SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

CARVALHO, N.; CANELA, F. M.; FERREIRA, M. A.; OLIVEIRA, V. R.; SANTOS, M. F.; BUSO, G. S. C..

2015

Análise genética de genótipos interespecíficos de amendoim divergentes para produção de óleo.

Palavras-chave: Pele de sapo; Cucumis melo; Variabilidade genética; ISSR; SSR.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1026269

QUEIROZ, C. M.; BATISTA, V. G. L.; GALVÃO FILHO, A. L. de A.; PINHEIRO, M. P. N.; SILVA, C. R. C.; SANTOS, R. C. dos; LIMA, L. M. de.

2010

Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Arachis hypogaea; ISSR; Polimorfismo.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/855290

Análise morfoanatômica, bioquímica e molecular de dendezeiros (Elaeis guineensis Jacq.) regenerados por embriogênese somática em sistema de imersão temporária.

Assessing Genetic Variation and Spread of Phalaris minor Resistant to ACCase Inhibiting Herbicides in Iran

GOMES, H. T..

O objetivo do trabalho foi avaliar a utilização de sistemas de imersão temporária na embriogênese somática de dendezeiros (Elaeis guineensis Jacq.), a partir de folhas imaturas de plantas adultas, caracterizar morfoanatômica e bioquimicamente os estádios embriogênicos obtidos no processo, além analisar os clones regenerados por marcadores ISSR e AFLP (MSAP). Num primeiro experimento, calos primários da variedade C2328 foram multiplicados por cinco subcultivos de 30 dias, em quatro diferentes sistemas de cultivo: semi-sólido, líquido sob agitação, além dos biorreatores de imersão temporária R.I.T.A.® e tipo frascos gêmeos (BIT). Em seguida, o biorreator mais eficiente foi avaliado isoladamente na multiplicação de calos de outras três variedades: B35-2932,...

Tipo: Tese/dissertação (ALICE)

Palavras-chave: Arecaceae; Biorreatores de imersão temporária; Embrião somático; Variação somaclonal; ISSR; AFLP; MSAP; Morfogênese; Ontogênese; Micropropagação; Marcador molecular; Histologia; Fisiologia.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1065516

Planta Daninha

GHEREKHLOO,J.; ALCÁNTARA-DE LA CRUZ,R.; OSUNA,M.D.; SOHRABI,S.; PRADO,R..

ABSTRACT: Littleseed canarygrass (Phalaris minor) is the second most serious and problematic grass weed in wheat fields in Iran, and has developed resistance to ACCase inhibiting herbicides. Inter-simple sequence repeat (ISSR) analysis was used to assess genetic variation between and within ACCase inhibitor-resistant and susceptible P. minor populations in Iran and to determine the origin of resistance and its dispersal. Sixteen P. minor populations from different regions in Iran were analysed using seven primers. Genetic relationships generated using UPGMA analysis indicated the presence of more than one genotype among the herbicide resistant populations. The results indicated that the high genetic similarity and physical proximity among the resistant P....

Assessment of Genetic Fidelity of in vitro Raised Plants in Swertia chirayita through ISSR, RAPD analysis and Peroxidase Profiling during Organogenesis

Palavras-chave: Dendrogram; Herbicide resistance; ISSR; Genotype; UPGMA.

Ano: 2020

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-83582020000100226

BABT

Sharma,Vikas; Belwal,Nidhi; Kamal,Barkha; Dobriyal,Anoop Kumar; Jadon,Vikash Singh.

ABSTRACT An efficient in vitro regeneration protocol for medicinally important herb Swertia chirayita was developed and the genetic fidelity was assessed using RAPD and ISSR markers. The best shoot regeneration was observed on MS basal supplemented with 1.0 mg/L Benzyl amino purine (BAP) in combination with Indole-3-acetic acid (IAA) (0.5 mg/L) that resulted in the increase by multiplication rate (7.65) with an average of 33.33 numbers of shoots and average shoot length of 2.70 cm. It was further enhanced by the addition of adenine sulfate (0.007%) that resulted in an average of 42 shoots per clum with 4.13 cm of average shoot length and the increase in multiplication fold to 9.75 that further resulted in the reduced use of other cytokinins and auxins. The...

Assessment of somaclonal variation in indirect morphogenesis-derived plants of Arracacia xanthorrhiza

Palavras-chave: Swertia chirayita; Micropropagation; Adenine sulfate; Ascorbate peroxidase; RAPD; ISSR.

Ano: 2016

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132016000100434

PAB

Vitamvas,Jan; Viehmannova,Iva; Cepkova,Petra Hlasna; Mrhalova,Hana; Eliasova,Katerina.

Abstract: The objective of this work was to induce and detect somaclonal variation in arracacha (Arracacia xanthorrhiza) plants regenerated via indirect morphogenesis, in order to evaluate the potential of this technique to produce new genotypes for breeding purposes of this crop. Calli were induced from petiole segments on Murashige & Skoog (MS) medium supplied with 0.1 mg L-1 2,4-dichlorophenoxyacetic acid. The regeneration of plants via indirect morphogenesis was carried out on half-strength MS medium without plant growth regulators. Fifteen randomly chosen plants were subjected to flow cytometry and “inter-simple sequence repeat” (ISSR) analysis. Ploidy level remained stable in all tested regenerants (2n=4x=44), with no changes in the genome....

Avaliação da diversidade genética entre progênies de P. quadrangularis e P. alata.

Palavras-chave: Arracacha; ISSR; Plant breeding; Ploidy level; Somatic embryogenesis.

Ano: 2019

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2019000102200

VIANA, C. G.; FALEIRO, F. G.; OLIVEIRA, J. da S.; FONSECA, K. G. da; VIANA, M. L.; BASSO, J. P.; JUNQUEIRA, N. T. V..

bitstream/item/171188/1/Anais-Simposio-p15.pdf

BSA and molecular markers screening for salt stress tolerant mutant of Petunia obtained in in vitro culture

Palavras-chave: Maracujá-melão; Marcadores RAPD; ISSR; Recurso genético; Fruticultura.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085568

Ciência Rural

Krupa-Małkiewicz,Marcelina; Bienias,Anna.

ABSTRACT: In this study, we performed BSA to identify genetic markers linked to salt tolerance. We tested the genetic diversity among four bulked DNA samples of EMS induced mutant clones and one bulked DNA sample of non-mutated clone of Petunia for salt tolerance in in vitro callus cultures using RAPD and ISSR markers. Out of the 36 RAPD and 16 ISSR primers identified, 25 and 13 were effectively used to amplify genomic DNA of all the five bulked samples, respectively. In total, 114 RAPD amplifications products were obtained, of which 28% were polymorphic and 2% were genotype-specific bands. Out of the 64 ISSR amplification products obtained, 51% were polymorphic and 1% was genotype-specific bands. Results of this study indicated the existence of two...

Caracterização citogenética e aplicação de marcadores ISSR em diferentes acessos de Passiflora cincinnata Mast.

Palavras-chave: Bulk segregant analysis; Chemical mutagenesis; ISSR; RAPD; Petunia × atkinsiana D. Don; Salt stress; Tissue culture..

Ano: 2018

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018001200400

ALMEIDA, L. E. da S.; MELO, N. F. de.

Neste contexto, o presente estudo objetivou caracterizar acessos de maracujá da caatinga (P. cincinnata ), pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Semiárido, por meio de estudos de cromossomos mitóticos, bandeamento com coloração diferencial, viabilidade polínica, além de estimar a diversidade genética através do uso de marcadores moleculares do tipo ISSR

Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Viabilidade polínica; Cromossomo; ISSR; Recursos genéticos vegetais; Marcador molecular; Maracujá do mato; Biodiversidade; Passiflora cincinnata.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1086346

Caracterização genética de progênies de gravioleira por meio de marcadores ISSR.

LIMA, E. N.; CAVALCANTI, J. J. V.; BORDALLO, P. do N.; ARAÚJO, M. E. B. de.

2010

Caracterização molecular de acessos do banco ativo de germoplasma de citros da Embrapa Mandioca e Fruticultura.

Palavras-chave: Polimorfismo; Diversidade; ISSR.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/882022

PIMENTEL, P. P. de J.; FERREIRA, C. F.; PASSOS, O. S.; SOARES FILHO, W. dos S.; GESTEIRA, A. da S..

A citricultura brasileira representa importante segmento econômico na pauta de produtos agrícolas, não só por seu expressivo valor de produção, como por sua importância na geração de empregos diretos e indiretos. Em nível mundial, o Brasil destaca-se como maior produtor de citros, detentor de pomares que somam uma população superior a 200 milhões de plantas, e maior produtor e exportador de suco concentrado congelado de laranja.

Caracterização molecular de híbridos de citros com potencial para porta-enxerto com tolerância à seca.

Palavras-chave: Banco ativo de germoplasma; Citros; Citrus spp.; Marcador molecular; ISSR.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/936799

MATTA, R. R. C. da; RAMALHO, E. V. B. M.; GESTEIRA, A. da S.; FERREIRA, C. F..

A caracterização agronômica e molecular é uma atividade essencial no manejo de coleções de germoplasma, pois consiste em tomar dados para descrever, identificar e diferenciar acessos dentro de espécies, classes ou categorias. As análises moleculares permitem uma visão do polimorfismo genético que muitas vezes difere do polimorfismo derivado da análise fenotípica.

Caracterização molecular de híbridos de citros com potencial para porta-enxerto com tolerância à seca.

Palavras-chave: Citros; Porta-enxerto; Marcadores moleculares; ISSR; Primer.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/937390

PINHO, J. de S.; SOARES FILHO, W. dos S.; GESTEIRA, A. da S.; FERREIRA, C. F..

Líder mundial, a citricultura brasileira se destaca por seu expressivo valor de produção e considerável geração de empregos diretos e indiretos, da ordem de 400 mil colocações de trabalho em nível nacional. Seus pomares somam mais de 300 milhões de plantas, distribuídas por todo o País, em área superior a 900 mil ha.

Caracterização molecular de mutantes de bananeira da cv. terra por meio de marcadores ISSR.

Palavras-chave: Marcadores moleculares; ISSR; Fruta cítrica; Porta enxerto.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/966026

PESTANA, R. K. N.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; SILVA, S. de O. e..

A técnica de indução de mutação por irradiação tem sido muito empregada em programas de melhoramento de plantas visando a seleção de mutantes com características agronômicas desejáveis. Os marcadores moleculares são importantes ferramentas para a detecção dos efeitos da radiação gama com precisão, uma vez que, com o advento das técnicas modernas de biologia molecular, surgiram diversos métodos de detecção de polimorfismo genético direto; ou seja, em nível de DNA. O maior interesse na aplicação dos marcadores genéticos no melhoramento vegetal é a perspectiva de estabelecer ligações entre os marcadores e os genes que controlam determinada característica (OLIVEIRA et al., 1996).

Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: ISSR; Banana; Mutação; Marcador molecular; Melhoramento genetico.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/873366

Caracterização morfológica e molecular de matrizes selecionadas da espécie de maracujazeiro silvestre Passiflora cincinnata.

FONSECA, K. G. da; FALEIRO, F. G.; LIMA, H. C. de; ARAUJO, F. P. de; ARAYA, S.; COSTA, A. M..

Neste trabalho, objetivou-se realizar a caracterização morfológica e molecular de 12 matrizes selecionadas de P. cincinnata.

Caracterização morfológica e molecular de matrizes selecionadas da espécie de maracujazeiro silvestre Passiflora cincinnata.

Palavras-chave: Passiflora cincinnata; Proteção de cultivares; Variabilidade genética; Descritores; ISSR; RAPD; Maracujá; Melhoramento genético; Marcador molecular; Passion fruit; Genetical enhancement; Molecular marker.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027415

FONSECA, K. G. da; FALEIRO, F. G.; LIMA, H. C. de; ARAUJO, F. P. de; ARAYA, S.; COSTA, A. M..

Neste trabalho, objetivou-se realizar a caracterização morfológica e molecular de 12 matrizes selecionadas de P. cincinnata.

Clonal diversity and conservation genetics of the medicinal plant Carapichea ipecacuanha (Rubiaceae)

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032906

Genet. Mol. Biol.

Oliveira,Luiz Orlando de; Venturini,Bruna Afonso; Rossi,Ana Aparecida Bandini; Hastenreiter,Saulo Santos.

The roots of the understorey shrub Carapichea ipecacuanha (ipecac) have medicinal properties, and the uprooting of wild plants has supplied most of the world demand for this species. Although under severe population decline, C. ipecacuanha lacks legal protection. In the wild, the aerial stems of ipecac clump together to form clusters with well-defined borders. Cluster size may range from several to hundreds of aerial stems. To investigate the extent of clonality among aerial stems in ipecac clusters, we sampled 50 wild clusters (a total of 291 aerial stems) and screened them with 89 inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. The 291 aerial stems were grouped into 42 putative clones. The clonal groups generally consisted of aerial stems from the same...

Construction of a molecular identification profile of new varieties of Nierembergia linariaefolia by anchored microsatellites

Palavras-chave: Clonal propagation; Genetic diversity; ISSR; Poaia; Psychotria ipecacuanha.

Ano: 2010

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000100016

Electron. J. Biotechnol.

Pérez de la Torre,Mariana C.; Escandón,Alejandro S..

The objective of the present work was to establish the molecular identification profile for six new varieties of Nierembergia linariaefolia to incorporate the fingerprint, as complementary information to the standard registration data. Total DNA was extracted from young leaves following the protocol of the cetyltrimethylammonium bromide. Anchored microsatellites were used as molecular markers. The amplification reactions were carried out with seven primers. A total of 251 loci were detected, 98% of them were polymorphic. The average of polymorphic loci was 35 loci per primer and, 41 loci per genotype. Six out of the seven primers used discriminated all the individuals involved in the present study; consequently, it was possible to generate the molecular...

Tipo: Journal article

Palavras-chave: ISSR; Ornamentals; Varietal identification.

Ano: 2006

URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582006000300014

Determination of genetic variation in Rhodiola crenulata from the Hengduan Mountains Region, China using inter-simple sequence repeats

Genet. Mol. Biol.

Lei,Yidong; Gao,Hong; Tsering,Tashi; Shi,Suhua; Zhong,Yang.

The plant Rhodiola crenulata is a perennial herbaceous species distributed in the plateau region of southwestern China, especially the Hengduan Mountains region. It has been one of the most important traditional herbal remedies in Tibet for more than one thousand years, but the accelerated and uncontrolled collection of this plant since the 1980s has lead to deforestation. We used inter-simple sequence repeats (ISSR) to assess levels of genetic variation in R. crenulata from nine diverse natural populations in eastern Tibet and northern Yunnan, the first time such a study has been carried out. The 12 primers we used were able to detect 184 polymorphic loc. Analysis of molecular variance (AMOVA) indicated that species level genetic diversity was relatively...