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A comparison of RAPD and ISSR markers reveals genetic diversity among sweet potato landraces (Ipomoea batatas (L.) Lam.) - doi: 10.4025/actasciagron.v34i2.12616 Agronomy
Moulin, Monique Moreira; Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Rodrigues, Rosana; Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Gonçalves, Leandro Simões Azeredo; Universidade Estadual do Norte Fluminense; Sudré, Cláudia Pombo; Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Pereira, Messias Gonzaga; Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
Small farmers have played an important role in maintaining genetic resources of traditional varieties. Collecting and characterizing germplasm, especially landraces and heirloom varieties, are strategic activities that would create a knowledge base describing the traditional varieties of a given region and reduce the risk of genetic erosion. The objectives of this work were as follows: collect sweet potato roots from rural properties and local markets in Rio de Janeiro State, Brazil; characterize the accessions using RAPD and ISSR molecular markers, comparing the efficiency in discrimination of these two types of molecular markers; and estimate the genetic variability of the population. Fifty-nine samples from rural properties and 19 from local markets...
Palavras-chave: Genetic resources; Germplasm characterization; Genetic variability; Heirloom seeds.
Ano: 2012 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/12616
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A NEW WORLD MONKEY MICROSATELLITE (AP74) HIGHLY CONSERVED IN PRIMATES Acta biol.Colomb.
OKLANDER,LUCIANA INÉS; STEINBERG3,ELIANA RUTH; DOLORES MUDRY,MARTA.
Given their great variability, microsatellites or STRs became the most commonly used genetic markers over the last 15 years. The analysis of these markers requires minimum quantities of DNA, allowing the use of non invasive samples, such as feces or hair. We amplified the microsatellite Ap74 in blood and hair samples in order to analyze the levels of genomic conservation among a wide range of primates including: Lemur catta, Alouatta caraya, Ateles belzebuth, Ateles chamek, Pan troglodytes, Papio sp., and Homo sapiens. In all cases we obtained amplification products that exhibited similar size both in monkeys and human (oscillating between 126 and 176 bp), except in the lemur where the detected fragment presented a size of approximately 1000 bp. The...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Primates; Microsatellite markers; PCR amplification; Non-invasive sampling; Genomic conservation; Genetic variability.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2012000100007
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A study of the diversity of whitefly-trnasmitted geminivirus in the Submedio of San Francisco Valley- Brazil using PCR. Repositório Alice
SILVEIRA, F. Q. de P.; ROCHA, H. G. C.; LIMA, M. F.; RESENDE, L. V.; AVILA, A. C. de; BEZERRA, I. C..
bitstream/item/182378/1/Fitopatologia-Brasileira-v.23-p.312-1998.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Geminiviruws; Diversidade; Variabilidade genetica; Submedio Sao Francisco; White flies; Diversity; Genetic variability; Mosca Branca; Inseto Para Controle Biológico; Praga de Planta.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/133384
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Adaptação de milho a solos ácidos: tolerância a toxidez de alumínio e eficiência no uso de nutrientes no programa de pesquisa da Embrapa Milho e Sorgo. Repositório Alice
PARENTONI, S. N.; GAMA, E. E. G.; SANTOS, M. X.; LOPES, M. A.; ALVES, V. M. C.; BAHIA FILHO, A. F. C.; VASCONCELOS, C. A.; MAGNAVACA, R.; PACHECO, C. A.; MEIRELLES, W. F.; GUIMARAES, P. E. O.; SILVA, A. E. da; NASPOLINI FILHO, W.; MORO, J. R.; VIANA, R. T.; PITTA, G. V. E.; FRANCA, G. E.; PURCINO, A. A. C.; SOUZA, I. R. P.; MARRIEL, I. E.; MACHADO, A. T.; CORREA, L. A.; OLIVEIRA, A. C.; PAIVA, E..
1999
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Solo acido; Aluminio; Tolerancia; Toxidez; Cerrado; Variabilidade genetica; Germoplasmma; Estresse; Fosforo; Nitrogenio; Zea mays; Maize; Acid soil; Aluminium; Tolerance; Toxicity; Savanna; Genetic variability; Germplasm; Nitrogen; Phosphorus; Stress.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/483417
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Agronomic evaluation and morphological characterization of chili peppers (Capsicum annuum, Solanaceae) from Brazil. Repositório Alice
PADILHA, H. K. M.; SIGALES, C. V.; VILLELA, J. C. B.; VALGAS, R. A.; BARBIERI, R. L..
2016
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genebank; Genetic resources; Ex situ conservation; Genetic variability; Genebank; Genetic resources; Ex situ conservation; Genetic variability.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1060263
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Agrupamento de acessos e cultivares de três espécies de Brachiaria por RAPD - DOI: 10.4025/actasciagron.v30i4.5298 Agronomy
Ambiel, Ana Claudia; UNOESTE; Guaberto, Luciana Machado; UNOESTE; Vanderlei, Talita Marques; UNOESTE; Machado Neto, Nelson Barbosa; UNOESTE.
O propósito deste trabalho foi determinar a similaridade genética entre acessos de germoplasma e cultivares comerciais de três espécies de Brachiaria (inter e intraespecífica), por meio de marcadores RAPD. Sementes foram utilizadas como fonte de DNA. 10 “primers” decâmeros foram selecionados de 120 “primers” avaliados, produzindo 107 bandas polimórficas, as quais foram utilizadas para a análise de variância molecular (Amova), o coeficiente de similaridade de Jaccard e índices de fixação gênica. 24,40% da variabilidade genética total estão contidas entre as espécies e 75,60% dentro destas, com índice de fixação gênica (FST) 0,24. No dendrograma, houve a formação de dois ramos, um formado por P. maximum e B. arrecta e o outro subdividido em três: todas...
Palavras-chave: 5.02.01.03-4 Genética e Melhoramento Florestal Brachiaria; Marcadores moleculares; Variabilidade genética; Dendrograma; Índice de fixação gênica. Brachiaria; Molecular markers; Genetic variability; Dendrogram; Genetic fixation index.
Ano: 2008 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/5298
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Allozyme analysis of the four species of Hypostomus (Teleostei: Loricariidae) from the Ivaí river, upper Paraná river basin, Brazil - doi: 10.4025/actascibiolsci.v35i4.16355 Biological Sciences
Paiva, Suzana de; Universidade Estadual de Maringá; Zawadzki, Claudio Henrique; Universidade Estadual de Maringa; Ruvulo-Takasusuki, Maria Claudia Colla; Universidade Estadual de Maringá; Lapenta, Ana Silvia; Universidade Estadual de Maringá; Renesto, Erasmo; Universidade Estadual de Maringá.
Allozyme electrophoresis analysis were performed in four species of Hypostomus (Loricariidae), H. albopunctatus, H. hermanni, H. regani, e Hypostomus sp. 1/NUP 5612 from the Ivaí river, a tributary of the upper Paraná river. The study of 14 loci revealed diagnostic characters and exclusive alleles in a low frequency. The heterozygosity ranged from 0.000 in H. albopunctatus to 0.199 in H. hermanni, which was higher than the heterozygosity in other samples of Hypostomus in literature, as well as in other fish groups. Hypostomus albopunctatus and H. regani revealed higher similarity (I = 0.804), while H. hermanni and Hypostomus sp. 1/NUP 5612 showed the least genetic identity (I = 0.569). All samples were genetically distinguished, despite there were several...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: 2.02.00.00-5 catfish; Heterozygosity; Neotropical fishes; Genetic variability; Siluriformes Genética.
Ano: 2013 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciBiolSci/article/view/16355
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An AFLP estimation of the outcrossing rate of Spondias tuberosa (Anacardiaceae), an endemic species to the Brazilian Semiarid region. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; GAMA, R. N. C. de S..
The umbu tree (Spondias tuberosa) is one of the most important endemic species to the Brazilian tropical semiarid region. The umbu tree has edible fruits with a peculiar flavor that are consumed in natura or in a semi-industrialized form, such as jams, candies and juices. The majority of endemic species to Brazilian semiarid region have not been studied or sampled to form germplasm collections, which increases the risk of losing genetic variability of the adapted species to xerophytic conditions. The aim of this study was to estimate outcrossing rates in S. tuberosa using a multilocus mixed model in order to guide genetic resources and breeding programs of this species. DNA samples were extracted from 92 progenies of umbu trees, which were distributed...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Spondia tuberosa; AFLP; Sistema reprodutivo; Variabilidade genética; Planta nativa; Caatinga; Umbu; Melhoramento genético; Genetic variability.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/957559
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Análise da variabilidade genética de populações de Spdoptera frugiperda (lepidoptera:Noctuidae) em culturas de milho e algodão no Brasil. Repositório Alice
RAMIRO, C. A.; QUEIROZ, P. R.; MONNERAT, R. G..
2007
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Spodoptera frugiperda; Lagarta; Insect; Variabilidade genética; Genetic variability; Milho; Algodão; Brasil; Corn; Cotton; Brazil; Praga; Pests; Biological control; Controle biológico.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188667
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Análise discriminante das características físicas e químicas de frutos de pupunha (Bactris gasipaes Kunth) do alto Rio Madeira, Rondônia, Brasil. Repositório Alice
SANTOS, B. W. C. dos; FERREIRA, F. M.; SOUZA, V. F. de; CLEMENT; ROCHA, R. B..
O objetivo deste trabalho foi caracterizar as propriedades físicas e químicas dos frutos de pupunha visando a quantificar a variabilidade genética e a associação dos caracteres com a classificação tradicional estabelecida pela massa dos frutos [microcarpa (10 a 20 g), mesocarpa (20 a 70 g) e macrocarpa (>70 g)].
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bromatology; Genetic variability; Plant breeding; Bromatologia; Melhoramento de plantas; Variabilidade genética.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1087180
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Analise isoenzimatica de dois hibridos putativos naturais de especies silvestres do genero Manihot (Euphorbiaceae) Repositório Alice
BRONDANI, C..
Dois hibridos putativos naturais e seus provaveis parentais foram analisados via marcadores isoenzimaticos. Para Manihot nana e M. nogueirae, foram empregados os sistemas SKD G6PDH, NADHDH, GOT, ACP, SOD, LAP, AK e NADPHDH. Para M. hilariana e M. Salicifolia, foram utilizados IDH, MDH, PGI, PGD e MR. A analise baseou-se na presenca ou ausencia de bandas, utilizando-se o indice de similaridade genetica de Jaccard. Os resultados indicaram nao se tratar de um hibrido entre M. nana e M. nogueirae, e que, provavelmente, para o caso de M. hilariana e M.salicifolia, ha ocorrencia do hibrido. E ventos como este podem proporcionar novas combinacoes de alelos e ser precursor do processo de fixacao de especies de genero Manhihot.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Variabilidade genetica; Isoenzimas; Cruzamentos naturais; Genetic variability; Isozymes; Natural crosse.
Ano: 1996 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/104129
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Analysis of diversity among six populations of Colombian mango (Mangifera indica L. cvar. Hilacha) using RAPDs markers Electron. J. Biotechnol.
Díaz-Matallana,Marcela; Schuler-García,Ingrid; Ruiz-García,Manuel; Hodson de Jaramillo,Elizabeth.
Currently in Colombia, there are only records of morph-agronomic characterizations of Mangifera indica cvar. Hilacha; molecular studies on this mango variety have not been carried out. The aim of this work was to identify the genetic diversity of six populations of mango Hilacha by RAPDs markers, as a fundamental base for breeding programs, conservation and selection of promissory materials for the fruit industry at the national level. From 60 primers evaluated in the populations, five primers were selected and were launched in the six populations. Polymorphic bands of RAPDs were transformed into binary matrices, which were then processed with NTSYS-PC, POPGENE and TFPGA softwares. The overall genetic diversity, H T = 0.468 ± 0.0016, is very similar to the...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Genetic variability; Mango Hilacha; Organoleptic quality; RAPDs.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582009000300001
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Analysis of genetic variability of commercial melon cultivars using SSR molecular markers. Repositório Alice
CARVALHO, N.; CANELA, F. M.; LEITE, P. H. S.; FERREIRA, M. A.; OLIVEIRA, V. R.; SANTOS, M. F.; SOUZA, N. O. S.; BUSO, G. S. C..
bitstream/item/166721/1/Genetics-and-Molecular-Research-v.-16-n.-3-2017-CARVALHO-et-al.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Commercial cultivars; SSR; Melão; Marcador molecular; Cucumis melo; Genetic variability; Molecular markers.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079736
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Aplicação de marcadores moleculares no melhoramento genético. Repositório Alice
LANZA, M.A.; GUIMARAES, C. T.; SCHUSTER, I..
O melhoramento genetico tem sido um dos grandes responsaveis pelos avancos na agricultura, com o desenvolvimento de cultivares superiores, quer pela maior produtividade, quer pela melhor adaptacao aos ambientes adversos. O sucesso de um programa de melhoramento genetico depende fundamentalmente de algumas etapas como a escolha de genitores que produzam individuos com a melhor combinacao de alelos favoraveis e a selecao de genotipos superiores em populacoes segregantes. Uma potente ferramenta para auxiliar o melhoramento sao os marcadores moleculares, que fornecem um numero ilimitado de polimorfismos com base do DNA e sao independentes dos efeitos ambientais e do estadio fisiologico da planta, permitindo a identificacao precoce e precisa de individuos com...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Alelos; Variabilidade genetica; Polimorfismo; Marcador molecular; Genome; Genetic variability; Molecular marker.
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/484109
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Assessment of Genetic Variability of Fish Personality Traits using Rainbow Trout Isogenic Lines ArchiMer
Millot, Sandie; Pean, Samuel; Labbe, Laurent; Kerneis, Thierry; Quillet, Edwige; Dupont-nivet, Mathilde; Begout, Marie-laure.
The study of inter-individual variability of personality in fish is a growing field of interest but the genetic basis of this complex trait is still poorly investigated due to the difficulty in controlling fish genetic origin and life history. When available, isogenic lines that allow performing independent tests on different individuals having identical genotype constitute a very relevant experimental material to disentangle the genetic and environmental components of behavioural individuality. We took advantage of heterozygous isogenic lines to investigate the personality in rainbow trout through the analysis of their reactions to different experimental situations. To this end, seven to ten rainbow trout isogenic lines were screened for their spatial...
Tipo: Text Palavras-chave: Personality; Isogenic lines; Genetic variability; Risk taking; Spatial exploration; Oncorhynchus mykiss.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00194/30496/29976.pdf
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Association between BMP4 gene polymorphism and in vitro embryo production traits in Gyr cows. Repositório Alice
ORTIZ, W. H.; QUIRINO, C. R.; SILVA, A.; OLIVEIRA, C. S.; SERAPIÃO, R. V.; PACHECO, A.; BARTHOLAZZI, A..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genetic variability; Molecular markers; Mutation; OPU-IVP; SNPs.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035211
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Atividade isoenzimática em plantas de trigo infectadas com o vírus SBWMV. Repositório Alice
SOUZA, R. de; SCHONS, J.; BRAMMER, S. P.; PRESTES, A. M.; SCHEEREN, P. L.; SÓ e SILVA, M.; DEL DUCA, L. de J. A..
2005
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Triticum aestivum; Variabilidade genética; Esterase; Peroxidase; Aspartato aminotransferase; Genetic variability; Aspartate aminotransferase.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/824548
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Atividade isoenzimática em plantas de trigo infectadas com o vírus SBWMV. Repositório Alice
SOUZA, R. de; SCHONS, J.; BRAMMER, S.P.; PRESTES, A.M.; SCHEEREN, P.L.; SILVA, M.S. e; DEL DUCA, L. de J.A..
O objetivo deste trabalho foi elucidar a atividade e a expressão isoenzimática das esterases, das peroxidases e das aspartato aminotransferases em função da infecção de plantas de trigo pelo Soil-borne wheat mosaic virus (SBWMV). Foram analisadas, aos 45 dias após a emergência, quatro cultivares e uma linhagem de trigo, com diferentes níveis de resistência ao SBWMV: BRS Guabiju, BRS 194, BRS 179, BR 23 e PF 980524. De modo geral, ocorreram diferenças qualitativas e quantitativas intra e interpopulacional, quando comparadas plantas assintomáticas e sintomáticas ao SBWMV. Para o sistema esterase, nove padrões de bandas foram determinados e para peroxidase e aspartato aminotransferase foram detectados três padrões de bandas, para ambas as condições. Padrões...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Triticum aestivum; Variabilidade genética; Aspartato aminotransferase; Genetic variability; Esterase; Peroxidase; Aspartate aminotransferase.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/116462
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Atributos desejáveis para gramados a serem cultivados sob condições brasileiras: uma proposta. Repositório Alice
SOUZA, F. H. D. de; GUSMAO, M. R.; MATTA, F. de P.; CASTRO, A. C. R. de; MITTELMANN, A.; FAVERO, A. P.; JANK, L..
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Poaceae; Paisagismo; Variabilidade genética; Plantas nativas; Landscaping; Genetic variability; Native plants.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1054773
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Avaliação da variabilidade das gerações G0 e F1 da linhagem GIFT de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) por RAPD - DOI: 10.4025/actascianimsci.v30i2.4708 Animal Sciences
Lupchinski Junior, Enio; UEM; Vargas, Lauro; UEM; Povh, Jayme Aparecido; UEM; Ribeiro, Ricardo Pereira; UEM; Mangolin, Claudete Aparecida; UEM; Barrero, Nelson Maurício Lopera; UEM.
Este trabalho teve como objetivo analisar, pela técnica RAPD, a variabilidade e a divergência genética de duas gerações da linhagem GIFT. Foram estimados parâmetros para os reprodutores (G0) e para a progênie (F1). A variabilidade genética foi determinada pela porcentagem de loci polimórficos e pelo índice de Shannon. As gerações apresentaram 69,6% de loci polimórficos (G0) e 60,0% de polimorfismo (F1). Os valores para o índice de Shannon foram de 0,367 para a geração G0 e de 0,317 para a F1. Os valores de divergência genética, calculados pelo teste de Mantel, foram de 0,213 para a G0 e 0,208 para a geração F1. Os resultados obtidos indicaram que houve perda da variabilidade genética da geração G0 para a F1. No entanto, um fato a ser destacado foi a alta...
Palavras-chave: 5.05.04.00-2 Reprodução Animal índice de Shannon; Gerações de cultivo; Divergência genética; Variabilidade genética. Shannon index; Cultivated generations; Genetic divergence; Genetic variability.
Ano: 2008 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/4708
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