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Association between genetic distances in wheat (Triticum aestivum L.) as estimated by AFLP and morphological markers. Repositório Alice
VIEIRA, E. A.; CARVALHO, F. I. F. de; BERTAN, I.; KOPP, M. M.; ZIMMER, P. D.; BENIN, G.; SILVA, J. A. G. da; HARTWIG, I.; MALONE, G.; OLIVEIRA, A. C. de..
2007
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Divergência genética; Trigo; Triticum aestivum; Genetic divergence; Molecular marker; Wheat.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/559343
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Avaliação da variabilidade das gerações G0 e F1 da linhagem GIFT de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) por RAPD - DOI: 10.4025/actascianimsci.v30i2.4708 Animal Sciences
Lupchinski Junior, Enio; UEM; Vargas, Lauro; UEM; Povh, Jayme Aparecido; UEM; Ribeiro, Ricardo Pereira; UEM; Mangolin, Claudete Aparecida; UEM; Barrero, Nelson Maurício Lopera; UEM.
Este trabalho teve como objetivo analisar, pela técnica RAPD, a variabilidade e a divergência genética de duas gerações da linhagem GIFT. Foram estimados parâmetros para os reprodutores (G0) e para a progênie (F1). A variabilidade genética foi determinada pela porcentagem de loci polimórficos e pelo índice de Shannon. As gerações apresentaram 69,6% de loci polimórficos (G0) e 60,0% de polimorfismo (F1). Os valores para o índice de Shannon foram de 0,367 para a geração G0 e de 0,317 para a F1. Os valores de divergência genética, calculados pelo teste de Mantel, foram de 0,213 para a G0 e 0,208 para a geração F1. Os resultados obtidos indicaram que houve perda da variabilidade genética da geração G0 para a F1. No entanto, um fato a ser destacado foi a alta...
Palavras-chave: 5.05.04.00-2 Reprodução Animal índice de Shannon; Gerações de cultivo; Divergência genética; Variabilidade genética. Shannon index; Cultivated generations; Genetic divergence; Genetic variability.
Ano: 2008 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/4708
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Avaliação de híbridos experimentais de cenoura no Distrito Federal. Repositório Alice
PEREIRA, R. B.; CARVALHO, A. D. F. de; PINHEIRO, J. B.; SILVA, G. O. da; VIEIRA, J. V..
O presente trabalho teve por objetivo avaliar o potencial agronômico de dois conjuntos de 24 híbridos de cenoura, sendo nove obtidos pelo cruzamento entre linhagens de origem tropical (grupo Brasília: CNPH-520 e CNPH- 536) e temperada (macho-estéreis: CNPH-610, CNPH-664, CNPH-633, CNPH-712 e CNPH-671) e 15 obtidos do cruzamento entre linhagens de origem tropical (CNPH-1 a CNPH-15) e a linhagem macho-estéril CNPH-612.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Queima-das-folhas; Divergencia genética; Cenoura; Doença de planta; Daucus carotta; Genetic divergence.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010352
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Caracterização e uso da variabilidade genética de banco ativo de germoplasma de Coffea canephora Pierre ex Froehner. Repositório Alice
ROCHA, R. B.; VIEIRA, D. dos S.; RAMALHO, A. R.; TEIXEIRA, A. L..
Objetivou-se, neste trabalho, quantificar a diversidade genética de acessos de C. canephora do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Rondônia, visando à identificação de plantas de maior divergência genética e maior potencial produtivo para hibridização.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coffea canephora; Genetic divergence; Productive potential; Robusta; Conilon; Divergência genética; Potencial produtivo.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/983944
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Disentangling the Influence of Mutation and Migration in Clonal Seagrasses Using the Genetic Diversity Spectrum for Microsatellites ArchiMer
Arnaud-haond, Sophie; Moalic, Yann; Hernandez-garcia, Emilio; Eguiluz, Victor M.; Alberto, Filipe; Serrao, Ester A.; Duarte, Carlos M..
The recurrent lack of isolation by distance reported at regional scale in seagrass species was recently suggested to stem from stochastic events of large-scale dispersal. We explored the usefulness of phylogenetic information contained in microsatellite loci to test this hypothesis by using the Genetic Diversity Spectrum (GDS) on databases containing, respectively, 7 and 9 microsatellites genotypes for 1541 sampling units of Posidonia oceanica and 1647 of Cymodocea nodosa. The simultaneous increase of microsatellite and geographic distances that emerges reveals a coherent pattern of isolation by distance in contrast to the chaotic pattern previously described using allele frequencies, in particular, for the long-lived P. oceanica. These results suggest...
Tipo: Text Palavras-chave: Clonality; Genetic Diversity Spectrum; Genetic divergence; Microsatellites; Seagrass; Stepwise mutation.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00182/29292/27733.pdf
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Divergência fenotípica entre acessos de uvas de mesa no Semi-Árido brasileiro. Repositório Alice
BORGES, R.M.E.; GONÇALVES, N.P. da S.; GOMES, A.P. de O.; ALVES, E.O. dos S..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a divergência fenotípica em uvas da Coleção da Embrapa Semi-Árido, com base em oito variáveis morfoagronômicas avaliadas nos anos 2005 e 2006. Nas uvas com sementes, a análise por componentes principais identificou oito grupos contrastantes. As variáveis mais relevantes, quanto à divergência genética, foram peso e comprimento de bagas. Em uvas sem sementes, formou-se apenas um grupo, e as variáveis mais relevantes foram peso de bagas e produção. A distância euclidiana média padronizada no grupo com sementes mostrou que 41% dos acessos apresentaram estimativas acima da média geral. No grupo sem sementes, o percentual foi de 47%. Foi observada concordância de resultados com os componentes principais. Pelo UPGMA,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis vinifera; Descritores de videira; Divergência genética; Melhoramento genético; Grape descriptors; Genetic divergence; Genetic inbreeding.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122145
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Divergência fenotípica entre linhagens de abobóra para caracteres associados à morfologia da planta. Repositório Alice
SANTOS, H. J. B.; MIRANDA, J. S. da S.; BORGES, R. M. E.; LIMA, M. A. C. de.
O objetivo deste trabalho foi determinar a divergência fenotípica entre linhagens de abóbora com base em caracteres relacionados à morfologia da planta.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergência genética; Descritores qualitativos; Cucurbita moschata; Abóbora; Melhoramento genético vegetal; Melhoramento vegetal; Plant breeding; Genetic divergence; Qualitative descriptors.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1028993
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Divergencia genetica em acessos de feijao de corda avaliados em dois ambientes distintos. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; ARAUJO, F. P. de.
A selecao de progenitores tendo como um dos criterios a distancia genetica, tem sido usada em diversos programas de melhoramento. Os efeitos do ambiente na expressao genica, entretanto, podem influenciar na divergencia, sendo recomendavel a avaliacao dos genotipos em ambientes diferentes. Neste trabalho, 50 acessos de feijao de corda foram avaliados em Petrolina,PE, em dois ambientes distintos: 1) plantio irrigado, no segundo semestre de 1994 (A1), e 2) plantio dependente de chuvas, no primeiro semestre de 1995 (A2). O delineamento foi em blocos ao acaso, com duas repeticoes, sendo as parcelas formadas por uma linha com 16 plantas, no espacamento de 1,0 x 0,5 m, para os dois ambientes. Foram analisados 10 caracteres quantitativos, tendo como medida de...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergencia genetica; Genetic divergence; Cowpea; Feijão de corda; Vigna Unguiculata.
Ano: 1995 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/133141
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Divergência genética entre genótipos de sorgo sacarino baseado em caracteres agroindustriais. Repositório Alice
FAGUNDES, T. G.; NUNES, J. A. R.; PARRELLA, R. A. da C.; BRUZI, A. T.; DURAES, N. N. L.; LOMBARDI, G. M. R..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Agribusiness characters; Genetic divergence; Sorghum bicolor; Melhoramento genético vegetal; Plant breeding.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974781
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Divergência genética entre progênies de Pinus caribaea var. caribaea com base em caracteres quantitativos PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Silva, Janete Motta da; Aguiar, Ananda Virgínia de; Mori, Edson Seizo; Moraes, Mario Luiz Teixeira de.
O objetivo desse trabalho foi quantificar a dissimilaridade genética entre progênies de P. caribaea var. caribaea para identificar genitores divergentes, visando gerar genótipos mais produtivos e avaliar a variabilidade total por meio de alguns caracteres fenotípicos de importância comercial. Assim, um teste de progênies de P. caribaea var. caribaea foi implantado em delineamento experimental látice 10 x 10 triplo, com 99 progênies e uma testemunha comercial em Selvíria, MS. Foram avaliados os caracteres quantitativos antes e após desbaste aos 14 anos, tais como: altura total de plantas (m), diâmetro à altura do peito - DAP (cm); volume (m3 árvore-1); forma do fuste das árvores, densidade básica da madeira, na altura do DAP - DBM-1, e na metade da altura...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Parâmetros genéticos; Divergência genética; Pinheiros tropicais; Teste de progênies Genetic parameters; Genetic divergence; Tropical pines; Progeny trial.
Ano: 2012 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/194
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Divergência genética entre variedades de videiras do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Semiárido. Repositório Alice
BATISTA, P. F.; LIMA, M. A. C. de; LEAO, P. C. de S.; SOUZA, F. de F.; ALVES, R. E..
Este trabalho teve por objetivo avaliar a divergência genética entre 31 variedades de videira do Banco de Germoplasma da Embrapa Semiárido, considerando características de qualidade, compostos de importância funcional e atividade antioxidante dos frutos. Foram avaliadas nas bagas as seguintes características: teor de sólidos solúveis (SS), acidez titulável (AT), relação SS/AT, resistência da baga à força de compressão, teor de taninos (dímeros, oligoméricos e poliméricos), polifenóis extraíveis totais, antocianinas totais, flavonoides amarelos e atividade antioxidante. Foi utilizada a distância generalizada de Mahalanobis para quantificar a divergência genética entre as variedades. Como estratégias de agrupamento, foram empregados UPGMA e a análise de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis vinifera; Divergência genética; Variação fenotípica; Uva; Recurso genético; Grapes; Genetic divergence; Phenotypic variation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1023034
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Eficiência de coeficientes de similaridade em genótipos de feijão mediante marcadores RAPD. Repositório Alice
EMYGDIO, B.M.; ANTUNES, I.F.; CHOER, E.; NEDEL, J.L..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência de coeficientes de similaridade em genótipos de feijão por meio de marcadores RAPD. A eficiência dos coeficientes de similaridade de Jaccard, Sorensen-Dice, Russel e Rao, Ochiai, Coincidência Simples, Rogers e Tanimoto, Hamann, Kulczynski 2, Yule e Phi no agrupamento de 35 cultivares locais e comerciais de feijão foi analisada com base em 104 marcadores RAPD. Os coeficientes foram comparados por dendrogramas, pela eficiência da projeção no espaço bidimensional e por grupos formados pelo método de otimização de Tocher. Os diferentes coeficientes de similaridade apresentaram variação quanto à eficiência de projeção no espaço bidimensional e quanto ao número de grupos formados pelo método de otimização de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Divergência genética; Análise de agrupamento; Genetic divergence; Cluster analysis.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/108903
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Evaluation of common bean accesses with multi-category variables - doi: 10.4025/actasciagron.v33i4.6944 Agronomy
Albuquerque, Amanda Nogueira de; Universidade do Estado do Mato Grosso; Barelli, Marco Antônio Aparecido; Universidade do Estado do Mato Grosso; Neves, Leonarda Grillo; Universidade do Estado do Mato Grosso; Arantes, Vinícius Ribeiro; Universidade do Estado do Mato Grosso; Silva, kleberson Luiz Miranda da; Universidade do Estado do Mato Grosso.
The morphologic traits of the common bean genotype (Phaseolus vulgaris L.) in Cáceres MT, Brazil, are evaluated to optimize genotypes for future improvement breeding cultures. Sixteen genotypes were evaluated through 33 morphological characters. The experiment was carried out in randomized blocks with four replicates at the Mato Grosso Company for Research and Extension (EMPAER) in Cáceres, Mato Grosso State. A dendrogram was produced by Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) and Plan projection. Results showed the occurrence of genetic variability among the genotypes and the dendrogram revealed the formation of two main groups, one comprised genotypes of the black group and the other comprised genotypes of the Cores and Carioca group,...
Palavras-chave: 5.01.03.05-9 Phaseolus vulgaris; Morphological description; UPGMA; Genetic divergence Melhoramento Vegetal Phaseolus vulgaris; Morphological description; UPGMA; Genetic divergence.
Ano: 2011 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/6944
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Genetic differentiation, origin and dispersal of Gammarus gauthieri from the Iberian peninsula and North Africa (Crustacea, Amphipoda) Naturalis
Scheepmaker, Maarten.
Genetic differentiation among population samples of G. gauthieri on both sides of the Strait of Gibraltar was investigated by enzyme electrophoresis at 20 enzyme loci with reference to G. gauthieri and G. ibericus from different areas in the Iberian peninsula. Levels of divergence resolved suggest that G. gauthieri reached North Africa from the Iberian peninsula, and not vice versa. With reference to geological evidence, this was likely to occur during the Messinian (6—5 My ago). As the opening of the Strait of Gibraltar represents a well dated geological event, an attempt has been made to calibrate the molecular clock for the G. pulex-group. Indirect estimations of gene flow levels were shown to be extremely low. Probably as a consequence of frequently...
Tipo: Article / Letter to the editor Palavras-chave: Distribution; Genetic divergence; Gene flow; Molecular clock; Gammarus.
Ano: 1990 URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/503962
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Genetic diversity in table grapes based on RAPD and microsatellite markers. Repositório Alice
LEAO, P. C. de S.; MOTOIKE, S. Y..
The objective of this work was to analyze the genetic diversity of 47 table grape accessions, from the grapevine germplasm bank of Embrapa Semiárido, using 20 RAPD and seven microsatellite markers. Genetic distances between pairs of accessions were obtained based on Jaccard's similarity index for RAPD data and on the arithmetic complement of the weighted index for microsatellite data. The groups were formed according to the Tocher's cluster analysis and to the unweighted pair-group method with arithmetic mean (UPGMA). The microsatellite markers were more efficient than the RAPD ones in the identification of genetic relationships. Information on the genetic distance, based on molecular characteristics and coupled with the cultivar agronomic performance,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cluster analysis; Genetic divergence; Grapevine; Multivariate analysis; Vitis vinifera.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/911901
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Genetic diversity in table grapes based on RAPD and microsatellite markers. Repositório Alice
LEAO, P. C. de S.; MOTOIKE, S. Y..
The objective of this work was to analyze the genetic diversity of 47 table grape accessions, from the grapevine germplasm bank of Embrapa Semiárido, using 20 RAPD and seven microsatellite markers. Genetic distances between pairs of accessions were obtained based on Jaccard's similarity index for RAPD data and on the arithmetic complement of the weighted index for microsatellite data. The groups were formed according to the Tocher's cluster analysis and to the unweighted pair-group method with arithmetic mean (UPGMA). The microsatellite markers were more efficient than the RAPD ones in the identification of genetic relationships. Information on the genetic distance, based on molecular characteristics and coupled with the cultivar agronomic performance,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetic divergence; Grapevine; Análise de agrupamento; Divergência genética; Análise multivariada; Uva; Marcador molecular; Vitis Vinifera; Cluster analysis; Multivariate analysis.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/913281
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Genetic diversity of macauba from natural populations of Brazil. Repositório Alice
CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. da; ANTONIASSI, R.; JUNQUEIRA, N. T. V.; BRAGA, M. F.; MACHADO, A. F. de F.; ROGÉRIO, J. B; DURARTE, I. D.; BIZZO, H. R..
The macauba has been identified as the most promising native species for the production of vegetable oil and biomass. Several studies confirm its potential for numerous purposes (liquid and solid biofuels, food, cosmetics and pharmaceuticals), but this Brazilian biodiversity resource has been little explored, and work aimed at their domestication and genetic improvement are relatively recent. This study consisted of a multivariate approach to levels of trans fatty acids, oil yield and physical characteristics found in fruits of macauba of natural populations. The objective was to quantify the genetic variability among 35 genotypes of natural populations of macauba from 16 locations in different regions of Brazil. Euclidean Distance measurements were...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Acrocomia aculeata; Euclidean distance; Agroenergy; Genetic divergence.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033515
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Identificacao de duplicidades de acessos de feijao por meio de tecnicas multivariadas. Repositório Alice
FONSECA, J.R.; SILVA, H.T. da.
Este trabalho objetivou testar as tecnicas de analise multivariada e da medida de divergencia genetica representada pela distancia generalizada de Mahalanobis na selecao de descritores e na identificao de duplicidades de acessos de feijao (Phaseolus vulgaris L.). Cinquenta acessos do Banco Ativo de Germoplasma (BAG-Feijao), da Embrapa-Centro Nacional de Pesquisa de Arroz e Feijao (CNPAF), foram avaliados em junho de 1993, utilizando-se delineamento experimental em blocos casualizados, com duas repeticoes. Dez descritores com caracteristicas quantitativas e fenologicas foram analisados por meio de variaveis canonicas e distancia de Mahalanobis. Todos os caracteres foram importantes na descricao do germoplasma. A tecnica de agrupamento pela distancia...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Analise multivariada; Divergencia genetica; Variaveis canonicas; Distancia de Mahalonobis; Phaseolus vulgaris; Multivariable analysis; Genetic divergence; Canonic variables; Mahalanobis distance.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/91504
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Mitochondrial evidence supports a Nearctic origin for the spreading limicolous earthworm Sparganophilus tamesis Benham, 1892 (Clitellata, Sparganophilidae) Naturalis
Rota, E.; Martinsson, S.; Bartoli, M.; Beylich, A.; Graefe, U.; Laini, A.; Wetzel, M.J.; Erséus, C..
We analysed samples of Sparganophilus taken at the corners of its distribution area in Europe (UK, Germany and Italy). No mitochondrial genetic divergence within and amongst them was found, neither in COI nor in 16S. Further, the COI haplotype was also identical to two sequences from Ontario, Canada in the Barcoding of Life Data System (BOLD) database. Our European COI and 16S sequences showed only minimal differentiation (only 1 or 2 substitutions) from specimens newly collected in Illinois and Washington states (USA), as well as from a COI haplotype from Tennessee (USA) in BOLD. An additional COI haplotype from Illinois (found in BOLD) is 2.1% different from the other haplotypes but clearly belongs to the same lineage of Sparganophilus. This...
Tipo: Article / Letter to the editor Palavras-chave: Aquatic megadriles; Genetic divergence; Oligochaeta; Recent introduction; Sparganophilus eiseni; Synonymy.
Ano: 2016 URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/607666
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Molecular identification of bamboo genera and species based on RAPD-RFLP markers. Repositório Alice
KONZEM, E. R.; PERON, R.; ITO, M. A.; BRONDANI, G. E.; TSA, S. M..
Article id 1691.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Rastreio molecular; Marcador molecular; Enzima de restrição; Divergência genética; Dendrocalamus; Bambusa; Molecular screening; Molecular markers; Restriction enzymes; Genetic divergence.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074480
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