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The best of both worlds: Phylogenetic eigenvector regression and mapping Genet. Mol. Biol.
Diniz Filho,José Alexandre Felizola; Villalobos,Fabricio; Bini,Luis Mauricio.
Eigenfunction analyses have been widely used to model patterns of autocorrelation in time, space and phylogeny. In a phylogenetic context, Diniz-Filho et al. (1998) proposed what they called Phylogenetic Eigenvector Regression (PVR), in which pairwise phylogenetic distances among species are submitted to a Principal Coordinate Analysis, and eigenvectors are then used as explanatory variables in regression, correlation or ANOVAs. More recently, a new approach called Phylogenetic Eigenvector Mapping (PEM) was proposed, with the main advantage of explicitly incorporating a model-based warping in phylogenetic distance in which an Ornstein-Uhlenbeck (O-U) process is fitted to data before eigenvector extraction. Here we compared PVR and PEM in respect to...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Evolutionary models; Phylogenetic comparative methods; Phylogenetic imputation; Phylogenetic signal.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572015000300396
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