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A segment and epithelium specific messenger ribonucleic acid fragment up-regulated by estradiol in the rat oviduct Biol. Res.
RIOS,MARIANA; OJEDA,SUANY; VELASQUEZ,LUIS A; MAISEY,KEVIN; CROXATTO,HORACIO B.
Estradiol accelerates oviductal embryo transport in the rat through changes of genomic expression in oviductal cells. However, the genes involved are unknown. We used a differential display by reverse transcription-polymerase chain reaction to detect estradiol (E2)-dependent genes in the rat oviduct. Rats on day 2 of pregnancy were untreated or treated with 10 µg of E2 and the oviducts were extracted at 30, 180 and 360 min later and used to isolate RNA. Products of reverse transcriptase-PCR, made with pairs of arbitrary and oligo-deoxythymidine primers, were separated on denaturing polyacrylamide gels and candidate bands were excised and reamplified. Truly positive cDNA fragments determined by a single strand conformation polymorphism assay were cloned and...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Differential display; Estradiol; Gene; MRNA; Oviduct.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-97602001000100011
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A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. Repositório Alice
NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F..
The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Expressão genética; Soja; Gene; Soybeans; Genes; Bioinformatics; Gene expression.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926586
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A web-based platform for RNA-Seq data analysis and storage: a case study on soybean gene expression experiments. Repositório Alice
BINNECK, E.; NASCIMENTO, L. S. do.
The availability of the soybean genome sequence and the rapid evolution of DNA sequencing technologies in recent years bring us exciting new promises for scientific discovery and its conversion into required technological breakthroughs in the production and use of soybean. In addition to be a major protein source in animal feeds, soybean is ranked number one among the chief oil crops in the world and is becoming a major crop for biodiesel production. As a leguminous crop, soybean fixes nitrogen in association with Bradyrhizobium, which significantly reduces the needs for ammonium-based fertilizer even in other crops. In this presentation, it will be described using a web-based platform, Soybean Gene Express, for analyzing and storing RNA-Seq data from...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Soja; Gene; Genoma; Soybeans; Gene expression.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943038
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Aluminum tolerance in tobacco plants transformed with a plant and a bacterial citrate sinthase genes regulated by root specific and constitutive promoters. Repositório Alice
BELELE, C.L.; CANCADO, G.M.; CARNEIRO, A. A.; PAIVA, E.; PURCINO, A. A. C.; LOPES, M.A.; CARNEIRO, N. P..
1999
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tabaco; Aluminio; Citrato sintase; Genes; Raiz; Promotor; Tobacco; Aluminium; Root; Promoters; Citrate sinthase; Gene.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/483518
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An overall evaluation of the resistance (R) and pathogenesis-related (PR) superfamilies in soybean, as compared with Medicago and Arabidopsis. Repositório Alice
WANDERLEY-NOGUEIRA, A. C.; BELARMINO, L. C.; SOARES-CAVALCANTI, N. da M.; BEZERRA-NETO, J. P.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E.; CARAZZOLE, M. F.; BENKO-ISEPPON, A. M..
Plants have the ability to recognize and respond to a multitude of pathogens, resulting in a massive reprogramming of the plant to activate defense responses including Resistance (R) and Pathogenesis-Related (PR) genes. Abiotic stresses can also activate PR genes and enhance pathogen resistance, representing valuable genes for breeding purposes. The present work offers an overview of soybean R and PR genes present in the GENOSOJA (Brazilian Soybean Genome Consortium) platform, regarding their structure, abundance, evolution and role in the plantpathogen metabolic pathway, as compared with Medicago and Arabidopsis. Searches revealed 3,065 R candidates (756 in Soybean, 1,142 in Medicago and 1,167 in Arabidopsis), and PR candidates matching to 1,261 sequences...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Biotic stress; Pathogen response; Soja; Resposta da planta; Doença de planta; Gene; Genoma; Soybeans; Bioinformatics; Plant diseases and disorders; Genome; Genes.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926612
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Análise da infecção viral e do produto de expressão de rolA em sistema de baculovírus. Repositório Alice
OLIVEIRA, M. S.; SIHLER, W.; CARNEIRO, M.; SOUZA, M. L..
2002
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene; RolA; Baculovírus.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/184625
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Análise de QTL para produtividade baseada em linhas puras recombinantes de arroz. Repositório Alice
SILVA, D. R. A.; VIANELLO, R. P.; MENDONÇA, J. A.; CORDEIRO, A. C. C.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve por objetivo identificar genes associados à produtividade por meio da genotipagem por sequenciamento e uma posterior análise de QTL.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: QTL; Arroz; Oryza sativa; Gene.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066155
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Análise do N-terminal da proteína capsidial de SCMV infectando milho e sorgo no Brasil. Infoteca-e
SOUZA, I. R. P. de; CARNEIRO, N. P.; GIOLITTI, F.; LENARDON, S. L.; SABATO, E. de O.; GOMES, E. A.; NODA, R. W.; SOUZA, F. A. de.
x
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Potyvírus; Sequenciamento; Gene; Fitopatologia; Genética vegetal.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/951986
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Análise do transcriptoma de arroz (Oryza sativa) cultivado sob déficit hídrico. Repositório Alice
SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; CARNEIRO, N. P..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene; Genética vegetal; Plant genetics; Plant-water relations; Transcriptome.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974343
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Análise filogenética do gene nodY/K revela coevolução e transferência horizontal entre Bradyrhizobium e leguminosas. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; MENNA, P.; HUNGRIA, M..
Plantas da família Leguminosae (Fabaceae) ocupam uma ampla variedade de biomas terrestres, com algumas delas estabelecendo simbiose com um grupo de bactérias coletivamente chamadas de rizóbios, cuja característica mais importante é a capacidade de fixar o nitrogênio atmosférico (N2). No caso do Brasil, bactérias do gênero Bradyrhizobium representam a grande maioria dos isolados de leguminosas tropicais nativas, além de apresentarem relevância como simbiontes de culturas de importância econômica, como é o caso da soja. Estudos taxonômicos com essas bactérias têm demonstrado uma elevada diversidade genética entre as estirpes e, nos últimos anos, várias espécies já foram descritas. Contudo, quando a filogenia dos genes envolvidos no processo de nodulação e...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene; Genes.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010714
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Análise funcional de genes de importância agronômica em macieira. Repositório Alice
SILVEIRA, C. P.; PORTO, D. D.; FALAVIGNA, V. S.; BUFFON, V.; MARASCHIN, F.; REVERS, L. F..
Neste estudo piloto, o gene repórter GFP foi clonado e testado em plantas de macieira para avaliar a utilização da tecnologia TraitUP.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vetor viral; TraitUP; Transformação de plantas; Macieira; Maçã; Fruticultura; Genética vegetal; Gene; Proteína; Vírus.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/996661
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Análise funcional do gene At4g10250 em resposta à infecção por Meloidogyne javanica em Arabidopsis thaliana. Repositório Alice
SILVA, A. G.; HISHINUMA-SILVA, S. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. G.; DIAS, W. P.; LOPES, I. de O. N.; CARVALHO, M. C. C. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C..
bitstream/item/183278/1/p-46-52-Doc401-XIII-JA.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja; Gene; Meloidogyne Javanica; Nematóide; Praga de Planta; Doença de Planta; Soybeans; Genes; Plant diseases and disorders.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096079
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Análise global da expressão de genes Dof em videira. Repositório Alice
FALAVIGNA, V. da S.; PORTO, D. D.; REVERS, L. F.; PEZZOTTI, M..
Neste trabalho é caracterizada a família gênica Dof em videira (Vitis vinifera L.), a qual é composta por 25 genes. A busca por domínios conservados foi realizada utilizando-se o programa MEME suite v.4.9.0. Estudos filogenéticos foram conduzidos comparando 163 sequências Dof de videira, álamo, Arabidopsis thaliana e tomate com proteínas Dof de função conhecida previamente descritos na literatura.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Videira; Viticultura; Genética; Gene; Vitis vinifera.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/996663
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Análise in silico de sequências nucleotídicas de botão floral de algodoeiro geradas a partir de uma biblioteca substrativa de cDNA. Repositório Alice
BATISTA, V. G.; LIMA, L. M. de; SANTOS, R. C. dos; PINHEIRO, M. P. N.; BARROS, T. F. S..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gossypium sp; Gene; RNA; Algodão.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/661749
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Anotação funcional de sequências com BLAST2GO. Infoteca-e
NODA, R. W.; DAMASCENO, C. M. B.; SOUSA, S. M. de.
2010
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bioinformática; Gene; Genoma.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/880839
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Associação dos polimorfismos dos genes H19/Rsal e IGF2/Apal com as síndromes hipertensivas gestacionais. Repositório Alice
ARAÚJO, F. M.; SOARES, M. R.; DUARTE, G.; MARCONDES, C. R.; LÔBO, R. B.; GALERANI, M. A. V.; RAMOS, E. S..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética animal; Mortalidade animal; Gene; Prenhez; Síndrome hipertensiva gestacional.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/385330
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Association between a SNP of IL2 gene and gastrointestinal resistance in goat Repositório Alice
BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; MALAGO JUNIOR, W.; GIGLIOTI, R.; IBELLI, A. M. G.; COUTINHO, R.; CARRILHO, E.; ZAROS, L. G.; VIEIRA, L. da S.; REGITANO, L. C. de A..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Goat; Gastrointestinal resitance; Gene; Association.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/904725
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Ativação do promotor AtPT2 de Arabidopsis thaliana sob estresse de fósforo em plantas transgênicas de milho. Infoteca-e
CARNEIRO, A. A.; CARVALHO, C. H. S.; COELHO, G. T. C. P.; SOUZA, I. R. P.; PAIVA, L. V.; CARNEIRO, N. P.; SCHAFFERT, R. E.; BRANDAO, R. L.; ALVES, V. M. C..
x
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Planta transgênica; Gene; Milho; Zea mays.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/865599
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Avaliação agronômica do milho geneticamente modificado com o gene SbMATE, que confere tolerância ao alumínio: processo de biossegurança para o primeiro estudo de campo. Infoteca-e
VASCONCELOS, M. J. V. de; CARNEIRO, A. A.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T..
O desenvolvimento de uma planta geneticamente modificada envolve a introdução de um ou vários genes exógenos nesse organismo, sem que haja fecundação ou cruzamento. As plantas que tiveram seu código genético alterado pela introdução de uma ou mais sequências de DNA provenientes de outra espécie devem passar por rigorosas análises que comprovam suas características agronômicas e de segurança, tanto para o meio ambiente, como para os seres vivos, cujo conjunto de práticas são chamadas de biossegurança. A biossegurança de uma planta transgênica, além de trabalhos em regime de contenção, passa por liberações planejadas no meio ambiente para se obter dados agronômicos, físico-químicos e ambientais, visando o preparo de um dossiê para a liberação comercial. O...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Biossegurança; Zea Mays; Genética; Gene; Planta Transgênica; Biotecnologia.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1100096
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Avaliação da coleção mundial de Solanum chacoense para resposta à murcha bacteriana (Raltonia solanacearum). Repositório Alice
LIMA-NETO, A. F.; BOITEUX, L. S.; LOPES, C. A..
bitstream/item/192643/1/digitalizar0156.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coleção; Cultivare; Controle; Ralstonia solenacearum; Bactéria; Batata; Gene; Germoplasma; Hospedeiro; Murcha Bacteriana; Resistência; Solanum Tuberosum; Solanum chacoense.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/780344
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