathogenesis; Diagnostic.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00274/38532/37049.pdf
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Comparison of PCR-based methods for the simultaneous detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and Streptococcus pneumoniae in clinical samples BJID
de Filippis,Ivano; Andrade,Claudia Ferreira de; Caldeira,Nathalia; Azevedo,Aline Carvalho de; Almeida,Antonio Eugenio de.
Abstract Background Several in-house PCR-based assays have been described for the detection of bacterial meningitis caused by Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, and Haemophilus influenzae from clinical samples. PCR-based methods targeting different bacterial genes are frequently used by different laboratories worldwide, but no standard method has ever been established. The aim of our study was to compare different in-house and a commercial PCR-based tests for the detection of bacterial pathogens causing meningitis and invasive disease in humans. Methods A total of 110 isolates and 134 clinical samples (99 cerebrospinal fluid and 35 blood samples) collected from suspected cases of invasive disease were analyzed. Specific sets of primers...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diagnostic; Neisseria meningitidis; Streptococcus pneumoniae; Haemophilus influenzae.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702016000400335
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Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998. Convention 95 RPC R 62 - Programme Pathologie - Rapport Scientifique année 1995 ArchiMer
Renault, Tristan; Berthe, Franck; Chollet, Bruno; Cochennec, Nathalie; Haffner, Philippe; Le Deuff, Rose-marie; Thuillier, Benoit.
Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Pathogènes; Virus; Herpès virus; Crassostrea gigas; Diagnostic; Herpesviridae.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15453/12828.pdf
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Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998. Convention 96 RPC R70 - Programme Pathologie - Rapport Scientifique année 1996 ArchiMer
Renault, Tristan; Berthe, Franck; Chollet, Bruno; Cochennec, Nathalie; Haffner, Philippe; Le Deuff, Rose-marie; Lipart, Cecile; Thebault, Anne.
Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Pathogènes; Virus; Herpès virus; Crassostrea gigas; Diagnostic; Herpesviridae.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15452/12827.pdf
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Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998. Convention 97 RPC R 58 - Programme Pathologie - Rapport Scientifique année 1997 ArchiMer
Renault, Tristan; Berthe, Franck; Thebault, Anne; Lipart, Cecile; Chollet, Bruno; Haffner, Philippe; Cochennec, Nathalie.
Le but de ce programme pathologie est de rechercher et d'étudier les agents pathogènes connus et inconnus chez les mollusques bivalves marins, plus particulièrement chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, afin d'identifier d'éventuels agents causant des mortalités, de proposer des mesures prophylactiques et de définir des conditions zootechniques permettant aux professionnels de limiter l'impact des maladies sur leur cheptel. La présence de maladies, chez les mollusques bivalves marins dont l'impact socio économique peut être catastrophique pour les productions conchylicoles, et l'accroissement des échanges de produits d'aquaculture entre les pays de la CEE et avec les pays tiers nécessitent le renforcement des recherches dans les domaines de la...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Pathogènes; Virus; Herpès virus; Crassostrea gigas; Diagnostic; Herpesviridae.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15454/12829.pdf
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Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998. Convention 98 RPC R 7 - Programme Pathologie - Rapport Final année 1998 ArchiMer
Renault, Tristan; Berthe, Franck; Thebault, Anne; Lipart, Cecile; Chollet, Bruno; Cochennec, Nathalie; Haffner, Philippe.
Depuis 1991, des mortalités massives sporadiques sont rapportées, en France, de manière régulière chez des larves et des juvéniles de différentes espèces de mollusques bivalves marins. Certains de ces épisodes de mortalité ont pu être associés à la détection de virus. Ces derniers par leur morphologie, leur cycle de réplication et leur localisation ont été apparentés à la famille des Herpesviridae. Cependant, les outils de diagnostic disponibles jusqu'alors (histologie et microscopie électronique à transmission) n'étaient pas adaptés à l'étude de ces virus du fait de leur manque de spécificité et de la lourdeur de leur mise en oeuvre. Par ailleurs, se posait la question de l'implication des virus détectés dans les phénomènes de mortalité observés. En...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Pathogènes; Virus; Herpès virus; Crassostrea gigas; Diagnostic; Herpesviridae.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15455/12830.pdf
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Contribution à la validation et à l'optimisation de la technique de PCR pour la détection de Bonamia ostreae chez l'huître plate : Ostrea edulis ArchiMer
Touzeau, Damien.
L'ostréiculture représente une part économique régionale et française importante avec une production d'environ 117 106 Tonnes de coquillages par an (FAO, 2003). Cependant le développement de cette activité peut être limité par des mortalités, parfois massives, dues à des maladies infectieuses. L'huître plate Ostrea edulis a subi deux maladies majeures : la Marteiliose due à Marteilia refringens et la Bonamiose due à Bonamia ostreae. Ces maladies à déclaration obligatoires ont fait chuter la production de 20 000 tonnes dans les années 70 à 2 098 Tonnes aujourd'hui. Suite à ces mortalités, différents programmes de recherche ont été lancés par Ifremer pour tenter de préserver voire de relancer la culture de l'huître plate. Un de ces programmes concerne la...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître plate; Ostrea edulis; Parasite; Bonamia ostreae; Technique PCR; ARN 18 S; Diagnostic.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14478/11777.pdf
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Contribution à l'étude de mollusques marins : Iridovirus-like et Herpèsvirus-like. Description, caractérisation biochimique, cycle de multiplication viral, diagnostic et étude épidémiologique ArchiMer
Renault, Tristan; Le Deuff, Rose-marie; Cochennec, Nathalie; Chollet, Bruno; Maffart, Patricia.
Among the marine molluscs, Pacifie oyster, Crassostrea gigas, is actually the most reared specie in the world. Noticely in France, where it was imported between 1960 and 1970, and replaced by Portuguese oyster, Crassostrea angulata, which specie was decimated during this period because of iridoviruses. Uncontroled introductions of new species may however be hazardous. Indeed, they might be responsible for the appearance and the dissemination of new diseases of bivalve molluscs in importing country. In addition to these observations, the quasi monobreeding of Pacific oyster in France enhances the necessity to develop research concerning the diagnosis of pathologies affecting this specie, namely the diagnosis of viral diseases. Several families of viruses...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques; Crassostrea gigas; Pathologie; Iridovirus; Herpèsvirus; Diagnostic; Molluscs; Crassostrea gigas; Pathology; Iridovirus; Herpesvirus; Diagnosis.
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15230/12548.pdf
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Contribution à l'étude de vibrions pathogènes d'huîtres creuses Crassostrea gigas - Interactions hémocytes-vibrions et développement de tests de diagnostic d'intérêt taxonomique ArchiMer
Duperthuy, Marylise.
Les bactéries du genre Vibrio représentent le groupe le plus fréquemment associé à des maladies infectieuses chez les mollusques marins et notamment l'huître creuse Crassostrea gigas. A ce jour trois espèces de Vibrio pathogènes d'huîtres creuses V. splendidus, V. aestuarianus et récemment V. coralliitycus ont été identifiés en France. La prévention des mortalités associées à ces vibrioses repose sur une meilleure compréhension des interactions hôte-pathogène et sur l'utilisation de techniques de diagnostic rapides à mettre en oeuvre et fiables. Ce travail a permis d'une part de caractériser la dynamique de phagocytose de vibrions par les cellules immunocompétentes de l'huître, les hémocytes. La mise au point d'un protocole d'analyse en cytométrie de flux...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Vibrio splendidus; Vibrio aestuarianus; Vibrio corralliitycus; Hémocytes; Phagocytose; Cytométrie de flux; Diagnostic; PCRq.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14452/11753.pdf
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Contribution à l'étude de virus de mollusques marins apparentés aux Iridoviridae et aux Herpesviridae ArchiMer
Le Deuff, Rose-marie.
Among the marine molluscs, Pacific oyster, Crassostrea gigas, is actually the most reared species in the world. Noticeably in France, where it was imported between 1960 and 1970, and replaced Portuguese oyster, Crassostrea angulata. Intensification of breeding and the associated introductions of new species may be hazardous. Indeed, they might be responsible for the appearance and the dissemination of new diseases in bivalve molluscs. In addition to these observations, the quasi monobreeding of C. gigas in France enhances the necessity to develop research concerning the diagnosis of pathologies affecting this species, namely the diagnosis of viral diseases. Several families of viruses have been described within marine bivalves molluscs. The purpose of this...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques bivalves; Crassostrea gigas; Huître japonaise; Pathologie; Iridovirus; Herpèsvirus; Diagnostic; Bivalve molluscs; Crassostrea gigas; Pacific oyster; Pathology; Iridovirus; Herpesvirus; Diagnosis.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21792/19367.pdf
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Detection and differentiation of Entamoeba histolytica and Entamoeba dispar in clinical samples through PCR-denaturing gradient gel electrophoresis BJMBR
López-López,P.; Martínez-López,M.C.; Boldo-León,X.M.; Hernández-Díaz,Y.; González-Castro,T.B.; Tovilla-Zárate,C.A.; Luna-Arias,J.P..
Amebiasis is one of the twenty major causes of disease in Mexico; however, the diagnosis is difficult due to limitations of conventional microscopy-based techniques. In this study, we analyzed stool samples using polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) to differentiate between Entamoeba histolytica (pathogenic) and E. dispar (non-pathogenic). The target for the PCR amplification was a small region (228 bp) of the adh112 gene selected to increase the sensitivity of the test. The study involved 62 stool samples that were collected from individuals with complaints of gastrointestinal discomfort. Of the 62 samples, 10 (16.1%) were positive for E. histolytica while 52 (83.9%) were negative. No sample was positive for E....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amebiasis; Neglected diseases; Diagnostic; PCR; DGGE; Adh112 gene.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2017000400607
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Development and Evaluation of an Indirect ELISA: Serological Survey to Detect Specific Antibodies to Bovine Herpesvirus 4 BABT
Krüger,Ernesto Renato; Penha,Tânia Regina; Hummelgen,Fernanda Cristina; Agottani,Jorge Bacila; Reva,Demétrio; Gonçalves,Robson; Thomaz-Soccol,Vanete.
ABSTRACTThe aim of this work was to develop and evaluate an indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and made a serological screening for specific antibodies to BoHV-4. Bovine serum samples were collected from different Brazilian states and evaluated for the presence of antibodies for BoHV-4 and BoHV-1. The serological results obtained showed that the indirect ELISA assay could be applied for the detection of specific antibodies for BoHV-4. The ELISA test allowed concluding that BoHV-4 is present in bovines in every Brazilian state from which serum samples were collected. The ELISA assay here standardized proved to be useful for the epidemiological studies and showed a positivity range from 1.8 to 66% in Brazil.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BoHV-4; Serology; Diagnostic; Cattle; Epidemiology.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132015000500725
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Development of a new diagnostic tool (Mini-Array) for ostreid Herpesvrus 1 (OsHV-1) detection in the Pacific oyster Crassostre gigas ArchiMer
Varsamos, S.; Pepin, Jean-francois; Sauvage, Christopher; Renault, Tristan.
OsHV-1 was the first herpesvirus to be identified in an invertebrate host and is associated to mortalities in the Pacific oyster (Crassostrea gigas) and other economically important bivalve species. Infections due to OsHV-1 are frequently reported and cause high mortality rates in larvae and spat of C. gigas. Detection of this pathogen is usually performed by PCR and/or in situ hybridization. This presentation will focus on the development of a new molecular diagnostic tool for OsHV-1 (and OsHV-1 variant 1) detection: the mini-array. This detection system, which allows multiple pathogens detection, combines viral DNA amplification by PCR and a specific hybridisation on a nylon membrane, revealed by a colorimetric reaction (DNA chip). Multiplex PCR involves...
Tipo: Text Palavras-chave: Diagnostic; Crassotrea gigas; Oyster; Detection; Herpesviridae; OsHV 1.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/acte-3652.pdf
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Diagnostic quantitatif de Perkinsus atlanticus (Apicomplexa, Perkinsea) chez les palourdes Ruditapes decussatus et Ruditapes philippinarum ArchiMer
Almeida, Manuela.
Le protozoaire parasite Perkinsus atlanticus (Azevedo, 1989) est une des causes des chutes de production de palourdes Ruditapes decussatus et R. philippinarum cultivées au Portugal, en Espagne et en Italie. Des modèles d'infection de Perkinsus ont été réalisés, par reproduction expérimentale de la maladie, pour étudier le rôle de la densité des palourdes, de la température et de la salinité sur le déroulement de la Perkinsiose. L'objectif de ce travail a été de développer une technique de diagnostic quantitative pour optimiser l'évaluation de l'intensité d'infection et détecter de faibles infections des palourdes par P. atlanticus. Le principe de cette technique consiste à cultiver tous les tissus de la palourde en milieu thioglycolate, suivi d'une lyse à...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Protozoaire; Parasite; Perkinsus atlanticus; Bivalvia; Ruditapes decussatus; Ruditapes philippinarum; Diagnostic.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14416/11710.pdf
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Diagnóstico da piscicultura na Bacia do Alto Taquari - MS. Infoteca-e
ROTTA, M. A..
O objetivo deste trabalho é a caracterização da situação da piscicultura na bacia do alto Taquari (BAT) a fim de se propor melhorias no seu sistema, viabilizando-o como meio alternativo de renda para os produtores da região. Este estudo foi realizado no mês de abril de 2003 através de levantamento com a aplicação de um questionário aos piscicultores da BAT. Foram obtidas informações para caracterizar os produtores, a propriedade e a produção, além de outros aspectos relevantes à atividade. Dos 24 produtores localizados na BAT, 12 (50%) se encontram em atividade, 10 estão inativos (42%) e em dois deles (8%) não foi possível obter informações. Na BAT a atividade de piscicultura vem sendo realizada principalmente em grandes propriedades, com área média de...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Caracterização; Bacia do Alto Taquari; Mato Grosso do Sul; Brasil; Diagnostic; Production; Scrutiny; Characterization; Taquari river; Wetland.; Diagnostico; Levantamento; Peixe; Produção.; Piscicultura; Brazil; Pantanal; Fish culture.; Fish.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/786918
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Enregistrement d'images vidéo géoréférencées par caméra remorquée dans les lagunes de Méditerranée. Expérimentations pilotes dans les étangs de Leucate (Juin 2004), de Thau et d'Ingril (avril 2005). ArchiMer
Oheix, Jocelyne.
Dans le cadre du Réseau de Suivi Lagunaire, des images vidéo géoréférencées par caméra tractée ont été réalisées dans trois lagunes de Méditerranée : Thau, Leucate et Ingril avec la collaboration de l'équipe d'Ifremer/Toulon qui assure le développement technique de l'outil d'acquisition d'images dans le cadre du projet « Prisme ». L'objectif est de déterminer la faisabilité technique en lagune puis d'optimiser l'exploitation des données. Ce rapport présente les résultats de la mise en œuvre de la caméra tractée, du rejeu des images et de la représentation cartographique des données sous SIG. Ces expérimentations ont permis de définir une typologie d'utilisation de la vidéo tractée en lagune: - Recouvrement végétal, - Cartographie d'herbier, - Grand type de...
Tipo: Text Palavras-chave: Lagunes littorales; Méditerranée; Vidéo sous-marine remorquée; Diagnostic; Macrophytes; Coastallagoon; Mediterranean; Towed submarine video; Diagnostic; Macrophytes.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00113/22400/20092.pdf
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Epidemiology of Mycoplasma agalactiae and Mycoplasma mycoides cluster in flocks of northeastern Brazil Ciência Rural
Santos,Sandra Batista dos; Melo,Renata Pimentel Bandeira de; Silva,Luana Thamires Rapôso da; Oliveira,Júnior Mário Baltazar de; Abad,Atzel Candido Acosta; Pinheiro Júnior,José Wilton; Mota,Rinaldo Aparecido.
ABSTRACT: The present study aimed to investigate contagious agalactia (CA) in flocks from Pernambuco State. The study involved 225 goats and 63 ewes; 288 milk samples and 100 vaginal swabs were collected in total. The PCR assays were carried out using specific primers to Mycoplasma agalactiae and the Mycoplasma mycoides cluster. Among the goat’s milk samples,12.0% (27/225) were positive for Mycoplasma agalactiae DNA, while 5.3% (12/225) contained the Mycoplasma mycoides cluster. Of the vaginal swabs taken from goats, 15.4% (12/78) were positive for Mycoplasma agalactiae DNA and 3.8% (3/78) contained the Mycoplasma mycoides cluster. In the case of ewes, 4.3% (1/23) of the milk samples contained Mycoplasma agalactiae DNA, and 7.5% (3/40) were positive for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Contagious agalactia; Flocks; Diagnostic; Epidemiology; Risk factor..
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018000400452
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