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A comparison of biological, molecular and enzymatic markers to investigate variability within Microdochium nivale (Fries) Samuels and Hallett Inra
Maurin, N.; Rezanoor, H.N.; Lamkadmi, Z.; Some, A.; Nicholson, P..
Les variations au sein d’une collection de souches européennes de Microdochium nivale isolées de plusieurs hôtes sont étudiées sur la base de la morphologie des conidies, des profils d’estérases et de RFLP de la région des ITS de l’ADN ribosomique, de l’agressivité sur des plantules de blé et de la capacité à produire des périthèces in vitro. Un groupe homogène est différencié à la fois par les profils d’estérases et les RFLP des ITS de l’ADN-r. Les isolats de ce groupe possèdent des profils d’ITS identiques aux isolats de référence de la variété majus utilisés par d’autres auteurs et sont, par conséquent, assignés à la variété majus. Les isolats à l’intérieur du groupe homogène majus ont été collectés à travers l’Europe, ce qui démontre que ce groupe...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MICRODOCHIUM NIVALE; RFLP; PROFIL BIOCHIMIQUE; PLANTE HOTE; MARQUEUR; VARIABILITE INTRASPECIFIQUE; CONIDIE; MARQUAGE ENZYMATIQUE; ISOLAT.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500012408050369&uri=/notices/prodinra1/2010/01/
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Analysis of recombinant Plum pox virus (PPV) isolates from Serbia confirms genetic homogeneity and supports a regional origin for the PPV-Rec subgroup Inra
Glasa, M.; Paunovic, S.; Jevremovic, D.; Myrta, A.; Pittnerová, S.; Candresse, T..
The recent observation of the frequent occurrence of natural recombinant Plum pox virus (PPV) isolates has led to the identification of a distinct PPV subgroup, named PPV-Rec. The diversity, origin and geographical spread of the recombinant PPV isolates belonging to this subgroup remain, however, relatively poorly known. In an effort to further our understanding of these isolates, eight PPV isolates from Serbia, the country from which the first such recombinant (PPV-o6) originated, were characterized. Depending on the genomic region targeted by different typing assays, seven of the eight isolates tested presented discrepancies in their typing behavior. Sequence analysis of the (Cter)NIb-(Nter)CP region confirmed the recombinant nature of these seven...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PPV; PLUM POX VIRUS; ISOLAT; PPV-REC.
Ano: 2005 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200752ccc4cf&uri=/notices/prodinra1/2010/10/
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Analysis of the population structure of three phenotypically different PSTVd isolates Inra
Gora, A.; Candresse, T.; Zagorski, W..
Phenotypically dissimilar greenhouse isolates from a Polish collection of potato spindle tuber viroid (PSTVd) were analysed. Partially purified PSTVd genomic RNAs from severe, intermediate and mild isolates was reverse transcribed and the resulting cDNAs enzymatically amplified. Abutting-primer PCR (Ab-P PCR) technology was used to obtain, in a single step, infectious full-length PSTVd cDNA monomers and these were sequenced. The mild isolate was found to be composed of a unique molecular variant (M), closely related to previously described PSTVd mild isolates. In the intermediate isolate, three variants, i2, i3 and i4, were detected. The severe isolate was found to be a mixture containing at least four molecular variants: s23, s27, i4 and i2. Infection of...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PSTVD; VIRUS DE LA POMME DE TERRE; VIROIDE PHYTOPATHOGENE; ISOLAT; SYMPTOMATOLOGIE; SEQUENCE NUCLEOTIDIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500010807048220&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Breakdown of resistance to grapevine downy mildew upon limited deployment Inra
Peressotti, E.; Merdinoglu-Wiedemann, S.; Delmotte, F.; Bellin, D.; Di Gaspero, G.; Testolin, R.; Merdinoglu, D.; Mestre Artigues, P.F..
Background: Natural disease resistance is a cost-effective and environmentally friendly way of controlling plant disease. Breeding programmes need to make sure that the resistance deployed is effective and durable. Grapevine downy mildew, caused by the Oomycete Plasmopara viticola, affects viticulture and it is controlled with pesticides. Downy mildew resistant grapevine varieties are a promising strategy to control the disease, but their use is currently restricted to very limited acreages. The arising of resistance-breaking isolates under such restricted deployment of resistant varieties would provide valuable information to design breeding strategies for the deployment of resistance genes over large acreages whilst reducing the risks of the...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RESISTANCE; GRAPEVINE DOWNY MILDEW; PLASMOPARA VITICOLA; CV BIANCA; ISOLAT; CONTOURNEMENT DE LA RESISTANCE.
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010e7b026a6&uri=/notices/prodinra1/2011/01/
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Caracterisation biologique de differents isolats du virus de la mosaique du chou fleur (CaMV). 1. Plantes hotes : Solanees Inra
Mevel, S.; Kerlan, C..
L’aptitude du CaMV à infecter une gamme de Solanées a été étudiée à partir de 11 isolats prélevés sur chou-fleur en Bretagne, 2 souches provenant de Crucifères en Argentine et 5 souches de référence, Cabb-S, Cabb-B, Cabb-BJI, PV-45, CM4-184. Six isolats français, plus 2 souches argentines et Cabb-BJI sont systémiques sur Datura stramonium. Sur Nicotiana bigelowi, un isolat français et une souche argentine sont systémiques, alors que sur N clevelandii, seules les 2 souches argentines le sont. N benthamiana est une nouvelle plante hôte à infection systémique pour le CaMV au vu des réactions induites par 3 isolats français, les 2 souches argentines et Cabb-BJI. N edwardsonii, N glutinosa, N glauca, N tabacum var Turkish, Samsum et Xanthi et N rustica...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: CAULIMOVIRUS; VIRUS MOSAIQUE DU CHOU FLEUR; SOLANEE; NICOTONIA; ISOLAT; PLANTE HOTE; SYMPTOMATOLOGIE; TECHNIQUE ELISA.
Ano: 1990 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9100012020019094&uri=/notices/prodinra1/2009/04/
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Characterization of a naturally occurring recombinant isolate of Grapevine fanleaf virus Inra
Vigne, E.; Demangeat, G.; Komar, V.; Fuchs, M..
The naturally occurring Grapevine fanleaf virus (GFLV) recombinant isolate A17b was recovered from its grapevine host by sap inoculation and serial passages onto Gomphrena globosa, a pseudo local lesion herbaceous host, and Chenopodium quinoa, a systemic herbaceous host, to characterize some of its biological properties. Sequence analysis of the CP gene, in which a recombinational event was previously detected, demonstrated the genetic stability of recombinant isolate A17b over a 5-year period in its natural host as well as in C. quinoa. Also, recombinant isolate A17b was graft transmissible, as shown by an in vitro heterologous approach, and transmitted by the nematode Xiphinema index as readily as nonrecombinant GFLV isolates. Furthermore, despite a...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VIRUS DU COURT NOUE DE LA VIGNE; ISOLAT; POUVOIR PATHOGENE; PLANTE HOTE; ISOLAT RECOMBINANT GRAPEVINE FANLEAF VIRUS; ISOLATE; CP GENE.
Ano: 2005 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2007d7973279&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Fusarium spp from potato: polymorphism of esterase phenotypes on polyacrylamide gel electrophoresis Inra
Some, A.; Tivoli, B..
L’électrophorèse sur gel de polyacrylamide est utilisée pour analyser 49 isolats monospores de Fusarium issus pour la plupart de pomme de terre en Bretagne. Ces isolats appartiennent à 3 espèces (F oxysporum, F solani et F roseum), et 5 variétés de F roseum (sambucinum, arthrosporioides, culmorum, graminearum, gibbosum). Les estérases du mycélium, seul critère enzymatique retenu, permettent de distinguer sans ambiguïté chaque espèce ou variété de Fusarium. Selon les espèces ou les variétés, 6 à 20 bandes enzymatiques sont mises en évidence mais 3 à 4 seulement peuvent servir à leur identification. F oxysporum, F solani var coeruleum et F roseum var arthrosporioides ont des zymogrammes bien distincts ; les profils d’estérases de F roseum var culmorum et de...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ELECTROPHORESE SUR GEL DE POLYACRYLAMIDE; ISOENZYME; SYSTEMATIQUE; ISOLAT; SPORE FONGIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300012527033934&uri=/notices/prodinra1/2009/11/
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Gm and Km allotypes in Wayampi, Wayana and Emerillon Indians from French Guiana IRD
Dugoujon, J.M.; Guitard, E.; Senegas, M.T.; Grenand, Pierre; Bois, E..
Tipo: Text Palavras-chave: ANTHROPOLOGIE; MIGRATION; HISTOIRE DU PEUPLEMENT; GENETIQUE; INTERPRETATION; IMMUNOLOGIE; IMMUNOGLOBULINE; ISOLAT.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39837
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Manifestation, en France, du pietin-echaudage sur gazon du a Gaeumannomyces graminis var avenae Inra
Lucas, P.; Sarniguet, A.; Laurent, C..
Des destructions de plantes en foyers circulaires ou semi-circulaires sont fréquemment observées sur parcours de golf de l’Ouest de la France. Ces dégâts affectent aussi bien la fétuque sur « fairways » que l’agrostide sur « greens ». L’examen morphologique des isolats responsables de la maladie montre qu’il s’agit d’un champignon appartenant à l’espèce Gaeumannomyces graminis (Sacc) von Arx et Olivier. La longueur des ascospores produites par ces isolats, supérieure à celle d’ascospores produites par G graminis var tritici Walker, permet de le rattacher à la variété avenae (Turner) Dennis. De plus, parmi 2 souches très agressives isolées l’une de blé, l’autre d’agrostide, seule celle isolée d’agrostide s’est révélée pathogène à la fois sur blé et sur...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: GAEUMANNOMYCES GRAMINIS; GOLF; PLANTE HERBACEE; VIRULENCE; ISOLAT; PIETIN ECHAUDAGE.
Ano: 1992 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9200012153024054&uri=/notices/prodinra1/2009/10/
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Polymorphisme des régions capside et 3’NTR de 3 isolats tunisiens du virus Y de la pomme de terre (PVY) Inra
Fakhfakh, H.; Makni, M.; Robaglia, C.; Elgaaied, A.; Marrakchi, M..
En Tunisie, le virus Y de la pomme de terre (PVY) occasionne des pertes importantes sur la production des cultures maraîchères, en particulier le piment. Le séquençage de la région 3’ non codante (3’NTR) et de la région codant pour la protéine capside (CP) de 2 isolats de PVY d’origine piment et d’un isolat d’origine pomme de terre semble indiquer une corrélation entre les manifestations symptomatologiques de ces isolats et leurs propriétés moléculaires. La structure secondaire potentielle de l’ARN viral au niveau de la région 3’NTR montre des différences entre les 3 isolats. L’analyse de la séquence de la région codant pour la protéine capside suggère qu’un phénomène de recombinaison serait à l’origine de l’isolat d’origine piment PVY-P21.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: POLYMORPHISME; CAPSIDE; PVY; CULTURE MARAICHERE; SEQUENCAGE; ISOLAT; SEQUENCE NUCLEOTIDIQUE; RECOMBINAISON; ARN VIRAL; EXPRESSION DES GENES SECONDARY STRUCTURE.
Ano: 1995 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20105a144ce0&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Some differences in isolates of the black pod disease organisms from six cocoa growing countries IRD
Asare-Nyako, A.; Muller, Raoul; Blaha, G..
Tipo: Text Palavras-chave: POURRITURE BRUNE; POUVOIR PATHOGENE; SEMENCE; CROISSANCE; PHYTOPHTORA; ISOLAT; CACAOYER; AMELONADO.
Ano: 1982 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:04281
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Use of intramolecular chimeras to map molecular determinants of symptom severity of potato spindle tuber viroid (PSTVD) Inra
Gora, A.; Candresse, T.; Zagorsky, W..
Nucleotide sequence comparison shows that sequence variations are mostly clustered in the P (pathogenicity) and V (variable) domains of the potato spindle tuber viroid (PSTVd) molecule. Although these comparisons suggest the P domain as the primary determinant of PSTVd symptom severity, the potential contribution of the V domain has never been analysed in detail. To investigate the relationship between the structure of these domains and pathogenicity, six intraspecific chimeric PSTVd variants were constructed by exchanging P and V domains between a mild and two different severe PSTVd isolates. Infectivity studies showed that the P domain is directly responsible for the severity of symptoms induced in tomato. The four recombinants containing a P domain from...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PSTVD; VIRUS DE LA POMME DE TERRE; PATHOGENECITE; ISOLAT; CHIMERE.
Ano: 1996 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9700011245060134&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Variabilite biologique du virus de la mosaique du chou-fleur sur chou-fleur en Bretagne Inra
Kerlan, C.; Mevel, S..
L’analyse d’échantillons de chou-fleur infectés par le CaMV, prélevés dans les trois zones de production en Bretagne et dans des collections de matériel génétique, met en évidence une variabilité biologique du virus. Les réactions de deux plantes-hôtes, Nicotiana clevelandii Gray et Brassica campestris L. Just Right permettent de classer les isolats en quatre groupes et 12 sous-groupes; 11 de ceux-ci sont présents dans le matériel étudié. Une forte proportion de ces isolats (42%) induit sur N. clevelandii une réaction d’hypersensibilité. L’indexage sur deux populations de chou-fleur révèle des degrés d’aggressivité différents selon les isolats, mais les réactions ne sont pas uniformes en raison de l’hétérogénéité génétique de ce matériel. A...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: VIRUS MOSAIQUE DU CHOU FLEUR; VARIABILITE; ISOLAT; INDEXAGE; TECHNIQUE ELISA.
Ano: 1989 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9000003117014160&uri=/notices/prodinra1/2009/09/
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Variabilite du pouvoir pathogene chez Septoria nodorum Berk. (Leptosphaeria nodorum Müll) Inra
Skajennikoff, M.; Rapilly, F..
Les résultats consignés montrent que ies amplitudes de variation du pouvoir pathogène de Septoria nodorum, évaluées par la réduction du poids de 1 000 grains ou par des éléments de la résistance partielle, sont du même ordre de grandeur entre isolats, entre pycnides issues d’un même isolat, qu’entre monopycnidiospores issues d’un même cirrhe. Les souches de S. nodorum sont donc des populations faites d’éléments aux pouvoirs pathogènes différents. Le noyau et le cytoplasme de l’hôte exercent sur ces populations des pressions de sélection permettant aux éléments les mieux adaptés à l’hôte de passage d’être sélectionnés. Suivant le niveau des perturbations qu’ils provoquent sur les blés sensibles, on peut classer les cytoplasmes dans l’ordre suivant: Triticum...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: SEPTORIA NODORUM; PRESSION DE SELECTION; EPIDEMIOLOGIE; RESISTANCE; POUVOIR PATHOGENE; ISOLAT.
Ano: 1989 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9100009633019276&uri=/notices/prodinra1/2009/09/
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