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Association between genetic distances in wheat (Triticum aestivum L.) as estimated by AFLP and morphological markers. Repositório Alice
VIEIRA, E. A.; CARVALHO, F. I. F. de; BERTAN, I.; KOPP, M. M.; ZIMMER, P. D.; BENIN, G.; SILVA, J. A. G. da; HARTWIG, I.; MALONE, G.; OLIVEIRA, A. C. de..
2007
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador molecular; Divergência genética; Trigo; Triticum aestivum; Genetic divergence; Molecular marker; Wheat.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/559343
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Association between genetic distances in wheat (Triticum aestivum L.) as estimated by AFLP and morphological markers Genet. Mol. Biol.
Vieira,Eduardo Alano; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Bertan,Ivandro; Kopp,Mauricio Marini; Zimmer,Paulo Dejalma; Benin,Giovani; Silva,José Antônio Gonzalez da; Hartwig,Irineu; Malone,Gaspar; Oliveira,Antônio Costa de.
Molecular and morphological data analyses matrices are very informative tools for the estimation of genetic distances. We used AFLP markers, morphological traits and combined analysis to estimate the genetic distances between wheat genotypes and ascertain any associations between the two techneques. Nineteen wheat (Triticum aestivum L.) genotypes were analyzed using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers and field evaluated for two years. The matrices obtained by morphological and molecular marker data analyses revealed a significant but moderate correlation (r = 0.47), indicating that such techniques sample distinct genome regions. The combined analysis was found to be highly correlated with AFLP (r = 0.97) and moderately correlated with...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Reeding; Genetic divergence; Molecular markers; Morphological traits.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300016
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Avaliação da variabilidade das gerações G0 e F1 da linhagem GIFT de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) por RAPD - DOI: 10.4025/actascianimsci.v30i2.4708 Animal Sciences
Lupchinski Junior, Enio; UEM; Vargas, Lauro; UEM; Povh, Jayme Aparecido; UEM; Ribeiro, Ricardo Pereira; UEM; Mangolin, Claudete Aparecida; UEM; Barrero, Nelson Maurício Lopera; UEM.
Este trabalho teve como objetivo analisar, pela técnica RAPD, a variabilidade e a divergência genética de duas gerações da linhagem GIFT. Foram estimados parâmetros para os reprodutores (G0) e para a progênie (F1). A variabilidade genética foi determinada pela porcentagem de loci polimórficos e pelo índice de Shannon. As gerações apresentaram 69,6% de loci polimórficos (G0) e 60,0% de polimorfismo (F1). Os valores para o índice de Shannon foram de 0,367 para a geração G0 e de 0,317 para a F1. Os valores de divergência genética, calculados pelo teste de Mantel, foram de 0,213 para a G0 e 0,208 para a geração F1. Os resultados obtidos indicaram que houve perda da variabilidade genética da geração G0 para a F1. No entanto, um fato a ser destacado foi a alta...
Palavras-chave: 5.05.04.00-2 Reprodução Animal índice de Shannon; Gerações de cultivo; Divergência genética; Variabilidade genética. Shannon index; Cultivated generations; Genetic divergence; Genetic variability.
Ano: 2008 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/4708
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Avaliação de híbridos experimentais de cenoura no Distrito Federal. Repositório Alice
PEREIRA, R. B.; CARVALHO, A. D. F. de; PINHEIRO, J. B.; SILVA, G. O. da; VIEIRA, J. V..
O presente trabalho teve por objetivo avaliar o potencial agronômico de dois conjuntos de 24 híbridos de cenoura, sendo nove obtidos pelo cruzamento entre linhagens de origem tropical (grupo Brasília: CNPH-520 e CNPH- 536) e temperada (macho-estéreis: CNPH-610, CNPH-664, CNPH-633, CNPH-712 e CNPH-671) e 15 obtidos do cruzamento entre linhagens de origem tropical (CNPH-1 a CNPH-15) e a linhagem macho-estéril CNPH-612.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Queima-das-folhas; Divergencia genética; Cenoura; Doença de planta; Daucus carotta; Genetic divergence.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010352
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Caracterização e uso da variabilidade genética de banco ativo de germoplasma de Coffea canephora Pierre ex Froehner. Repositório Alice
ROCHA, R. B.; VIEIRA, D. dos S.; RAMALHO, A. R.; TEIXEIRA, A. L..
Objetivou-se, neste trabalho, quantificar a diversidade genética de acessos de C. canephora do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Rondônia, visando à identificação de plantas de maior divergência genética e maior potencial produtivo para hibridização.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coffea canephora; Genetic divergence; Productive potential; Robusta; Conilon; Divergência genética; Potencial produtivo.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/983944
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Characterization and genetic diversity between guarana progenies. Repositório Alice
FAJARDO, J. D. V.; ATROCH, A. L.; PINTO, C. E. D. L.; NASCIMENTO FILHO, F. J. do.
Caracterização e diversidade genética entre progênies do guaraná: o objetivo do estudo foi estimar a diversidade genética, estimar componentes de variância para caracteres morfoagronômicos, e da produção de progênies de guaranazeiro.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetic divergence; Melhoramento genético; Paullinia Cupana; Breeding; Genetic similarity; Genetic resources.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118217
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Comparison between multivariate methods applied for the evaluation of genetic divergence in Cacao (Theobroma cacao L.) BABT
Dias,Luiz Antônio dos Santos; Kageyama,Paulo Yoshio.
Several multivariate methods have been used in divergence analyses of populations. Consistency and relative association among four methods were assessed using a 5 x 5 complete-diallel data involving cacao cultivars. Over a 5-year period, five cultivars were analyzed based upon five yield components. In assessing the divergence of parents only the data obtained from five cacao cultivars were analyzed. Four multivariate statistics presented close association when considered in pairs, in this case the Mahalanobis' (D²) with the mean Euclidean distance obtained from canonical variates (d cv), and mean Euclidean distance (d e) with the mean Euclidean distance obtained from principal components (d pc). In both cases, high correlations (r > 0.95) were...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cacao cultivars; Canonical variates; Genetic divergence; Mahalanobis' and mean Euclidean distances; Principal components.
Ano: 1998 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89131998000200005
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Comparison of similarity coefficients used for cluster analysis with dominant markers in maize (Zea mays L) Genet. Mol. Biol.
Meyer,Andréia da Silva; Garcia,Antonio Augusto Franco; Souza,Anete Pereira de; Souza Jr.,Cláudio Lopes de.
The objective of this study was to evaluate whether different similarity coefficients used with dominant markers can influence the results of cluster analysis, using eighteen inbred lines of maize from two different populations, BR-105 and BR-106. These were analyzed by AFLP and RAPD markers and eight similarity coefficients were calculated: Jaccard, Sorensen-Dice, Anderberg, Ochiai, Simple-matching, Rogers and Tanimoto, Ochiai II and Russel and Rao. The similarity matrices obtained were compared by the Spearman correlation, cluster analysis with dendrograms (UPGMA, WPGMA, Single Linkage, Complete Linkage and Neighbour-Joining methods), the consensus fork index between all pairs of dendrograms, groups obtained through the Tocher optimization procedure and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic divergence; Heterotic groups; AFLP; RAPD; Multivariate analysis.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572004000100014
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Cytotaxonomy of some species and of interspecific hybrids of Pennisetum (Poaceae, Poales) Genet. Mol. Biol.
Techio,Vânia Helena; Davide,Lisete Chamma; Pereira,Antônio Vander; Bearzoti,Eduardo.
Cytotaxonomic studies were carried out on 26 accessions of Pennisetum spp. originating from the Active Germplasm Bank of Embrapa Gado de Leite-Juiz de Fora, Minas Gerais, Brazil.This study presents cytogenetics and reproductive morphological data for each one of these accessions, which allowed groupings and suggest botanical identifications to be established. The metaphases of the accessions characterized as P. purpureum confirmed the presence of 2n = 28 chromosomes that have already been described for this species. For the hybrids between P. purpureum and P. glaucum and for the hexaploids, resulting from the chromosome duplication of these hybrids, 2n = 21 and 2n = 42 chromosomes were confirmed, respectively. The wild accession identified as P. setosum...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pennisetum; Cytogenetic; Taxonomy; Germplasm; Genetic divergence.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572002000200014
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Disentangling the Influence of Mutation and Migration in Clonal Seagrasses Using the Genetic Diversity Spectrum for Microsatellites ArchiMer
Arnaud-haond, Sophie; Moalic, Yann; Hernandez-garcia, Emilio; Eguiluz, Victor M.; Alberto, Filipe; Serrao, Ester A.; Duarte, Carlos M..
The recurrent lack of isolation by distance reported at regional scale in seagrass species was recently suggested to stem from stochastic events of large-scale dispersal. We explored the usefulness of phylogenetic information contained in microsatellite loci to test this hypothesis by using the Genetic Diversity Spectrum (GDS) on databases containing, respectively, 7 and 9 microsatellites genotypes for 1541 sampling units of Posidonia oceanica and 1647 of Cymodocea nodosa. The simultaneous increase of microsatellite and geographic distances that emerges reveals a coherent pattern of isolation by distance in contrast to the chaotic pattern previously described using allele frequencies, in particular, for the long-lived P. oceanica. These results suggest...
Tipo: Text Palavras-chave: Clonality; Genetic Diversity Spectrum; Genetic divergence; Microsatellites; Seagrass; Stepwise mutation.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00182/29292/27733.pdf
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Dissimilaridade morfológica entre progênies de açaizeiro provenientes de Anajás - PA. Repositório Alice
YOKOMIZO, G. K.-I.; FARIAS NETO, J. T. de; OLIVEIRA, M. do S. P. de.
O consumo do suco de açaí tem aumentado no país e no exterior, principalmente por ser um alimento funcional, havendo a necessidade de pesquisas de melhoramento para atender essa crescente demanda. Com o objetivo de avaliar a dissimilaridade para fins de seleção, 30 progênies de meios-irmãos de açaizeiros provenientes do município de Anajás e cultivadas em Tomé-Açu, Pará, foram avaliados para as seguintes características: peso médio do cacho (PMC), em gramas; peso total de frutos (PTF), em gramas; peso médio do cacho vazio (PMCV), em gramas; tamanho médio da ráquis/cacho (TMR), em centímetros; peso médio de 100 frutos (PCF), em gramas; número total de cachos (NTC) e; peso total do cacho (PTC), sendo obtida pela multiplicação entre PMC e NTC. Os resultados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Divergência genética; Medidas de dissimilaridade; Análise multivariada; UPGMA; Genetic divergence; Dissimilarity measure; Multivariate analisys; Açaí; Euterpe Oleracea; Alimento; Morfologia Vegetal.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092286
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Divergência fenotípica entre acessos de uvas de mesa no Semi-Árido brasileiro. Repositório Alice
BORGES, R.M.E.; GONÇALVES, N.P. da S.; GOMES, A.P. de O.; ALVES, E.O. dos S..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a divergência fenotípica em uvas da Coleção da Embrapa Semi-Árido, com base em oito variáveis morfoagronômicas avaliadas nos anos 2005 e 2006. Nas uvas com sementes, a análise por componentes principais identificou oito grupos contrastantes. As variáveis mais relevantes, quanto à divergência genética, foram peso e comprimento de bagas. Em uvas sem sementes, formou-se apenas um grupo, e as variáveis mais relevantes foram peso de bagas e produção. A distância euclidiana média padronizada no grupo com sementes mostrou que 41% dos acessos apresentaram estimativas acima da média geral. No grupo sem sementes, o percentual foi de 47%. Foi observada concordância de resultados com os componentes principais. Pelo UPGMA,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis vinifera; Descritores de videira; Divergência genética; Melhoramento genético; Grape descriptors; Genetic divergence; Genetic inbreeding.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/122145
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Divergência fenotípica entre linhagens de abobóra para caracteres associados à morfologia da planta. Repositório Alice
SANTOS, H. J. B.; MIRANDA, J. S. da S.; BORGES, R. M. E.; LIMA, M. A. C. de.
O objetivo deste trabalho foi determinar a divergência fenotípica entre linhagens de abóbora com base em caracteres relacionados à morfologia da planta.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergência genética; Descritores qualitativos; Cucurbita moschata; Abóbora; Melhoramento genético vegetal; Melhoramento vegetal; Plant breeding; Genetic divergence; Qualitative descriptors.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1028993
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Divergencia genetica em acessos de feijao de corda avaliados em dois ambientes distintos. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; ARAUJO, F. P. de.
A selecao de progenitores tendo como um dos criterios a distancia genetica, tem sido usada em diversos programas de melhoramento. Os efeitos do ambiente na expressao genica, entretanto, podem influenciar na divergencia, sendo recomendavel a avaliacao dos genotipos em ambientes diferentes. Neste trabalho, 50 acessos de feijao de corda foram avaliados em Petrolina,PE, em dois ambientes distintos: 1) plantio irrigado, no segundo semestre de 1994 (A1), e 2) plantio dependente de chuvas, no primeiro semestre de 1995 (A2). O delineamento foi em blocos ao acaso, com duas repeticoes, sendo as parcelas formadas por uma linha com 16 plantas, no espacamento de 1,0 x 0,5 m, para os dois ambientes. Foram analisados 10 caracteres quantitativos, tendo como medida de...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergencia genetica; Genetic divergence; Cowpea; Feijão de corda; Vigna Unguiculata.
Ano: 1995 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/133141
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Divergência genética entre genótipos de sorgo sacarino baseado em caracteres agroindustriais. Repositório Alice
FAGUNDES, T. G.; NUNES, J. A. R.; PARRELLA, R. A. da C.; BRUZI, A. T.; DURAES, N. N. L.; LOMBARDI, G. M. R..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Agribusiness characters; Genetic divergence; Sorghum bicolor; Melhoramento genético vegetal; Plant breeding.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974781
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Divergência genética entre progênies de Pinus caribaea var. caribaea com base em caracteres quantitativos PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Silva, Janete Motta da; Aguiar, Ananda Virgínia de; Mori, Edson Seizo; Moraes, Mario Luiz Teixeira de.
O objetivo desse trabalho foi quantificar a dissimilaridade genética entre progênies de P. caribaea var. caribaea para identificar genitores divergentes, visando gerar genótipos mais produtivos e avaliar a variabilidade total por meio de alguns caracteres fenotípicos de importância comercial. Assim, um teste de progênies de P. caribaea var. caribaea foi implantado em delineamento experimental látice 10 x 10 triplo, com 99 progênies e uma testemunha comercial em Selvíria, MS. Foram avaliados os caracteres quantitativos antes e após desbaste aos 14 anos, tais como: altura total de plantas (m), diâmetro à altura do peito - DAP (cm); volume (m3 árvore-1); forma do fuste das árvores, densidade básica da madeira, na altura do DAP - DBM-1, e na metade da altura...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Parâmetros genéticos; Divergência genética; Pinheiros tropicais; Teste de progênies Genetic parameters; Genetic divergence; Tropical pines; Progeny trial.
Ano: 2012 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/194
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Divergência genética entre variedades de videiras do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Semiárido. Repositório Alice
BATISTA, P. F.; LIMA, M. A. C. de; LEAO, P. C. de S.; SOUZA, F. de F.; ALVES, R. E..
Este trabalho teve por objetivo avaliar a divergência genética entre 31 variedades de videira do Banco de Germoplasma da Embrapa Semiárido, considerando características de qualidade, compostos de importância funcional e atividade antioxidante dos frutos. Foram avaliadas nas bagas as seguintes características: teor de sólidos solúveis (SS), acidez titulável (AT), relação SS/AT, resistência da baga à força de compressão, teor de taninos (dímeros, oligoméricos e poliméricos), polifenóis extraíveis totais, antocianinas totais, flavonoides amarelos e atividade antioxidante. Foi utilizada a distância generalizada de Mahalanobis para quantificar a divergência genética entre as variedades. Como estratégias de agrupamento, foram empregados UPGMA e a análise de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis vinifera; Divergência genética; Variação fenotípica; Uva; Recurso genético; Grapes; Genetic divergence; Phenotypic variation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1023034
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Eficiência de coeficientes de similaridade em genótipos de feijão mediante marcadores RAPD. Repositório Alice
EMYGDIO, B.M.; ANTUNES, I.F.; CHOER, E.; NEDEL, J.L..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência de coeficientes de similaridade em genótipos de feijão por meio de marcadores RAPD. A eficiência dos coeficientes de similaridade de Jaccard, Sorensen-Dice, Russel e Rao, Ochiai, Coincidência Simples, Rogers e Tanimoto, Hamann, Kulczynski 2, Yule e Phi no agrupamento de 35 cultivares locais e comerciais de feijão foi analisada com base em 104 marcadores RAPD. Os coeficientes foram comparados por dendrogramas, pela eficiência da projeção no espaço bidimensional e por grupos formados pelo método de otimização de Tocher. Os diferentes coeficientes de similaridade apresentaram variação quanto à eficiência de projeção no espaço bidimensional e quanto ao número de grupos formados pelo método de otimização de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Divergência genética; Análise de agrupamento; Genetic divergence; Cluster analysis.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/108903
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Estimates of genetic parameters between and within black oat populations Bragantia
Meira,Daniela; Meier,Carine; Olivoto,Tiago; Nardino,Maicon; Klein,Luís Antônio; Moro,Ederson Duranti; Fassini,Fabrício; Marchioro,Volmir Sergio; Souza,Velci Queiróz de.
ABSTRACT The aims of this study were to characterize black oat populations by estimating between- and within-populations variance components and genetic parameters, as well as to distinguish the populations using multivariable statistics. The experiment was carried out in randomized blocks design with three repetitions, with 14 black oat populations collected in several municipalities of Rio Grande do Sul state. Agronomic important traits were assessed at physiological maturation stage. Variance components and genetic parameters were estimated considering within-block information. In addition, Mahalanobis distance, relative contribution of traits, and canonical variables were used to distinguish the populations. Selection based on panicle length, number of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avena strigosa; Genetic divergence; Genotypic variance.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052019000100043
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Evaluation of common bean accesses with multi-category variables - doi: 10.4025/actasciagron.v33i4.6944 Agronomy
Albuquerque, Amanda Nogueira de; Universidade do Estado do Mato Grosso; Barelli, Marco Antônio Aparecido; Universidade do Estado do Mato Grosso; Neves, Leonarda Grillo; Universidade do Estado do Mato Grosso; Arantes, Vinícius Ribeiro; Universidade do Estado do Mato Grosso; Silva, kleberson Luiz Miranda da; Universidade do Estado do Mato Grosso.
The morphologic traits of the common bean genotype (Phaseolus vulgaris L.) in Cáceres MT, Brazil, are evaluated to optimize genotypes for future improvement breeding cultures. Sixteen genotypes were evaluated through 33 morphological characters. The experiment was carried out in randomized blocks with four replicates at the Mato Grosso Company for Research and Extension (EMPAER) in Cáceres, Mato Grosso State. A dendrogram was produced by Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) and Plan projection. Results showed the occurrence of genetic variability among the genotypes and the dendrogram revealed the formation of two main groups, one comprised genotypes of the black group and the other comprised genotypes of the Cores and Carioca group,...
Palavras-chave: 5.01.03.05-9 Phaseolus vulgaris; Morphological description; UPGMA; Genetic divergence Melhoramento Vegetal Phaseolus vulgaris; Morphological description; UPGMA; Genetic divergence.
Ano: 2011 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/6944
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