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Avaliacao da divergencia genetica de germoplasma de abobora procedente de diferentes areas do Nordeste do Brasil. Repositório Alice
RAMOS, S. R. R.; QUEIROZ, M. A. de; CASALI, V. W. D.; CRUZ, C. D..
O objetivo deste estudo foi utilizar tecnicas de analise multivariada para avaliar o grau de similaridade genetica entre 40 acessos de abobora (Cucurbita moschata D.), coletados em tres areas distintas da regiao Nordeste do brasil, verificando a relacao entre procedencia e divergencia genetica. O delineamento utilizado foi o de blocos casualizados com tres repeticoes. Foram avaliados os seguintes caracteres: comprimento do intemodio; diametro do caule; comprimento do peciolo e do limbo; largura do limbo; numero de dias para surgimento da primeira flor masculina e feminina.; n. do no em que surgiu a primeira flor masculina e feminina; peso e comprimento do fruto; diametro maior e menor do fruto. espessura do epicarpo e da polpa; diametro da cavidade...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergencia genetica; Avaliacao; Nordeste; Northeast; Abóbora; Cucúrbita Moschata; Germoplasma; Genetic distance; Germplasm; Brazil; Pumpkins.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/132978
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Dissimilaridade entre genótipos de Tucumã-do-Pará (Astrocaryum vulgare Mart.) desejáveis para frutos por marcadores RAPD. Repositório Alice
OLIVEIRA, N. P. de; OLIVEIRA, M. do S. P. de; CUNHA, E. F. M..
2010
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RAPD; Dissimilaridade; Tucumã; Astrocarium vulgare; Marcador molecular; Variação genética; Astrocaryum vulgare; Genetic markers; Genetic variation; Random amplified polymorphic DNA technique; Genetic distance.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1036925
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Divergencia entre sete populacoes de melancia (Citrullus lanatus), com base em caracteres morfologicos. Repositório Alice
FERREIRA, M. A. J. da F.; QUEIROZ, M. A. de; BRAZ, L. T.; CHURATA-MASCA, M.G.C..
bitstream/item/182363/1/Genetcs-and-Molecular-Biology-v.21-n.3-p.253-1998.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergencia genetica; Morfologia; Plant population; Citrullus Lanatus; Melancia; População de Planta; Genetic distance; Plant anatomy; Watermelons.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/132058
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Divergencia genetica em acessos de guandu. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; ARAUJO, F. P. de.
Foram caracterizados, no ano de 1991, em Petrolina, PE, 54 acessos de guandu, em parcelas unicas, sem repeticao. Nove caracteres quantitativos de maior importancia agronomica foram usados para determinacao da distancia genetica e formacao de grupos similares de acessos. As tecnicas empregadas foram: a) o Metodo de Agrupamento de Tocher, adotando a distancia euclidiana dos dados originais padronizados como medida de dissimilaridade; e b) dispersao grafica dos acessos em relacao aos dois primeiros componentes principais. Os acessos graniferos ICPL 6 e ICP6971, os forrageiros D1 Type, D3 Type e ICP 6970 e misto D1 Type, sao recomendados como progenitores, considerando nao so sua distancia genetica, mas tambem seu comportamento agronomico.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Guandu; Genetica; Distancia; Melhoramento; Genotipo; Cajanus cajan; Pigeonpea; Breeding; Genotype; Genetic distance; Guandu; Melhoramento genetico.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/133142
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Divergência genética em acessos de mangueira no Vale do São Francisco. Repositório Alice
COSTA, J. G. da..
bitstream/item/176742/1/Separata-9569.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Característica; Divergência genética; Characteristics; Manga; Mangifera Indica; Variedade; Genetic distance; Mangoes; Varieties.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/134531
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Divergencia genetica em genotipos de feijao-de-corda avaliados em dois ambientes. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; ARAUJO, F. P. de.
Foram avaliados 50 genotipos de feijao-de-corda em Petrolina, PE, em dois ambientes distintos: 1) plantio irrigado, no segundo semstre de 1994 (A1), e 2) plantio dependente de chuvas, no primeiro semestre de 1995 (A2). O delineamento foi em blocos ao acaso, com duas repeticoes, sendo as parcelas formadas por uma linha com 16 plantas, com espacamento de 1,0m x 0,5m para os dois ambientes. Foram analisados 10 caracteres quantitativos, tendo como medida de dissimilaridade as distancias generalizadas de Mahalanobis e para agrupamento o metodo proposto por Tocher. Houve a formacao de nove e 12 grupos de genotipos, respectivamente para A1 e A2. Os genotipos constituintes de cada grupo nao foram exatamente os mesmos nos dois ambientes, exceto no grupo 4. Os que...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genotipo; Divergencia genetica; Genotypes; Genetic distance; Feijao de corda; Cowpea.
Ano: 1997 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/133157
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Divergência genética entre acessos de açaizeiro fundamentada em descritores morfoagronômicos. Repositório Alice
OLIVEIRA, M. do S.P. de.; FERREIRA, D.F.; SANTOS, J.B. dos..
Este trabalho teve como objetivo estimar a divergência genética entre acessos de açaizeiro conservados na coleção de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, em Belém, PA, por meio de descritores morfoagronômicos. A avaliação foi realizada em 87 acessos, com base em 22 caracteres: sete relativos à planta, três à floração, três a frutos e nove à produção de frutos, no período de 1995 a 2001. Foram efetuadas análises univariadas e multivariadas, com estimativas das dissimilaridades obtidas pela distância euclidiana média padronizada, e formação dos agrupamentos obtida pelos métodos UPGMA e Tocher. Os acessos apresentaram alto índice de variação na maioria dos caracteres. As distâncias genéticas entre os pares de acessos variaram de 0,09 a 1,87, com média de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Euterpe oleracea; Variabilidade; Análise multivariada; Agrupamento; Distância genética; Variability; Multivariate analysis; Grouping; Genetic distance.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/126117
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Divergência genética entre acessos de um banco de germoplasma de capim-elefante. Repositório Alice
SHIMOYA, A.; CRUZ, C.D.; FERREIRA, R. de P.; PEREIRA, A.V.; CARNEIRO, P.C.S..
O objetivo deste trabalho foi estudar a divergência genética entre 99 acessos de capim-elefante (Pennisetum purpureum) do Banco de Germoplasma da Embrapa, em Coronel Pacheco, MG. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, com cinco repetições de 99 tratamentos (97 genótipos e duas testemunhas). Foram avaliadas 17 características quantitativas. Utilizaram-se as análises multivariadas: distância de Mahalanobis, método de Tocher e variáveis canônicas. Pelo método de Tocher, 99 genótipos de capim-elefante foram agrupados em 18 grupos. Pela análise de variáveis canônicas, 81,80% da variância acumulada foi explicada pelas sete primeiras variáveis canônicas. Quanto à importância relativa das características avaliadas, diâmetro do colmo, largura da...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pennisetum purpureum; Genótipos; Distância genética; Variabilidade genética; Seleção; Forrageiras; Genotypes; Genetic distance; Genetic variability; Selection; Forage.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/107476
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Divergencia genetica entre clones de guaranazeiro. Repositório Alice
NASCIMENTO FILHO, F.J. do; ATROCH, A.L.; SOUSA, N.R. de; GARCIA, T.B.; CRAVO, M.da S.; COUTINHO, E.F..
As técnicas multivariadas, para estimar a diversidade genética de um grupo de progenitores, têm sido utilizadas com freqüência pelos melhoristas de plantas. Os progenitores são utilizados em cruzamentos biparentais ou múltiplos, para formação de populações segregantes que tenham maior probabilidade de recuperação de genótipos superiores. Este trabalho foi realizado com o objetivo de identificar clones de guaranazeiro produtivos e divergentes que possam ser utilizados em um programa de cruzamentos para obter híbridos com alto valor heterótico e materiais para propagação vegetativa. Foram avaliados 148 clones de guaranazeiro atualmente em uso no programa de melhoramento genético da Embrapa-Centro de Pesquisa Agroflorestal da Amazônia Ocidental. Utilizou-se,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Paullinia cupana; Distancia genetica; Cruzamento; Hibridos; Populacao de plantas; Metodos de melhoramento; Genetic distance; Crossbreeding; Hybrids; Plant population; Breeding methods.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/103741
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Diversidad genética, estructura genética y sistema de cruzamiento en Pinus johannis. Colegio de Postgraduados
García Gómez, Verónica.
Pinus johannis M. F. Robert es una especie endémica de México que se distribuye en poblaciones aisladas en la sierra Madre Oriental. Los objetivos del presente estudio fueron: a) conocer el nivel de diversidad genética y estructura genética de P. johannis; y b) estimar su tasa de cruzamiento. Se utilizaron 143 árboles en cuatro poblaciones de Pinus johannis para estimar los parámetros de diversidad genética tales como número promedio de alelos por locus, porcentaje de loci polimórficos, heterocigosidad observada y esperada. Para calcular la tasa de cruzamiento (t) se utilizó tejido de semilla de 127 árboles. Para conocer la diversidad genética se analizaron nueve sistemas enzimáticos en geles de almidón utilizando electroforesis, y tres para el sistema de...
Palavras-chave: Heterocigosidad; Índice de fijación; Distancia genética; Tasa de cruzamiento; Autofecundación; Heterozygosity; Fixation index; Genetic distance; Outcrossing rate; Selfing.
Ano: 2013 URL: http://hdl.handle.net/10521/2377
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Diversidade molecular entre populações de Spodoptera frugiperda no Brasil avaliada por marcadores AFLP. Repositório Alice
PINTO, C. C.; GRÜTZMACHER, A. D.; ROSA, A. P. S. A. da; MANICA-BERTO, R.; MENDES, S. M.; ARGE, L. W. P.; BORGES, C. T..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade molecular, por meio de marcadores AFLP, de seis populações de Spodoptera frugiperda coletadas na cultura do milho, em diferentes regiões geográficas do Brasil. O DNA foi extraído de lagartas de quarto instar, e as reações de AFLP foram realizadas com sete combinações de oligonucleotídeos iniciadores. A partir das seis populações de S. frugiperda estudadas, foi identificado um grupo principal formado por três populações geneticamente mais relacionadas. As populações de S. frugiperda analisadas mostram alta variabilidade genética, com máximo de 58% de similaridade.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Biotype; Genetic distance; Fall armyworm; Molecular markers.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1017873
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Estimation of genetic distance among genotypes of caraway (Carum carvi L.) using RAPD-PCR Agronomy
Seidler-Łożykowska, Katarzyna; Institute of Natural Fibres and Medicinal Plants; Kuczyńska, Anetta; Polish Academy of Sciences; Mikołajczyk, Katarzyna; Plant Breeding and Acclimatization Institute; Nowakowska, Joanna; Plant Breeding and Acclimatization Institute; Bocianowski, Jan; Poznań University of Life Sciences.
In order to estimate genetic diversity among starting materials and breeding strains of caraway, a collection of 17 accessions from botanical gardens in Europe, two cultivars ‘Rekord’ and ‘Kończewicki’, and four own breeding strains were analyzed by RAPD-PCR. The representative samples, each of five individual plants of accession, cultivar or strain, were taken from young rosette leaves. Forty of Genset Oligos RAPD primers were used for analysis and eight of them produced clear and reproducible banding patterns. In total, 62 banding patterns were obtained revealing 23 polymorphic bands, whereas the number of polymorphic bands ranged from two to four for one primer. The GS12 and GS43 primers generated two polymorphic bands, while each of the GS8, GS21,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Carum carvi L.; Genetic distance; Genotype; RAPD.
Ano: 2014 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/18197
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Genetic characterization of Japanese plum cultivars (Prunus salicina) using SSR and ISSR molecular markers Ciencia e Investigación Agraria
Carrasco,Basilio; Díaz,Carole; Moya,Mario; Gebauer,Marlene; García-González,Rolando.
The genetic characterization of 29 elite Japanese plum cultivars (Prunus salicina) and 4 Prunus cultivars was carried out by analyzing 97 Simple Sequence Repeat (SSR) alleles and 232 binary Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) loci. A high level of genetic variability was found for these two molecular markers among the Japanese plum cultivars compared to other Prunus species. On average, the variability found by analyzing the SSR alleles were Na = 12.1, Ne = 5.2, Ho = 0.9, He = 0.8 and F= -0.127, whereas ISSR yielded values of h = 0.15 and I = 0.27. The genetic relationship among cultivars was estimated with Principal Coordinate Analysis (PCA) and a Bayesian clustering approach using the software program Structure. This program identified two subgroups...
Tipo: Journal article Palavras-chave: AMOVA; Bayesian analysis; Genetic distance; PCA; Plum; Structure.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202012000300012
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Genetic diversity in Egeria densa and E. najas in Jupiá Reservoir, Brazil Ciencia e Investigación Agraria
Mori,Edson S; Martins,Dagoberto; Velini,Edivaldo D; Marino,Celso L; Gouvêa,Cantídio F; Leite,Suzi M.M; Camacho,Edwin; Guries,Raymond P.
The aquatic plant species Egeria densa (Planch.) Casp and E. najas Planchon occur naturally in the Paraná River Basin of southeastern Brazil. Hydroelectric dam construction in the river basin has created several lakes, changing the ecology of the river and altering the population ecology of Egeria. Large, dense populations of Egeria now grow in Jupiá Lake and its tributaries, occasionally blocking hydroelectric turbines. This study is part of a larger project examining environmental changes associated with large dam projects; the research objective of this study was to assess patterns of genetic diversity in Egeria populations growing in Jupiá and Três Irmãos Lakes and their Paraná River tributaries using genetic markers. Forty-two plants of E. najas and...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Egeria; Dam; Isoenzyme; Genetic distance; RAPD; Reservoir.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202012000200008
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Genetic diversity of Spanish melons (Cucumis melo) of the Madrid provenance National Institute of Agronomic Research
Escribano, S.; Lázaro, A.; Staub, J.E..
The genetic diversity of five winter melon landraces having a historic presence in the town of Villaconejos, Spain (near Madrid) and four reference accessions including one accession from snakemelon, was assessed using the allelic variation at 19 SSR loci. Seventy-two polymorphic bands were scored which provided for adequate discrimination among the accessions examined. Cluster analysis (UPGMA) employing SSR-based genetic similarity (GS, Jaccard similarity coefficient) data resulted in a dendrogram with two major clades. Although winter melon accessions were represented in both clades, genetic differences among two Madrid accessions and the other seven landraces were remarkable. In fact, this genetic difference (GS = 0.24; lack of genetic affinity) was...
Tipo: Poster Palavras-chave: Mediterranean country; Cucumis melo; SSRs; Genetic resource; Genetic distance; Multivariate analysis; Genetic diversity.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/2174/225
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Genetic variability analysis of elite upland rice genotypes with SSR markers. Repositório Alice
BRONDANI, C.; CALDEIRA, K. da S.; BORBA, T. C. O.; RANGEL. P. N.; MORAIS, O. P. de; CASTRO, E. da M. de; RANGEL, P. H. N.; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, R. V..
Rice is one of the staple foods consumed worldwide, and rice breeding programmes have become important to warrant high yield levels and grain quality in upland rice. Laboratory experiments were conducted to study the genetic variation of 30 elite genotypes from a VCU trial, of the upland rice breeding programme of Embrapa, Brazil, using 25 SSR markers. A total of 131 alleles were obtained, with an average of 5.2 alleles per locus and a mean PIC equal to 0.61. Results indicated that genetically different elite parents from the breeding programme and selection in segregating families have given rise to broad-based rice genotypes. Based on the analysis of different combinations of 10 SSR markers, it was observed that the use of more informative markers is...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Recurso genético; Marcador microssatélite; Distância genética; Genetic Resources; Microsatellite markers; Genetic distance.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/214369
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Genetic variability and evidence of founder effect in Hemiodus orthonops (Characiformes: Hemiodontidae) from the upper Paraná River basin, Brazil Biological Sciences
Marques, Liégie Alher; Renesto, Erasmo.
 Hemiodus orthonops is a small fish of the Hemiodontidae family, order Characiformes, with a maximum of 25 cm standard length. Until recently, H. orthonops was an endemic species from the Paraná-Paraguay basin and it was absent from the upper Paraná River basin. Since 2008, it has started to be collected in the upper Paraná River, representing up to 10% of catches. Two population samples of H. orthonops from two localities of the upper Parana River basin (Porto Camargo and Porto Figueira) were analyzed using the allozymes electrophoresis technique. Twenty-one enzymatic loci were detected. The population sample from Porto Camargo displayed a genetic variability (He = 0.1061) higher than that from Porto Figueira (He = 0.0580) and homozygote excess in both of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Allozymes; Fish; Genetic distance; Heterozygosity; Protein polymorphism. genética de populações.
Ano: 2017 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciBiolSci/article/view/31793
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Genetic variability of the Amazon River prawn Macrobrachium amazonicum (Decapoda, Caridea, Palaemonidae) Naturalis
Vergamini, F.G.; Pileggi, L.G.; Mantelatto, F.L..
The freshwater prawn Macrobrachium amazonicum is widely distributed in South America, and occupies habitats with a wide range of salinities. Several investigations have revealed the existence of wide intraspecific variability among different populations, although the understanding of this variability is still fragmentary and incomplete. We compared and characterized inland and coastal populations of M. amazonicum from Brazil, using molecular data (16S and COI mtDNA) to describe the degree of variability, structure, and relationships among them. Genetic divergence rates among populations showed variability at the intraspecific level. All the analyses evidenced significant genetic divergence among populations, structuring them in three groups: I- inland...
Tipo: Article / Letter to the editor Palavras-chave: Brazil; Genetic distance; Inland versus coastal populations; Phylogeny; Mitochondrial DNA; Population; 42.74.
Ano: 2011 URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/369711
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Genetics and morphology of the genus Tritetrabdella (Hirudinea, Haemadipsidae) from the mountainous rain forests of Sabah, Borneo, reveal a new species with two new subspecies Naturalis
Kappes, H..
Blood-feeding terrestrial leeches of the family Haemadipsidae are a notorious part of the invertebrate diversity in Asian and Australian rain forests. All hitherto published records of terrestrial leeches of Borneo belong to the genus Haemadipsa. Here, a second, poorly known haemadipsid genus is reported from Mount Kinabalu and Crocker Range National Park. The individuals were barcoded and compared to sequences available in GenBank. The results show that the genus Tritetrabdella has representatives in the Indochinese and the Sundaic bioregions. All six specimens from Borneo are from a single new Tritetrabdella lineage, T. kinabaluensis spec. nov. Within the Bornean lineage, two groups differing 4-5% in the COI barcoding sequence were identified. Because 1)...
Tipo: Article / Letter to the editor Palavras-chave: Annelida; Clitellata; Ecological specialization; Genetic distance; Parasite; Phylogeny; Speciation; Tropical mountains; 42.76; 42.64.
Ano: 2013 URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/462900
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Heterozygosity following half-sib recurrent selection in popcorn using isoenzyme markers Electron. J. Biotechnol.
Pereira,Liz Kazmirczak; Scapim,Carlos Alberto; Mangolin,Claudete Aparecida; Machado,Maria de Fátima Pires da Silva; Pacheco,Cleso Antônio Patto; Mora,Freddy.
Isozyme biochemical marker may be useful tool for genomic analysis of maize populations undergoing recurrent selection. Thus, isozymes markers was utilized for assess the changes in the genetic variability and distance in a Brazilian composite population of popcorn following four cycles of recurrent selection for yield. One hundred and ninety-six half-sib families were evaluated from each cycle and the ten highest-yielding families (5.2%) were recombined to produce the next cycle. Isozyme analysis considered 80 seedlings per cycle. Simple linear regression equations were estimated among the allele frequencies in each locus in function of the selection cycles, the genetic distances among the cycles and the average heterozygosity per locus for each cycle....
Tipo: Journal article Palavras-chave: Allozymes frequency; Genetic distance; Selection cycles; Zea mays.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000100004
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